MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome I

Total Repeats: 57925

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_012582	TTG	2	6	623789	623794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12002	NC_012582	T	6	6	623807	623812	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12003	NC_012582	GTA	2	6	623917	623922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12004	NC_012582	AGC	2	6	623940	623945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116944
12005	NC_012582	TGA	2	6	623983	623988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116944
12006	NC_012582	AAG	2	6	624095	624100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227116944
12007	NC_012582	T	7	7	624178	624184	0 %	100 %	0 %	0 %	227116944
12008	NC_012582	AAG	2	6	624203	624208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227116944
12009	NC_012582	TGA	2	6	624334	624339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116944
12010	NC_012582	CGATG	2	10	624361	624370	20 %	20 %	40 %	20 %	227116944
12011	NC_012582	TGG	2	6	624498	624503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116944
12012	NC_012582	GTG	2	6	624534	624539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116944
12013	NC_012582	CAG	2	6	624629	624634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116944
12014	NC_012582	TGC	2	6	624801	624806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116944
12015	NC_012582	GAT	2	6	624839	624844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116944
12016	NC_012582	TGG	2	6	624867	624872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116944
12017	NC_012582	ATT	2	6	624902	624907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227116944
12018	NC_012582	CTG	2	6	624909	624914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116944
12019	NC_012582	GAATTT	2	12	624953	624964	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	227116944
12020	NC_012582	T	8	8	625065	625072	0 %	100 %	0 %	0 %	227116945
12021	NC_012582	A	7	7	625085	625091	100 %	0 %	0 %	0 %	227116945
12022	NC_012582	T	6	6	625097	625102	0 %	100 %	0 %	0 %	227116945
12023	NC_012582	CCAC	2	8	625165	625172	25 %	0 %	0 %	75 %	227116945
12024	NC_012582	TGA	2	6	625182	625187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12025	NC_012582	TAAATT	2	12	625228	625239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12026	NC_012582	TTA	3	9	625246	625254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12027	NC_012582	CAT	2	6	625415	625420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116946
12028	NC_012582	GTT	2	6	625422	625427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116946
12029	NC_012582	ACC	2	6	625477	625482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227116946
12030	NC_012582	TGC	2	6	625652	625657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116946
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12032	NC_012582	TAC	2	6	625716	625721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116947
12033	NC_012582	GCT	2	6	625746	625751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116947
12034	NC_012582	TTA	2	6	625759	625764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227116947
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12036	NC_012582	GTC	2	6	625819	625824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116947
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12040	NC_012582	TGC	2	6	625997	626002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116947
12041	NC_012582	TCG	2	6	626024	626029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116947
12042	NC_012582	CGT	3	9	626064	626072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116947
12043	NC_012582	T	6	6	626163	626168	0 %	100 %	0 %	0 %	227116948
12044	NC_012582	ATAA	2	8	626221	626228	75 %	25 %	0 %	0 %	227116948
12045	NC_012582	GTT	2	6	626229	626234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12046	NC_012582	TTTA	2	8	626311	626318	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12047	NC_012582	AAAT	2	8	626331	626338	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12048	NC_012582	GGT	2	6	626484	626489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116949
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12051	NC_012582	ACA	2	6	626720	626725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116949
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12053	NC_012582	CAC	2	6	626929	626934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227116949
12054	NC_012582	CGC	2	6	626950	626955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227116949
12055	NC_012582	TGA	2	6	626993	626998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116949
12056	NC_012582	AACTTT	2	12	627101	627112	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	227116950
12057	NC_012582	CAAC	2	8	627151	627158	50 %	0 %	0 %	50 %	227116950
12058	NC_012582	CAT	2	6	627229	627234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116950
12059	NC_012582	TGA	2	6	627502	627507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116950
12060	NC_012582	GTG	2	6	627525	627530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116950
12061	NC_012582	CTTTG	2	10	627565	627574	0 %	60 %	20 %	20 %	227116950
12062	NC_012582	TGC	2	6	627615	627620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116950
12063	NC_012582	TAC	2	6	627731	627736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116950
12064	NC_012582	AAG	2	6	627740	627745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227116950
12065	NC_012582	TCGAT	2	10	627756	627765	20 %	40 %	20 %	20 %	227116950
12066	NC_012582	ATTCTT	2	12	627814	627825	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	227116950
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12068	NC_012582	GGA	2	6	627860	627865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227116950
12069	NC_012582	GCC	2	6	627877	627882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227116950
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12072	NC_012582	GCT	2	6	627982	627987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116950
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12080	NC_012582	TGC	2	6	628307	628312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116951
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12084	NC_012582	TGG	2	6	628933	628938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116951
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12086	NC_012582	AAGA	2	8	628984	628991	75 %	0 %	25 %	0 %	227116951
12087	NC_012582	TAT	2	6	629020	629025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12088	NC_012582	TCA	2	6	629051	629056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12089	NC_012582	T	6	6	629080	629085	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12090	NC_012582	CAA	2	6	629127	629132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116952
12091	NC_012582	TGA	2	6	629141	629146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116952
12092	NC_012582	AGTTG	2	10	629223	629232	20 %	40 %	40 %	0 %	227116952
12093	NC_012582	TGA	2	6	629235	629240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116952
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12097	NC_012582	TATCG	2	10	629422	629431	20 %	40 %	20 %	20 %	227116952
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12101	NC_012582	ACTG	2	8	629709	629716	25 %	25 %	25 %	25 %	227116952
12102	NC_012582	CGC	2	6	629839	629844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227116953
12103	NC_012582	TCG	2	6	629848	629853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116953
12104	NC_012582	ATT	2	6	629910	629915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227116953
12105	NC_012582	ATG	2	6	629959	629964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116953
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12109	NC_012582	TTGA	2	8	630135	630142	25 %	50 %	25 %	0 %	227116953
12110	NC_012582	TAAA	2	8	630222	630229	75 %	25 %	0 %	0 %	227116953
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12115	NC_012582	ACG	2	6	630629	630634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116954
12116	NC_012582	GC	3	6	630661	630666	0 %	0 %	50 %	50 %	227116954
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12120	NC_012582	TGA	2	6	631076	631081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116955
12121	NC_012582	GCAA	2	8	631111	631118	50 %	0 %	25 %	25 %	227116955
12122	NC_012582	CGG	2	6	631190	631195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227116955
12123	NC_012582	CGT	2	6	631200	631205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116955
12124	NC_012582	TTG	2	6	631281	631286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116955
12125	NC_012582	CGA	2	6	631296	631301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116955
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12230	NC_012582	GA	3	6	636276	636281	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12231	NC_012582	GAT	2	6	636300	636305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116962
12232	NC_012582	TCT	2	6	636318	636323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116962
12233	NC_012582	CACTG	2	10	636349	636358	20 %	20 %	20 %	40 %	227116962
12234	NC_012582	GGCA	2	8	636535	636542	25 %	0 %	50 %	25 %	227116962
12235	NC_012582	GTA	2	6	636571	636576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116962
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12238	NC_012582	CAC	2	6	636645	636650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227116962
12239	NC_012582	CA	3	6	636665	636670	50 %	0 %	0 %	50 %	227116962
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12241	NC_012582	GCA	2	6	636687	636692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116962
12242	NC_012582	AAT	2	6	636770	636775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227116962
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12246	NC_012582	AAT	2	6	636965	636970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12247	NC_012582	CAA	2	6	636974	636979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12354	NC_012582	CA	3	6	642357	642362	50 %	0 %	0 %	50 %	227116968
12355	NC_012582	CAT	2	6	642494	642499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116968
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12357	NC_012582	T	7	7	642563	642569	0 %	100 %	0 %	0 %	227116968
12358	NC_012582	TTG	2	6	642629	642634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116969
12359	NC_012582	ATCGAG	2	12	642785	642796	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	227116969
12360	NC_012582	TG	3	6	642855	642860	0 %	50 %	50 %	0 %	227116969
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12362	NC_012582	TGC	2	6	642949	642954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116969
12363	NC_012582	AG	3	6	642994	642999	50 %	0 %	50 %	0 %	227116969
12364	NC_012582	TGT	2	6	643005	643010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116969
12365	NC_012582	CAT	2	6	643073	643078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116969
12366	NC_012582	TTG	2	6	643100	643105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116970
12367	NC_012582	CGG	2	6	643118	643123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227116970
12368	NC_012582	TGC	3	9	643137	643145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116970
12369	NC_012582	CACC	2	8	643164	643171	25 %	0 %	0 %	75 %	227116970
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12375	NC_012582	GGC	2	6	643519	643524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227116970
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12377	NC_012582	GTCG	2	8	643570	643577	0 %	25 %	50 %	25 %	227116970
12378	NC_012582	GCA	2	6	643716	643721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116970
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12381	NC_012582	TCT	2	6	643802	643807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116970
12382	NC_012582	CG	3	6	643843	643848	0 %	0 %	50 %	50 %	227116970
12383	NC_012582	GCC	2	6	643930	643935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227116970
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12389	NC_012582	CGA	2	6	644124	644129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116970
12390	NC_012582	TGG	2	6	644223	644228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116970
12391	NC_012582	CCG	3	9	644276	644284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227116970
12392	NC_012582	CTG	2	6	644350	644355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116970
12393	NC_012582	ATG	2	6	644384	644389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116970
12394	NC_012582	TTA	2	6	644438	644443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227116970
12395	NC_012582	GCT	2	6	644490	644495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12397	NC_012582	TAA	2	6	644529	644534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12398	NC_012582	CATC	2	8	644766	644773	25 %	25 %	0 %	50 %	227116971
12399	NC_012582	GCC	2	6	644835	644840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227116971
12400	NC_012582	ACC	2	6	644870	644875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227116971
12401	NC_012582	ATC	2	6	644896	644901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116971
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12432	NC_012582	GCTG	2	8	647099	647106	0 %	25 %	50 %	25 %	227116975
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12438	NC_012582	AGCA	2	8	647502	647509	50 %	0 %	25 %	25 %	227116975
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12459	NC_012582	CAC	2	6	648510	648515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227116976
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12478	NC_012582	AGC	3	9	649527	649535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116976
12479	NC_012582	GC	3	6	649605	649610	0 %	0 %	50 %	50 %	227116976
12480	NC_012582	GCA	2	6	649666	649671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116976
12481	NC_012582	GCAC	2	8	649700	649707	25 %	0 %	25 %	50 %	227116976
12482	NC_012582	TGC	2	6	649762	649767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116976
12483	NC_012582	TGC	2	6	649770	649775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116976
12484	NC_012582	TGAT	2	8	649857	649864	25 %	50 %	25 %	0 %	227116976
12485	NC_012582	ACA	2	6	649867	649872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116976
12486	NC_012582	GCA	2	6	649888	649893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116976
12487	NC_012582	GTC	2	6	649896	649901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116976
12488	NC_012582	CAAA	2	8	649906	649913	75 %	0 %	0 %	25 %	227116976
12489	NC_012582	GCT	2	6	649915	649920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116976
12490	NC_012582	CTC	2	6	649972	649977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227116976
12491	NC_012582	TGG	2	6	650001	650006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116976
12492	NC_012582	CAG	2	6	650036	650041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116976
12493	NC_012582	CAA	2	6	650048	650053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116976
12494	NC_012582	TGGC	2	8	650090	650097	0 %	25 %	50 %	25 %	227116976
12495	NC_012582	CCG	3	9	650115	650123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227116976
12496	NC_012582	GCCG	2	8	650267	650274	0 %	0 %	50 %	50 %	227116976
12497	NC_012582	TCG	2	6	650317	650322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116976
12498	NC_012582	A	6	6	650349	650354	100 %	0 %	0 %	0 %	227116976
12499	NC_012582	CGAG	2	8	650421	650428	25 %	0 %	50 %	25 %	227116976
12500	NC_012582	CGCTG	2	10	650444	650453	0 %	20 %	40 %	40 %	227116976

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