MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome I

Total Repeats: 57925

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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55002	NC_012582	GTC	2	6	2867219	2867224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119051
55003	NC_012582	CGG	2	6	2867227	2867232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119051
55004	NC_012582	GCT	2	6	2867269	2867274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119051
55005	NC_012582	CAA	2	6	2867276	2867281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119051
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55009	NC_012582	ATT	2	6	2867545	2867550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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55013	NC_012582	GAT	2	6	2867727	2867732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119052
55014	NC_012582	TC	3	6	2867733	2867738	0 %	50 %	0 %	50 %	227119052
55015	NC_012582	GAA	2	6	2867782	2867787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119052
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55118	NC_012582	CATG	2	8	2873709	2873716	25 %	25 %	25 %	25 %	227119057
55119	NC_012582	CCA	2	6	2873741	2873746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119057
55120	NC_012582	AAAC	2	8	2873774	2873781	75 %	0 %	0 %	25 %	227119057
55121	NC_012582	CGC	2	6	2873818	2873823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119057
55122	NC_012582	GC	3	6	2873889	2873894	0 %	0 %	50 %	50 %	227119057
55123	NC_012582	GATC	2	8	2873907	2873914	25 %	25 %	25 %	25 %	227119057
55124	NC_012582	TCA	2	6	2873915	2873920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119057
55125	NC_012582	GTAA	2	8	2873974	2873981	50 %	25 %	25 %	0 %	227119057
55126	NC_012582	ATC	2	6	2873999	2874004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119057
55127	NC_012582	GCAT	2	8	2874009	2874016	25 %	25 %	25 %	25 %	227119057
55128	NC_012582	GCA	2	6	2874053	2874058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55129	NC_012582	GC	3	6	2874112	2874117	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55130	NC_012582	T	6	6	2874119	2874124	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55131	NC_012582	TC	3	6	2874139	2874144	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55132	NC_012582	CA	3	6	2874255	2874260	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55133	NC_012582	A	7	7	2874317	2874323	100 %	0 %	0 %	0 %	227119058
55134	NC_012582	A	6	6	2874394	2874399	100 %	0 %	0 %	0 %	227119058
55135	NC_012582	GC	3	6	2874591	2874596	0 %	0 %	50 %	50 %	227119058
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55145	NC_012582	ATTCC	2	10	2875124	2875133	20 %	40 %	0 %	40 %	227119058
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55155	NC_012582	TGAT	2	8	2875497	2875504	25 %	50 %	25 %	0 %	227119058
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55160	NC_012582	TAC	2	6	2875717	2875722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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55168	NC_012582	CGG	2	6	2876291	2876296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119059
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55215	NC_012582	A	6	6	2879503	2879508	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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55220	NC_012582	TCT	2	6	2879914	2879919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119061
55221	NC_012582	TGA	2	6	2879920	2879925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119061
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55223	NC_012582	TTG	2	6	2880084	2880089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119061
55224	NC_012582	TGT	2	6	2880123	2880128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119061
55225	NC_012582	GC	3	6	2880157	2880162	0 %	0 %	50 %	50 %	227119061
55226	NC_012582	CAG	2	6	2880167	2880172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119061
55227	NC_012582	GCC	2	6	2880180	2880185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119061
55228	NC_012582	GCTCA	2	10	2880266	2880275	20 %	20 %	20 %	40 %	227119061
55229	NC_012582	TGCA	2	8	2880443	2880450	25 %	25 %	25 %	25 %	227119061
55230	NC_012582	ATC	2	6	2880479	2880484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119061
55231	NC_012582	AGT	2	6	2880517	2880522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119061
55232	NC_012582	TGAAAT	2	12	2880601	2880612	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	227119061
55233	NC_012582	ACAAA	2	10	2880616	2880625	80 %	0 %	0 %	20 %	227119061
55234	NC_012582	CAC	2	6	2880723	2880728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119062
55235	NC_012582	AGC	2	6	2880733	2880738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119062
55236	NC_012582	ATC	2	6	2880747	2880752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119062
55237	NC_012582	T	6	6	2880835	2880840	0 %	100 %	0 %	0 %	227119062
55238	NC_012582	GCC	2	6	2880841	2880846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119062
55239	NC_012582	TAA	2	6	2880909	2880914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227119062
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55241	NC_012582	ATCAC	2	10	2880967	2880976	40 %	20 %	0 %	40 %	227119062
55242	NC_012582	TCA	2	6	2881141	2881146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119062
55243	NC_012582	GC	4	8	2881216	2881223	0 %	0 %	50 %	50 %	227119062
55244	NC_012582	CCG	2	6	2881277	2881282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119062
55245	NC_012582	CGC	2	6	2881299	2881304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119062
55246	NC_012582	CCG	2	6	2881310	2881315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119062
55247	NC_012582	AGC	2	6	2881342	2881347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119062
55248	NC_012582	AATT	2	8	2881368	2881375	50 %	50 %	0 %	0 %	227119062
55249	NC_012582	CCA	2	6	2881547	2881552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119063
55250	NC_012582	CG	3	6	2881603	2881608	0 %	0 %	50 %	50 %	227119063
55251	NC_012582	AAATC	2	10	2881674	2881683	60 %	20 %	0 %	20 %	227119063
55252	NC_012582	ATG	2	6	2881694	2881699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119063
55253	NC_012582	CGCC	2	8	2881740	2881747	0 %	0 %	25 %	75 %	227119063
55254	NC_012582	TGA	2	6	2881764	2881769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119063
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55257	NC_012582	GCG	2	6	2882000	2882005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119063
55258	NC_012582	GA	3	6	2882048	2882053	50 %	0 %	50 %	0 %	227119063
55259	NC_012582	ATGG	2	8	2882054	2882061	25 %	25 %	50 %	0 %	227119063
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55261	NC_012582	CCA	2	6	2882189	2882194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55262	NC_012582	GTG	2	6	2882348	2882353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119064
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55266	NC_012582	T	6	6	2882659	2882664	0 %	100 %	0 %	0 %	227119064
55267	NC_012582	CATCG	2	10	2882728	2882737	20 %	20 %	20 %	40 %	227119064
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55271	NC_012582	AG	3	6	2883187	2883192	50 %	0 %	50 %	0 %	227119065
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55296	NC_012582	ACA	2	6	2884359	2884364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119065
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55298	NC_012582	CAG	2	6	2884522	2884527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119065
55299	NC_012582	TC	3	6	2884634	2884639	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55300	NC_012582	T	6	6	2884759	2884764	0 %	100 %	0 %	0 %	227119066
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55322	NC_012582	CAC	2	6	2885617	2885622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119066
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55324	NC_012582	AGA	2	6	2885645	2885650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119066
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55335	NC_012582	GTT	2	6	2886198	2886203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119067
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55339	NC_012582	CAG	2	6	2886568	2886573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119068
55340	NC_012582	ATT	2	6	2886592	2886597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227119068
55341	NC_012582	ATCG	2	8	2886676	2886683	25 %	25 %	25 %	25 %	227119068
55342	NC_012582	T	6	6	2886805	2886810	0 %	100 %	0 %	0 %	227119068
55343	NC_012582	CAC	2	6	2886828	2886833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119068
55344	NC_012582	AGGC	2	8	2886879	2886886	25 %	0 %	50 %	25 %	227119068
55345	NC_012582	TTA	2	6	2886890	2886895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227119068
55346	NC_012582	GAT	2	6	2886919	2886924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119068
55347	NC_012582	CAA	2	6	2886967	2886972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119068
55348	NC_012582	TCA	2	6	2887070	2887075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119068
55349	NC_012582	CT	3	6	2887106	2887111	0 %	50 %	0 %	50 %	227119068
55350	NC_012582	TCC	2	6	2887117	2887122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227119068
55351	NC_012582	CTC	2	6	2887171	2887176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227119068
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55353	NC_012582	AGTT	2	8	2887302	2887309	25 %	50 %	25 %	0 %	227119068
55354	NC_012582	TCG	2	6	2887313	2887318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119068
55355	NC_012582	ACA	2	6	2887341	2887346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119068
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55395	NC_012582	ATCTTG	2	12	2889521	2889532	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	227119071
55396	NC_012582	TGC	2	6	2889602	2889607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119071
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55422	NC_012582	GAT	2	6	2890949	2890954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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55461	NC_012582	TGA	2	6	2893178	2893183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119073
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55464	NC_012582	TC	3	6	2893293	2893298	0 %	50 %	0 %	50 %	227119073
55465	NC_012582	CAA	2	6	2893385	2893390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119073
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55467	NC_012582	T	6	6	2893559	2893564	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55468	NC_012582	ATTCG	2	10	2893567	2893576	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
55469	NC_012582	CCGC	2	8	2893698	2893705	0 %	0 %	25 %	75 %	227119074
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55471	NC_012582	TGG	2	6	2893809	2893814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119074
55472	NC_012582	TCA	2	6	2893826	2893831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119074
55473	NC_012582	GCA	2	6	2893844	2893849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119074
55474	NC_012582	CGC	2	6	2893945	2893950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119074
55475	NC_012582	CGA	2	6	2894315	2894320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119074
55476	NC_012582	CTG	2	6	2894321	2894326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119074
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55478	NC_012582	AAATT	2	10	2894587	2894596	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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55483	NC_012582	A	6	6	2895027	2895032	100 %	0 %	0 %	0 %	227119075
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55491	NC_012582	TGA	2	6	2895512	2895517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119076
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55499	NC_012582	CAG	2	6	2895863	2895868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119076
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