MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome I

Total Repeats: 57925

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_012582	CAG	2	6	676234	676239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116993
13002	NC_012582	ATG	2	6	676262	676267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116993
13003	NC_012582	GCG	2	6	676274	676279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227116993
13004	NC_012582	TCG	2	6	676289	676294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116993
13005	NC_012582	CA	3	6	676412	676417	50 %	0 %	0 %	50 %	227116993
13006	NC_012582	GTG	2	6	676433	676438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116993
13007	NC_012582	T	6	6	676456	676461	0 %	100 %	0 %	0 %	227116993
13008	NC_012582	GCG	2	6	676477	676482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227116993
13009	NC_012582	AAG	2	6	676597	676602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227116993
13010	NC_012582	GCG	2	6	676607	676612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227116993
13011	NC_012582	A	6	6	676624	676629	100 %	0 %	0 %	0 %	227116993
13012	NC_012582	ATC	2	6	676652	676657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116993
13013	NC_012582	ATT	2	6	676700	676705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227116994
13014	NC_012582	AAC	2	6	676734	676739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116994
13015	NC_012582	CAG	2	6	676755	676760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116994
13016	NC_012582	CAG	2	6	676791	676796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116994
13017	NC_012582	ACAGT	2	10	676841	676850	40 %	20 %	20 %	20 %	227116994
13018	NC_012582	GAT	2	6	676872	676877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116994
13019	NC_012582	ACC	2	6	676893	676898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227116994
13020	NC_012582	TGC	2	6	676956	676961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116994
13021	NC_012582	GCCTTT	2	12	676992	677003	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	227116994
13022	NC_012582	TGT	2	6	677042	677047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116994
13023	NC_012582	AAG	2	6	677062	677067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227116994
13024	NC_012582	GAA	2	6	677102	677107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227116994
13025	NC_012582	TGA	2	6	677129	677134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116994
13026	NC_012582	CTG	2	6	677165	677170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116994
13027	NC_012582	TAA	2	6	677279	677284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227116994
13028	NC_012582	GAT	2	6	677352	677357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116994
13029	NC_012582	CCG	2	6	677360	677365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227116994
13030	NC_012582	ACCA	2	8	677384	677391	50 %	0 %	0 %	50 %	227116994
13031	NC_012582	CAC	2	6	677396	677401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227116994
13032	NC_012582	AGC	2	6	677404	677409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116994
13033	NC_012582	TTGA	2	8	677434	677441	25 %	50 %	25 %	0 %	227116994
13034	NC_012582	CAA	2	6	677507	677512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116994
13035	NC_012582	CAT	2	6	677577	677582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116994
13036	NC_012582	AAT	2	6	677613	677618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227116994
13037	NC_012582	TGC	2	6	677631	677636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116994
13038	NC_012582	GAC	2	6	677771	677776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13039	NC_012582	AAC	2	6	677796	677801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13040	NC_012582	GGC	2	6	677819	677824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13041	NC_012582	GTA	2	6	677886	677891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116995
13042	NC_012582	TTC	2	6	677938	677943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116995
13043	NC_012582	CCA	2	6	677947	677952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227116995
13044	NC_012582	GTG	2	6	677966	677971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116995
13045	NC_012582	TCT	2	6	678033	678038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116995
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13048	NC_012582	AGT	2	6	678219	678224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116995
13049	NC_012582	CGT	2	6	678237	678242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116995
13050	NC_012582	CTT	2	6	678312	678317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116995
13051	NC_012582	GCT	2	6	678321	678326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116995
13052	NC_012582	TGT	2	6	678345	678350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116995
13053	NC_012582	AGTC	2	8	678354	678361	25 %	25 %	25 %	25 %	227116995
13054	NC_012582	CAG	2	6	678382	678387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116995
13055	NC_012582	CTT	2	6	678463	678468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116995
13056	NC_012582	TCA	2	6	678521	678526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116995
13057	NC_012582	ATG	2	6	678602	678607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116995
13058	NC_012582	ACG	2	6	678637	678642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116995
13059	NC_012582	CTT	2	6	678663	678668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116995
13060	NC_012582	T	6	6	678667	678672	0 %	100 %	0 %	0 %	227116995
13061	NC_012582	GCT	2	6	678719	678724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116995
13062	NC_012582	AGT	2	6	678732	678737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116995
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13068	NC_012582	AGT	2	6	678894	678899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116995
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13072	NC_012582	CGT	2	6	679191	679196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116995
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13074	NC_012582	GTC	2	6	679264	679269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116995
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13077	NC_012582	TGC	3	9	679474	679482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116995
13078	NC_012582	GCG	2	6	679490	679495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227116995
13079	NC_012582	TTTCA	2	10	679548	679557	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
13080	NC_012582	ATGG	2	8	679561	679568	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13081	NC_012582	TCA	2	6	679573	679578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13082	NC_012582	ACCT	2	8	679599	679606	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13083	NC_012582	TG	3	6	679767	679772	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13084	NC_012582	A	6	6	679783	679788	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13085	NC_012582	TACT	2	8	679844	679851	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13086	NC_012582	TTAAT	2	10	679927	679936	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13087	NC_012582	ATTAA	2	10	679939	679948	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13088	NC_012582	TTG	2	6	679959	679964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13089	NC_012582	CAAA	2	8	679983	679990	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13090	NC_012582	CTGA	2	8	679993	680000	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13091	NC_012582	TGC	2	6	680011	680016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13092	NC_012582	AAG	2	6	680052	680057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13093	NC_012582	T	7	7	680073	680079	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13094	NC_012582	GT	3	6	680100	680105	0 %	50 %	50 %	0 %	227116996
13095	NC_012582	TTG	2	6	680169	680174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116996
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13097	NC_012582	GTT	2	6	680245	680250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116996
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13099	NC_012582	A	7	7	680391	680397	100 %	0 %	0 %	0 %	227116996
13100	NC_012582	GGT	2	6	680407	680412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116996
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13102	NC_012582	CGAG	2	8	680533	680540	25 %	0 %	50 %	25 %	227116997
13103	NC_012582	TGC	2	6	680620	680625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116997
13104	NC_012582	CAC	2	6	680800	680805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227116997
13105	NC_012582	CG	3	6	680895	680900	0 %	0 %	50 %	50 %	227116997
13106	NC_012582	GCC	2	6	680912	680917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227116997
13107	NC_012582	AG	3	6	680978	680983	50 %	0 %	50 %	0 %	227116997
13108	NC_012582	CAT	2	6	680995	681000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116997
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13111	NC_012582	TAAA	2	8	681109	681116	75 %	25 %	0 %	0 %	227116997
13112	NC_012582	TGC	2	6	681119	681124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116997
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13115	NC_012582	GTGAG	2	10	681309	681318	20 %	20 %	60 %	0 %	227116997
13116	NC_012582	GC	3	6	681326	681331	0 %	0 %	50 %	50 %	227116997
13117	NC_012582	TTGT	2	8	681341	681348	0 %	75 %	25 %	0 %	227116997
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13120	NC_012582	ATA	3	9	681429	681437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227116997
13121	NC_012582	CA	3	6	681475	681480	50 %	0 %	0 %	50 %	227116997
13122	NC_012582	CAT	2	6	681503	681508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116997
13123	NC_012582	TCA	2	6	681639	681644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116997
13124	NC_012582	TTGCT	2	10	681687	681696	0 %	60 %	20 %	20 %	227116997
13125	NC_012582	GC	3	6	681752	681757	0 %	0 %	50 %	50 %	227116997
13126	NC_012582	TCT	2	6	681768	681773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116997
13127	NC_012582	TCGC	2	8	681774	681781	0 %	25 %	25 %	50 %	227116997
13128	NC_012582	ACT	2	6	681824	681829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116997
13129	NC_012582	AG	3	6	681835	681840	50 %	0 %	50 %	0 %	227116997
13130	NC_012582	GAC	2	6	681865	681870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116997
13131	NC_012582	CAT	2	6	681913	681918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116997
13132	NC_012582	GTT	2	6	681955	681960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116997
13133	NC_012582	CCA	2	6	681985	681990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227116997
13134	NC_012582	GTT	2	6	682126	682131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116997
13135	NC_012582	TAA	2	6	682144	682149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227116997
13136	NC_012582	GC	3	6	682243	682248	0 %	0 %	50 %	50 %	227116997
13137	NC_012582	ATC	2	6	682277	682282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116997
13138	NC_012582	CTG	2	6	682308	682313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116997
13139	NC_012582	ATG	2	6	682317	682322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116997
13140	NC_012582	GCT	2	6	682341	682346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116997
13141	NC_012582	CATGC	2	10	682394	682403	20 %	20 %	20 %	40 %	227116997
13142	NC_012582	ATGTG	2	10	682421	682430	20 %	40 %	40 %	0 %	227116997
13143	NC_012582	CT	3	6	682506	682511	0 %	50 %	0 %	50 %	227116997
13144	NC_012582	T	6	6	682543	682548	0 %	100 %	0 %	0 %	227116997
13145	NC_012582	TCA	2	6	682629	682634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116997
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13147	NC_012582	CTT	2	6	682792	682797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116997
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13149	NC_012582	GAT	2	6	682862	682867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116997
13150	NC_012582	T	6	6	682942	682947	0 %	100 %	0 %	0 %	227116997
13151	NC_012582	CGG	2	6	682960	682965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227116997
13152	NC_012582	AAT	2	6	683105	683110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227116997
13153	NC_012582	GCCAA	2	10	683117	683126	40 %	0 %	20 %	40 %	227116997
13154	NC_012582	TAA	2	6	683267	683272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227116997
13155	NC_012582	ACG	2	6	683310	683315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116997
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13158	NC_012582	TAAG	2	8	683372	683379	50 %	25 %	25 %	0 %	227116997
13159	NC_012582	GCA	2	6	683398	683403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116997
13160	NC_012582	GCT	2	6	683429	683434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116997
13161	NC_012582	GCT	2	6	683488	683493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116997
13162	NC_012582	CGCC	2	8	683562	683569	0 %	0 %	25 %	75 %	227116997
13163	NC_012582	CAT	2	6	683624	683629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116997
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13166	NC_012582	CTG	2	6	683687	683692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116997
13167	NC_012582	TG	3	6	683707	683712	0 %	50 %	50 %	0 %	227116997
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13171	NC_012582	T	7	7	683921	683927	0 %	100 %	0 %	0 %	227116997
13172	NC_012582	AAGT	2	8	683936	683943	50 %	25 %	25 %	0 %	227116997
13173	NC_012582	A	6	6	683970	683975	100 %	0 %	0 %	0 %	227116997
13174	NC_012582	GAG	2	6	683979	683984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13175	NC_012582	T	7	7	684038	684044	0 %	100 %	0 %	0 %	227116998
13176	NC_012582	GCG	2	6	684075	684080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227116998
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13182	NC_012582	TGTC	2	8	684364	684371	0 %	50 %	25 %	25 %	227116998
13183	NC_012582	CA	3	6	684407	684412	50 %	0 %	0 %	50 %	227116998
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13193	NC_012582	CTT	2	6	684787	684792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116998
13194	NC_012582	ATCAG	2	10	684819	684828	40 %	20 %	20 %	20 %	227116998
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13196	NC_012582	AGT	2	6	684895	684900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116998
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13228	NC_012582	GCT	2	6	686266	686271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117000
13229	NC_012582	TGT	2	6	686297	686302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227117000
13230	NC_012582	TGT	2	6	686315	686320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227117000
13231	NC_012582	TAT	2	6	686393	686398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227117000
13232	NC_012582	GTG	2	6	686451	686456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13233	NC_012582	GCTT	2	8	686565	686572	0 %	50 %	25 %	25 %	227117001
13234	NC_012582	GCA	2	6	686606	686611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227117001
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13238	NC_012582	GGC	2	6	686790	686795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227117001
13239	NC_012582	CTT	2	6	686813	686818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227117001
13240	NC_012582	ACC	2	6	686934	686939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227117001
13241	NC_012582	GTC	2	6	686983	686988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117001
13242	NC_012582	TGT	2	6	687002	687007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227117001
13243	NC_012582	GCC	2	6	687021	687026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227117001
13244	NC_012582	TCA	2	6	687047	687052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227117001
13245	NC_012582	CTT	2	6	687077	687082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227117001
13246	NC_012582	TGG	2	6	687123	687128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227117001
13247	NC_012582	CAG	2	6	687257	687262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227117001
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13249	NC_012582	TGA	2	6	687359	687364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117001
13250	NC_012582	TCG	2	6	687410	687415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117001
13251	NC_012582	GGTG	2	8	687501	687508	0 %	25 %	75 %	0 %	227117001
13252	NC_012582	TGC	2	6	687531	687536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117001
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13257	NC_012582	CATTAT	2	12	687976	687987	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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13260	NC_012582	GA	3	6	688038	688043	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13261	NC_012582	GCA	2	6	688090	688095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227117002
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13264	NC_012582	GCG	2	6	688241	688246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227117002
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13270	NC_012582	CAT	2	6	688376	688381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227117002
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13273	NC_012582	ACT	2	6	688527	688532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227117003
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13277	NC_012582	AGCG	2	8	688857	688864	25 %	0 %	50 %	25 %	227117003
13278	NC_012582	ACA	2	6	688885	688890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227117003
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13333	NC_012582	AAGG	2	8	692031	692038	50 %	0 %	50 %	0 %	227117004
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13336	NC_012582	GGCGAT	2	12	692189	692200	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	227117004
13337	NC_012582	CAT	3	9	692315	692323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227117004
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13344	NC_012582	TGC	2	6	692500	692505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117004
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13347	NC_012582	CGG	2	6	692593	692598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227117004
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13349	NC_012582	CTTG	2	8	692647	692654	0 %	50 %	25 %	25 %	227117004
13350	NC_012582	GCG	2	6	692666	692671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227117004
13351	NC_012582	CTC	2	6	692698	692703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227117004
13352	NC_012582	GAT	2	6	692797	692802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117005
13353	NC_012582	ATTG	2	8	692804	692811	25 %	50 %	25 %	0 %	227117005
13354	NC_012582	TTCGCA	2	12	692857	692868	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	227117005
13355	NC_012582	CAGT	2	8	692891	692898	25 %	25 %	25 %	25 %	227117005
13356	NC_012582	CGTG	2	8	692922	692929	0 %	25 %	50 %	25 %	227117005
13357	NC_012582	C	6	6	692995	693000	0 %	0 %	0 %	100 %	227117005
13358	NC_012582	GGC	2	6	693050	693055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227117005
13359	NC_012582	TGGA	2	8	693231	693238	25 %	25 %	50 %	0 %	227117005
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13483	NC_012582	CCAG	2	8	699917	699924	25 %	0 %	25 %	50 %	227117011
13484	NC_012582	TGA	2	6	700091	700096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117011
13485	NC_012582	CTC	2	6	700151	700156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227117011
13486	NC_012582	GCTA	2	8	700247	700254	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13487	NC_012582	GTA	2	6	700261	700266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13488	NC_012582	A	6	6	700323	700328	100 %	0 %	0 %	0 %	227117012
13489	NC_012582	CAA	2	6	700470	700475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227117012
13490	NC_012582	CGT	2	6	700495	700500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117012
13491	NC_012582	GGC	2	6	700504	700509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227117012
13492	NC_012582	CTC	2	6	700549	700554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227117012
13493	NC_012582	ATCA	2	8	700564	700571	50 %	25 %	0 %	25 %	227117012
13494	NC_012582	CCT	2	6	700594	700599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227117012
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