MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome I

Total Repeats: 57925

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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52002	NC_012582	ATCGA	2	10	2705056	2705065	40 %	20 %	20 %	20 %	227118883
52003	NC_012582	TGGG	2	8	2705110	2705117	0 %	25 %	75 %	0 %	227118883
52004	NC_012582	AGCGC	2	10	2705133	2705142	20 %	0 %	40 %	40 %	227118883
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52008	NC_012582	ATTGGT	2	12	2705393	2705404	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	227118884
52009	NC_012582	CAATG	2	10	2705419	2705428	40 %	20 %	20 %	20 %	227118884
52010	NC_012582	ATT	3	9	2705471	2705479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227118884
52011	NC_012582	GAT	2	6	2705482	2705487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118884
52012	NC_012582	CTTA	2	8	2705505	2705512	25 %	50 %	0 %	25 %	227118884
52013	NC_012582	GGT	2	6	2705516	2705521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227118884
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52015	NC_012582	ATG	2	6	2705600	2705605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118884
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52118	NC_012582	GC	3	6	2710319	2710324	0 %	0 %	50 %	50 %	227118888
52119	NC_012582	GCA	2	6	2710411	2710416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118888
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52122	NC_012582	CGA	2	6	2710461	2710466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118888
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52132	NC_012582	TGT	2	6	2710925	2710930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227118888
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52138	NC_012582	CTT	2	6	2711235	2711240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227118889
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52187	NC_012582	GGACG	2	10	2714279	2714288	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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52207	NC_012582	AACAT	2	10	2715444	2715453	60 %	20 %	0 %	20 %	227118893
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52221	NC_012582	GC	4	8	2716182	2716189	0 %	0 %	50 %	50 %	227118893
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52227	NC_012582	TCT	2	6	2716531	2716536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227118893
52228	NC_012582	TGC	2	6	2716553	2716558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118893
52229	NC_012582	CTG	2	6	2716560	2716565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118893
52230	NC_012582	GGATCT	2	12	2716630	2716641	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	227118893
52231	NC_012582	ATC	2	6	2716718	2716723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118893
52232	NC_012582	AAT	2	6	2716799	2716804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227118893
52233	NC_012582	CCGCA	2	10	2716805	2716814	20 %	0 %	20 %	60 %	227118893
52234	NC_012582	TCA	2	6	2716830	2716835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118893
52235	NC_012582	TCT	2	6	2716849	2716854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227118893
52236	NC_012582	CACG	2	8	2716969	2716976	25 %	0 %	25 %	50 %	227118893
52237	NC_012582	GTT	2	6	2717023	2717028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227118893
52238	NC_012582	TTCAC	2	10	2717154	2717163	20 %	40 %	0 %	40 %	227118893
52239	NC_012582	CAC	2	6	2717195	2717200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118893
52240	NC_012582	ATC	2	6	2717210	2717215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118893
52241	NC_012582	CATG	2	8	2717272	2717279	25 %	25 %	25 %	25 %	227118893
52242	NC_012582	CGC	2	6	2717300	2717305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227118893
52243	NC_012582	CAC	2	6	2717380	2717385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118893
52244	NC_012582	TGG	2	6	2717386	2717391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227118893
52245	NC_012582	GCC	2	6	2717409	2717414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227118893
52246	NC_012582	AGC	2	6	2717478	2717483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118893
52247	NC_012582	GGCT	2	8	2717572	2717579	0 %	25 %	50 %	25 %	227118893
52248	NC_012582	TAA	2	6	2717653	2717658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52249	NC_012582	CAAA	2	8	2717719	2717726	75 %	0 %	0 %	25 %	227118894
52250	NC_012582	ACACG	2	10	2717840	2717849	40 %	0 %	20 %	40 %	227118894
52251	NC_012582	AG	3	6	2717876	2717881	50 %	0 %	50 %	0 %	227118894
52252	NC_012582	CTGCGC	2	12	2717899	2717910	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	227118894
52253	NC_012582	CTG	2	6	2717942	2717947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118894
52254	NC_012582	ATT	2	6	2718002	2718007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227118894
52255	NC_012582	TCA	2	6	2718051	2718056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118894
52256	NC_012582	CAC	2	6	2718071	2718076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118894
52257	NC_012582	CGCTTG	2	12	2718077	2718088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118894
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52263	NC_012582	GC	3	6	2718376	2718381	0 %	0 %	50 %	50 %	227118894
52264	NC_012582	GCA	2	6	2718391	2718396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118894
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52269	NC_012582	ATC	2	6	2718635	2718640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118894
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52271	NC_012582	TGC	2	6	2718708	2718713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118894
52272	NC_012582	ACC	2	6	2718758	2718763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118894
52273	NC_012582	CG	4	8	2718835	2718842	0 %	0 %	50 %	50 %	227118894
52274	NC_012582	CAA	2	6	2718901	2718906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227118894
52275	NC_012582	GTGCT	2	10	2718993	2719002	0 %	40 %	40 %	20 %	227118894
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52277	NC_012582	CCACA	2	10	2719175	2719184	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
52278	NC_012582	AAT	2	6	2719195	2719200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227118895
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52280	NC_012582	ATT	2	6	2719259	2719264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227118895
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52288	NC_012582	TCAC	2	8	2719809	2719816	25 %	25 %	0 %	50 %	227118895
52289	NC_012582	TCG	2	6	2719840	2719845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118895
52290	NC_012582	A	6	6	2719901	2719906	100 %	0 %	0 %	0 %	227118895
52291	NC_012582	GCA	2	6	2719954	2719959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118895
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52293	NC_012582	AAG	2	6	2720052	2720057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227118895
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52300	NC_012582	GTG	2	6	2720396	2720401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227118895
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52304	NC_012582	CTG	2	6	2720810	2720815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118895
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52320	NC_012582	ATT	2	6	2721723	2721728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227118895
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52322	NC_012582	CTG	2	6	2721791	2721796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118895
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52334	NC_012582	T	6	6	2722490	2722495	0 %	100 %	0 %	0 %	227118896
52335	NC_012582	TAG	2	6	2722532	2722537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118896
52336	NC_012582	GCA	2	6	2722578	2722583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118896
52337	NC_012582	ACCAA	2	10	2722628	2722637	60 %	0 %	0 %	40 %	227118896
52338	NC_012582	TCT	2	6	2722652	2722657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227118896
52339	NC_012582	GCG	2	6	2722741	2722746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227118896
52340	NC_012582	TGA	2	6	2722844	2722849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118896
52341	NC_012582	ATC	2	6	2722859	2722864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118896
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52343	NC_012582	TGG	2	6	2722956	2722961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227118896
52344	NC_012582	AGC	3	9	2723021	2723029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118896
52345	NC_012582	CATC	2	8	2723031	2723038	25 %	25 %	0 %	50 %	227118896
52346	NC_012582	ATT	2	6	2723059	2723064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227118896
52347	NC_012582	GCC	2	6	2723081	2723086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227118896
52348	NC_012582	TGC	2	6	2723132	2723137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118896
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52350	NC_012582	CA	3	6	2723199	2723204	50 %	0 %	0 %	50 %	227118896
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52467	NC_012582	TGGC	2	8	2730412	2730419	0 %	25 %	50 %	25 %	227118905
52468	NC_012582	TTG	2	6	2730453	2730458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227118905
52469	NC_012582	GTG	2	6	2730492	2730497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227118905
52470	NC_012582	GAT	2	6	2730536	2730541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118905
52471	NC_012582	GCA	2	6	2730550	2730555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118905
52472	NC_012582	TCA	2	6	2730672	2730677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118905
52473	NC_012582	TTC	2	6	2730753	2730758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227118905
52474	NC_012582	ATG	2	6	2730792	2730797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118905
52475	NC_012582	CA	3	6	2730808	2730813	50 %	0 %	0 %	50 %	227118905
52476	NC_012582	TCA	2	6	2730910	2730915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118905
52477	NC_012582	TTC	2	6	2730933	2730938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227118905
52478	NC_012582	AGT	2	6	2730979	2730984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118905
52479	NC_012582	GAT	2	6	2731001	2731006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118905
52480	NC_012582	CGA	2	6	2731135	2731140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118905
52481	NC_012582	GCC	2	6	2731176	2731181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227118905
52482	NC_012582	CCA	3	9	2731282	2731290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118905
52483	NC_012582	CGC	2	6	2731307	2731312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227118905
52484	NC_012582	GCC	2	6	2731499	2731504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227118905
52485	NC_012582	ATA	2	6	2731614	2731619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52486	NC_012582	GGC	2	6	2731641	2731646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52487	NC_012582	ATTC	2	8	2731648	2731655	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
52488	NC_012582	CAT	2	6	2731692	2731697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52489	NC_012582	TGC	2	6	2731741	2731746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118906
52490	NC_012582	GCAGT	2	10	2731811	2731820	20 %	20 %	40 %	20 %	227118906
52491	NC_012582	GCCA	2	8	2731858	2731865	25 %	0 %	25 %	50 %	227118906
52492	NC_012582	CAT	2	6	2731890	2731895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118906
52493	NC_012582	TAA	2	6	2731908	2731913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227118906
52494	NC_012582	GCC	2	6	2731924	2731929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227118906
52495	NC_012582	GCA	2	6	2731934	2731939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118906
52496	NC_012582	ACC	2	6	2731966	2731971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118906
52497	NC_012582	TG	3	6	2731990	2731995	0 %	50 %	50 %	0 %	227118906
52498	NC_012582	CTG	2	6	2732077	2732082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118906
52499	NC_012582	TTG	2	6	2732124	2732129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227118906
52500	NC_012582	TCA	2	6	2732165	2732170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118906

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