MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome I

Total Repeats: 57925

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_012582	GCC	2	6	519776	519781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10002	NC_012582	GTT	2	6	519863	519868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10003	NC_012582	GCT	2	6	519882	519887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116845
10004	NC_012582	AGT	2	6	519895	519900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116845
10005	NC_012582	GCA	2	6	519916	519921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116845
10006	NC_012582	CA	4	8	519939	519946	50 %	0 %	0 %	50 %	227116845
10007	NC_012582	TCAC	2	8	519972	519979	25 %	25 %	0 %	50 %	227116845
10008	NC_012582	GCC	2	6	519993	519998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227116845
10009	NC_012582	GTA	2	6	520057	520062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116845
10010	NC_012582	GTCA	2	8	520070	520077	25 %	25 %	25 %	25 %	227116845
10011	NC_012582	CTT	2	6	520078	520083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116845
10012	NC_012582	TGCAT	2	10	520096	520105	20 %	40 %	20 %	20 %	227116845
10013	NC_012582	GCT	2	6	520363	520368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116845
10014	NC_012582	GCG	2	6	520392	520397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227116845
10015	NC_012582	GTG	2	6	520445	520450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116845
10016	NC_012582	GCAAAT	2	12	520468	520479	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	227116845
10017	NC_012582	TGC	2	6	520502	520507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116845
10018	NC_012582	AGC	2	6	520642	520647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116845
10019	NC_012582	CA	3	6	520676	520681	50 %	0 %	0 %	50 %	227116845
10020	NC_012582	ATC	2	6	520762	520767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116846
10021	NC_012582	CTG	2	6	520816	520821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116846
10022	NC_012582	TCA	2	6	520928	520933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116846
10023	NC_012582	TGA	2	6	520967	520972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116846
10024	NC_012582	CTC	2	6	521076	521081	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10025	NC_012582	TAG	2	6	521086	521091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10026	NC_012582	GAC	2	6	521116	521121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10027	NC_012582	GTC	2	6	521127	521132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10028	NC_012582	TG	4	8	521155	521162	0 %	50 %	50 %	0 %	227116847
10029	NC_012582	TGG	3	9	521405	521413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116847
10030	NC_012582	AGT	2	6	521458	521463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116847
10031	NC_012582	CAC	2	6	521525	521530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227116847
10032	NC_012582	GCA	2	6	521539	521544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116847
10033	NC_012582	GCG	2	6	521596	521601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227116847
10034	NC_012582	TGT	2	6	521608	521613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116847
10035	NC_012582	CGCAT	2	10	521676	521685	20 %	20 %	20 %	40 %	227116847
10036	NC_012582	GAT	2	6	521722	521727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116847
10037	NC_012582	ATG	2	6	521880	521885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116847
10038	NC_012582	CAT	2	6	521944	521949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116847
10039	NC_012582	T	6	6	521979	521984	0 %	100 %	0 %	0 %	227116847
10040	NC_012582	CCAG	2	8	522049	522056	25 %	0 %	25 %	50 %	227116848
10041	NC_012582	TTG	2	6	522192	522197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116848
10042	NC_012582	ACCA	2	8	522237	522244	50 %	0 %	0 %	50 %	227116848
10043	NC_012582	GTAGG	2	10	522275	522284	20 %	20 %	60 %	0 %	227116848
10044	NC_012582	CAT	2	6	522510	522515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116848
10045	NC_012582	ACG	2	6	522517	522522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116848
10046	NC_012582	A	6	6	522546	522551	100 %	0 %	0 %	0 %	227116848
10047	NC_012582	CGA	2	6	522710	522715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116848
10048	NC_012582	CAAC	2	8	522740	522747	50 %	0 %	0 %	50 %	227116848
10049	NC_012582	TTG	2	6	522759	522764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116848
10050	NC_012582	CA	3	6	522854	522859	50 %	0 %	0 %	50 %	227116848
10051	NC_012582	CCA	2	6	522860	522865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227116848
10052	NC_012582	ATG	2	6	522943	522948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116848
10053	NC_012582	CAA	2	6	522984	522989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116849
10054	NC_012582	CTT	2	6	523026	523031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116849
10055	NC_012582	CGA	2	6	523103	523108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116849
10056	NC_012582	GCT	2	6	523335	523340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116849
10057	NC_012582	GC	3	6	523344	523349	0 %	0 %	50 %	50 %	227116849
10058	NC_012582	GAT	2	6	523363	523368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116849
10059	NC_012582	CAT	2	6	523434	523439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116849
10060	NC_012582	AAT	2	6	523483	523488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227116849
10061	NC_012582	TGATC	2	10	523509	523518	20 %	40 %	20 %	20 %	227116849
10062	NC_012582	TCT	2	6	523538	523543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116849
10063	NC_012582	CATC	2	8	523549	523556	25 %	25 %	0 %	50 %	227116849
10064	NC_012582	TTG	2	6	523649	523654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116849
10065	NC_012582	CAG	2	6	523750	523755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116849
10066	NC_012582	CGG	2	6	523776	523781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227116849
10067	NC_012582	ACG	3	9	523795	523803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116849
10068	NC_012582	CGC	2	6	523828	523833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227116849
10069	NC_012582	CTT	2	6	523878	523883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116849
10070	NC_012582	GTTG	2	8	523917	523924	0 %	50 %	50 %	0 %	227116849
10071	NC_012582	TCA	2	6	523964	523969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116849
10072	NC_012582	ATCCG	2	10	523982	523991	20 %	20 %	20 %	40 %	227116849
10073	NC_012582	CTT	2	6	523992	523997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116849
10074	NC_012582	GCT	2	6	523998	524003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116849
10075	NC_012582	GAT	2	6	524014	524019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116849
10076	NC_012582	GCA	2	6	524043	524048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116849
10077	NC_012582	GCT	2	6	524067	524072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116849
10078	NC_012582	GTA	2	6	524127	524132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116849
10079	NC_012582	CGC	2	6	524136	524141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227116849
10080	NC_012582	GTT	2	6	524169	524174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116849
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10082	NC_012582	GAA	2	6	524312	524317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227116850
10083	NC_012582	GAGT	2	8	524333	524340	25 %	25 %	50 %	0 %	227116850
10084	NC_012582	AAT	2	6	524399	524404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227116850
10085	NC_012582	GTAA	2	8	524495	524502	50 %	25 %	25 %	0 %	227116850
10086	NC_012582	CAA	2	6	524514	524519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116850
10087	NC_012582	AGCC	2	8	524540	524547	25 %	0 %	25 %	50 %	227116850
10088	NC_012582	GGTCA	2	10	524567	524576	20 %	20 %	40 %	20 %	227116850
10089	NC_012582	TCA	2	6	524664	524669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116850
10090	NC_012582	GCC	2	6	524816	524821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227116850
10091	NC_012582	TTGG	2	8	525020	525027	0 %	50 %	50 %	0 %	227116850
10092	NC_012582	CGC	2	6	525046	525051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227116850
10093	NC_012582	GTA	2	6	525077	525082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116850
10094	NC_012582	GCA	2	6	525091	525096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116850
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10096	NC_012582	CT	3	6	525258	525263	0 %	50 %	0 %	50 %	227116850
10097	NC_012582	TTG	2	6	525296	525301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116850
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10099	NC_012582	TAG	2	6	525483	525488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116850
10100	NC_012582	AGCTG	2	10	525493	525502	20 %	20 %	40 %	20 %	227116850
10101	NC_012582	AGT	2	6	525549	525554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116850
10102	NC_012582	CTT	2	6	525613	525618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116850
10103	NC_012582	AGT	2	6	525694	525699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116850
10104	NC_012582	TTG	2	6	525719	525724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116850
10105	NC_012582	TCG	2	6	525786	525791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116850
10106	NC_012582	GATTT	2	10	525804	525813	20 %	60 %	20 %	0 %	227116850
10107	NC_012582	AC	3	6	525844	525849	50 %	0 %	0 %	50 %	227116850
10108	NC_012582	GGT	2	6	525887	525892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116850
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10110	NC_012582	CA	3	6	526231	526236	50 %	0 %	0 %	50 %	227116850
10111	NC_012582	TGGT	2	8	526284	526291	0 %	50 %	50 %	0 %	227116850
10112	NC_012582	TGG	2	6	526297	526302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116850
10113	NC_012582	GT	3	6	526304	526309	0 %	50 %	50 %	0 %	227116850
10114	NC_012582	ACTGA	2	10	526325	526334	40 %	20 %	20 %	20 %	227116850
10115	NC_012582	ACGACA	2	12	526413	526424	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	227116850
10116	NC_012582	ATTG	2	8	526451	526458	25 %	50 %	25 %	0 %	227116850
10117	NC_012582	TAG	2	6	526504	526509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116850
10118	NC_012582	T	7	7	526839	526845	0 %	100 %	0 %	0 %	227116851
10119	NC_012582	TGG	2	6	526857	526862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116851
10120	NC_012582	CCA	2	6	526896	526901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227116851
10121	NC_012582	CGT	2	6	526915	526920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116851
10122	NC_012582	GGCT	2	8	526929	526936	0 %	25 %	50 %	25 %	227116851
10123	NC_012582	T	6	6	526990	526995	0 %	100 %	0 %	0 %	227116851
10124	NC_012582	AGA	2	6	527052	527057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227116851
10125	NC_012582	CAT	2	6	527073	527078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116851
10126	NC_012582	TGC	2	6	527115	527120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116851
10127	NC_012582	GAAA	2	8	527142	527149	75 %	0 %	25 %	0 %	227116851
10128	NC_012582	CGGG	2	8	527195	527202	0 %	0 %	75 %	25 %	227116851
10129	NC_012582	TTC	2	6	527319	527324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116851
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10134	NC_012582	GCA	3	9	527400	527408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116851
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10143	NC_012582	CTTT	2	8	527716	527723	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10144	NC_012582	GATA	2	8	527759	527766	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10145	NC_012582	AAAAC	2	10	527782	527791	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
10146	NC_012582	CTC	2	6	527821	527826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10147	NC_012582	CTG	2	6	527827	527832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10149	NC_012582	ATT	2	6	527894	527899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10150	NC_012582	CTAC	2	8	527962	527969	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10151	NC_012582	GCAAG	2	10	527994	528003	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
10152	NC_012582	CTC	2	6	528015	528020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10153	NC_012582	CTG	2	6	528021	528026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10154	NC_012582	AGG	2	6	528081	528086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10155	NC_012582	ATT	2	6	528088	528093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10156	NC_012582	T	6	6	528095	528100	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10157	NC_012582	CTAC	2	8	528157	528164	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10158	NC_012582	CAA	2	6	528205	528210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10159	NC_012582	ACC	2	6	528242	528247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10160	NC_012582	GTC	2	6	528327	528332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10161	NC_012582	A	8	8	528346	528353	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10162	NC_012582	TGT	2	6	528361	528366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10163	NC_012582	AG	3	6	528454	528459	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10164	NC_012582	GTAG	2	8	528584	528591	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10165	NC_012582	GAC	2	6	528616	528621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10169	NC_012582	ACTGA	2	10	528692	528701	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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10230	NC_012582	GA	3	6	531581	531586	50 %	0 %	50 %	0 %	227116853
10231	NC_012582	T	6	6	531668	531673	0 %	100 %	0 %	0 %	227116853
10232	NC_012582	GC	3	6	531732	531737	0 %	0 %	50 %	50 %	227116853
10233	NC_012582	CTG	2	6	531776	531781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116853
10234	NC_012582	GAG	2	6	531819	531824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227116853
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10236	NC_012582	TGA	2	6	531868	531873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116853
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10238	NC_012582	T	6	6	531993	531998	0 %	100 %	0 %	0 %	227116853
10239	NC_012582	GCG	2	6	532074	532079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227116853
10240	NC_012582	AAT	2	6	532191	532196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227116853
10241	NC_012582	CCT	2	6	532232	532237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227116853
10242	NC_012582	CAT	2	6	532273	532278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116853
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10244	NC_012582	T	6	6	532299	532304	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10477	NC_012582	GTGA	2	8	544319	544326	25 %	25 %	50 %	0 %	227116868
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10491	NC_012582	GC	3	6	545144	545149	0 %	0 %	50 %	50 %	227116868
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