MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae M66-2 chromosome II

Total Repeats: 19727

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_012580	GCA	2	6	746442	746447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812393
14002	NC_012580	CCA	2	6	746489	746494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227812393
14003	NC_012580	GTCACG	2	12	746496	746507	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	227812393
14004	NC_012580	TAA	2	6	746519	746524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227812393
14005	NC_012580	AGC	2	6	746673	746678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812393
14006	NC_012580	TGC	2	6	746682	746687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812393
14007	NC_012580	TCT	2	6	746688	746693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227812393
14008	NC_012580	CTGCA	2	10	746713	746722	20 %	20 %	20 %	40 %	227812393
14009	NC_012580	TGT	3	9	746749	746757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227812393
14010	NC_012580	ATA	2	6	746868	746873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	475645783
14011	NC_012580	ATA	2	6	746920	746925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	475645783
14012	NC_012580	GAC	2	6	746983	746988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	475645783
14013	NC_012580	GAA	2	6	747180	747185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	475645783
14014	NC_012580	CTC	2	6	747210	747215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	475645783
14015	NC_012580	CGC	2	6	747220	747225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	475645783
14016	NC_012580	CTT	2	6	747246	747251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	475645783
14017	NC_012580	AAG	2	6	747268	747273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	475645783
14018	NC_012580	CAC	2	6	747426	747431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	475645783
14019	NC_012580	CAAT	2	8	747484	747491	50 %	25 %	0 %	25 %	475645783
14020	NC_012580	CCTA	2	8	747567	747574	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14021	NC_012580	TCAA	2	8	747605	747612	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14022	NC_012580	AAT	2	6	747630	747635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14023	NC_012580	TTC	2	6	747877	747882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227812395
14024	NC_012580	ATT	2	6	747971	747976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227812395
14025	NC_012580	AGCTC	2	10	748042	748051	20 %	20 %	20 %	40 %	227812395
14026	NC_012580	AAAATG	2	12	748116	748127	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	227812395
14027	NC_012580	GCA	2	6	748150	748155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812395
14028	NC_012580	TG	3	6	748158	748163	0 %	50 %	50 %	0 %	227812395
14029	NC_012580	CGT	2	6	748174	748179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812395
14030	NC_012580	TGGC	2	8	748224	748231	0 %	25 %	50 %	25 %	227812395
14031	NC_012580	GCC	2	6	748271	748276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227812395
14032	NC_012580	TGT	2	6	748373	748378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227812395
14033	NC_012580	AGCG	2	8	748435	748442	25 %	0 %	50 %	25 %	227812395
14034	NC_012580	GAG	2	6	748560	748565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227812395
14035	NC_012580	CCG	2	6	748573	748578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227812395
14036	NC_012580	TGTT	2	8	748599	748606	0 %	75 %	25 %	0 %	227812395
14037	NC_012580	AAC	2	6	748621	748626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227812395
14038	NC_012580	GAT	2	6	748750	748755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812395
14039	NC_012580	ATG	2	6	748806	748811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812395
14040	NC_012580	GTTT	2	8	748872	748879	0 %	75 %	25 %	0 %	227812395
14041	NC_012580	A	7	7	748911	748917	100 %	0 %	0 %	0 %	227812395
14042	NC_012580	TGG	2	6	749053	749058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227812395
14043	NC_012580	GCT	2	6	749073	749078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812395
14044	NC_012580	TCG	2	6	749178	749183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812395
14045	NC_012580	ATG	3	9	749244	749252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812395
14046	NC_012580	CAT	2	6	749300	749305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812395
14047	NC_012580	GAAATC	2	12	749312	749323	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	227812395
14048	NC_012580	TAT	2	6	749340	749345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227812395
14049	NC_012580	CGATT	2	10	749440	749449	20 %	40 %	20 %	20 %	227812395
14050	NC_012580	GCC	2	6	749457	749462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227812395
14051	NC_012580	GCA	2	6	749533	749538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812395
14052	NC_012580	GCT	2	6	749565	749570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812395
14053	NC_012580	GT	3	6	749660	749665	0 %	50 %	50 %	0 %	227812395
14054	NC_012580	TTAC	2	8	749732	749739	25 %	50 %	0 %	25 %	227812395
14055	NC_012580	CCG	2	6	749962	749967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227812396
14056	NC_012580	TG	3	6	749974	749979	0 %	50 %	50 %	0 %	227812396
14057	NC_012580	TCCA	2	8	749984	749991	25 %	25 %	0 %	50 %	227812396
14058	NC_012580	GAC	2	6	750033	750038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812396
14059	NC_012580	T	6	6	750040	750045	0 %	100 %	0 %	0 %	227812396
14060	NC_012580	CAT	2	6	750105	750110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812396
14061	NC_012580	TGCAC	2	10	750136	750145	20 %	20 %	20 %	40 %	227812396
14062	NC_012580	CGC	2	6	750239	750244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227812396
14063	NC_012580	TTGA	2	8	750315	750322	25 %	50 %	25 %	0 %	227812396
14064	NC_012580	CAGC	2	8	750347	750354	25 %	0 %	25 %	50 %	227812396
14065	NC_012580	AATCG	2	10	750389	750398	40 %	20 %	20 %	20 %	227812396
14066	NC_012580	TGA	2	6	750415	750420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812396
14067	NC_012580	ATC	2	6	750427	750432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812396
14068	NC_012580	TGC	2	6	750616	750621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812396
14069	NC_012580	A	6	6	750676	750681	100 %	0 %	0 %	0 %	227812396
14070	NC_012580	ATGA	2	8	750738	750745	50 %	25 %	25 %	0 %	227812396
14071	NC_012580	AAAGG	2	10	750811	750820	60 %	0 %	40 %	0 %	227812397
14072	NC_012580	CCTTT	2	10	750837	750846	0 %	60 %	0 %	40 %	227812397
14073	NC_012580	TAA	2	6	750870	750875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227812397
14074	NC_012580	GTCA	2	8	750891	750898	25 %	25 %	25 %	25 %	227812397
14075	NC_012580	ATT	2	6	750947	750952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227812397
14076	NC_012580	AAG	2	6	750995	751000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14077	NC_012580	AATG	2	8	751072	751079	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14078	NC_012580	AAC	2	6	751107	751112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14079	NC_012580	GGC	2	6	751128	751133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14080	NC_012580	GA	3	6	751138	751143	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14081	NC_012580	ATAG	2	8	751156	751163	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14082	NC_012580	GAAC	2	8	751180	751187	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14083	NC_012580	A	6	6	751238	751243	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14084	NC_012580	TTAC	2	8	751294	751301	25 %	50 %	0 %	25 %	227812398
14085	NC_012580	GCA	2	6	751392	751397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812398
14086	NC_012580	CGT	2	6	751411	751416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812398
14087	NC_012580	ATA	2	6	751496	751501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227812398
14088	NC_012580	CCA	2	6	751614	751619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227812398
14089	NC_012580	CTC	2	6	751654	751659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227812398
14090	NC_012580	TGA	2	6	751672	751677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812398
14091	NC_012580	CAA	2	6	751686	751691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227812398
14092	NC_012580	AG	3	6	751771	751776	50 %	0 %	50 %	0 %	227812398
14093	NC_012580	TGC	2	6	751843	751848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812398
14094	NC_012580	CAT	2	6	751870	751875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812398
14095	NC_012580	CTT	2	6	751889	751894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227812398
14096	NC_012580	TGC	2	6	751907	751912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812398
14097	NC_012580	GCA	2	6	752013	752018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14098	NC_012580	TAT	2	6	752033	752038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14099	NC_012580	CG	3	6	752130	752135	0 %	0 %	50 %	50 %	227812399
14100	NC_012580	ACT	2	6	752225	752230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812399
14101	NC_012580	TCA	2	6	752282	752287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812399
14102	NC_012580	GCC	2	6	752335	752340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227812399
14103	NC_012580	CG	3	6	752352	752357	0 %	0 %	50 %	50 %	227812399
14104	NC_012580	TGA	2	6	752358	752363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812399
14105	NC_012580	GCCA	2	8	752395	752402	25 %	0 %	25 %	50 %	227812399
14106	NC_012580	ACA	2	6	752481	752486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227812399
14107	NC_012580	GT	3	6	752575	752580	0 %	50 %	50 %	0 %	227812399
14108	NC_012580	TGAG	2	8	752750	752757	25 %	25 %	50 %	0 %	227812399
14109	NC_012580	AGC	2	6	752807	752812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812399
14110	NC_012580	TACG	2	8	752832	752839	25 %	25 %	25 %	25 %	227812399
14111	NC_012580	AAG	2	6	752849	752854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227812399
14112	NC_012580	GTGA	2	8	752920	752927	25 %	25 %	50 %	0 %	227812399
14113	NC_012580	TCC	3	9	752950	752958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14114	NC_012580	ATTA	2	8	753007	753014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14115	NC_012580	TATT	2	8	753032	753039	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14116	NC_012580	TCG	2	6	753067	753072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14117	NC_012580	GCG	2	6	753113	753118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227812400
14118	NC_012580	T	6	6	753172	753177	0 %	100 %	0 %	0 %	227812400
14119	NC_012580	TCG	2	6	753237	753242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812400
14120	NC_012580	ATT	2	6	753298	753303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227812400
14121	NC_012580	GC	3	6	753361	753366	0 %	0 %	50 %	50 %	227812400
14122	NC_012580	CTC	2	6	753436	753441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227812400
14123	NC_012580	CTC	2	6	753452	753457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227812400
14124	NC_012580	TGG	2	6	753533	753538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227812400
14125	NC_012580	ATT	2	6	753681	753686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227812400
14126	NC_012580	CCGAT	2	10	753696	753705	20 %	20 %	20 %	40 %	227812400
14127	NC_012580	GAT	3	9	753703	753711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812400
14128	NC_012580	TTG	2	6	753779	753784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227812400
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14130	NC_012580	AAC	2	6	753852	753857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227812400
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14133	NC_012580	GCA	2	6	753976	753981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812400
14134	NC_012580	GGC	2	6	753988	753993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227812400
14135	NC_012580	TTACC	2	10	753995	754004	20 %	40 %	0 %	40 %	227812400
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14145	NC_012580	GCGA	2	8	754567	754574	25 %	0 %	50 %	25 %	227812401
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14149	NC_012580	GCGCC	2	10	754889	754898	0 %	0 %	40 %	60 %	227812401
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14161	NC_012580	TGA	2	6	755424	755429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812402
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14165	NC_012580	TGC	2	6	755725	755730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14166	NC_012580	TTC	2	6	755811	755816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227812403
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14201	NC_012580	AG	3	6	757241	757246	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14202	NC_012580	CG	3	6	757371	757376	0 %	0 %	50 %	50 %	227812404
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14232	NC_012580	A	6	6	759324	759329	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14233	NC_012580	TCA	2	6	759418	759423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14236	NC_012580	ATT	2	6	759455	759460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14237	NC_012580	AAC	2	6	759511	759516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227812408
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14241	NC_012580	TGC	3	9	759654	759662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14242	NC_012580	GT	3	6	759712	759717	0 %	50 %	50 %	0 %	227812409
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14245	NC_012580	A	6	6	759838	759843	100 %	0 %	0 %	0 %	227812409
14246	NC_012580	CAT	2	6	759953	759958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812409
14247	NC_012580	GCA	2	6	760028	760033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812409
14248	NC_012580	GCCA	2	8	760083	760090	25 %	0 %	25 %	50 %	227812409
14249	NC_012580	GCA	2	6	760097	760102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812409
14250	NC_012580	CGC	2	6	760151	760156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227812409
14251	NC_012580	CTCG	2	8	760227	760234	0 %	25 %	25 %	50 %	227812409
14252	NC_012580	GCG	2	6	760252	760257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227812409
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14264	NC_012580	TGC	2	6	761338	761343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14265	NC_012580	GCC	2	6	761389	761394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14266	NC_012580	T	6	6	761412	761417	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14267	NC_012580	GGA	2	6	761532	761537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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14272	NC_012580	AATGA	2	10	761806	761815	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
14273	NC_012580	GGCGCG	2	12	761886	761897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227812412
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14276	NC_012580	A	6	6	762042	762047	100 %	0 %	0 %	0 %	227812412
14277	NC_012580	GGC	2	6	762189	762194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227812412
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14283	NC_012580	TTGA	2	8	762524	762531	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14284	NC_012580	ATGGA	2	10	762570	762579	40 %	20 %	40 %	0 %	227812413
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14301	NC_012580	TCG	2	6	763581	763586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812413
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14305	NC_012580	GGTA	2	8	763873	763880	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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14330	NC_012580	TGA	2	6	764989	764994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14355	NC_012580	GATT	2	8	765992	765999	25 %	50 %	25 %	0 %	227812415
14356	NC_012580	CTGC	2	8	766135	766142	0 %	25 %	25 %	50 %	227812415
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14358	NC_012580	CAT	2	6	766196	766201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812415
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14360	NC_012580	CAGT	2	8	766244	766251	25 %	25 %	25 %	25 %	227812415
14361	NC_012580	TCA	2	6	766267	766272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812415
14362	NC_012580	ATCA	2	8	766329	766336	50 %	25 %	0 %	25 %	227812415
14363	NC_012580	GC	3	6	766343	766348	0 %	0 %	50 %	50 %	227812415
14364	NC_012580	GCA	2	6	766483	766488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812415
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14366	NC_012580	GAT	2	6	766572	766577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812415
14367	NC_012580	CGC	2	6	766583	766588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227812415
14368	NC_012580	CCG	2	6	766736	766741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227812415
14369	NC_012580	GTTG	2	8	766850	766857	0 %	50 %	50 %	0 %	227812415
14370	NC_012580	GCT	2	6	766889	766894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812415
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14386	NC_012580	TCGG	2	8	767977	767984	0 %	25 %	50 %	25 %	227812415
14387	NC_012580	CTG	3	9	768070	768078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812415
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14469	NC_012580	GTA	2	6	773248	773253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812415
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14472	NC_012580	GCT	2	6	773327	773332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812415
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14476	NC_012580	ATCA	2	8	773565	773572	50 %	25 %	0 %	25 %	227812415
14477	NC_012580	CAGT	2	8	773702	773709	25 %	25 %	25 %	25 %	227812415
14478	NC_012580	TTCA	2	8	773745	773752	25 %	50 %	0 %	25 %	227812415
14479	NC_012580	CAT	2	6	773792	773797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812415
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14481	NC_012580	C	6	6	773908	773913	0 %	0 %	0 %	100 %	227812415
14482	NC_012580	GGCT	2	8	773935	773942	0 %	25 %	50 %	25 %	227812415
14483	NC_012580	AAT	2	6	774033	774038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227812415
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14485	NC_012580	AGC	2	6	774112	774117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812415
14486	NC_012580	A	6	6	774124	774129	100 %	0 %	0 %	0 %	227812415
14487	NC_012580	GCA	2	6	774155	774160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812415
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