MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome I

Total Repeats: 57925

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
56501	NC_012582	GGC	2	6	2947575	2947580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119132
56502	NC_012582	AAG	2	6	2947642	2947647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119132
56503	NC_012582	CAA	2	6	2947704	2947709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119132
56504	NC_012582	CCA	2	6	2947729	2947734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119132
56505	NC_012582	GATG	2	8	2947754	2947761	25 %	25 %	50 %	0 %	227119132
56506	NC_012582	CGTG	2	8	2947769	2947776	0 %	25 %	50 %	25 %	227119132
56507	NC_012582	TG	3	6	2947799	2947804	0 %	50 %	50 %	0 %	227119132
56508	NC_012582	TAC	2	6	2947815	2947820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119132
56509	NC_012582	CCG	2	6	2947835	2947840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119132
56510	NC_012582	GTG	2	6	2947859	2947864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119132
56511	NC_012582	ATC	2	6	2947929	2947934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56512	NC_012582	CTT	2	6	2947955	2947960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56513	NC_012582	CT	3	6	2947994	2947999	0 %	50 %	0 %	50 %	227119133
56514	NC_012582	CAT	2	6	2948031	2948036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119133
56515	NC_012582	TG	3	6	2948042	2948047	0 %	50 %	50 %	0 %	227119133
56516	NC_012582	GCGCC	2	10	2948112	2948121	0 %	0 %	40 %	60 %	227119133
56517	NC_012582	CGC	2	6	2948169	2948174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119133
56518	NC_012582	CAC	2	6	2948226	2948231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119133
56519	NC_012582	CA	3	6	2948238	2948243	50 %	0 %	0 %	50 %	227119133
56520	NC_012582	CAT	2	6	2948245	2948250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119133
56521	NC_012582	CAA	2	6	2948266	2948271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119133
56522	NC_012582	TGC	2	6	2948279	2948284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119133
56523	NC_012582	TGCC	2	8	2948309	2948316	0 %	25 %	25 %	50 %	227119133
56524	NC_012582	AGC	2	6	2948342	2948347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119133
56525	NC_012582	GAT	2	6	2948361	2948366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119133
56526	NC_012582	GC	3	6	2948374	2948379	0 %	0 %	50 %	50 %	227119133
56527	NC_012582	ATT	2	6	2948407	2948412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227119133
56528	NC_012582	TAT	2	6	2948489	2948494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227119134
56529	NC_012582	GCT	2	6	2948586	2948591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119134
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56531	NC_012582	TCA	2	6	2948637	2948642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119134
56532	NC_012582	GCAG	2	8	2948669	2948676	25 %	0 %	50 %	25 %	227119134
56533	NC_012582	AAC	2	6	2948723	2948728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119134
56534	NC_012582	AC	3	6	2948727	2948732	50 %	0 %	0 %	50 %	227119134
56535	NC_012582	TGT	2	6	2948798	2948803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119134
56536	NC_012582	CAA	2	6	2948850	2948855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119134
56537	NC_012582	CA	3	6	2948888	2948893	50 %	0 %	0 %	50 %	227119134
56538	NC_012582	CGC	2	6	2948901	2948906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119134
56539	NC_012582	AATA	2	8	2948947	2948954	75 %	25 %	0 %	0 %	227119134
56540	NC_012582	AGT	2	6	2948960	2948965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119134
56541	NC_012582	CCT	2	6	2948981	2948986	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56542	NC_012582	AG	3	6	2949034	2949039	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56543	NC_012582	CAA	2	6	2949051	2949056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56544	NC_012582	CAG	2	6	2949113	2949118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119135
56545	NC_012582	CAG	2	6	2949127	2949132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119135
56546	NC_012582	TCA	2	6	2949160	2949165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119135
56547	NC_012582	CTG	2	6	2949206	2949211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119135
56548	NC_012582	GTC	2	6	2949284	2949289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119135
56549	NC_012582	CA	3	6	2949329	2949334	50 %	0 %	0 %	50 %	227119135
56550	NC_012582	CAA	2	6	2949362	2949367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119135
56551	NC_012582	GCA	2	6	2949382	2949387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119135
56552	NC_012582	CAG	2	6	2949397	2949402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119135
56553	NC_012582	GAA	2	6	2949497	2949502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119135
56554	NC_012582	AG	3	6	2949564	2949569	50 %	0 %	50 %	0 %	227119135
56555	NC_012582	CA	3	6	2949673	2949678	50 %	0 %	0 %	50 %	227119135
56556	NC_012582	TTA	2	6	2949855	2949860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227119135
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56561	NC_012582	TA	3	6	2950040	2950045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56562	NC_012582	TAT	2	6	2950129	2950134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56563	NC_012582	T	6	6	2950217	2950222	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56564	NC_012582	AAT	2	6	2950228	2950233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56565	NC_012582	GAA	2	6	2950302	2950307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119136
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56569	NC_012582	CAAA	2	8	2950462	2950469	75 %	0 %	0 %	25 %	227119136
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56578	NC_012582	TGAA	2	8	2950912	2950919	50 %	25 %	25 %	0 %	227119136
56579	NC_012582	CG	3	6	2950926	2950931	0 %	0 %	50 %	50 %	227119136
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56585	NC_012582	TGAA	2	8	2951206	2951213	50 %	25 %	25 %	0 %	227119136
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56591	NC_012582	CAA	2	6	2951468	2951473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119136
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56598	NC_012582	TCA	2	6	2951739	2951744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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56600	NC_012582	T	6	6	2951801	2951806	0 %	100 %	0 %	0 %	227119137
56601	NC_012582	CTTCAT	2	12	2951862	2951873	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	227119137
56602	NC_012582	GGT	2	6	2951911	2951916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119137
56603	NC_012582	ATC	2	6	2951992	2951997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119137
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56606	NC_012582	TGA	2	6	2952128	2952133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119137
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56615	NC_012582	GCA	2	6	2952676	2952681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119137
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56740	NC_012582	CCG	2	6	2960399	2960404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119140
56741	NC_012582	AAC	2	6	2960485	2960490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119140
56742	NC_012582	CAC	2	6	2960601	2960606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119140
56743	NC_012582	CAT	2	6	2960670	2960675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119140
56744	NC_012582	GAT	2	6	2960691	2960696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119140
56745	NC_012582	CCCAA	2	10	2960715	2960724	40 %	0 %	0 %	60 %	227119140
56746	NC_012582	GC	3	6	2960793	2960798	0 %	0 %	50 %	50 %	227119140
56747	NC_012582	ATC	2	6	2960806	2960811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119140
56748	NC_012582	GCCA	2	8	2960902	2960909	25 %	0 %	25 %	50 %	227119140
56749	NC_012582	GAC	2	6	2960942	2960947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119140
56750	NC_012582	AAAT	2	8	2960983	2960990	75 %	25 %	0 %	0 %	227119140
56751	NC_012582	ATC	2	6	2961034	2961039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119140
56752	NC_012582	GATT	2	8	2961092	2961099	25 %	50 %	25 %	0 %	227119140
56753	NC_012582	CCA	2	6	2961102	2961107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119140
56754	NC_012582	GCCAA	2	10	2961124	2961133	40 %	0 %	20 %	40 %	227119140
56755	NC_012582	CTG	2	6	2961153	2961158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119140
56756	NC_012582	CCG	3	9	2961329	2961337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119140
56757	NC_012582	GGT	2	6	2961426	2961431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119140
56758	NC_012582	GA	4	8	2961453	2961460	50 %	0 %	50 %	0 %	227119140
56759	NC_012582	TCT	2	6	2961595	2961600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119140
56760	NC_012582	GAG	2	6	2961655	2961660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227119140
56761	NC_012582	A	7	7	2961708	2961714	100 %	0 %	0 %	0 %	227119140
56762	NC_012582	A	7	7	2961887	2961893	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56763	NC_012582	TCG	3	9	2961906	2961914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56764	NC_012582	T	6	6	2961995	2962000	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56765	NC_012582	GCT	2	6	2962046	2962051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56766	NC_012582	AGGA	2	8	2962101	2962108	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56767	NC_012582	ATC	2	6	2962127	2962132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119141
56768	NC_012582	GGAA	2	8	2962153	2962160	50 %	0 %	50 %	0 %	227119141
56769	NC_012582	TTTG	2	8	2962223	2962230	0 %	75 %	25 %	0 %	227119141
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56772	NC_012582	GC	3	6	2962335	2962340	0 %	0 %	50 %	50 %	227119141
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56774	NC_012582	GCGG	2	8	2962498	2962505	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
56775	NC_012582	CTTC	2	8	2962562	2962569	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56776	NC_012582	GGCA	2	8	2962578	2962585	25 %	0 %	50 %	25 %	227119142
56777	NC_012582	TGC	2	6	2962646	2962651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119142
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56833	NC_012582	GTTTG	2	10	2964880	2964889	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
56834	NC_012582	GCG	2	6	2964966	2964971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56835	NC_012582	T	6	6	2965005	2965010	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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56843	NC_012582	GCC	2	6	2965604	2965609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119144
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56846	NC_012582	CG	3	6	2965642	2965647	0 %	0 %	50 %	50 %	227119144
56847	NC_012582	TCA	2	6	2965729	2965734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119144
56848	NC_012582	ATG	2	6	2965738	2965743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119144
56849	NC_012582	CAT	2	6	2965775	2965780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119144
56850	NC_012582	CAAG	2	8	2965805	2965812	50 %	0 %	25 %	25 %	227119144
56851	NC_012582	TGT	2	6	2965831	2965836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119144
56852	NC_012582	CAGC	2	8	2965858	2965865	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
56853	NC_012582	A	6	6	2965995	2966000	100 %	0 %	0 %	0 %	227119145
56854	NC_012582	CGC	2	6	2966036	2966041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119145
56855	NC_012582	GAA	2	6	2966126	2966131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119145
56856	NC_012582	AGC	2	6	2966175	2966180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119145
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