MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae M66-2 chromosome II

Total Repeats: 19727

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_012580	TTG	2	6	314426	314431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227811920
6002	NC_012580	T	7	7	314459	314465	0 %	100 %	0 %	0 %	227811920
6003	NC_012580	GCA	2	6	314473	314478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811920
6004	NC_012580	TTG	2	6	314492	314497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227811920
6005	NC_012580	GAA	2	6	314532	314537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227811920
6006	NC_012580	CAG	2	6	314617	314622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811920
6007	NC_012580	CAT	2	6	314635	314640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811920
6008	NC_012580	AGT	2	6	314685	314690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811920
6009	NC_012580	ATT	2	6	314698	314703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227811920
6010	NC_012580	GGT	2	6	314765	314770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_012580	GTT	2	6	314775	314780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_012580	T	6	6	315095	315100	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_012580	TTTG	2	8	315112	315119	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_012580	TCTA	2	8	315302	315309	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6015	NC_012580	A	6	6	315311	315316	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_012580	TCA	2	6	315317	315322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6017	NC_012580	AAT	2	6	315344	315349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_012580	CAA	2	6	315453	315458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227811922
6019	NC_012580	TGT	2	6	315474	315479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227811922
6020	NC_012580	CAT	2	6	315519	315524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811922
6021	NC_012580	GT	3	6	315628	315633	0 %	50 %	50 %	0 %	227811922
6022	NC_012580	CAAA	2	8	315664	315671	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6023	NC_012580	A	6	6	315678	315683	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_012580	GGT	2	6	315770	315775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_012580	GGCG	2	8	315824	315831	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6026	NC_012580	GCA	2	6	315922	315927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811923
6027	NC_012580	ATT	2	6	315984	315989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227811923
6028	NC_012580	TAAT	2	8	316005	316012	50 %	50 %	0 %	0 %	227811923
6029	NC_012580	A	6	6	316024	316029	100 %	0 %	0 %	0 %	227811923
6030	NC_012580	ATA	2	6	316059	316064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227811923
6031	NC_012580	AT	3	6	316122	316127	50 %	50 %	0 %	0 %	227811923
6032	NC_012580	TGA	2	6	316147	316152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811923
6033	NC_012580	TGA	2	6	316177	316182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811923
6034	NC_012580	CCA	2	6	316205	316210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227811923
6035	NC_012580	AGA	2	6	316237	316242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227811923
6036	NC_012580	AT	3	6	316287	316292	50 %	50 %	0 %	0 %	227811923
6037	NC_012580	TTC	2	6	316323	316328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227811923
6038	NC_012580	ATG	2	6	316415	316420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811923
6039	NC_012580	A	8	8	316442	316449	100 %	0 %	0 %	0 %	227811923
6040	NC_012580	GAT	2	6	316457	316462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811923
6041	NC_012580	T	7	7	316480	316486	0 %	100 %	0 %	0 %	227811923
6042	NC_012580	ATG	2	6	316512	316517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811923
6043	NC_012580	TTG	2	6	316530	316535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227811923
6044	NC_012580	ATT	2	6	316575	316580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227811923
6045	NC_012580	GA	3	6	316658	316663	50 %	0 %	50 %	0 %	227811923
6046	NC_012580	A	8	8	316673	316680	100 %	0 %	0 %	0 %	227811923
6047	NC_012580	TTC	2	6	316684	316689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227811923
6048	NC_012580	TCTA	2	8	316699	316706	25 %	50 %	0 %	25 %	227811923
6049	NC_012580	ATA	2	6	316719	316724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227811923
6050	NC_012580	A	6	6	316724	316729	100 %	0 %	0 %	0 %	227811923
6051	NC_012580	TAA	3	9	316752	316760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227811923
6052	NC_012580	A	6	6	316826	316831	100 %	0 %	0 %	0 %	227811923
6053	NC_012580	A	8	8	316938	316945	100 %	0 %	0 %	0 %	227811923
6054	NC_012580	CG	3	6	317000	317005	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6055	NC_012580	GTT	2	6	317040	317045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_012580	GGCG	2	8	317083	317090	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6057	NC_012580	AGA	2	6	317119	317124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227811924
6058	NC_012580	TTG	2	6	317301	317306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227811924
6059	NC_012580	GATGTT	2	12	317392	317403	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	227811924
6060	NC_012580	AGCTT	2	10	317442	317451	20 %	40 %	20 %	20 %	227811924
6061	NC_012580	GAACA	2	10	317462	317471	60 %	0 %	20 %	20 %	227811924
6062	NC_012580	GGT	2	6	317643	317648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_012580	GTT	2	6	317653	317658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_012580	GGCG	2	8	317696	317703	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6065	NC_012580	CTT	2	6	317708	317713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6066	NC_012580	CAG	2	6	317835	317840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811925
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6072	NC_012580	GGT	2	6	318176	318181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6073	NC_012580	TGT	2	6	318188	318193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_012580	GGCG	2	8	318230	318237	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6075	NC_012580	ATT	2	6	318271	318276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227811927
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6084	NC_012580	GGT	2	6	318827	318832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6085	NC_012580	GTT	2	6	318837	318842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6086	NC_012580	GGCG	2	8	318880	318887	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6087	NC_012580	CAT	2	6	318903	318908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811928
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6090	NC_012580	CTCGA	2	10	319031	319040	20 %	20 %	20 %	40 %	227811928
6091	NC_012580	ATG	2	6	319094	319099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811928
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6093	NC_012580	T	6	6	319213	319218	0 %	100 %	0 %	0 %	227811928
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6095	NC_012580	AATA	2	8	319418	319425	75 %	25 %	0 %	0 %	227811928
6096	NC_012580	GTT	2	6	319496	319501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6097	NC_012580	GGCG	2	8	319539	319546	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6098	NC_012580	TTC	2	6	319742	319747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227811929
6099	NC_012580	CGG	2	6	319920	319925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227811929
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6101	NC_012580	CA	3	6	320005	320010	50 %	0 %	0 %	50 %	227811929
6102	NC_012580	GTTG	2	8	320061	320068	0 %	50 %	50 %	0 %	227811929
6103	NC_012580	GGT	2	6	320157	320162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_012580	GGCG	2	8	320210	320217	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6105	NC_012580	T	6	6	320487	320492	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6106	NC_012580	TTTG	2	8	320504	320511	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6107	NC_012580	TCTA	2	8	320694	320701	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6108	NC_012580	A	6	6	320703	320708	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6109	NC_012580	TCA	2	6	320709	320714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6110	NC_012580	AAT	2	6	320736	320741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6111	NC_012580	CAA	2	6	320845	320850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6112	NC_012580	TGT	2	6	320866	320871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6113	NC_012580	CAT	2	6	320911	320916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811931
6114	NC_012580	GT	3	6	321019	321024	0 %	50 %	50 %	0 %	227811931
6115	NC_012580	CAAA	2	8	321055	321062	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6116	NC_012580	A	6	6	321069	321074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_012580	GTT	2	6	321171	321176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_012580	TGG	2	6	321188	321193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_012580	GGCG	2	8	321215	321222	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6120	NC_012580	CAA	2	6	321238	321243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6121	NC_012580	GTA	2	6	321274	321279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811932
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6124	NC_012580	T	7	7	321436	321442	0 %	100 %	0 %	0 %	227811932
6125	NC_012580	GCT	2	6	321447	321452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811932
6126	NC_012580	GA	3	6	321497	321502	50 %	0 %	50 %	0 %	227811932
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6128	NC_012580	TGC	2	6	321677	321682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811933
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6250	NC_012580	AAGC	2	8	328162	328169	50 %	0 %	25 %	25 %	227811940
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