MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome I

Total Repeats: 57925

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
51501	NC_012582	ATCA	2	8	2680357	2680364	50 %	25 %	0 %	25 %	227118863
51502	NC_012582	GGC	2	6	2680441	2680446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51503	NC_012582	AAGT	2	8	2680447	2680454	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51504	NC_012582	GAAC	2	8	2680489	2680496	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
51505	NC_012582	GCCA	2	8	2680598	2680605	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
51506	NC_012582	GGTTT	2	10	2680618	2680627	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
51507	NC_012582	CTGC	2	8	2680712	2680719	0 %	25 %	25 %	50 %	227118864
51508	NC_012582	GGC	2	6	2680763	2680768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227118864
51509	NC_012582	CAT	2	6	2680834	2680839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118864
51510	NC_012582	CGG	2	6	2680900	2680905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227118864
51511	NC_012582	CCAA	2	8	2680953	2680960	50 %	0 %	0 %	50 %	227118864
51512	NC_012582	GCGCA	2	10	2681131	2681140	20 %	0 %	40 %	40 %	227118864
51513	NC_012582	GGC	2	6	2681162	2681167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227118864
51514	NC_012582	ACC	2	6	2681175	2681180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118864
51515	NC_012582	ATT	2	6	2681222	2681227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227118864
51516	NC_012582	GTGGAA	2	12	2681288	2681299	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	227118864
51517	NC_012582	CAT	2	6	2681347	2681352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118864
51518	NC_012582	GAT	2	6	2681377	2681382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118864
51519	NC_012582	GCG	2	6	2681414	2681419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227118864
51520	NC_012582	TCGG	2	8	2681489	2681496	0 %	25 %	50 %	25 %	227118864
51521	NC_012582	AGG	2	6	2681589	2681594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51522	NC_012582	CCT	2	6	2681602	2681607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51523	NC_012582	T	6	6	2681661	2681666	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51524	NC_012582	TCA	2	6	2681671	2681676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51525	NC_012582	ACTC	2	8	2681702	2681709	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
51526	NC_012582	C	6	6	2681732	2681737	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
51527	NC_012582	GGA	2	6	2681786	2681791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227118865
51528	NC_012582	ACAA	2	8	2681812	2681819	75 %	0 %	0 %	25 %	227118865
51529	NC_012582	AATTG	2	10	2681837	2681846	40 %	40 %	20 %	0 %	227118865
51530	NC_012582	TGG	2	6	2681854	2681859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227118865
51531	NC_012582	GT	3	6	2681869	2681874	0 %	50 %	50 %	0 %	227118865
51532	NC_012582	A	7	7	2681912	2681918	100 %	0 %	0 %	0 %	227118865
51533	NC_012582	CAA	2	6	2682004	2682009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227118865
51534	NC_012582	AGG	2	6	2682104	2682109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227118865
51535	NC_012582	GTA	2	6	2682138	2682143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118865
51536	NC_012582	GTA	2	6	2682193	2682198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118865
51537	NC_012582	CAA	2	6	2682244	2682249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227118865
51538	NC_012582	TTG	2	6	2682270	2682275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227118866
51539	NC_012582	GGT	2	6	2682322	2682327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227118866
51540	NC_012582	GCT	2	6	2682367	2682372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118866
51541	NC_012582	AAC	2	6	2682408	2682413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227118866
51542	NC_012582	CAAG	2	8	2682529	2682536	50 %	0 %	25 %	25 %	227118866
51543	NC_012582	TGC	2	6	2682546	2682551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118866
51544	NC_012582	GAA	3	9	2682584	2682592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227118866
51545	NC_012582	ACTGGC	2	12	2682622	2682633	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	227118866
51546	NC_012582	CG	3	6	2682641	2682646	0 %	0 %	50 %	50 %	227118866
51547	NC_012582	CCAA	2	8	2682696	2682703	50 %	0 %	0 %	50 %	227118866
51548	NC_012582	GAC	2	6	2682752	2682757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118866
51549	NC_012582	TGC	2	6	2682822	2682827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118866
51550	NC_012582	CTGCG	2	10	2682896	2682905	0 %	20 %	40 %	40 %	227118866
51551	NC_012582	GCC	2	6	2682948	2682953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227118866
51552	NC_012582	TC	3	6	2682976	2682981	0 %	50 %	0 %	50 %	227118866
51553	NC_012582	A	6	6	2683095	2683100	100 %	0 %	0 %	0 %	227118866
51554	NC_012582	TGC	2	6	2683104	2683109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118866
51555	NC_012582	AGC	2	6	2683121	2683126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118866
51556	NC_012582	GCC	2	6	2683127	2683132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227118866
51557	NC_012582	GCA	2	6	2683165	2683170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118866
51558	NC_012582	CT	3	6	2683331	2683336	0 %	50 %	0 %	50 %	227118866
51559	NC_012582	CAAGTG	2	12	2683346	2683357	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	227118866
51560	NC_012582	GGCTTT	2	12	2683370	2683381	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	227118866
51561	NC_012582	CTCA	2	8	2683582	2683589	25 %	25 %	0 %	50 %	227118866
51562	NC_012582	ATC	2	6	2683595	2683600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118866
51563	NC_012582	CG	3	6	2683612	2683617	0 %	0 %	50 %	50 %	227118866
51564	NC_012582	GCG	2	6	2683715	2683720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227118866
51565	NC_012582	GGC	2	6	2683739	2683744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227118866
51566	NC_012582	TCA	2	6	2683825	2683830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118866
51567	NC_012582	AGCCAA	2	12	2683843	2683854	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	227118866
51568	NC_012582	TAACC	2	10	2683959	2683968	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
51569	NC_012582	A	6	6	2684051	2684056	100 %	0 %	0 %	0 %	227118867
51570	NC_012582	A	6	6	2684129	2684134	100 %	0 %	0 %	0 %	227118867
51571	NC_012582	A	6	6	2684138	2684143	100 %	0 %	0 %	0 %	227118867
51572	NC_012582	CAC	2	6	2684230	2684235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118867
51573	NC_012582	TGG	2	6	2684265	2684270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227118867
51574	NC_012582	GA	3	6	2684412	2684417	50 %	0 %	50 %	0 %	227118867
51575	NC_012582	CTTA	2	8	2684547	2684554	25 %	50 %	0 %	25 %	227118867
51576	NC_012582	GCA	2	6	2684626	2684631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118867
51577	NC_012582	GCA	2	6	2684690	2684695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118867
51578	NC_012582	ATT	2	6	2684777	2684782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227118867
51579	NC_012582	CCA	2	6	2684832	2684837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118867
51580	NC_012582	TGC	2	6	2685000	2685005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118867
51581	NC_012582	TGA	2	6	2685012	2685017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118867
51582	NC_012582	GAC	2	6	2685041	2685046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118867
51583	NC_012582	CAA	2	6	2685052	2685057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227118867
51584	NC_012582	ATC	2	6	2685128	2685133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118867
51585	NC_012582	TCTT	2	8	2685135	2685142	0 %	75 %	0 %	25 %	227118867
51586	NC_012582	GGC	2	6	2685155	2685160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227118867
51587	NC_012582	GTG	2	6	2685164	2685169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227118867
51588	NC_012582	GC	3	6	2685242	2685247	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51589	NC_012582	GC	3	6	2685394	2685399	0 %	0 %	50 %	50 %	227118868
51590	NC_012582	GCG	2	6	2685407	2685412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227118868
51591	NC_012582	CCA	2	6	2685437	2685442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118868
51592	NC_012582	ATA	2	6	2685513	2685518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227118868
51593	NC_012582	TTGA	2	8	2685593	2685600	25 %	50 %	25 %	0 %	227118868
51594	NC_012582	CACT	2	8	2685634	2685641	25 %	25 %	0 %	50 %	227118868
51595	NC_012582	GCT	2	6	2685667	2685672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118868
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51597	NC_012582	GCACTG	2	12	2685770	2685781	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	227118868
51598	NC_012582	TC	3	6	2685838	2685843	0 %	50 %	0 %	50 %	227118868
51599	NC_012582	CTG	2	6	2685872	2685877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118868
51600	NC_012582	AAG	2	6	2685885	2685890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227118868
51601	NC_012582	CGC	2	6	2685919	2685924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227118868
51602	NC_012582	GCA	2	6	2685946	2685951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118868
51603	NC_012582	GGT	2	6	2685979	2685984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227118868
51604	NC_012582	CAG	2	6	2686016	2686021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118868
51605	NC_012582	A	6	6	2686022	2686027	100 %	0 %	0 %	0 %	227118868
51606	NC_012582	ATTG	2	8	2686106	2686113	25 %	50 %	25 %	0 %	227118868
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51608	NC_012582	CGG	2	6	2686167	2686172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227118869
51609	NC_012582	ACGTG	2	10	2686254	2686263	20 %	20 %	40 %	20 %	227118869
51610	NC_012582	TGC	2	6	2686296	2686301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118869
51611	NC_012582	CTCA	2	8	2686335	2686342	25 %	25 %	0 %	50 %	227118869
51612	NC_012582	CGCGC	2	10	2686345	2686354	0 %	0 %	40 %	60 %	227118869
51613	NC_012582	GCC	2	6	2686372	2686377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227118869
51614	NC_012582	CTG	2	6	2686405	2686410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118869
51615	NC_012582	GAT	2	6	2686416	2686421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118869
51616	NC_012582	A	6	6	2686547	2686552	100 %	0 %	0 %	0 %	227118869
51617	NC_012582	TGC	2	6	2686614	2686619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118869
51618	NC_012582	TGA	2	6	2686653	2686658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118869
51619	NC_012582	A	6	6	2686818	2686823	100 %	0 %	0 %	0 %	227118870
51620	NC_012582	GCT	2	6	2686849	2686854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118870
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51623	NC_012582	TGA	2	6	2687085	2687090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118870
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51653	NC_012582	TGCT	2	8	2688554	2688561	0 %	50 %	25 %	25 %	227118872
51654	NC_012582	TG	3	6	2688582	2688587	0 %	50 %	50 %	0 %	227118872
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51727	NC_012582	CAAG	2	8	2692231	2692238	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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51733	NC_012582	ATCA	2	8	2692405	2692412	50 %	25 %	0 %	25 %	227118874
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51970	NC_012582	TCA	2	6	2702606	2702611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51971	NC_012582	GCAT	2	8	2702679	2702686	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51972	NC_012582	AAAAG	2	10	2702720	2702729	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
51973	NC_012582	TTAT	2	8	2702747	2702754	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51974	NC_012582	CCA	2	6	2702906	2702911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118882
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51982	NC_012582	ATG	2	6	2703475	2703480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118882
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51989	NC_012582	ACG	2	6	2704119	2704124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118882
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51993	NC_012582	AG	3	6	2704352	2704357	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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51998	NC_012582	AGAA	2	8	2704673	2704680	75 %	0 %	25 %	0 %	227118883
51999	NC_012582	ACT	2	6	2704761	2704766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118883
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