MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae M66-2 chromosome II

Total Repeats: 19727

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_012580	TGC	2	6	692834	692839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812342
13002	NC_012580	GCA	2	6	692893	692898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812343
13003	NC_012580	CAT	2	6	692966	692971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812343
13004	NC_012580	TGA	2	6	692992	692997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812343
13005	NC_012580	CTT	2	6	693007	693012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227812343
13006	NC_012580	ACC	2	6	693015	693020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227812343
13007	NC_012580	TGAT	2	8	693025	693032	25 %	50 %	25 %	0 %	227812343
13008	NC_012580	TGG	2	6	693064	693069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227812343
13009	NC_012580	TAC	2	6	693144	693149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812343
13010	NC_012580	GGC	2	6	693245	693250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227812343
13011	NC_012580	GCC	2	6	693304	693309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227812343
13012	NC_012580	CAA	2	6	693366	693371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227812343
13013	NC_012580	GGC	2	6	693399	693404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227812343
13014	NC_012580	TGA	2	6	693509	693514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812343
13015	NC_012580	CAG	2	6	693598	693603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13016	NC_012580	AGGAAT	2	12	693633	693644	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13017	NC_012580	AAG	2	6	693645	693650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13018	NC_012580	AAGG	2	8	693665	693672	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13019	NC_012580	CAAG	2	8	693966	693973	50 %	0 %	25 %	25 %	227812344
13020	NC_012580	TC	3	6	694046	694051	0 %	50 %	0 %	50 %	227812344
13021	NC_012580	TGA	2	6	694131	694136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812344
13022	NC_012580	GCA	2	6	694152	694157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812344
13023	NC_012580	CCA	2	6	694354	694359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227812344
13024	NC_012580	TC	3	6	694371	694376	0 %	50 %	0 %	50 %	227812344
13025	NC_012580	CCG	2	6	694408	694413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227812344
13026	NC_012580	TG	3	6	694477	694482	0 %	50 %	50 %	0 %	227812344
13027	NC_012580	CAAGC	2	10	694510	694519	40 %	0 %	20 %	40 %	227812344
13028	NC_012580	GGTGT	2	10	694569	694578	0 %	40 %	60 %	0 %	227812344
13029	NC_012580	T	6	6	694615	694620	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13030	NC_012580	CG	3	6	694697	694702	0 %	0 %	50 %	50 %	227812345
13031	NC_012580	CTG	2	6	694720	694725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812345
13032	NC_012580	CTG	2	6	694732	694737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812345
13033	NC_012580	CCG	2	6	694899	694904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227812345
13034	NC_012580	CTG	2	6	694933	694938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812345
13035	NC_012580	CGCA	2	8	695011	695018	25 %	0 %	25 %	50 %	227812345
13036	NC_012580	TGC	2	6	695030	695035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812345
13037	NC_012580	GCCA	2	8	695046	695053	25 %	0 %	25 %	50 %	227812345
13038	NC_012580	CATGC	2	10	695152	695161	20 %	20 %	20 %	40 %	227812345
13039	NC_012580	TGCCA	2	10	695197	695206	20 %	20 %	20 %	40 %	227812345
13040	NC_012580	CCA	2	6	695245	695250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227812345
13041	NC_012580	TGA	2	6	695252	695257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812345
13042	NC_012580	AGTG	2	8	695268	695275	25 %	25 %	50 %	0 %	227812345
13043	NC_012580	CGC	2	6	695281	695286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227812345
13044	NC_012580	CCA	2	6	695295	695300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227812345
13045	NC_012580	TGG	2	6	695312	695317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227812345
13046	NC_012580	CCA	2	6	695448	695453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227812345
13047	NC_012580	AC	3	6	695526	695531	50 %	0 %	0 %	50 %	227812345
13048	NC_012580	TCA	2	6	695612	695617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812345
13049	NC_012580	TTG	2	6	695638	695643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227812345
13050	NC_012580	CTG	2	6	695644	695649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812345
13051	NC_012580	CCA	2	6	695733	695738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227812345
13052	NC_012580	TTC	2	6	695782	695787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227812345
13053	NC_012580	CGGAT	2	10	695797	695806	20 %	20 %	40 %	20 %	227812345
13054	NC_012580	GT	3	6	695843	695848	0 %	50 %	50 %	0 %	227812345
13055	NC_012580	CTG	2	6	695896	695901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812345
13056	NC_012580	T	6	6	695976	695981	0 %	100 %	0 %	0 %	227812345
13057	NC_012580	ACA	2	6	695990	695995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227812345
13058	NC_012580	GCC	2	6	696023	696028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227812345
13059	NC_012580	TAA	2	6	696154	696159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13060	NC_012580	T	6	6	696167	696172	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13061	NC_012580	T	6	6	696231	696236	0 %	100 %	0 %	0 %	227812346
13062	NC_012580	TCC	2	6	696245	696250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227812346
13063	NC_012580	CAC	2	6	696367	696372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227812346
13064	NC_012580	ATG	2	6	696401	696406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812346
13065	NC_012580	GATG	2	8	696412	696419	25 %	25 %	50 %	0 %	227812346
13066	NC_012580	ACCA	2	8	696466	696473	50 %	0 %	0 %	50 %	227812346
13067	NC_012580	TTA	2	6	696554	696559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227812346
13068	NC_012580	ACC	2	6	696613	696618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227812346
13069	NC_012580	TTG	2	6	696635	696640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227812346
13070	NC_012580	GAT	2	6	696679	696684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812346
13071	NC_012580	CGTA	2	8	696714	696721	25 %	25 %	25 %	25 %	227812346
13072	NC_012580	A	6	6	696733	696738	100 %	0 %	0 %	0 %	227812346
13073	NC_012580	GAGT	2	8	696797	696804	25 %	25 %	50 %	0 %	227812346
13074	NC_012580	CAA	2	6	696805	696810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227812346
13075	NC_012580	CAA	2	6	696844	696849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227812346
13076	NC_012580	CAA	2	6	696885	696890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227812346
13077	NC_012580	GTT	2	6	696961	696966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227812346
13078	NC_012580	CAG	2	6	696968	696973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812346
13079	NC_012580	GTT	2	6	696978	696983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227812346
13080	NC_012580	ATG	2	6	697028	697033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812346
13081	NC_012580	CAT	2	6	697056	697061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812346
13082	NC_012580	GCT	2	6	697254	697259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812346
13083	NC_012580	AGCA	2	8	697306	697313	50 %	0 %	25 %	25 %	227812346
13084	NC_012580	GA	3	6	697417	697422	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13085	NC_012580	AAC	2	6	697502	697507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13086	NC_012580	T	6	6	697521	697526	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13087	NC_012580	A	6	6	697568	697573	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13088	NC_012580	A	7	7	697577	697583	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13089	NC_012580	CAC	2	6	697616	697621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13090	NC_012580	CAACC	2	10	697668	697677	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
13091	NC_012580	TACTT	2	10	697690	697699	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
13092	NC_012580	CAA	2	6	697796	697801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227812347
13093	NC_012580	GCA	2	6	697815	697820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812347
13094	NC_012580	CGA	2	6	697909	697914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812347
13095	NC_012580	CGG	2	6	697995	698000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227812347
13096	NC_012580	CTG	2	6	698036	698041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812347
13097	NC_012580	CTGA	2	8	698045	698052	25 %	25 %	25 %	25 %	227812347
13098	NC_012580	GCA	2	6	698062	698067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812347
13099	NC_012580	GCC	2	6	698106	698111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227812347
13100	NC_012580	CAA	2	6	698141	698146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227812347
13101	NC_012580	CAT	2	6	698227	698232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812347
13102	NC_012580	ACTG	2	8	698264	698271	25 %	25 %	25 %	25 %	227812347
13103	NC_012580	CAC	2	6	698282	698287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227812347
13104	NC_012580	GC	3	6	698359	698364	0 %	0 %	50 %	50 %	227812347
13105	NC_012580	TCGC	2	8	698421	698428	0 %	25 %	25 %	50 %	227812347
13106	NC_012580	CT	3	6	698547	698552	0 %	50 %	0 %	50 %	227812347
13107	NC_012580	ATG	2	6	698613	698618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812347
13108	NC_012580	AGC	2	6	698624	698629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812347
13109	NC_012580	TGCT	2	8	698641	698648	0 %	50 %	25 %	25 %	227812347
13110	NC_012580	GAT	2	6	698771	698776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812347
13111	NC_012580	AG	4	8	698792	698799	50 %	0 %	50 %	0 %	227812347
13112	NC_012580	TGC	2	6	698825	698830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812347
13113	NC_012580	CAG	2	6	698891	698896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812347
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13115	NC_012580	CAC	2	6	698939	698944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227812347
13116	NC_012580	CAG	2	6	698990	698995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812347
13117	NC_012580	CAG	2	6	699020	699025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812347
13118	NC_012580	ACCGCA	2	12	699069	699080	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	227812347
13119	NC_012580	AAG	2	6	699132	699137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227812347
13120	NC_012580	CTG	2	6	699138	699143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812347
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13122	NC_012580	GCA	2	6	699217	699222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812347
13123	NC_012580	ACC	2	6	699258	699263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227812347
13124	NC_012580	GCG	2	6	699314	699319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227812347
13125	NC_012580	TGCG	2	8	699354	699361	0 %	25 %	50 %	25 %	227812347
13126	NC_012580	GGT	2	6	699395	699400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227812347
13127	NC_012580	TCGC	2	8	699504	699511	0 %	25 %	25 %	50 %	227812347
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13130	NC_012580	TCA	2	6	699552	699557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812347
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13132	NC_012580	TGC	2	6	699948	699953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812347
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13144	NC_012580	AGC	2	6	700493	700498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812348
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13146	NC_012580	AACA	2	8	700535	700542	75 %	0 %	0 %	25 %	227812348
13147	NC_012580	GCG	2	6	700628	700633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227812348
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13149	NC_012580	TCA	2	6	700719	700724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812348
13150	NC_012580	GA	3	6	700784	700789	50 %	0 %	50 %	0 %	227812348
13151	NC_012580	ATG	2	6	700859	700864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812348
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13154	NC_012580	CTG	2	6	700914	700919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812349
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13157	NC_012580	CT	3	6	701101	701106	0 %	50 %	0 %	50 %	227812349
13158	NC_012580	ACG	2	6	701154	701159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812349
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13162	NC_012580	GAT	2	6	701386	701391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812349
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13170	NC_012580	T	6	6	701900	701905	0 %	100 %	0 %	0 %	227812350
13171	NC_012580	TCA	2	6	701969	701974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812350
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13178	NC_012580	CTTA	2	8	702437	702444	25 %	50 %	0 %	25 %	227812350
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13185	NC_012580	CA	3	6	702801	702806	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13186	NC_012580	TGAC	2	8	702852	702859	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13187	NC_012580	CGATCC	2	12	702962	702973	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	227812351
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13216	NC_012580	TTTC	2	8	704922	704929	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13217	NC_012580	CAG	2	6	705006	705011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812352
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13221	NC_012580	CTGTT	2	10	705265	705274	0 %	60 %	20 %	20 %	227812352
13222	NC_012580	A	6	6	705342	705347	100 %	0 %	0 %	0 %	227812352
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13231	NC_012580	ATCA	2	8	705834	705841	50 %	25 %	0 %	25 %	227812352
13232	NC_012580	CTG	2	6	705948	705953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812352
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13236	NC_012580	TGA	2	6	706070	706075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812352
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13239	NC_012580	CGT	2	6	706218	706223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812352
13240	NC_012580	CTG	3	9	706290	706298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812352
13241	NC_012580	GT	3	6	706312	706317	0 %	50 %	50 %	0 %	227812352
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13244	NC_012580	GACA	2	8	706451	706458	50 %	0 %	25 %	25 %	227812352
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13248	NC_012580	T	6	6	706726	706731	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13249	NC_012580	T	6	6	706752	706757	0 %	100 %	0 %	0 %	227812354
13250	NC_012580	GTA	2	6	707044	707049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812354
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13491	NC_012580	ACA	2	6	720088	720093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227812369
13492	NC_012580	TGC	2	6	720122	720127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812369
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13498	NC_012580	TTAT	2	8	720365	720372	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13499	NC_012580	AATGA	2	10	720392	720401	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
13500	NC_012580	A	6	6	720422	720427	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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