MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae M66-2 chromosome II

Total Repeats: 19727

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_012580	CAA	2	6	800286	800291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227812439
15002	NC_012580	ATG	2	6	800358	800363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812439
15003	NC_012580	TAT	2	6	800441	800446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227812439
15004	NC_012580	TCA	2	6	800476	800481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812439
15005	NC_012580	CAT	2	6	800585	800590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812439
15006	NC_012580	T	6	6	800593	800598	0 %	100 %	0 %	0 %	227812439
15007	NC_012580	AT	3	6	800645	800650	50 %	50 %	0 %	0 %	227812439
15008	NC_012580	ATC	2	6	800659	800664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812439
15009	NC_012580	ACTC	2	8	800665	800672	25 %	25 %	0 %	50 %	227812439
15010	NC_012580	CAAT	2	8	801001	801008	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15011	NC_012580	CA	3	6	801014	801019	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15012	NC_012580	A	6	6	801068	801073	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15013	NC_012580	TCTA	2	8	801075	801082	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15014	NC_012580	T	6	6	801113	801118	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15015	NC_012580	ATTC	2	8	801129	801136	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15016	NC_012580	GT	3	6	801174	801179	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15017	NC_012580	TAT	2	6	801209	801214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15018	NC_012580	AGA	2	6	801257	801262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15019	NC_012580	A	6	6	801264	801269	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15020	NC_012580	AAG	2	6	801290	801295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15021	NC_012580	AAG	2	6	801315	801320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15022	NC_012580	ATT	2	6	801326	801331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15023	NC_012580	TTAA	2	8	801347	801354	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15024	NC_012580	TGA	2	6	801420	801425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15025	NC_012580	TATT	2	8	801427	801434	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15026	NC_012580	TAA	3	9	801459	801467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15027	NC_012580	GAA	2	6	801502	801507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227812440
15028	NC_012580	A	8	8	801527	801534	100 %	0 %	0 %	0 %	227812440
15029	NC_012580	A	6	6	801536	801541	100 %	0 %	0 %	0 %	227812440
15030	NC_012580	TGTC	2	8	801612	801619	0 %	50 %	25 %	25 %	227812440
15031	NC_012580	A	6	6	801642	801647	100 %	0 %	0 %	0 %	227812440
15032	NC_012580	T	6	6	801683	801688	0 %	100 %	0 %	0 %	227812440
15033	NC_012580	TTA	2	6	801710	801715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15034	NC_012580	ATG	2	6	801725	801730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15035	NC_012580	GTG	2	6	801731	801736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15036	NC_012580	CAT	2	6	801758	801763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15037	NC_012580	TCA	2	6	801766	801771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15038	NC_012580	T	6	6	801927	801932	0 %	100 %	0 %	0 %	227812441
15039	NC_012580	TCT	2	6	801948	801953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227812441
15040	NC_012580	ATC	2	6	802013	802018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812441
15041	NC_012580	TTCA	2	8	802115	802122	25 %	50 %	0 %	25 %	227812441
15042	NC_012580	TCA	2	6	802149	802154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812441
15043	NC_012580	CAG	2	6	802175	802180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812441
15044	NC_012580	CGAC	2	8	802194	802201	25 %	0 %	25 %	50 %	227812441
15045	NC_012580	CAT	2	6	802307	802312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812441
15046	NC_012580	CGC	2	6	802408	802413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227812441
15047	NC_012580	GGTA	2	8	802416	802423	25 %	25 %	50 %	0 %	227812441
15048	NC_012580	TGC	2	6	802437	802442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812441
15049	NC_012580	TCA	3	9	802530	802538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812441
15050	NC_012580	CTT	2	6	802567	802572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227812441
15051	NC_012580	TTC	2	6	802650	802655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227812441
15052	NC_012580	TTC	2	6	802787	802792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227812441
15053	NC_012580	T	6	6	802925	802930	0 %	100 %	0 %	0 %	227812441
15054	NC_012580	GAG	2	6	802931	802936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227812441
15055	NC_012580	AAT	2	6	803015	803020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227812441
15056	NC_012580	GTTT	2	8	803024	803031	0 %	75 %	25 %	0 %	227812441
15057	NC_012580	ATGG	2	8	803151	803158	25 %	25 %	50 %	0 %	227812441
15058	NC_012580	TCA	2	6	803239	803244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812441
15059	NC_012580	TTTA	2	8	803258	803265	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15060	NC_012580	AGA	2	6	803283	803288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15061	NC_012580	GAA	2	6	803307	803312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15062	NC_012580	TCAG	2	8	803436	803443	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15063	NC_012580	ATA	2	6	803466	803471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227812442
15064	NC_012580	AATA	2	8	803491	803498	75 %	25 %	0 %	0 %	227812442
15065	NC_012580	CTCA	2	8	803575	803582	25 %	25 %	0 %	50 %	227812442
15066	NC_012580	AATA	2	8	803605	803612	75 %	25 %	0 %	0 %	227812442
15067	NC_012580	GAA	2	6	803621	803626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227812442
15068	NC_012580	AATTA	2	10	803632	803641	60 %	40 %	0 %	0 %	227812442
15069	NC_012580	GTA	2	6	803663	803668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812442
15070	NC_012580	TA	3	6	803689	803694	50 %	50 %	0 %	0 %	227812442
15071	NC_012580	A	6	6	803706	803711	100 %	0 %	0 %	0 %	227812442
15072	NC_012580	AAT	2	6	803717	803722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227812442
15073	NC_012580	A	6	6	803746	803751	100 %	0 %	0 %	0 %	227812442
15074	NC_012580	TATT	2	8	803776	803783	25 %	75 %	0 %	0 %	227812442
15075	NC_012580	CTT	2	6	803790	803795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227812442
15076	NC_012580	ATCC	2	8	803844	803851	25 %	25 %	0 %	50 %	227812442
15077	NC_012580	TGA	2	6	803926	803931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812442
15078	NC_012580	CAGATG	2	12	804090	804101	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	227812442
15079	NC_012580	GCCAAT	2	12	804116	804127	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	227812442
15080	NC_012580	AT	3	6	804147	804152	50 %	50 %	0 %	0 %	227812442
15081	NC_012580	AAT	2	6	804200	804205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227812442
15082	NC_012580	TCG	2	6	804251	804256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812442
15083	NC_012580	TGA	2	6	804264	804269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812442
15084	NC_012580	ATTG	2	8	804359	804366	25 %	50 %	25 %	0 %	227812442
15085	NC_012580	A	7	7	804382	804388	100 %	0 %	0 %	0 %	227812442
15086	NC_012580	CAA	2	6	804524	804529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15087	NC_012580	TGT	2	6	804540	804545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15088	NC_012580	GTT	2	6	804578	804583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15089	NC_012580	GCC	2	6	804610	804615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15090	NC_012580	CATCA	2	10	804670	804679	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
15091	NC_012580	AGATGA	2	12	804695	804706	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	227812443
15092	NC_012580	ACG	2	6	804724	804729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812443
15093	NC_012580	CGCT	2	8	804761	804768	0 %	25 %	25 %	50 %	227812443
15094	NC_012580	AATC	2	8	804823	804830	50 %	25 %	0 %	25 %	227812443
15095	NC_012580	CAATC	2	10	804930	804939	40 %	20 %	0 %	40 %	227812443
15096	NC_012580	ATT	2	6	804964	804969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227812443
15097	NC_012580	ATG	2	6	804980	804985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812443
15098	NC_012580	GAAT	2	8	805001	805008	50 %	25 %	25 %	0 %	227812443
15099	NC_012580	AGG	2	6	805043	805048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227812443
15100	NC_012580	G	6	6	805055	805060	0 %	0 %	100 %	0 %	227812443
15101	NC_012580	AGA	2	6	805137	805142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227812443
15102	NC_012580	TCC	2	6	805164	805169	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227812443
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15106	NC_012580	CAG	2	6	805336	805341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812443
15107	NC_012580	GCA	2	6	805362	805367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812443
15108	NC_012580	TTC	2	6	805385	805390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227812443
15109	NC_012580	CAAT	2	8	805397	805404	50 %	25 %	0 %	25 %	227812443
15110	NC_012580	CTTGCA	2	12	805471	805482	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	227812443
15111	NC_012580	T	6	6	805487	805492	0 %	100 %	0 %	0 %	227812443
15112	NC_012580	TTA	2	6	805596	805601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227812443
15113	NC_012580	CCG	2	6	805622	805627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227812443
15114	NC_012580	CAG	2	6	805739	805744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812443
15115	NC_012580	TCA	2	6	805808	805813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15116	NC_012580	GAT	2	6	805880	805885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812444
15117	NC_012580	CAA	2	6	805920	805925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227812444
15118	NC_012580	AAGA	2	8	805989	805996	75 %	0 %	25 %	0 %	227812444
15119	NC_012580	CCG	2	6	806043	806048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15120	NC_012580	T	6	6	806058	806063	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15121	NC_012580	ACA	2	6	806116	806121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15122	NC_012580	GAA	2	6	806161	806166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15123	NC_012580	AGC	2	6	806223	806228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15124	NC_012580	A	6	6	806273	806278	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15125	NC_012580	GAG	2	6	806282	806287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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15250	NC_012580	CCA	2	6	812599	812604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227812452
15251	NC_012580	CTT	2	6	812678	812683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227812452
15252	NC_012580	T	6	6	812744	812749	0 %	100 %	0 %	0 %	227812452
15253	NC_012580	CAG	2	6	812817	812822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812452
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15256	NC_012580	GC	3	6	813008	813013	0 %	0 %	50 %	50 %	227812453
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15278	NC_012580	TCT	2	6	813795	813800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227812453
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15280	NC_012580	CGC	2	6	813911	813916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227812453
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15291	NC_012580	T	6	6	814363	814368	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15292	NC_012580	GAC	2	6	814427	814432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15294	NC_012580	CAG	2	6	814465	814470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15297	NC_012580	GTG	2	6	814537	814542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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15301	NC_012580	ATC	2	6	814647	814652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15302	NC_012580	ATC	2	6	814677	814682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15307	NC_012580	TCT	2	6	814802	814807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15308	NC_012580	GTGAT	2	10	814830	814839	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
15309	NC_012580	GT	3	6	814875	814880	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15310	NC_012580	TAT	2	6	814972	814977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15311	NC_012580	CCTT	2	8	815001	815008	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15312	NC_012580	TGA	2	6	815017	815022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15323	NC_012580	CGT	2	6	815781	815786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812454
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15342	NC_012580	GGT	2	6	816896	816901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227812455
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15360	NC_012580	GCCC	2	8	818254	818261	0 %	0 %	25 %	75 %	227812457
15361	NC_012580	CAG	2	6	818287	818292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812457
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15364	NC_012580	ATC	2	6	818435	818440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812457
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15366	NC_012580	TCAA	2	8	818459	818466	50 %	25 %	0 %	25 %	227812457
15367	NC_012580	CAAT	2	8	818484	818491	50 %	25 %	0 %	25 %	227812457
15368	NC_012580	GCT	2	6	818700	818705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812457
15369	NC_012580	TCA	3	9	818774	818782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812457
15370	NC_012580	AAC	2	6	818783	818788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227812457
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15372	NC_012580	CAC	2	6	818827	818832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227812457
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15377	NC_012580	GAA	2	6	818969	818974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15378	NC_012580	TTATTG	2	12	819014	819025	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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15493	NC_012580	GCG	2	6	824981	824986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227812462
15494	NC_012580	ATCTG	2	10	825052	825061	20 %	40 %	20 %	20 %	227812462
15495	NC_012580	CAA	2	6	825064	825069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227812462
15496	NC_012580	GGC	2	6	825145	825150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227812462
15497	NC_012580	TCA	2	6	825189	825194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812462
15498	NC_012580	ATC	2	6	825332	825337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812462
15499	NC_012580	TGA	2	6	825349	825354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812462
15500	NC_012580	TGA	2	6	825363	825368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812462

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