MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae M66-2 chromosome II

Total Repeats: 19727

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_012580	TACC	2	8	956638	956645	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
18002	NC_012580	CAA	2	6	956749	956754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227812597
18003	NC_012580	CGT	2	6	956774	956779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812597
18004	NC_012580	CCAA	2	8	956901	956908	50 %	0 %	0 %	50 %	227812597
18005	NC_012580	TCA	2	6	956934	956939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812597
18006	NC_012580	TTGCG	2	10	956969	956978	0 %	40 %	40 %	20 %	227812597
18007	NC_012580	CAT	2	6	957014	957019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812597
18008	NC_012580	CGC	2	6	957026	957031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227812597
18009	NC_012580	AAG	2	6	957048	957053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227812597
18010	NC_012580	GCT	2	6	957141	957146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812597
18011	NC_012580	AGG	2	6	957230	957235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227812597
18012	NC_012580	AAT	2	6	957475	957480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227812597
18013	NC_012580	A	6	6	957587	957592	100 %	0 %	0 %	0 %	227812597
18014	NC_012580	TTA	2	6	957642	957647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227812597
18015	NC_012580	A	6	6	957651	957656	100 %	0 %	0 %	0 %	227812597
18016	NC_012580	ATC	2	6	957803	957808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812597
18017	NC_012580	GGC	2	6	957814	957819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227812597
18018	NC_012580	GAT	2	6	957941	957946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812597
18019	NC_012580	T	6	6	957946	957951	0 %	100 %	0 %	0 %	227812597
18020	NC_012580	ATC	2	6	957968	957973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812597
18021	NC_012580	GC	3	6	957975	957980	0 %	0 %	50 %	50 %	227812597
18022	NC_012580	TAG	2	6	958022	958027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812597
18023	NC_012580	CCT	2	6	958065	958070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227812598
18024	NC_012580	GTT	2	6	958092	958097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227812598
18025	NC_012580	GCT	2	6	958098	958103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812598
18026	NC_012580	CTG	3	9	958130	958138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812598
18027	NC_012580	TGAC	2	8	958211	958218	25 %	25 %	25 %	25 %	227812598
18028	NC_012580	CGAT	2	8	958287	958294	25 %	25 %	25 %	25 %	227812598
18029	NC_012580	CCA	2	6	958467	958472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227812598
18030	NC_012580	CG	3	6	958502	958507	0 %	0 %	50 %	50 %	227812598
18031	NC_012580	CGC	2	6	958516	958521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227812598
18032	NC_012580	CAA	2	6	958531	958536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227812598
18033	NC_012580	TTA	2	6	958586	958591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227812598
18034	NC_012580	ACG	2	6	958660	958665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812598
18035	NC_012580	CG	3	6	958708	958713	0 %	0 %	50 %	50 %	227812598
18036	NC_012580	GCTT	2	8	958861	958868	0 %	50 %	25 %	25 %	227812598
18037	NC_012580	CAG	2	6	958906	958911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812598
18038	NC_012580	T	6	6	959034	959039	0 %	100 %	0 %	0 %	227812598
18039	NC_012580	GC	3	6	959059	959064	0 %	0 %	50 %	50 %	227812598
18040	NC_012580	GTG	2	6	959066	959071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227812598
18041	NC_012580	CAG	3	9	959091	959099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812598
18042	NC_012580	GCA	2	6	959144	959149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812598
18043	NC_012580	GAGCA	2	10	959257	959266	40 %	0 %	40 %	20 %	227812598
18044	NC_012580	CTG	2	6	959275	959280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812598
18045	NC_012580	GC	3	6	959356	959361	0 %	0 %	50 %	50 %	227812598
18046	NC_012580	T	6	6	959477	959482	0 %	100 %	0 %	0 %	227812598
18047	NC_012580	TCAGC	2	10	959508	959517	20 %	20 %	20 %	40 %	227812598
18048	NC_012580	TGT	2	6	959549	959554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227812598
18049	NC_012580	CGG	2	6	959565	959570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227812598
18050	NC_012580	TGG	2	6	959691	959696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227812598
18051	NC_012580	TGCT	2	8	959779	959786	0 %	50 %	25 %	25 %	227812598
18052	NC_012580	CT	3	6	959864	959869	0 %	50 %	0 %	50 %	227812598
18053	NC_012580	AAC	2	6	959990	959995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227812598
18054	NC_012580	GATA	2	8	960034	960041	50 %	25 %	25 %	0 %	227812598
18055	NC_012580	TAAA	2	8	960098	960105	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18056	NC_012580	GTT	2	6	960150	960155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18057	NC_012580	ACGC	2	8	960201	960208	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18058	NC_012580	AAC	2	6	960255	960260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	475645793
18059	NC_012580	ACCC	2	8	960272	960279	25 %	0 %	0 %	75 %	475645793
18060	NC_012580	AGA	2	6	960383	960388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	475645793
18061	NC_012580	TTA	2	6	960488	960493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	475645793
18062	NC_012580	A	7	7	960545	960551	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18063	NC_012580	TAGAAA	2	12	960559	960570	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18064	NC_012580	T	6	6	960576	960581	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18065	NC_012580	TTCG	2	8	960585	960592	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18066	NC_012580	GAC	2	6	960602	960607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812600
18067	NC_012580	GCA	2	6	960619	960624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812600
18068	NC_012580	ATC	2	6	960748	960753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812600
18069	NC_012580	ATC	2	6	960859	960864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812600
18070	NC_012580	AGCC	2	8	960878	960885	25 %	0 %	25 %	50 %	227812600
18071	NC_012580	CTTG	2	8	960896	960903	0 %	50 %	25 %	25 %	227812600
18072	NC_012580	AAT	2	6	960954	960959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227812600
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18077	NC_012580	ACTC	2	8	961220	961227	25 %	25 %	0 %	50 %	227812600
18078	NC_012580	CAG	2	6	961257	961262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812600
18079	NC_012580	CAT	2	6	961286	961291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812600
18080	NC_012580	TCA	2	6	961405	961410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812600
18081	NC_012580	GCT	2	6	961444	961449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812600
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18084	NC_012580	GCA	2	6	961508	961513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812600
18085	NC_012580	CG	3	6	961529	961534	0 %	0 %	50 %	50 %	227812600
18086	NC_012580	CGT	2	6	961542	961547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812600
18087	NC_012580	GAC	2	6	961549	961554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812600
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18090	NC_012580	CAT	2	6	961628	961633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812600
18091	NC_012580	CTT	2	6	961652	961657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227812600
18092	NC_012580	TTC	2	6	961722	961727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227812600
18093	NC_012580	TAAA	2	8	961771	961778	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18094	NC_012580	ATA	2	6	961820	961825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18095	NC_012580	A	6	6	961859	961864	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18096	NC_012580	GA	3	6	962033	962038	50 %	0 %	50 %	0 %	227812601
18097	NC_012580	ACGC	2	8	962151	962158	25 %	0 %	25 %	50 %	227812601
18098	NC_012580	CT	3	6	962260	962265	0 %	50 %	0 %	50 %	227812601
18099	NC_012580	AAG	2	6	962270	962275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227812601
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18101	NC_012580	GGC	2	6	962353	962358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227812601
18102	NC_012580	CAA	2	6	962362	962367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227812601
18103	NC_012580	GCTC	2	8	962380	962387	0 %	25 %	25 %	50 %	227812601
18104	NC_012580	TGCA	2	8	962392	962399	25 %	25 %	25 %	25 %	227812601
18105	NC_012580	TGA	2	6	962418	962423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812601
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18107	NC_012580	GTT	2	6	962604	962609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227812601
18108	NC_012580	CAA	2	6	962635	962640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227812601
18109	NC_012580	TGA	2	6	962665	962670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812601
18110	NC_012580	CTG	2	6	962691	962696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812602
18111	NC_012580	GCC	2	6	962700	962705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227812602
18112	NC_012580	ATG	2	6	962712	962717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812602
18113	NC_012580	TGG	2	6	962829	962834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227812602
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18115	NC_012580	ACC	2	6	962916	962921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227812602
18116	NC_012580	TGC	2	6	962926	962931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812602
18117	NC_012580	GTCA	2	8	962932	962939	25 %	25 %	25 %	25 %	227812602
18118	NC_012580	CGC	2	6	962995	963000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227812602
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18120	NC_012580	CGG	2	6	963122	963127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227812602
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18122	NC_012580	T	6	6	963186	963191	0 %	100 %	0 %	0 %	227812602
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