MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome I

Total Repeats: 57925

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_012582	AAGCCA	2	12	336014	336025	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	227116684
6502	NC_012582	ATTT	2	8	336031	336038	25 %	75 %	0 %	0 %	227116684
6503	NC_012582	TAA	2	6	336063	336068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227116684
6504	NC_012582	CAA	2	6	336216	336221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116684
6505	NC_012582	TGA	2	6	336278	336283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116684
6506	NC_012582	GGT	2	6	336327	336332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116684
6507	NC_012582	TGA	2	6	336339	336344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116684
6508	NC_012582	TGG	2	6	336389	336394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116684
6509	NC_012582	TTC	2	6	336398	336403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116684
6510	NC_012582	CTA	2	6	336466	336471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116684
6511	NC_012582	CAA	2	6	336472	336477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116684
6512	NC_012582	ATTA	2	8	336501	336508	50 %	50 %	0 %	0 %	227116684
6513	NC_012582	CAA	2	6	336643	336648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116684
6514	NC_012582	ATT	2	6	336738	336743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227116684
6515	NC_012582	AG	3	6	336769	336774	50 %	0 %	50 %	0 %	227116684
6516	NC_012582	T	6	6	336894	336899	0 %	100 %	0 %	0 %	227116684
6517	NC_012582	CCGA	2	8	336916	336923	25 %	0 %	25 %	50 %	227116684
6518	NC_012582	TGT	2	6	336926	336931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116684
6519	NC_012582	GTTG	2	8	336998	337005	0 %	50 %	50 %	0 %	227116684
6520	NC_012582	TGT	2	6	337085	337090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116684
6521	NC_012582	TGAT	2	8	337154	337161	25 %	50 %	25 %	0 %	227116684
6522	NC_012582	TGA	2	6	337179	337184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116684
6523	NC_012582	CCA	2	6	337209	337214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227116684
6524	NC_012582	TTG	2	6	337402	337407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116684
6525	NC_012582	AAGCA	2	10	337449	337458	60 %	0 %	20 %	20 %	227116684
6526	NC_012582	CAT	2	6	337564	337569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116684
6527	NC_012582	T	6	6	337571	337576	0 %	100 %	0 %	0 %	227116684
6528	NC_012582	GGA	2	6	337590	337595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227116684
6529	NC_012582	TTAG	2	8	337621	337628	25 %	50 %	25 %	0 %	227116684
6530	NC_012582	TGAT	2	8	337756	337763	25 %	50 %	25 %	0 %	227116685
6531	NC_012582	GCTGG	2	10	337788	337797	0 %	20 %	60 %	20 %	227116685
6532	NC_012582	AAC	2	6	337821	337826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116685
6533	NC_012582	G	7	7	337841	337847	0 %	0 %	100 %	0 %	227116685
6534	NC_012582	A	6	6	337858	337863	100 %	0 %	0 %	0 %	227116685
6535	NC_012582	TTG	3	9	337878	337886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116685
6536	NC_012582	AGA	2	6	337913	337918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227116685
6537	NC_012582	TGA	2	6	337919	337924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116685
6538	NC_012582	TGCC	2	8	338032	338039	0 %	25 %	25 %	50 %	227116685
6539	NC_012582	TAC	2	6	338099	338104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116685
6540	NC_012582	CAA	2	6	338121	338126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116685
6541	NC_012582	GTT	2	6	338303	338308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116685
6542	NC_012582	GGT	2	6	338333	338338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116685
6543	NC_012582	AAG	2	6	338368	338373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227116685
6544	NC_012582	ACT	2	6	338533	338538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116685
6545	NC_012582	TTG	2	6	338670	338675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116685
6546	NC_012582	CGC	2	6	338713	338718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227116685
6547	NC_012582	GAT	2	6	338829	338834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116685
6548	NC_012582	TCAG	2	8	338840	338847	25 %	25 %	25 %	25 %	227116685
6549	NC_012582	A	6	6	338929	338934	100 %	0 %	0 %	0 %	227116685
6550	NC_012582	GTC	2	6	338949	338954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116685
6551	NC_012582	ATTT	2	8	339043	339050	25 %	75 %	0 %	0 %	227116685
6552	NC_012582	TG	3	6	339058	339063	0 %	50 %	50 %	0 %	227116685
6553	NC_012582	ATC	2	6	339235	339240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116685
6554	NC_012582	ACA	2	6	339278	339283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116686
6555	NC_012582	TTA	2	6	339436	339441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227116686
6556	NC_012582	TATTG	2	10	339487	339496	20 %	60 %	20 %	0 %	227116686
6557	NC_012582	GCG	2	6	339502	339507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227116686
6558	NC_012582	GCT	2	6	339562	339567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116686
6559	NC_012582	GTTCGA	2	12	339629	339640	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	227116686
6560	NC_012582	TACT	2	8	339668	339675	25 %	50 %	0 %	25 %	227116686
6561	NC_012582	TTGA	2	8	339676	339683	25 %	50 %	25 %	0 %	227116686
6562	NC_012582	ACC	2	6	339707	339712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227116686
6563	NC_012582	AAC	2	6	339722	339727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116686
6564	NC_012582	TCG	2	6	339789	339794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116686
6565	NC_012582	TGAG	2	8	339828	339835	25 %	25 %	50 %	0 %	227116686
6566	NC_012582	TAGA	2	8	339858	339865	50 %	25 %	25 %	0 %	227116687
6567	NC_012582	CG	3	6	339866	339871	0 %	0 %	50 %	50 %	227116687
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6572	NC_012582	CAC	2	6	340382	340387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227116687
6573	NC_012582	CTGAT	2	10	340471	340480	20 %	40 %	20 %	20 %	227116687
6574	NC_012582	ATA	2	6	340487	340492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6575	NC_012582	CA	3	6	340502	340507	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6576	NC_012582	A	6	6	340510	340515	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6577	NC_012582	GC	3	6	340581	340586	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6578	NC_012582	TTG	2	6	340599	340604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6579	NC_012582	GTG	2	6	340605	340610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6580	NC_012582	AGGTT	2	10	340650	340659	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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6591	NC_012582	TGA	2	6	341071	341076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116688
6592	NC_012582	GAA	3	9	341087	341095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227116688
6593	NC_012582	CA	3	6	341106	341111	50 %	0 %	0 %	50 %	227116688
6594	NC_012582	CAA	2	6	341177	341182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116688
6595	NC_012582	TGA	2	6	341191	341196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116688
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6599	NC_012582	A	6	6	341390	341395	100 %	0 %	0 %	0 %	227116688
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6601	NC_012582	TGA	2	6	341473	341478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116688
6602	NC_012582	A	7	7	341550	341556	100 %	0 %	0 %	0 %	227116689
6603	NC_012582	GCTT	2	8	341664	341671	0 %	50 %	25 %	25 %	227116689
6604	NC_012582	TGT	2	6	341672	341677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116689
6605	NC_012582	TGG	2	6	341689	341694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116689
6606	NC_012582	A	6	6	341715	341720	100 %	0 %	0 %	0 %	227116689
6607	NC_012582	GA	3	6	341800	341805	50 %	0 %	50 %	0 %	227116689
6608	NC_012582	ATG	3	9	341829	341837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116689
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6614	NC_012582	ATG	2	6	342189	342194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116689
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6616	NC_012582	TTTA	2	8	342334	342341	25 %	75 %	0 %	0 %	227116690
6617	NC_012582	GAC	2	6	342367	342372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116690
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6619	NC_012582	GATGCC	2	12	342391	342402	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	227116690
6620	NC_012582	CTA	2	6	342442	342447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116690
6621	NC_012582	TGGG	2	8	342514	342521	0 %	25 %	75 %	0 %	227116690
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6992	NC_012582	CAT	2	6	363373	363378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116712
6993	NC_012582	TGC	2	6	363406	363411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116712
6994	NC_012582	TG	3	6	363515	363520	0 %	50 %	50 %	0 %	227116712
6995	NC_012582	AGC	2	6	363550	363555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116712
6996	NC_012582	GAG	2	6	363567	363572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227116712
6997	NC_012582	TCA	2	6	363656	363661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116712
6998	NC_012582	GGGCA	2	10	363684	363693	20 %	0 %	60 %	20 %	227116712
6999	NC_012582	CGT	2	6	363733	363738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116712
7000	NC_012582	CACT	2	8	363739	363746	25 %	25 %	0 %	50 %	227116712

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