MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae M66-2 chromosome II

Total Repeats: 19727

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10502	NC_012580	GC	3	6	558538	558543	0 %	0 %	50 %	50 %	227812217
10503	NC_012580	AT	3	6	558656	558661	50 %	50 %	0 %	0 %	227812217
10504	NC_012580	TCGCT	2	10	558665	558674	0 %	40 %	20 %	40 %	227812217
10505	NC_012580	CAC	2	6	558710	558715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227812217
10506	NC_012580	TTGT	2	8	558888	558895	0 %	75 %	25 %	0 %	227812217
10507	NC_012580	ACGC	2	8	558993	559000	25 %	0 %	25 %	50 %	227812217
10508	NC_012580	GAT	2	6	559041	559046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812217
10509	NC_012580	TGC	2	6	559114	559119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812217
10510	NC_012580	GTT	2	6	559166	559171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227812217
10511	NC_012580	CAC	2	6	559199	559204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227812217
10512	NC_012580	TAAA	2	8	559398	559405	75 %	25 %	0 %	0 %	227812217
10513	NC_012580	TGG	2	6	559406	559411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227812217
10514	NC_012580	CCA	2	6	559418	559423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227812217
10515	NC_012580	TAA	2	6	559444	559449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227812217
10516	NC_012580	CAG	2	6	559455	559460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812217
10517	NC_012580	CAC	3	9	559470	559478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227812217
10518	NC_012580	CGTT	2	8	559528	559535	0 %	50 %	25 %	25 %	227812217
10519	NC_012580	GGC	2	6	559536	559541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227812217
10520	NC_012580	AAC	2	6	559662	559667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227812218
10521	NC_012580	CCA	3	9	559685	559693	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227812218
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10525	NC_012580	AAT	2	6	559938	559943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227812218
10526	NC_012580	TAA	2	6	559986	559991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227812218
10527	NC_012580	TCT	2	6	560097	560102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227812218
10528	NC_012580	AATA	2	8	560103	560110	75 %	25 %	0 %	0 %	227812218
10529	NC_012580	GCT	2	6	560150	560155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812218
10530	NC_012580	AATC	2	8	560193	560200	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10531	NC_012580	ATT	2	6	560208	560213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10532	NC_012580	TTA	2	6	560222	560227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10533	NC_012580	AAAGA	2	10	560275	560284	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
10534	NC_012580	GAAAA	2	10	560289	560298	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
10535	NC_012580	AAG	2	6	560342	560347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10536	NC_012580	TGT	2	6	560399	560404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10537	NC_012580	T	6	6	560438	560443	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10538	NC_012580	CAAAC	2	10	560473	560482	60 %	0 %	0 %	40 %	227812219
10539	NC_012580	TC	3	6	560512	560517	0 %	50 %	0 %	50 %	227812219
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10542	NC_012580	GAA	2	6	560760	560765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227812219
10543	NC_012580	TG	3	6	560814	560819	0 %	50 %	50 %	0 %	227812219
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10547	NC_012580	A	6	6	561016	561021	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10548	NC_012580	T	6	6	561095	561100	0 %	100 %	0 %	0 %	227812220
10549	NC_012580	GGC	2	6	561132	561137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227812220
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10554	NC_012580	CAG	2	6	561348	561353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812220
10555	NC_012580	TCA	2	6	561404	561409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812220
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10558	NC_012580	ATCA	2	8	562065	562072	50 %	25 %	0 %	25 %	227812220
10559	NC_012580	ACC	2	6	562134	562139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227812220
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10562	NC_012580	CAT	2	6	562235	562240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812220
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10569	NC_012580	TCAA	2	8	562945	562952	50 %	25 %	0 %	25 %	227812221
10570	NC_012580	A	6	6	562975	562980	100 %	0 %	0 %	0 %	227812221
10571	NC_012580	CG	3	6	563005	563010	0 %	0 %	50 %	50 %	227812221
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10573	NC_012580	AGCA	2	8	563062	563069	50 %	0 %	25 %	25 %	227812221
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10585	NC_012580	ATG	2	6	563623	563628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812221
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10592	NC_012580	CAC	3	9	564172	564180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227812222
10593	NC_012580	TTTA	2	8	564207	564214	25 %	75 %	0 %	0 %	227812222
10594	NC_012580	TCA	2	6	564215	564220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812222
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10599	NC_012580	CG	3	6	564473	564478	0 %	0 %	50 %	50 %	227812222
10600	NC_012580	GC	3	6	564604	564609	0 %	0 %	50 %	50 %	227812222
10601	NC_012580	CGCT	2	8	564613	564620	0 %	25 %	25 %	50 %	227812222
10602	NC_012580	GAC	2	6	564628	564633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812222
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10606	NC_012580	GCA	2	6	564977	564982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812222
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10609	NC_012580	ACGTTA	2	12	565218	565229	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	227812222
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10612	NC_012580	TAC	2	6	565464	565469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812222
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10614	NC_012580	AT	3	6	565567	565572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10615	NC_012580	AG	3	6	565576	565581	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10616	NC_012580	AT	3	6	565582	565587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10617	NC_012580	TG	3	6	565700	565705	0 %	50 %	50 %	0 %	227812223
10618	NC_012580	GCC	2	6	565801	565806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227812223
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10622	NC_012580	CTT	2	6	565959	565964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227812223
10623	NC_012580	TCC	3	9	565997	566005	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227812223
10624	NC_012580	CAC	2	6	566014	566019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227812223
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10626	NC_012580	C	6	6	566114	566119	0 %	0 %	0 %	100 %	227812223
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10631	NC_012580	A	7	7	566422	566428	100 %	0 %	0 %	0 %	227812223
10632	NC_012580	CAC	2	6	566478	566483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227812223
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10635	NC_012580	CTC	2	6	566570	566575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227812223
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10637	NC_012580	ATC	2	6	566737	566742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10638	NC_012580	CATCC	2	10	566749	566758	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
10639	NC_012580	GCA	2	6	566773	566778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10652	NC_012580	TGA	2	6	567775	567780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812224
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10986	NC_012580	GGT	2	6	584244	584249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227812242
10987	NC_012580	AGT	2	6	584251	584256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812242
10988	NC_012580	ATG	2	6	584305	584310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812242
10989	NC_012580	CTTA	2	8	584319	584326	25 %	50 %	0 %	25 %	227812242
10990	NC_012580	AG	3	6	584391	584396	50 %	0 %	50 %	0 %	227812242
10991	NC_012580	TGG	2	6	584432	584437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227812242
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10993	NC_012580	GCGCT	2	10	584472	584481	0 %	20 %	40 %	40 %	227812242
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10995	NC_012580	CG	4	8	584496	584503	0 %	0 %	50 %	50 %	227812242
10996	NC_012580	ATCA	2	8	584523	584530	50 %	25 %	0 %	25 %	227812242
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