MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae M66-2 chromosome II

Total Repeats: 19727

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_012580	TTGG	2	8	851602	851609	0 %	50 %	50 %	0 %	475645788
16002	NC_012580	CTTCA	2	10	851625	851634	20 %	40 %	0 %	40 %	475645788
16003	NC_012580	GATACG	2	12	851691	851702	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	475645788
16004	NC_012580	TGAA	2	8	851769	851776	50 %	25 %	25 %	0 %	475645788
16005	NC_012580	GCG	2	6	851787	851792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	475645788
16006	NC_012580	ACG	2	6	851807	851812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	475645788
16007	NC_012580	GATTG	2	10	851882	851891	20 %	40 %	40 %	0 %	475645788
16008	NC_012580	CGC	2	6	851894	851899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	475645788
16009	NC_012580	GGT	3	9	851958	851966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	475645788
16010	NC_012580	CAT	2	6	852074	852079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	475645788
16011	NC_012580	ACG	2	6	852162	852167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	475645788
16012	NC_012580	GAC	2	6	852202	852207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	475645788
16013	NC_012580	GAC	2	6	852265	852270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	475645788
16014	NC_012580	GTT	2	6	852286	852291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16015	NC_012580	GAA	2	6	852376	852381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16016	NC_012580	ACG	2	6	852410	852415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16017	NC_012580	CAT	2	6	852431	852436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16018	NC_012580	GTT	2	6	852465	852470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16019	NC_012580	GGC	2	6	852529	852534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16020	NC_012580	AGTG	2	8	852536	852543	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16021	NC_012580	AGAC	2	8	852629	852636	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16022	NC_012580	GAAC	2	8	852651	852658	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16023	NC_012580	ATC	2	6	852754	852759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16024	NC_012580	TGG	2	6	852820	852825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227812491
16025	NC_012580	ACA	2	6	852838	852843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227812491
16026	NC_012580	GAC	2	6	852862	852867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812491
16027	NC_012580	CG	3	6	852937	852942	0 %	0 %	50 %	50 %	227812491
16028	NC_012580	ACC	2	6	852973	852978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227812491
16029	NC_012580	GCT	2	6	853015	853020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812491
16030	NC_012580	CAAAGC	2	12	853092	853103	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	227812491
16031	NC_012580	ACC	2	6	853147	853152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227812491
16032	NC_012580	TAC	2	6	853196	853201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812491
16033	NC_012580	CACG	2	8	853251	853258	25 %	0 %	25 %	50 %	227812491
16034	NC_012580	CAC	2	6	853356	853361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227812491
16035	NC_012580	GTTG	2	8	853452	853459	0 %	50 %	50 %	0 %	227812491
16036	NC_012580	CCAC	2	8	853505	853512	25 %	0 %	0 %	75 %	227812491
16037	NC_012580	GCA	2	6	853544	853549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812491
16038	NC_012580	A	6	6	853549	853554	100 %	0 %	0 %	0 %	227812491
16039	NC_012580	TTC	2	6	853555	853560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227812491
16040	NC_012580	GCC	2	6	853603	853608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227812491
16041	NC_012580	AAG	2	6	853673	853678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227812491
16042	NC_012580	CAAG	2	8	853767	853774	50 %	0 %	25 %	25 %	227812491
16043	NC_012580	GTG	2	6	853816	853821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227812491
16044	NC_012580	TTA	2	6	853914	853919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16045	NC_012580	TTC	2	6	854114	854119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227812492
16046	NC_012580	CCG	3	9	854136	854144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227812492
16047	NC_012580	T	6	6	854217	854222	0 %	100 %	0 %	0 %	227812492
16048	NC_012580	TTTC	2	8	854295	854302	0 %	75 %	0 %	25 %	227812492
16049	NC_012580	TCA	2	6	854339	854344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812492
16050	NC_012580	ACCA	2	8	854362	854369	50 %	0 %	0 %	50 %	227812492
16051	NC_012580	GA	3	6	854461	854466	50 %	0 %	50 %	0 %	227812492
16052	NC_012580	CAG	2	6	854494	854499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812492
16053	NC_012580	AGAT	2	8	854612	854619	50 %	25 %	25 %	0 %	227812492
16054	NC_012580	CAA	2	6	854665	854670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227812492
16055	NC_012580	AAC	2	6	854709	854714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227812492
16056	NC_012580	GCA	2	6	854756	854761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812492
16057	NC_012580	CAG	2	6	854926	854931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812492
16058	NC_012580	ATC	2	6	854960	854965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812492
16059	NC_012580	GA	3	6	854993	854998	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16060	NC_012580	CCA	2	6	855095	855100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16061	NC_012580	AAC	2	6	855197	855202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227812493
16062	NC_012580	TGG	2	6	855216	855221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227812493
16063	NC_012580	GCTC	2	8	855227	855234	0 %	25 %	25 %	50 %	227812493
16064	NC_012580	TGG	3	9	855250	855258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227812493
16065	NC_012580	TCA	2	6	855313	855318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812493
16066	NC_012580	TGG	2	6	855378	855383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227812493
16067	NC_012580	TACT	2	8	855429	855436	25 %	50 %	0 %	25 %	227812493
16068	NC_012580	TCC	2	6	855450	855455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227812493
16069	NC_012580	CTG	2	6	855503	855508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812494
16070	NC_012580	CGG	2	6	855531	855536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227812494
16071	NC_012580	CTA	2	6	855581	855586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812494
16072	NC_012580	CTT	2	6	855614	855619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227812494
16073	NC_012580	TGA	2	6	855753	855758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812494
16074	NC_012580	GAT	2	6	855818	855823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812494
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16077	NC_012580	TCG	2	6	855913	855918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812494
16078	NC_012580	GCT	2	6	855934	855939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812494
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16081	NC_012580	CAGT	2	8	856231	856238	25 %	25 %	25 %	25 %	227812495
16082	NC_012580	ACG	2	6	856253	856258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812495
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16089	NC_012580	CG	3	6	856509	856514	0 %	0 %	50 %	50 %	227812495
16090	NC_012580	GCT	2	6	856525	856530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812495
16091	NC_012580	TCG	2	6	856693	856698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812495
16092	NC_012580	CAAT	2	8	856708	856715	50 %	25 %	0 %	25 %	227812495
16093	NC_012580	GCA	2	6	856771	856776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812495
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16101	NC_012580	AAC	2	6	857239	857244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16102	NC_012580	TGT	2	6	857271	857276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16103	NC_012580	GA	3	6	857343	857348	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16104	NC_012580	CTA	2	6	857385	857390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	475645789
16105	NC_012580	GCCA	2	8	857398	857405	25 %	0 %	25 %	50 %	475645789
16106	NC_012580	TCA	2	6	857424	857429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	475645789
16107	NC_012580	CATG	2	8	857459	857466	25 %	25 %	25 %	25 %	475645789
16108	NC_012580	GAC	2	6	857467	857472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	475645789
16109	NC_012580	ATG	2	6	857494	857499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	475645789
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16121	NC_012580	TCT	2	6	857970	857975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	475645789
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16132	NC_012580	TCC	2	6	858507	858512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227812497
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16232	NC_012580	CT	4	8	863919	863926	0 %	50 %	0 %	50 %	475645791
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16239	NC_012580	A	6	6	864245	864250	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16240	NC_012580	CGC	2	6	864253	864258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16241	NC_012580	GAAC	2	8	864417	864424	50 %	0 %	25 %	25 %	227812505
16242	NC_012580	CGC	2	6	864451	864456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227812505
16243	NC_012580	GTT	2	6	864492	864497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227812505
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16492	NC_012580	TTG	2	6	877727	877732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227812520
16493	NC_012580	CT	3	6	877763	877768	0 %	50 %	0 %	50 %	227812520
16494	NC_012580	AGTG	2	8	877876	877883	25 %	25 %	50 %	0 %	227812520
16495	NC_012580	AACA	2	8	878166	878173	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
16496	NC_012580	ATG	2	6	878243	878248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812521
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16498	NC_012580	CTGAG	2	10	878473	878482	20 %	20 %	40 %	20 %	227812521
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16500	NC_012580	TGT	2	6	878733	878738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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