MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome I

Total Repeats: 57925

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
56001	NC_012582	AAT	2	6	2922397	2922402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56002	NC_012582	T	6	6	2922513	2922518	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56003	NC_012582	CGT	2	6	2922549	2922554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119108
56004	NC_012582	TGT	2	6	2922557	2922562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119108
56005	NC_012582	GCA	2	6	2922586	2922591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119108
56006	NC_012582	TGT	2	6	2922656	2922661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119108
56007	NC_012582	CCA	2	6	2922669	2922674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119108
56008	NC_012582	GGC	2	6	2922714	2922719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119108
56009	NC_012582	GTG	2	6	2922763	2922768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119108
56010	NC_012582	CAT	3	9	2922821	2922829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119108
56011	NC_012582	CGT	2	6	2922843	2922848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119108
56012	NC_012582	TCG	2	6	2922874	2922879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119108
56013	NC_012582	GAAA	2	8	2922899	2922906	75 %	0 %	25 %	0 %	227119108
56014	NC_012582	TCT	2	6	2922922	2922927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119108
56015	NC_012582	ATC	2	6	2923038	2923043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119108
56016	NC_012582	CAG	2	6	2923087	2923092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119108
56017	NC_012582	ATG	2	6	2923093	2923098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119108
56018	NC_012582	TGC	2	6	2923145	2923150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119108
56019	NC_012582	ATC	2	6	2923167	2923172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119108
56020	NC_012582	CGG	2	6	2923178	2923183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119108
56021	NC_012582	GCA	2	6	2923296	2923301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119108
56022	NC_012582	A	6	6	2923308	2923313	100 %	0 %	0 %	0 %	227119108
56023	NC_012582	TTG	2	6	2923367	2923372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56024	NC_012582	TCCCT	2	10	2923404	2923413	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
56025	NC_012582	GAT	2	6	2923538	2923543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119109
56026	NC_012582	TGG	2	6	2923552	2923557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119109
56027	NC_012582	CTTT	2	8	2923585	2923592	0 %	75 %	0 %	25 %	227119109
56028	NC_012582	GGC	2	6	2923619	2923624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119109
56029	NC_012582	GGGTT	2	10	2923681	2923690	0 %	40 %	60 %	0 %	227119109
56030	NC_012582	GAC	2	6	2923729	2923734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119109
56031	NC_012582	CG	4	8	2923739	2923746	0 %	0 %	50 %	50 %	227119109
56032	NC_012582	TGC	2	6	2923831	2923836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119109
56033	NC_012582	GCCA	2	8	2923842	2923849	25 %	0 %	25 %	50 %	227119109
56034	NC_012582	TGG	2	6	2923879	2923884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119109
56035	NC_012582	ATG	2	6	2923977	2923982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119109
56036	NC_012582	GC	3	6	2924002	2924007	0 %	0 %	50 %	50 %	227119109
56037	NC_012582	CTG	2	6	2924016	2924021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119109
56038	NC_012582	TGC	2	6	2924063	2924068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119109
56039	NC_012582	TTGG	2	8	2924087	2924094	0 %	50 %	50 %	0 %	227119109
56040	NC_012582	CTG	2	6	2924247	2924252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119109
56041	NC_012582	GCG	2	6	2924301	2924306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119109
56042	NC_012582	CTG	2	6	2924442	2924447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119109
56043	NC_012582	ATG	2	6	2924469	2924474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119109
56044	NC_012582	GGC	2	6	2924495	2924500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119109
56045	NC_012582	CTG	2	6	2924532	2924537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119109
56046	NC_012582	GTG	2	6	2924583	2924588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119109
56047	NC_012582	ATG	2	6	2924589	2924594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119109
56048	NC_012582	GGC	2	6	2924691	2924696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119109
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56050	NC_012582	TTAT	2	8	2924718	2924725	25 %	75 %	0 %	0 %	227119109
56051	NC_012582	ATT	2	6	2924756	2924761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227119109
56052	NC_012582	GCG	2	6	2924786	2924791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119109
56053	NC_012582	A	6	6	2924849	2924854	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56054	NC_012582	CTT	2	6	2924926	2924931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119110
56055	NC_012582	GAT	3	9	2924963	2924971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119110
56056	NC_012582	TCT	2	6	2924997	2925002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119110
56057	NC_012582	CGC	2	6	2925016	2925021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119110
56058	NC_012582	TTC	2	6	2925170	2925175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119110
56059	NC_012582	GCC	2	6	2925183	2925188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119110
56060	NC_012582	GCC	2	6	2925221	2925226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119110
56061	NC_012582	GTG	2	6	2925309	2925314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119110
56062	NC_012582	CCA	2	6	2925339	2925344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119110
56063	NC_012582	GATA	2	8	2925385	2925392	50 %	25 %	25 %	0 %	227119110
56064	NC_012582	CA	3	6	2925394	2925399	50 %	0 %	0 %	50 %	227119110
56065	NC_012582	GTATT	2	10	2925408	2925417	20 %	60 %	20 %	0 %	227119110
56066	NC_012582	TA	3	6	2925456	2925461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56067	NC_012582	CAA	2	6	2925528	2925533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119111
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56069	NC_012582	CAT	2	6	2925574	2925579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119111
56070	NC_012582	CAC	2	6	2925634	2925639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119111
56071	NC_012582	ACA	2	6	2925726	2925731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119111
56072	NC_012582	CGCA	2	8	2925751	2925758	25 %	0 %	25 %	50 %	227119111
56073	NC_012582	TTG	2	6	2925824	2925829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119111
56074	NC_012582	ACCGCC	2	12	2925839	2925850	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	227119111
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56076	NC_012582	GT	3	6	2925902	2925907	0 %	50 %	50 %	0 %	227119111
56077	NC_012582	A	6	6	2925911	2925916	100 %	0 %	0 %	0 %	227119111
56078	NC_012582	CAAG	2	8	2925930	2925937	50 %	0 %	25 %	25 %	227119111
56079	NC_012582	A	6	6	2925940	2925945	100 %	0 %	0 %	0 %	227119111
56080	NC_012582	CGC	2	6	2926012	2926017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119111
56081	NC_012582	AATA	2	8	2926042	2926049	75 %	25 %	0 %	0 %	227119111
56082	NC_012582	GC	3	6	2926175	2926180	0 %	0 %	50 %	50 %	227119111
56083	NC_012582	GCA	2	6	2926257	2926262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119111
56084	NC_012582	CAG	2	6	2926273	2926278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119111
56085	NC_012582	CG	3	6	2926376	2926381	0 %	0 %	50 %	50 %	227119111
56086	NC_012582	CCAA	2	8	2926386	2926393	50 %	0 %	0 %	50 %	227119111
56087	NC_012582	A	6	6	2926467	2926472	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56088	NC_012582	CCA	2	6	2926475	2926480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56089	NC_012582	TCTTCG	2	12	2926539	2926550	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	227119112
56090	NC_012582	AGC	2	6	2926580	2926585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119112
56091	NC_012582	GGT	2	6	2926688	2926693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119112
56092	NC_012582	TCA	2	6	2926771	2926776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119112
56093	NC_012582	GTGA	2	8	2926794	2926801	25 %	25 %	50 %	0 %	227119112
56094	NC_012582	TCAG	2	8	2926812	2926819	25 %	25 %	25 %	25 %	227119112
56095	NC_012582	CCATG	2	10	2926960	2926969	20 %	20 %	20 %	40 %	227119112
56096	NC_012582	TGG	2	6	2926972	2926977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119112
56097	NC_012582	TCAA	2	8	2926992	2926999	50 %	25 %	0 %	25 %	227119112
56098	NC_012582	GCA	2	6	2927002	2927007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119112
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56100	NC_012582	CTT	3	9	2927161	2927169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119112
56101	NC_012582	CCA	2	6	2927170	2927175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119112
56102	NC_012582	GTTG	2	8	2927254	2927261	0 %	50 %	50 %	0 %	227119112
56103	NC_012582	GTG	2	6	2927431	2927436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119112
56104	NC_012582	GCA	2	6	2927440	2927445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119112
56105	NC_012582	TCAG	2	8	2927535	2927542	25 %	25 %	25 %	25 %	227119112
56106	NC_012582	GAT	2	6	2927549	2927554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119112
56107	NC_012582	TGA	2	6	2927611	2927616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119112
56108	NC_012582	ATC	2	6	2927682	2927687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119112
56109	NC_012582	CT	3	6	2927721	2927726	0 %	50 %	0 %	50 %	227119112
56110	NC_012582	ACG	2	6	2927738	2927743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119112
56111	NC_012582	ATG	2	6	2927796	2927801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119112
56112	NC_012582	GCTC	2	8	2927812	2927819	0 %	25 %	25 %	50 %	227119112
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56115	NC_012582	CGTG	2	8	2928031	2928038	0 %	25 %	50 %	25 %	227119113
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56117	NC_012582	CCA	2	6	2928092	2928097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119113
56118	NC_012582	GCA	2	6	2928129	2928134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119113
56119	NC_012582	GC	3	6	2928207	2928212	0 %	0 %	50 %	50 %	227119113
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56143	NC_012582	CTT	2	6	2929334	2929339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119115
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56148	NC_012582	CAT	2	6	2929430	2929435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119115
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56210	NC_012582	AT	3	6	2932972	2932977	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56211	NC_012582	CT	3	6	2933007	2933012	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56212	NC_012582	GTG	2	6	2933046	2933051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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56220	NC_012582	ATCTC	2	10	2933396	2933405	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
56221	NC_012582	GAAT	2	8	2933417	2933424	50 %	25 %	25 %	0 %	227119118
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56223	NC_012582	T	7	7	2933529	2933535	0 %	100 %	0 %	0 %	227119118
56224	NC_012582	ATAA	2	8	2933603	2933610	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56225	NC_012582	GAA	2	6	2933662	2933667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119119
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56227	NC_012582	CTG	2	6	2933750	2933755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119119
56228	NC_012582	CTG	2	6	2933944	2933949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119119
56229	NC_012582	GGATT	2	10	2933965	2933974	20 %	40 %	40 %	0 %	227119119
56230	NC_012582	CGA	2	6	2934006	2934011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119119
56231	NC_012582	CGG	2	6	2934048	2934053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119119
56232	NC_012582	AGA	2	6	2934063	2934068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119119
56233	NC_012582	GCC	2	6	2934101	2934106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119119
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56235	NC_012582	TAT	2	6	2934222	2934227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227119119
56236	NC_012582	GCA	2	6	2934250	2934255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119119
56237	NC_012582	TGA	2	6	2934345	2934350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119119
56238	NC_012582	CAA	2	6	2934378	2934383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119119
56239	NC_012582	TGC	2	6	2934455	2934460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119119
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56242	NC_012582	GC	3	6	2934654	2934659	0 %	0 %	50 %	50 %	227119119
56243	NC_012582	GCT	2	6	2934748	2934753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119119
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56246	NC_012582	T	6	6	2934965	2934970	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56247	NC_012582	TCAC	2	8	2935001	2935008	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
56248	NC_012582	TCA	2	6	2935055	2935060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119120
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56256	NC_012582	TCGAA	2	10	2935357	2935366	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
56257	NC_012582	TTTA	2	8	2935442	2935449	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56258	NC_012582	ATG	2	6	2935559	2935564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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56305	NC_012582	CAG	2	6	2937850	2937855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119122
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56331	NC_012582	ATC	2	6	2939032	2939037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119122
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56333	NC_012582	TC	3	6	2939194	2939199	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56334	NC_012582	TCG	2	6	2939222	2939227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56335	NC_012582	TCCC	2	8	2939241	2939248	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
56336	NC_012582	CAT	2	6	2939276	2939281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56337	NC_012582	TC	4	8	2939288	2939295	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56338	NC_012582	CATA	2	8	2939305	2939312	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
56339	NC_012582	ATTCAG	2	12	2939437	2939448	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56340	NC_012582	AC	4	8	2939486	2939493	50 %	0 %	0 %	50 %	227119123
56341	NC_012582	T	6	6	2939560	2939565	0 %	100 %	0 %	0 %	227119123
56342	NC_012582	CAC	2	6	2939576	2939581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119123
56343	NC_012582	GAA	2	6	2939587	2939592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119123
56344	NC_012582	ACTC	2	8	2939683	2939690	25 %	25 %	0 %	50 %	227119123
56345	NC_012582	TGA	2	6	2939763	2939768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119123
56346	NC_012582	ACT	2	6	2939789	2939794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119123
56347	NC_012582	GGT	2	6	2939848	2939853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119123
56348	NC_012582	GCT	2	6	2939886	2939891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119123
56349	NC_012582	GCC	2	6	2939923	2939928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119123
56350	NC_012582	GC	3	6	2939957	2939962	0 %	0 %	50 %	50 %	227119123
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56471	NC_012582	T	7	7	2946056	2946062	0 %	100 %	0 %	0 %	227119131
56472	NC_012582	GCA	2	6	2946167	2946172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119131
56473	NC_012582	CTG	2	6	2946234	2946239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119131
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56481	NC_012582	GCA	2	6	2946524	2946529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119131
56482	NC_012582	GAT	2	6	2946668	2946673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119131
56483	NC_012582	AGT	2	6	2946741	2946746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119131
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56486	NC_012582	CAG	2	6	2946906	2946911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119131
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56497	NC_012582	TCTG	2	8	2947427	2947434	0 %	50 %	25 %	25 %	227119132
56498	NC_012582	CG	4	8	2947481	2947488	0 %	0 %	50 %	50 %	227119132
56499	NC_012582	GGT	2	6	2947521	2947526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119132
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