MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome I

Total Repeats: 57925

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012582	CTGGG	2	10	25955	25964	0 %	20 %	60 %	20 %	227116392
502	NC_012582	ATT	2	6	26030	26035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227116392
503	NC_012582	TGAT	2	8	26038	26045	25 %	50 %	25 %	0 %	227116392
504	NC_012582	GCC	2	6	26055	26060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227116392
505	NC_012582	T	6	6	26061	26066	0 %	100 %	0 %	0 %	227116392
506	NC_012582	ATTG	2	8	26080	26087	25 %	50 %	25 %	0 %	227116392
507	NC_012582	TGTC	2	8	26112	26119	0 %	50 %	25 %	25 %	227116392
508	NC_012582	GGT	2	6	26192	26197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116392
509	NC_012582	TTTGG	2	10	26213	26222	0 %	60 %	40 %	0 %	227116392
510	NC_012582	CAT	2	6	26309	26314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116392
511	NC_012582	T	6	6	26314	26319	0 %	100 %	0 %	0 %	227116392
512	NC_012582	CATC	2	8	26528	26535	25 %	25 %	0 %	50 %	227116392
513	NC_012582	TATT	2	8	26662	26669	25 %	75 %	0 %	0 %	227116392
514	NC_012582	ATA	2	6	26681	26686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227116392
515	NC_012582	ATC	2	6	26691	26696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116392
516	NC_012582	TC	3	6	26721	26726	0 %	50 %	0 %	50 %	227116392
517	NC_012582	AGG	2	6	26786	26791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227116392
518	NC_012582	TCA	2	6	26946	26951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116392
519	NC_012582	TAA	2	6	27007	27012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227116392
520	NC_012582	GAA	2	6	27031	27036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227116392
521	NC_012582	CATTT	2	10	27108	27117	20 %	60 %	0 %	20 %	227116392
522	NC_012582	CT	3	6	27224	27229	0 %	50 %	0 %	50 %	227116392
523	NC_012582	TTC	2	6	27299	27304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116392
524	NC_012582	AGT	2	6	27318	27323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116392
525	NC_012582	CTG	2	6	27338	27343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116392
526	NC_012582	TCT	2	6	27351	27356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116392
527	NC_012582	TTC	2	6	27490	27495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116393
528	NC_012582	TCA	2	6	27536	27541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116393
529	NC_012582	TCA	2	6	27659	27664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116393
530	NC_012582	GTC	2	6	27718	27723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116393
531	NC_012582	TAA	2	6	27732	27737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227116393
532	NC_012582	GTTG	2	8	27833	27840	0 %	50 %	50 %	0 %	227116393
533	NC_012582	T	6	6	27847	27852	0 %	100 %	0 %	0 %	227116393
534	NC_012582	T	6	6	28003	28008	0 %	100 %	0 %	0 %	227116393
535	NC_012582	TGCTG	2	10	28023	28032	0 %	40 %	40 %	20 %	227116393
536	NC_012582	TCG	2	6	28102	28107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116393
537	NC_012582	AGG	2	6	28234	28239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227116393
538	NC_012582	ACC	2	6	28267	28272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227116393
539	NC_012582	TGC	2	6	28306	28311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116393
540	NC_012582	GAA	2	6	28329	28334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227116393
541	NC_012582	AGGT	2	8	28336	28343	25 %	25 %	50 %	0 %	227116393
542	NC_012582	TC	3	6	28404	28409	0 %	50 %	0 %	50 %	227116393
543	NC_012582	TTG	2	6	28512	28517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116393
544	NC_012582	AGAT	2	8	28532	28539	50 %	25 %	25 %	0 %	227116393
545	NC_012582	TCT	2	6	28568	28573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116393
546	NC_012582	CT	3	6	28572	28577	0 %	50 %	0 %	50 %	227116393
547	NC_012582	CAA	2	6	28611	28616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116393
548	NC_012582	CTT	2	6	28734	28739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116393
549	NC_012582	AT	3	6	28750	28755	50 %	50 %	0 %	0 %	227116393
550	NC_012582	AG	3	6	28789	28794	50 %	0 %	50 %	0 %	227116393
551	NC_012582	CAA	2	6	28863	28868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116393
552	NC_012582	AAC	2	6	28925	28930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116393
553	NC_012582	TTA	2	6	29040	29045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227116393
554	NC_012582	GTA	2	6	29065	29070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116393
555	NC_012582	GCC	2	6	29090	29095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227116393
556	NC_012582	ATT	2	6	29161	29166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227116393
557	NC_012582	AGTTG	2	10	29237	29246	20 %	40 %	40 %	0 %	227116393
558	NC_012582	AG	3	6	29249	29254	50 %	0 %	50 %	0 %	227116393
559	NC_012582	TGA	2	6	29317	29322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116393
560	NC_012582	AGT	2	6	29393	29398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116393
561	NC_012582	TCC	2	6	29432	29437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227116393
562	NC_012582	AGCC	2	8	29442	29449	25 %	0 %	25 %	50 %	227116393
563	NC_012582	C	6	6	29549	29554	0 %	0 %	0 %	100 %	227116393
564	NC_012582	TA	3	6	29626	29631	50 %	50 %	0 %	0 %	227116393
565	NC_012582	ACT	2	6	29638	29643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116393
566	NC_012582	T	6	6	29648	29653	0 %	100 %	0 %	0 %	227116393
567	NC_012582	CT	3	6	29654	29659	0 %	50 %	0 %	50 %	227116393
568	NC_012582	AAG	2	6	29752	29757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227116393
569	NC_012582	TG	3	6	29843	29848	0 %	50 %	50 %	0 %	227116393
570	NC_012582	ATC	2	6	29899	29904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116394
571	NC_012582	TGT	2	6	29913	29918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116394
572	NC_012582	TCAT	2	8	29964	29971	25 %	50 %	0 %	25 %	227116394
573	NC_012582	AT	3	6	29979	29984	50 %	50 %	0 %	0 %	227116394
574	NC_012582	GTA	2	6	29991	29996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116394
575	NC_012582	TGTT	2	8	30069	30076	0 %	75 %	25 %	0 %	227116394
576	NC_012582	CAGT	2	8	30084	30091	25 %	25 %	25 %	25 %	227116394
577	NC_012582	AAAT	2	8	30123	30130	75 %	25 %	0 %	0 %	227116394
578	NC_012582	TAA	2	6	30142	30147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227116394
579	NC_012582	TAA	2	6	30239	30244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227116394
580	NC_012582	TCCT	2	8	30261	30268	0 %	50 %	0 %	50 %	227116394
581	NC_012582	TCC	2	6	30438	30443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227116394
582	NC_012582	CAACC	2	10	30449	30458	40 %	0 %	0 %	60 %	227116394
583	NC_012582	TGT	2	6	30617	30622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116394
584	NC_012582	ATA	2	6	30630	30635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227116394
585	NC_012582	CATGT	2	10	30668	30677	20 %	40 %	20 %	20 %	227116394
586	NC_012582	CT	3	6	30682	30687	0 %	50 %	0 %	50 %	227116394
587	NC_012582	CTTT	2	8	30709	30716	0 %	75 %	0 %	25 %	227116394
588	NC_012582	AGGT	2	8	30774	30781	25 %	25 %	50 %	0 %	227116394
589	NC_012582	GTA	2	6	30782	30787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116394
590	NC_012582	TCT	2	6	30906	30911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116394
591	NC_012582	TCT	2	6	30913	30918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116394
592	NC_012582	AT	3	6	30929	30934	50 %	50 %	0 %	0 %	227116394
593	NC_012582	CAAC	2	8	30955	30962	50 %	0 %	0 %	50 %	227116394
594	NC_012582	AC	3	6	30961	30966	50 %	0 %	0 %	50 %	227116394
595	NC_012582	TAA	2	6	31022	31027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227116394
596	NC_012582	GGA	2	6	31058	31063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227116394
597	NC_012582	CAC	2	6	31109	31114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227116394
598	NC_012582	GAT	2	6	31187	31192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116394
599	NC_012582	TA	3	6	31220	31225	50 %	50 %	0 %	0 %	227116394
600	NC_012582	ATC	2	6	31277	31282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116394
601	NC_012582	CT	3	6	31388	31393	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
602	NC_012582	TGAA	2	8	31514	31521	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
603	NC_012582	CAAT	2	8	31571	31578	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
604	NC_012582	TGTT	2	8	31732	31739	0 %	75 %	25 %	0 %	227116395
605	NC_012582	TAC	2	6	31836	31841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116395
606	NC_012582	CG	3	6	31861	31866	0 %	0 %	50 %	50 %	227116395
607	NC_012582	GCG	2	6	31893	31898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227116395
608	NC_012582	GCC	2	6	31900	31905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227116395
609	NC_012582	CTG	2	6	31926	31931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116395
610	NC_012582	CTG	2	6	32022	32027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116395
611	NC_012582	GAA	2	6	32046	32051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227116395
612	NC_012582	GCG	2	6	32061	32066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227116395
613	NC_012582	AGT	2	6	32138	32143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116395
614	NC_012582	GTG	2	6	32160	32165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116395
615	NC_012582	TA	3	6	32197	32202	50 %	50 %	0 %	0 %	227116395
616	NC_012582	A	6	6	32248	32253	100 %	0 %	0 %	0 %	227116395
617	NC_012582	AG	3	6	32282	32287	50 %	0 %	50 %	0 %	227116395
618	NC_012582	CAG	2	6	32455	32460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116395
619	NC_012582	CAC	2	6	32563	32568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227116395
620	NC_012582	GTG	2	6	32688	32693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116395
621	NC_012582	CT	3	6	32701	32706	0 %	50 %	0 %	50 %	227116395
622	NC_012582	CAC	2	6	32727	32732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227116395
623	NC_012582	A	6	6	32775	32780	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_012582	T	6	6	32797	32802	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_012582	CTT	2	6	32891	32896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116396
626	NC_012582	CGA	2	6	32939	32944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116396
627	NC_012582	CTGAG	2	10	33015	33024	20 %	20 %	40 %	20 %	227116396
628	NC_012582	AAAGC	2	10	33083	33092	60 %	0 %	20 %	20 %	227116396
629	NC_012582	GTT	2	6	33159	33164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116396
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631	NC_012582	TC	3	6	33176	33181	0 %	50 %	0 %	50 %	227116396
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