MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome I

Total Repeats: 57925

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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53002	NC_012582	AAG	2	6	2759377	2759382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227118934
53003	NC_012582	CTT	2	6	2759591	2759596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227118934
53004	NC_012582	T	6	6	2759631	2759636	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53005	NC_012582	GAAA	2	8	2759642	2759649	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
53006	NC_012582	CTTT	2	8	2759720	2759727	0 %	75 %	0 %	25 %	227118935
53007	NC_012582	T	6	6	2759735	2759740	0 %	100 %	0 %	0 %	227118935
53008	NC_012582	TC	3	6	2759819	2759824	0 %	50 %	0 %	50 %	227118935
53009	NC_012582	GA	3	6	2759870	2759875	50 %	0 %	50 %	0 %	227118935
53010	NC_012582	AATT	2	8	2760026	2760033	50 %	50 %	0 %	0 %	227118935
53011	NC_012582	AACCCT	2	12	2760126	2760137	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	227118935
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53013	NC_012582	GCA	2	6	2760280	2760285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118935
53014	NC_012582	CAG	2	6	2760300	2760305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118935
53015	NC_012582	TCCTC	2	10	2760338	2760347	0 %	40 %	0 %	60 %	227118935
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53019	NC_012582	GAAA	2	8	2760480	2760487	75 %	0 %	25 %	0 %	227118935
53020	NC_012582	CAAA	2	8	2760666	2760673	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
53021	NC_012582	CA	3	6	2760787	2760792	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53022	NC_012582	TTAAA	2	10	2760826	2760835	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53023	NC_012582	GTTTC	2	10	2760889	2760898	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
53024	NC_012582	CAA	2	6	2760995	2761000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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53027	NC_012582	AAC	2	6	2761167	2761172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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53033	NC_012582	CTC	2	6	2761703	2761708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53034	NC_012582	GAG	2	6	2761722	2761727	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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53037	NC_012582	GTA	2	6	2761904	2761909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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53041	NC_012582	TAA	2	6	2762202	2762207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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53043	NC_012582	ACC	2	6	2762359	2762364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53044	NC_012582	GTA	2	6	2762447	2762452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53045	NC_012582	CGT	2	6	2762459	2762464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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53047	NC_012582	C	6	6	2762559	2762564	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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53055	NC_012582	GT	3	6	2763033	2763038	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53056	NC_012582	TACT	2	8	2763050	2763057	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53057	NC_012582	AGT	2	6	2763126	2763131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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53061	NC_012582	GTCA	2	8	2763535	2763542	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53062	NC_012582	GGA	2	6	2763558	2763563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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53078	NC_012582	AATC	2	8	2764439	2764446	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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53095	NC_012582	C	6	6	2765350	2765355	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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53099	NC_012582	TTAAC	2	10	2765555	2765564	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
53100	NC_012582	TCC	2	6	2765570	2765575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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53109	NC_012582	ATC	2	6	2766147	2766152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53110	NC_012582	CA	3	6	2766163	2766168	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53111	NC_012582	GATT	2	8	2766169	2766176	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53112	NC_012582	T	6	6	2766264	2766269	0 %	100 %	0 %	0 %	227118936
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53116	NC_012582	TTTA	2	8	2766436	2766443	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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53122	NC_012582	TGG	2	6	2766765	2766770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227118937
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53126	NC_012582	TAT	2	6	2767043	2767048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227118937
53127	NC_012582	AGT	2	6	2767085	2767090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118937
53128	NC_012582	TTC	2	6	2767092	2767097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227118937
53129	NC_012582	TACG	2	8	2767121	2767128	25 %	25 %	25 %	25 %	227118937
53130	NC_012582	TTCT	2	8	2767193	2767200	0 %	75 %	0 %	25 %	227118937
53131	NC_012582	ATC	2	6	2767225	2767230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118937
53132	NC_012582	TGAC	2	8	2767238	2767245	25 %	25 %	25 %	25 %	227118937
53133	NC_012582	ATC	2	6	2767314	2767319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118937
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53138	NC_012582	GGCT	2	8	2767582	2767589	0 %	25 %	50 %	25 %	227118937
53139	NC_012582	ATCT	2	8	2767739	2767746	25 %	50 %	0 %	25 %	227118937
53140	NC_012582	AGA	2	6	2767808	2767813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53141	NC_012582	TAA	3	9	2767817	2767825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53142	NC_012582	GTT	2	6	2767851	2767856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53143	NC_012582	ATATGA	2	12	2767872	2767883	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53144	NC_012582	CTT	2	6	2767915	2767920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53145	NC_012582	GGAC	2	8	2767938	2767945	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53146	NC_012582	CGT	2	6	2767983	2767988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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53149	NC_012582	AAAAT	2	10	2768083	2768092	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53150	NC_012582	ATT	2	6	2768102	2768107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53151	NC_012582	CAC	2	6	2768109	2768114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53152	NC_012582	CT	3	6	2768137	2768142	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53153	NC_012582	AATGAT	2	12	2768193	2768204	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	227118938
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53155	NC_012582	TTTC	2	8	2768232	2768239	0 %	75 %	0 %	25 %	227118938
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53164	NC_012582	CT	3	6	2768383	2768388	0 %	50 %	0 %	50 %	227118938
53165	NC_012582	T	7	7	2768445	2768451	0 %	100 %	0 %	0 %	227118938
53166	NC_012582	CGG	2	6	2768469	2768474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227118938
53167	NC_012582	GC	3	6	2768490	2768495	0 %	0 %	50 %	50 %	227118938
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53171	NC_012582	TTTTGA	2	12	2768724	2768735	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53172	NC_012582	A	6	6	2768885	2768890	100 %	0 %	0 %	0 %	227118939
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53217	NC_012582	T	7	7	2770980	2770986	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53218	NC_012582	T	6	6	2771022	2771027	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53219	NC_012582	AAT	2	6	2771029	2771034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53220	NC_012582	CAGCG	2	10	2771184	2771193	20 %	0 %	40 %	40 %	227118941
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53232	NC_012582	TCG	2	6	2771768	2771773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118941
53233	NC_012582	CAC	2	6	2771798	2771803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118941
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53239	NC_012582	GATGA	2	10	2772006	2772015	40 %	20 %	40 %	0 %	227118941
53240	NC_012582	TG	3	6	2772025	2772030	0 %	50 %	50 %	0 %	227118941
53241	NC_012582	GCA	2	6	2772033	2772038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118941
53242	NC_012582	GT	3	6	2772097	2772102	0 %	50 %	50 %	0 %	227118941
53243	NC_012582	TGGC	2	8	2772103	2772110	0 %	25 %	50 %	25 %	227118941
53244	NC_012582	GCA	2	6	2772127	2772132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118941
53245	NC_012582	GAC	2	6	2772158	2772163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118941
53246	NC_012582	TG	3	6	2772220	2772225	0 %	50 %	50 %	0 %	227118941
53247	NC_012582	GT	3	6	2772293	2772298	0 %	50 %	50 %	0 %	227118941
53248	NC_012582	CATCA	2	10	2772312	2772321	40 %	20 %	0 %	40 %	227118941
53249	NC_012582	AGC	2	6	2772427	2772432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118941
53250	NC_012582	TGG	2	6	2772464	2772469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227118941
53251	NC_012582	GTC	2	6	2772592	2772597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118941
53252	NC_012582	ACT	2	6	2772605	2772610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118941
53253	NC_012582	GTG	2	6	2772717	2772722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53254	NC_012582	AGC	2	6	2772891	2772896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118942
53255	NC_012582	GGT	2	6	2773078	2773083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227118942
53256	NC_012582	AGC	2	6	2773113	2773118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118942
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53258	NC_012582	CT	3	6	2773214	2773219	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53259	NC_012582	CAT	2	6	2773393	2773398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118943
53260	NC_012582	TGG	2	6	2773548	2773553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227118943
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53264	NC_012582	GATG	2	8	2773717	2773724	25 %	25 %	50 %	0 %	227118943
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53271	NC_012582	TG	3	6	2774108	2774113	0 %	50 %	50 %	0 %	227118943
53272	NC_012582	GAT	2	6	2774173	2774178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118943
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53302	NC_012582	TGGT	2	8	2775897	2775904	0 %	50 %	50 %	0 %	227118943
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53309	NC_012582	GAT	2	6	2776212	2776217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53310	NC_012582	GAC	2	6	2776228	2776233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118944
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53314	NC_012582	CAG	2	6	2776336	2776341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118944
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53329	NC_012582	AGT	2	6	2777185	2777190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118944
53330	NC_012582	AAT	2	6	2777235	2777240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53331	NC_012582	TGC	2	6	2777294	2777299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118945
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53345	NC_012582	A	6	6	2777999	2778004	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53346	NC_012582	TA	3	6	2778013	2778018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53347	NC_012582	TCA	2	6	2778073	2778078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118946
53348	NC_012582	TG	3	6	2778081	2778086	0 %	50 %	50 %	0 %	227118946
53349	NC_012582	CCA	2	6	2778087	2778092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118946
53350	NC_012582	CTGCGC	2	12	2778121	2778132	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	227118946
53351	NC_012582	TGC	2	6	2778158	2778163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118946
53352	NC_012582	TCA	2	6	2778182	2778187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118946
53353	NC_012582	CTG	2	6	2778247	2778252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118946
53354	NC_012582	CCG	2	6	2778300	2778305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227118946
53355	NC_012582	GCTGA	2	10	2778385	2778394	20 %	20 %	40 %	20 %	227118946
53356	NC_012582	AG	3	6	2778424	2778429	50 %	0 %	50 %	0 %	227118946
53357	NC_012582	CG	3	6	2778438	2778443	0 %	0 %	50 %	50 %	227118946
53358	NC_012582	CATC	2	8	2778444	2778451	25 %	25 %	0 %	50 %	227118946
53359	NC_012582	AAG	2	6	2778476	2778481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227118946
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53361	NC_012582	TCA	2	6	2778606	2778611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118946
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53420	NC_012582	AG	3	6	2781282	2781287	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53421	NC_012582	GCA	2	6	2781303	2781308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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53425	NC_012582	GAA	2	6	2781620	2781625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227118947
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53476	NC_012582	CA	3	6	2785474	2785479	50 %	0 %	0 %	50 %	227118951
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53479	NC_012582	TACC	2	8	2785637	2785644	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
53480	NC_012582	AAGA	2	8	2785693	2785700	75 %	0 %	25 %	0 %	227118952
53481	NC_012582	TGA	2	6	2785984	2785989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118952
53482	NC_012582	ATCGAA	2	12	2786057	2786068	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	227118952
53483	NC_012582	CTTT	2	8	2786137	2786144	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
53484	NC_012582	TCAGC	2	10	2786184	2786193	20 %	20 %	20 %	40 %	227118953
53485	NC_012582	TCA	2	6	2786226	2786231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118953
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53494	NC_012582	CGC	2	6	2786767	2786772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227118953
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53499	NC_012582	ATGA	2	8	2786958	2786965	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53500	NC_012582	GATA	2	8	2787054	2787061	50 %	25 %	25 %	0 %	227118954

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