MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome I

Total Repeats: 57925

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_012582	TGG	2	6	233122	233127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116591
4502	NC_012582	ATG	2	6	233168	233173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116591
4503	NC_012582	CTG	2	6	233188	233193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116591
4504	NC_012582	GC	3	6	233232	233237	0 %	0 %	50 %	50 %	227116591
4505	NC_012582	GC	3	6	233371	233376	0 %	0 %	50 %	50 %	227116591
4506	NC_012582	CA	3	6	233485	233490	50 %	0 %	0 %	50 %	227116591
4507	NC_012582	GAGC	2	8	233533	233540	25 %	0 %	50 %	25 %	227116591
4508	NC_012582	GAT	2	6	233576	233581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116591
4509	NC_012582	GGC	2	6	233645	233650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227116591
4510	NC_012582	TGG	2	6	233719	233724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116591
4511	NC_012582	TCT	2	6	233751	233756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116591
4512	NC_012582	CGAGG	2	10	233770	233779	20 %	0 %	60 %	20 %	227116591
4513	NC_012582	TCAA	2	8	233820	233827	50 %	25 %	0 %	25 %	227116591
4514	NC_012582	GC	3	6	233828	233833	0 %	0 %	50 %	50 %	227116591
4515	NC_012582	CAG	2	6	233870	233875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116591
4516	NC_012582	CCG	2	6	233907	233912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227116591
4517	NC_012582	T	6	6	234017	234022	0 %	100 %	0 %	0 %	227116591
4518	NC_012582	GAT	2	6	234066	234071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116591
4519	NC_012582	GTC	2	6	234102	234107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116591
4520	NC_012582	TCGC	2	8	234159	234166	0 %	25 %	25 %	50 %	227116591
4521	NC_012582	GCC	2	6	234177	234182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227116591
4522	NC_012582	GTT	2	6	234354	234359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_012582	TTG	2	6	234406	234411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_012582	GAT	2	6	234420	234425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4525	NC_012582	GCA	2	6	234430	234435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4526	NC_012582	GCG	2	6	234527	234532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227116592
4527	NC_012582	AT	3	6	234665	234670	50 %	50 %	0 %	0 %	227116592
4528	NC_012582	A	7	7	234673	234679	100 %	0 %	0 %	0 %	227116592
4529	NC_012582	ACG	2	6	234743	234748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116592
4530	NC_012582	GGC	3	9	234835	234843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227116592
4531	NC_012582	GCA	2	6	234846	234851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116592
4532	NC_012582	TGG	2	6	234930	234935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116592
4533	NC_012582	AGC	2	6	235061	235066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116592
4534	NC_012582	GTA	2	6	235087	235092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116592
4535	NC_012582	TTGA	2	8	235124	235131	25 %	50 %	25 %	0 %	227116592
4536	NC_012582	C	6	6	235154	235159	0 %	0 %	0 %	100 %	227116592
4537	NC_012582	CAG	2	6	235180	235185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116592
4538	NC_012582	GT	3	6	235202	235207	0 %	50 %	50 %	0 %	227116592
4539	NC_012582	ACG	2	6	235217	235222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116592
4540	NC_012582	ACG	2	6	235231	235236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116592
4541	NC_012582	ACCAC	2	10	235272	235281	40 %	0 %	0 %	60 %	227116592
4542	NC_012582	AAAT	2	8	235328	235335	75 %	25 %	0 %	0 %	227116592
4543	NC_012582	T	6	6	235384	235389	0 %	100 %	0 %	0 %	227116592
4544	NC_012582	TTG	2	6	235396	235401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116592
4545	NC_012582	AAC	2	6	235415	235420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116592
4546	NC_012582	TGA	2	6	235435	235440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4547	NC_012582	GGC	2	6	235448	235453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4548	NC_012582	AGC	2	6	235457	235462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4549	NC_012582	TTG	2	6	235540	235545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_012582	TCT	2	6	235604	235609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116593
4551	NC_012582	CT	3	6	235611	235616	0 %	50 %	0 %	50 %	227116593
4552	NC_012582	GGC	2	6	235693	235698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227116593
4553	NC_012582	GCTG	2	8	235699	235706	0 %	25 %	50 %	25 %	227116593
4554	NC_012582	GGT	2	6	235739	235744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116593
4555	NC_012582	TGA	2	6	235818	235823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116593
4556	NC_012582	CGC	2	6	235858	235863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227116593
4557	NC_012582	GT	3	6	235867	235872	0 %	50 %	50 %	0 %	227116593
4558	NC_012582	GC	3	6	235886	235891	0 %	0 %	50 %	50 %	227116593
4559	NC_012582	GCAT	2	8	235917	235924	25 %	25 %	25 %	25 %	227116593
4560	NC_012582	GCT	2	6	235939	235944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116593
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4562	NC_012582	AGC	2	6	236094	236099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116593
4563	NC_012582	TGG	2	6	236238	236243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116593
4564	NC_012582	CAT	2	6	236305	236310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116593
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4566	NC_012582	CGC	2	6	236374	236379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227116593
4567	NC_012582	TGA	2	6	236440	236445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116593
4568	NC_012582	TGG	2	6	236457	236462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116593
4569	NC_012582	TAA	2	6	236488	236493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227116593
4570	NC_012582	CTA	2	6	236545	236550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116593
4571	NC_012582	GCCT	2	8	236580	236587	0 %	25 %	25 %	50 %	227116593
4572	NC_012582	ATG	2	6	236597	236602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116593
4573	NC_012582	CTG	2	6	236613	236618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116593
4574	NC_012582	GC	3	6	236661	236666	0 %	0 %	50 %	50 %	227116593
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4578	NC_012582	TGG	2	6	236892	236897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116593
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4581	NC_012582	ACTG	2	8	237067	237074	25 %	25 %	25 %	25 %	227116593
4582	NC_012582	AAG	2	6	237075	237080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227116593
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4585	NC_012582	ATCG	2	8	237223	237230	25 %	25 %	25 %	25 %	227116593
4586	NC_012582	TGA	3	9	237232	237240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116593
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4588	NC_012582	TTGA	2	8	237278	237285	25 %	50 %	25 %	0 %	227116593
4589	NC_012582	GC	3	6	237461	237466	0 %	0 %	50 %	50 %	227116594
4590	NC_012582	ACTT	2	8	237517	237524	25 %	50 %	0 %	25 %	227116594
4591	NC_012582	TGC	3	9	237598	237606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116594
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4593	NC_012582	GAG	2	6	237666	237671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227116594
4594	NC_012582	GTT	2	6	237724	237729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4595	NC_012582	CG	3	6	237734	237739	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4596	NC_012582	GGA	2	6	237865	237870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227116595
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4599	NC_012582	CTG	2	6	237980	237985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116595
4600	NC_012582	GCTG	2	8	238018	238025	0 %	25 %	50 %	25 %	227116595
4601	NC_012582	CCA	2	6	238096	238101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227116595
4602	NC_012582	T	6	6	238157	238162	0 %	100 %	0 %	0 %	227116595
4603	NC_012582	TC	3	6	238164	238169	0 %	50 %	0 %	50 %	227116595
4604	NC_012582	CCG	2	6	238295	238300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227116596
4605	NC_012582	AGT	2	6	238343	238348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116596
4606	NC_012582	CATC	2	8	238383	238390	25 %	25 %	0 %	50 %	227116596
4607	NC_012582	GCAATC	2	12	238433	238444	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	227116596
4608	NC_012582	TGCC	2	8	238452	238459	0 %	25 %	25 %	50 %	227116596
4609	NC_012582	GCC	2	6	238588	238593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227116596
4610	NC_012582	CAT	2	6	238626	238631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116596
4611	NC_012582	TGAA	2	8	238664	238671	50 %	25 %	25 %	0 %	227116596
4612	NC_012582	CTT	2	6	238698	238703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116596
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4616	NC_012582	AATTTG	2	12	238846	238857	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	227116596
4617	NC_012582	CAT	2	6	238869	238874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116596
4618	NC_012582	GCA	2	6	238881	238886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116596
4619	NC_012582	T	6	6	238983	238988	0 %	100 %	0 %	0 %	227116596
4620	NC_012582	GC	3	6	238989	238994	0 %	0 %	50 %	50 %	227116596
4621	NC_012582	AGCTC	2	10	239019	239028	20 %	20 %	20 %	40 %	227116596
4622	NC_012582	GA	3	6	239246	239251	50 %	0 %	50 %	0 %	227116596
4623	NC_012582	GCA	2	6	239252	239257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116596
4624	NC_012582	GT	3	6	239336	239341	0 %	50 %	50 %	0 %	227116596
4625	NC_012582	GGT	2	6	239371	239376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116596
4626	NC_012582	GGT	2	6	239407	239412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116596
4627	NC_012582	CAA	2	6	239430	239435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116596
4628	NC_012582	AGA	2	6	239523	239528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227116596
4629	NC_012582	CAC	2	6	239548	239553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227116596
4630	NC_012582	ATC	2	6	239576	239581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116596
4631	NC_012582	GAA	2	6	239707	239712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227116596
4632	NC_012582	TTTG	2	8	239721	239728	0 %	75 %	25 %	0 %	227116596
4633	NC_012582	GCA	2	6	239790	239795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116596
4634	NC_012582	TACCAG	2	12	239830	239841	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	227116596
4635	NC_012582	GCC	2	6	239843	239848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227116596
4636	NC_012582	TGG	2	6	239885	239890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116596
4637	NC_012582	CAA	2	6	239913	239918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116596
4638	NC_012582	GTA	2	6	240013	240018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116596
4639	NC_012582	T	6	6	240148	240153	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4640	NC_012582	TTAA	2	8	240158	240165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4641	NC_012582	TAA	2	6	240200	240205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227116597
4642	NC_012582	TCG	2	6	240278	240283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116597
4643	NC_012582	TGT	2	6	240308	240313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116597
4644	NC_012582	ACCA	2	8	240345	240352	50 %	0 %	0 %	50 %	227116597
4645	NC_012582	GTG	2	6	240378	240383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116597
4646	NC_012582	AAG	2	6	240451	240456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227116597
4647	NC_012582	CG	3	6	240468	240473	0 %	0 %	50 %	50 %	227116597
4648	NC_012582	GCGCT	2	10	240492	240501	0 %	20 %	40 %	40 %	227116597
4649	NC_012582	GCC	2	6	240598	240603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227116597
4650	NC_012582	TAC	2	6	240618	240623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116597
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4652	NC_012582	ACCG	2	8	240737	240744	25 %	0 %	25 %	50 %	227116597
4653	NC_012582	ATG	2	6	240781	240786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116597
4654	NC_012582	ACCTTA	2	12	240795	240806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116597
4655	NC_012582	TGA	2	6	240862	240867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116597
4656	NC_012582	ATG	2	6	240874	240879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116597
4657	NC_012582	GCG	2	6	241017	241022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227116597
4658	NC_012582	CGT	2	6	241101	241106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116597
4659	NC_012582	ATG	2	6	241144	241149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116597
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4661	NC_012582	ATG	2	6	241222	241227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116597
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4667	NC_012582	CCAG	2	8	241793	241800	25 %	0 %	25 %	50 %	227116597
4668	NC_012582	ATG	2	6	241807	241812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116597
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4671	NC_012582	CAA	2	6	242019	242024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116597
4672	NC_012582	GCG	2	6	242073	242078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227116597
4673	NC_012582	TCAACA	2	12	242233	242244	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	227116597
4674	NC_012582	TAC	2	6	242289	242294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116597
4675	NC_012582	TTG	2	6	242347	242352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4676	NC_012582	GAT	2	6	242393	242398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116598
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4679	NC_012582	CGAT	2	8	242522	242529	25 %	25 %	25 %	25 %	227116598
4680	NC_012582	CGTG	2	8	242742	242749	0 %	25 %	50 %	25 %	227116598
4681	NC_012582	A	6	6	242837	242842	100 %	0 %	0 %	0 %	227116598
4682	NC_012582	CGG	2	6	242886	242891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227116598
4683	NC_012582	TGC	2	6	242918	242923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116598
4684	NC_012582	GCA	2	6	242928	242933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116598
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4689	NC_012582	TTG	2	6	243139	243144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116598
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4709	NC_012582	TG	3	6	244118	244123	0 %	50 %	50 %	0 %	227116599
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4733	NC_012582	GAGT	2	8	245323	245330	25 %	25 %	50 %	0 %	227116600
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4745	NC_012582	GAT	2	6	245971	245976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116600
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4833	NC_012582	AG	3	6	250058	250063	50 %	0 %	50 %	0 %	227116605
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4839	NC_012582	TC	3	6	250329	250334	0 %	50 %	0 %	50 %	227116606
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4852	NC_012582	CTT	2	6	251137	251142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116606
4853	NC_012582	TGCG	2	8	251143	251150	0 %	25 %	50 %	25 %	227116606
4854	NC_012582	ATC	2	6	251169	251174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116606
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4861	NC_012582	TGG	2	6	251638	251643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116607
4862	NC_012582	TGTGA	2	10	251682	251691	20 %	40 %	40 %	0 %	227116607
4863	NC_012582	TGG	2	6	251702	251707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116607
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4865	NC_012582	TGTGC	2	10	251846	251855	0 %	40 %	40 %	20 %	227116607
4866	NC_012582	GAA	2	6	251913	251918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227116607
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4868	NC_012582	GCTG	2	8	251987	251994	0 %	25 %	50 %	25 %	227116607
4869	NC_012582	A	6	6	252000	252005	100 %	0 %	0 %	0 %	227116607
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4872	NC_012582	T	7	7	252079	252085	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4874	NC_012582	TTG	2	6	252240	252245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4875	NC_012582	AGGGG	2	10	252276	252285	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
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4989	NC_012582	GTG	2	6	258625	258630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116613
4990	NC_012582	AG	3	6	258662	258667	50 %	0 %	50 %	0 %	227116613
4991	NC_012582	AGC	2	6	258736	258741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116613
4992	NC_012582	AGA	2	6	258755	258760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227116613
4993	NC_012582	CAG	2	6	258786	258791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116613
4994	NC_012582	ACA	2	6	258860	258865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116613
4995	NC_012582	TTGG	2	8	258876	258883	0 %	50 %	50 %	0 %	227116613
4996	NC_012582	ATTGC	2	10	258911	258920	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4997	NC_012582	TTA	2	6	258942	258947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4998	NC_012582	CG	3	6	259045	259050	0 %	0 %	50 %	50 %	227116614
4999	NC_012582	TGC	2	6	259057	259062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116614
5000	NC_012582	CTG	3	9	259155	259163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116614

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