MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae M66-2 chromosome II

Total Repeats: 19727

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_012580	GTG	3	9	610917	610925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227812264
11502	NC_012580	GCA	2	6	611070	611075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812265
11503	NC_012580	ATT	2	6	611079	611084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227812265
11504	NC_012580	TAC	2	6	611168	611173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11505	NC_012580	GGTT	2	8	611182	611189	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11506	NC_012580	TAC	2	6	611191	611196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11507	NC_012580	AC	3	6	611199	611204	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11508	NC_012580	GGC	2	6	611229	611234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11509	NC_012580	TGAA	2	8	611280	611287	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11510	NC_012580	AGG	2	6	611313	611318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11511	NC_012580	AGG	2	6	611385	611390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227812266
11512	NC_012580	TGG	2	6	611448	611453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227812266
11513	NC_012580	CGC	2	6	611506	611511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227812266
11514	NC_012580	TCA	2	6	611600	611605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812266
11515	NC_012580	GTG	2	6	611608	611613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227812266
11516	NC_012580	CCG	2	6	611614	611619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227812266
11517	NC_012580	GGA	2	6	611632	611637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227812266
11518	NC_012580	CCG	2	6	611654	611659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227812266
11519	NC_012580	CGT	2	6	611709	611714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812266
11520	NC_012580	TGC	2	6	611751	611756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812266
11521	NC_012580	GAA	2	6	611764	611769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227812266
11522	NC_012580	TGA	2	6	611853	611858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812266
11523	NC_012580	TTG	2	6	611879	611884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227812266
11524	NC_012580	A	6	6	611974	611979	100 %	0 %	0 %	0 %	227812266
11525	NC_012580	ATG	2	6	612149	612154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812266
11526	NC_012580	TTG	2	6	612166	612171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227812266
11527	NC_012580	A	7	7	612200	612206	100 %	0 %	0 %	0 %	227812266
11528	NC_012580	AGC	2	6	612227	612232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812266
11529	NC_012580	TCAAT	2	10	612287	612296	40 %	40 %	0 %	20 %	227812266
11530	NC_012580	TCA	2	6	612311	612316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812266
11531	NC_012580	GGC	2	6	612322	612327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227812266
11532	NC_012580	ATC	2	6	612343	612348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812266
11533	NC_012580	TCG	2	6	612383	612388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812266
11534	NC_012580	TGA	2	6	612402	612407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812266
11535	NC_012580	TCAT	2	8	612434	612441	25 %	50 %	0 %	25 %	227812266
11536	NC_012580	GTT	2	6	612538	612543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227812266
11537	NC_012580	AAC	2	6	612608	612613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11538	NC_012580	GGC	2	6	612629	612634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11539	NC_012580	AGTG	2	8	612636	612643	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11540	NC_012580	GAAC	2	8	612681	612688	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11541	NC_012580	TA	3	6	612724	612729	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11542	NC_012580	AT	3	6	612737	612742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11543	NC_012580	AAG	2	6	612796	612801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11544	NC_012580	TGA	2	6	612825	612830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11545	NC_012580	CTT	2	6	612865	612870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227812267
11546	NC_012580	CCA	2	6	613014	613019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227812267
11547	NC_012580	ACC	3	9	613025	613033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227812267
11548	NC_012580	CCG	2	6	613041	613046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227812267
11549	NC_012580	TTG	2	6	613128	613133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227812267
11550	NC_012580	GTA	2	6	613172	613177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812267
11551	NC_012580	CAG	2	6	613204	613209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812267
11552	NC_012580	AG	3	6	613230	613235	50 %	0 %	50 %	0 %	227812267
11553	NC_012580	GCC	2	6	613313	613318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227812267
11554	NC_012580	TCC	2	6	613379	613384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227812267
11555	NC_012580	TTG	2	6	613404	613409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227812267
11556	NC_012580	GATT	2	8	613426	613433	25 %	50 %	25 %	0 %	227812267
11557	NC_012580	CAG	2	6	613492	613497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812267
11558	NC_012580	TCT	2	6	613777	613782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227812267
11559	NC_012580	GTG	2	6	613851	613856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227812267
11560	NC_012580	TTC	2	6	613911	613916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227812267
11561	NC_012580	TGT	2	6	613981	613986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227812267
11562	NC_012580	GTT	2	6	614012	614017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227812267
11563	NC_012580	CAC	2	6	614092	614097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227812267
11564	NC_012580	AGT	2	6	614173	614178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812267
11565	NC_012580	ACC	2	6	614210	614215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227812267
11566	NC_012580	GCG	2	6	614280	614285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227812267
11567	NC_012580	TAA	2	6	614384	614389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227812267
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11569	NC_012580	AAG	2	6	614491	614496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227812267
11570	NC_012580	ACG	2	6	614510	614515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812267
11571	NC_012580	ATC	2	6	614534	614539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812267
11572	NC_012580	ATC	2	6	614613	614618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812267
11573	NC_012580	TGG	2	6	614677	614682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227812267
11574	NC_012580	CCA	2	6	614697	614702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227812267
11575	NC_012580	CCG	2	6	614736	614741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227812267
11576	NC_012580	CCG	2	6	614754	614759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227812267
11577	NC_012580	TTTG	2	8	614788	614795	0 %	75 %	25 %	0 %	227812267
11578	NC_012580	TG	3	6	614950	614955	0 %	50 %	50 %	0 %	227812267
11579	NC_012580	ATC	2	6	615002	615007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812267
11580	NC_012580	GAT	2	6	615049	615054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812267
11581	NC_012580	CAC	2	6	615170	615175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227812267
11582	NC_012580	CG	3	6	615225	615230	0 %	0 %	50 %	50 %	227812267
11583	NC_012580	CAC	2	6	615307	615312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227812267
11584	NC_012580	CCG	2	6	615352	615357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227812267
11585	NC_012580	AG	4	8	615404	615411	50 %	0 %	50 %	0 %	227812267
11586	NC_012580	TCAC	2	8	615450	615457	25 %	25 %	0 %	50 %	227812267
11587	NC_012580	ATC	2	6	615497	615502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812267
11588	NC_012580	ACCA	2	8	615578	615585	50 %	0 %	0 %	50 %	227812267
11589	NC_012580	CG	3	6	615612	615617	0 %	0 %	50 %	50 %	227812267
11590	NC_012580	TGC	2	6	615644	615649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812267
11591	NC_012580	GCGGT	2	10	615691	615700	0 %	20 %	60 %	20 %	227812267
11592	NC_012580	C	7	7	615728	615734	0 %	0 %	0 %	100 %	227812267
11593	NC_012580	TGC	2	6	615739	615744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812267
11594	NC_012580	GTT	2	6	615797	615802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227812267
11595	NC_012580	AGT	2	6	615811	615816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812267
11596	NC_012580	TGC	2	6	615840	615845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812267
11597	NC_012580	CAC	2	6	615853	615858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227812267
11598	NC_012580	GCA	2	6	615909	615914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812267
11599	NC_012580	GCT	2	6	615917	615922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812267
11600	NC_012580	TTG	2	6	616000	616005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227812267
11601	NC_012580	TTC	2	6	616006	616011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11602	NC_012580	TTA	2	6	616019	616024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11603	NC_012580	TAAA	2	8	616035	616042	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11604	NC_012580	AAC	2	6	616079	616084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11605	NC_012580	A	6	6	616113	616118	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11606	NC_012580	TAA	2	6	616129	616134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11607	NC_012580	CAA	2	6	616188	616193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11608	NC_012580	A	7	7	616220	616226	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11609	NC_012580	CAA	2	6	616257	616262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11610	NC_012580	TG	3	6	616267	616272	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11611	NC_012580	AAT	2	6	616339	616344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11612	NC_012580	AAC	2	6	616380	616385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11613	NC_012580	GCA	2	6	616402	616407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11614	NC_012580	AGTG	2	8	616408	616415	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11615	NC_012580	GAAC	2	8	616453	616460	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11616	NC_012580	GCT	2	6	616615	616620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11617	NC_012580	CAACC	2	10	616689	616698	40 %	0 %	0 %	60 %	227812269
11618	NC_012580	TGG	3	9	616776	616784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227812269
11619	NC_012580	CCAA	2	8	616873	616880	50 %	0 %	0 %	50 %	227812269
11620	NC_012580	CGG	2	6	616944	616949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227812269
11621	NC_012580	GCC	2	6	616981	616986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227812269
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11623	NC_012580	AC	3	6	617031	617036	50 %	0 %	0 %	50 %	227812269
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11985	NC_012580	GA	3	6	637001	637006	50 %	0 %	50 %	0 %	227812285
11986	NC_012580	TATT	2	8	637040	637047	25 %	75 %	0 %	0 %	227812285
11987	NC_012580	GAA	2	6	637112	637117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227812285
11988	NC_012580	GCA	2	6	637152	637157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812285
11989	NC_012580	TGCGC	2	10	637210	637219	0 %	20 %	40 %	40 %	227812285
11990	NC_012580	ATC	2	6	637250	637255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812285
11991	NC_012580	CAC	2	6	637294	637299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227812285
11992	NC_012580	TGTT	2	8	637302	637309	0 %	75 %	25 %	0 %	227812285
11993	NC_012580	GCCA	2	8	637311	637318	25 %	0 %	25 %	50 %	227812285
11994	NC_012580	CGC	2	6	637324	637329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227812285
11995	NC_012580	CG	3	6	637348	637353	0 %	0 %	50 %	50 %	227812285
11996	NC_012580	CTT	2	6	637402	637407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227812285
11997	NC_012580	AG	3	6	637417	637422	50 %	0 %	50 %	0 %	227812285
11998	NC_012580	TCT	2	6	637440	637445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227812285
11999	NC_012580	T	6	6	637457	637462	0 %	100 %	0 %	0 %	227812285
12000	NC_012580	CAA	2	6	637474	637479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227812285

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