MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae M66-2 chromosome II

Total Repeats: 19727

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_012580	TTG	2	6	584818	584823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227812242
11002	NC_012580	CGCC	2	8	584873	584880	0 %	0 %	25 %	75 %	227812242
11003	NC_012580	TGC	2	6	584918	584923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812242
11004	NC_012580	TCC	2	6	584929	584934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227812242
11005	NC_012580	CAAT	2	8	585086	585093	50 %	25 %	0 %	25 %	227812242
11006	NC_012580	T	6	6	585198	585203	0 %	100 %	0 %	0 %	227812242
11007	NC_012580	GTA	2	6	585231	585236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812242
11008	NC_012580	TTG	2	6	585240	585245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227812242
11009	NC_012580	CAT	2	6	585413	585418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812242
11010	NC_012580	AGA	2	6	585423	585428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227812242
11011	NC_012580	GTC	2	6	585454	585459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812242
11012	NC_012580	GA	3	6	585466	585471	50 %	0 %	50 %	0 %	227812242
11013	NC_012580	AATG	2	8	585511	585518	50 %	25 %	25 %	0 %	227812242
11014	NC_012580	TC	4	8	585542	585549	0 %	50 %	0 %	50 %	227812242
11015	NC_012580	TGAT	2	8	585550	585557	25 %	50 %	25 %	0 %	227812242
11016	NC_012580	AC	3	6	585584	585589	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11017	NC_012580	CCA	2	6	585630	585635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11018	NC_012580	CCT	2	6	585645	585650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11019	NC_012580	ACG	2	6	585750	585755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812243
11020	NC_012580	CCAA	2	8	585779	585786	50 %	0 %	0 %	50 %	227812243
11021	NC_012580	GGC	2	6	585898	585903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227812243
11022	NC_012580	TCGA	2	8	585922	585929	25 %	25 %	25 %	25 %	227812243
11023	NC_012580	AAGCG	2	10	585990	585999	40 %	0 %	40 %	20 %	227812243
11024	NC_012580	GCAA	2	8	586005	586012	50 %	0 %	25 %	25 %	227812243
11025	NC_012580	TGCC	2	8	586074	586081	0 %	25 %	25 %	50 %	227812243
11026	NC_012580	AGA	2	6	586083	586088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227812243
11027	NC_012580	TTTGC	2	10	586099	586108	0 %	60 %	20 %	20 %	227812243
11028	NC_012580	CCGCA	2	10	586116	586125	20 %	0 %	20 %	60 %	227812243
11029	NC_012580	TGG	2	6	586300	586305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227812244
11030	NC_012580	CAG	2	6	586341	586346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812244
11031	NC_012580	GAGC	2	8	586349	586356	25 %	0 %	50 %	25 %	227812244
11032	NC_012580	TCG	2	6	586399	586404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812244
11033	NC_012580	TCA	2	6	586432	586437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812244
11034	NC_012580	TAA	2	6	586457	586462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227812244
11035	NC_012580	TCA	2	6	586496	586501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812244
11036	NC_012580	GAA	3	9	586518	586526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227812244
11037	NC_012580	AC	3	6	586532	586537	50 %	0 %	0 %	50 %	227812244
11038	NC_012580	GCC	2	6	586610	586615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227812245
11039	NC_012580	GCG	2	6	586622	586627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227812245
11040	NC_012580	CCA	2	6	586656	586661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227812245
11041	NC_012580	CA	3	6	586774	586779	50 %	0 %	0 %	50 %	227812245
11042	NC_012580	CGC	2	6	586872	586877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227812245
11043	NC_012580	TGC	2	6	586878	586883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812245
11044	NC_012580	TGATG	2	10	586948	586957	20 %	40 %	40 %	0 %	227812245
11045	NC_012580	CGG	2	6	587049	587054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227812245
11046	NC_012580	TGA	2	6	587061	587066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812245
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11048	NC_012580	TGA	2	6	587155	587160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812245
11049	NC_012580	GAC	2	6	587177	587182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812245
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11051	NC_012580	CCAC	2	8	587353	587360	25 %	0 %	0 %	75 %	227812245
11052	NC_012580	CAT	2	6	587398	587403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812245
11053	NC_012580	CAA	2	6	587434	587439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227812245
11054	NC_012580	A	6	6	587564	587569	100 %	0 %	0 %	0 %	227812245
11055	NC_012580	ACTT	2	8	587748	587755	25 %	50 %	0 %	25 %	227812245
11056	NC_012580	TGG	3	9	587868	587876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227812245
11057	NC_012580	GCA	2	6	587962	587967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812245
11058	NC_012580	TAA	2	6	588016	588021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227812245
11059	NC_012580	AAG	2	6	588168	588173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227812245
11060	NC_012580	CAA	2	6	588215	588220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227812245
11061	NC_012580	GAA	2	6	588305	588310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227812245
11062	NC_012580	CTG	2	6	588311	588316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812245
11063	NC_012580	GAT	2	6	588416	588421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812245
11064	NC_012580	CAC	2	6	588425	588430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227812245
11065	NC_012580	ACC	2	6	588519	588524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227812245
11066	NC_012580	AAG	2	6	588582	588587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227812245
11067	NC_012580	ATC	2	6	588656	588661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812245
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11069	NC_012580	CGT	2	6	588764	588769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812245
11070	NC_012580	GC	3	6	588833	588838	0 %	0 %	50 %	50 %	227812245
11071	NC_012580	GTG	2	6	588879	588884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227812245
11072	NC_012580	TAA	2	6	588916	588921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227812245
11073	NC_012580	GCC	2	6	588922	588927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227812245
11074	NC_012580	CTTT	2	8	588948	588955	0 %	75 %	0 %	25 %	227812245
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11076	NC_012580	CGAC	2	8	588993	589000	25 %	0 %	25 %	50 %	227812245
11077	NC_012580	GACT	2	8	589015	589022	25 %	25 %	25 %	25 %	227812245
11078	NC_012580	AAG	2	6	589025	589030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227812245
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11080	NC_012580	CTGG	2	8	589169	589176	0 %	25 %	50 %	25 %	227812246
11081	NC_012580	GCTGA	2	10	589187	589196	20 %	20 %	40 %	20 %	227812246
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11084	NC_012580	AG	3	6	589303	589308	50 %	0 %	50 %	0 %	227812246
11085	NC_012580	ACC	2	6	589324	589329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227812246
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11088	NC_012580	TCAC	2	8	589440	589447	25 %	25 %	0 %	50 %	227812246
11089	NC_012580	TC	3	6	589482	589487	0 %	50 %	0 %	50 %	227812246
11090	NC_012580	CGC	2	6	589490	589495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227812246
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11092	NC_012580	CGG	2	6	589683	589688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227812247
11093	NC_012580	TAT	2	6	589691	589696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227812247
11094	NC_012580	TGG	2	6	589898	589903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227812247
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11098	NC_012580	TG	3	6	590107	590112	0 %	50 %	50 %	0 %	227812247
11099	NC_012580	CA	3	6	590132	590137	50 %	0 %	0 %	50 %	227812247
11100	NC_012580	CATG	2	8	590148	590155	25 %	25 %	25 %	25 %	227812247
11101	NC_012580	T	6	6	590206	590211	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11102	NC_012580	TCA	2	6	590242	590247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11103	NC_012580	CGT	2	6	590273	590278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11104	NC_012580	AG	4	8	590322	590329	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11105	NC_012580	T	6	6	590355	590360	0 %	100 %	0 %	0 %	227812248
11106	NC_012580	ATA	2	6	590474	590479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227812248
11107	NC_012580	TCA	2	6	590481	590486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812248
11108	NC_012580	TGC	2	6	590502	590507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812248
11109	NC_012580	CTTG	2	8	590519	590526	0 %	50 %	25 %	25 %	227812248
11110	NC_012580	CGCAAT	2	12	590548	590559	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	227812248
11111	NC_012580	CGC	2	6	590581	590586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227812248
11112	NC_012580	TGG	2	6	590630	590635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227812248
11113	NC_012580	CA	3	6	590649	590654	50 %	0 %	0 %	50 %	227812248
11114	NC_012580	TCT	2	6	590762	590767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227812248
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11116	NC_012580	A	6	6	590977	590982	100 %	0 %	0 %	0 %	227812248
11117	NC_012580	ATG	3	9	591019	591027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812248
11118	NC_012580	A	7	7	591212	591218	100 %	0 %	0 %	0 %	227812248
11119	NC_012580	CGC	2	6	591223	591228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227812248
11120	NC_012580	GTTT	2	8	591234	591241	0 %	75 %	25 %	0 %	227812248
11121	NC_012580	TGG	2	6	591284	591289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227812248
11122	NC_012580	CGCA	2	8	591350	591357	25 %	0 %	25 %	50 %	227812248
11123	NC_012580	TGC	2	6	591359	591364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812248
11124	NC_012580	GCCAC	2	10	591419	591428	20 %	0 %	20 %	60 %	227812248
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11126	NC_012580	CTCCA	2	10	591476	591485	20 %	20 %	0 %	60 %	227812248
11127	NC_012580	TGAT	2	8	591530	591537	25 %	50 %	25 %	0 %	227812248
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11130	NC_012580	A	7	7	591576	591582	100 %	0 %	0 %	0 %	227812248
11131	NC_012580	TGCC	2	8	591583	591590	0 %	25 %	25 %	50 %	227812248
11132	NC_012580	ATA	2	6	591665	591670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11133	NC_012580	GTA	2	6	591676	591681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11134	NC_012580	ACC	2	6	591683	591688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11135	NC_012580	CAT	2	6	591809	591814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812249
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11219	NC_012580	AAT	2	6	596643	596648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11220	NC_012580	CATG	2	8	596659	596666	25 %	25 %	25 %	25 %	227812253
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11229	NC_012580	CTG	2	6	597122	597127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812253
11230	NC_012580	CTT	2	6	597298	597303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227812253
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11232	NC_012580	GAA	2	6	597596	597601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227812253
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11236	NC_012580	CTG	3	9	597833	597841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812253
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11240	NC_012580	TCA	2	6	598125	598130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812253
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11485	NC_012580	GC	3	6	610076	610081	0 %	0 %	50 %	50 %	227812264
11486	NC_012580	TGA	2	6	610089	610094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812264
11487	NC_012580	CT	3	6	610121	610126	0 %	50 %	0 %	50 %	227812264
11488	NC_012580	A	6	6	610168	610173	100 %	0 %	0 %	0 %	227812264
11489	NC_012580	AGC	2	6	610198	610203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812264
11490	NC_012580	GATG	2	8	610204	610211	25 %	25 %	50 %	0 %	227812264
11491	NC_012580	GGT	2	6	610222	610227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227812264
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