MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae M66-2 chromosome II

Total Repeats: 19727

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_012580	TTG	2	6	262507	262512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227811864
5002	NC_012580	GGTTTT	2	12	262549	262560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227811864
5003	NC_012580	TCT	2	6	262583	262588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227811864
5004	NC_012580	GCC	2	6	262597	262602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227811864
5005	NC_012580	AG	3	6	262630	262635	50 %	0 %	50 %	0 %	227811864
5006	NC_012580	CCAA	2	8	262666	262673	50 %	0 %	0 %	50 %	227811864
5007	NC_012580	GGT	2	6	262701	262706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811864
5008	NC_012580	T	6	6	262810	262815	0 %	100 %	0 %	0 %	227811864
5009	NC_012580	TG	3	6	262836	262841	0 %	50 %	50 %	0 %	227811864
5010	NC_012580	GA	3	6	262892	262897	50 %	0 %	50 %	0 %	227811864
5011	NC_012580	GGT	2	6	262912	262917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811864
5012	NC_012580	CA	3	6	262926	262931	50 %	0 %	0 %	50 %	227811864
5013	NC_012580	TTCC	2	8	262980	262987	0 %	50 %	0 %	50 %	227811864
5014	NC_012580	GGTT	2	8	263067	263074	0 %	50 %	50 %	0 %	227811864
5015	NC_012580	TTGGT	2	10	263097	263106	0 %	60 %	40 %	0 %	227811864
5016	NC_012580	GTT	2	6	263160	263165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227811865
5017	NC_012580	GC	3	6	263184	263189	0 %	0 %	50 %	50 %	227811865
5018	NC_012580	GCA	2	6	263246	263251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811865
5019	NC_012580	GGC	2	6	263295	263300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227811865
5020	NC_012580	GGC	2	6	263355	263360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227811865
5021	NC_012580	CGA	2	6	263456	263461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811865
5022	NC_012580	GCG	2	6	263525	263530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227811865
5023	NC_012580	TGAG	2	8	263533	263540	25 %	25 %	50 %	0 %	227811865
5024	NC_012580	AG	3	6	263539	263544	50 %	0 %	50 %	0 %	227811865
5025	NC_012580	GCTGC	2	10	263589	263598	0 %	20 %	40 %	40 %	227811865
5026	NC_012580	TTGT	2	8	263679	263686	0 %	75 %	25 %	0 %	227811865
5027	NC_012580	GAT	2	6	263751	263756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811865
5028	NC_012580	GTA	2	6	263781	263786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811865
5029	NC_012580	GC	3	6	263790	263795	0 %	0 %	50 %	50 %	227811865
5030	NC_012580	GTG	2	6	263802	263807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811865
5031	NC_012580	TGC	2	6	263836	263841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811865
5032	NC_012580	TGGA	2	8	263871	263878	25 %	25 %	50 %	0 %	227811865
5033	NC_012580	GTA	2	6	263954	263959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811866
5034	NC_012580	GAGC	2	8	264029	264036	25 %	0 %	50 %	25 %	227811866
5035	NC_012580	CAC	2	6	264071	264076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227811866
5036	NC_012580	ATGACG	2	12	264167	264178	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	227811866
5037	NC_012580	CGA	2	6	264187	264192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811866
5038	NC_012580	T	7	7	264207	264213	0 %	100 %	0 %	0 %	227811866
5039	NC_012580	CGC	2	6	264361	264366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227811866
5040	NC_012580	CCA	2	6	264436	264441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227811866
5041	NC_012580	CATCG	2	10	264482	264491	20 %	20 %	20 %	40 %	227811866
5042	NC_012580	CGC	2	6	264499	264504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227811866
5043	NC_012580	CGC	2	6	264523	264528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227811866
5044	NC_012580	CTCC	2	8	264636	264643	0 %	25 %	0 %	75 %	227811867
5045	NC_012580	TTG	2	6	264664	264669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227811867
5046	NC_012580	TTG	2	6	264679	264684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227811867
5047	NC_012580	GCG	2	6	264733	264738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227811867
5048	NC_012580	TCA	2	6	264773	264778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811867
5049	NC_012580	GGA	2	6	264823	264828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227811867
5050	NC_012580	GC	3	6	264940	264945	0 %	0 %	50 %	50 %	227811867
5051	NC_012580	GGGCA	2	10	264949	264958	20 %	0 %	60 %	20 %	227811867
5052	NC_012580	GCT	2	6	264990	264995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811867
5053	NC_012580	GAT	2	6	265006	265011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811867
5054	NC_012580	TTGGCT	2	12	265091	265102	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	227811867
5055	NC_012580	GTT	2	6	265117	265122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227811867
5056	NC_012580	CTT	2	6	265184	265189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5057	NC_012580	AG	3	6	265216	265221	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_012580	GAG	2	6	265380	265385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227811868
5059	NC_012580	ATG	2	6	265389	265394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811868
5060	NC_012580	GGT	2	6	265397	265402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811868
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5062	NC_012580	TAC	2	6	265618	265623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811868
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5065	NC_012580	TTG	2	6	265793	265798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227811868
5066	NC_012580	TCA	2	6	265864	265869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811868
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5070	NC_012580	GAT	2	6	265946	265951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811868
5071	NC_012580	CTG	2	6	265987	265992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811868
5072	NC_012580	GA	3	6	266041	266046	50 %	0 %	50 %	0 %	227811868
5073	NC_012580	CGC	2	6	266057	266062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227811868
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5075	NC_012580	AG	3	6	266258	266263	50 %	0 %	50 %	0 %	227811868
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5089	NC_012580	ATG	2	6	266598	266603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811868
5090	NC_012580	ATG	2	6	266616	266621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811868
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5100	NC_012580	CGT	2	6	266989	266994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811868
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5102	NC_012580	TGG	2	6	267049	267054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_012580	ATT	2	6	267128	267133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_012580	GAT	2	6	267282	267287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_012580	TAA	2	6	267288	267293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_012580	AAT	2	6	267322	267327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_012580	T	6	6	267350	267355	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_012580	ATGA	2	8	267373	267380	50 %	25 %	25 %	0 %	227811869
5109	NC_012580	ATT	2	6	267445	267450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227811869
5110	NC_012580	CGGCG	2	10	267476	267485	0 %	0 %	60 %	40 %	227811869
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5112	NC_012580	A	6	6	267557	267562	100 %	0 %	0 %	0 %	227811869
5113	NC_012580	GTG	2	6	267661	267666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811869
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5117	NC_012580	ATC	2	6	267787	267792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811869
5118	NC_012580	ACAAT	2	10	267801	267810	60 %	20 %	0 %	20 %	227811869
5119	NC_012580	CAG	2	6	267946	267951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811869
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5123	NC_012580	TCAC	2	8	268133	268140	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5371	NC_012580	ATC	2	6	280702	280707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811885
5372	NC_012580	CTT	2	6	280761	280766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227811885
5373	NC_012580	TCAGAA	2	12	280775	280786	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	227811885
5374	NC_012580	ATTC	2	8	280846	280853	25 %	50 %	0 %	25 %	227811885
5375	NC_012580	GCA	2	6	280908	280913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811886
5376	NC_012580	ATAG	2	8	280922	280929	50 %	25 %	25 %	0 %	227811886
5377	NC_012580	AGT	2	6	281014	281019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811886
5378	NC_012580	T	6	6	281072	281077	0 %	100 %	0 %	0 %	227811886
5379	NC_012580	A	6	6	281208	281213	100 %	0 %	0 %	0 %	227811886
5380	NC_012580	ATG	2	6	281247	281252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811886
5381	NC_012580	CAGC	2	8	281431	281438	25 %	0 %	25 %	50 %	227811886
5382	NC_012580	TGC	2	6	281481	281486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811886
5383	NC_012580	TTCA	2	8	281600	281607	25 %	50 %	0 %	25 %	227811886
5384	NC_012580	TAAG	2	8	281675	281682	50 %	25 %	25 %	0 %	227811886
5385	NC_012580	GA	3	6	281702	281707	50 %	0 %	50 %	0 %	227811886
5386	NC_012580	GTG	2	6	281708	281713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811886
5387	NC_012580	CT	3	6	281717	281722	0 %	50 %	0 %	50 %	227811886
5388	NC_012580	TCA	2	6	281784	281789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811886
5389	NC_012580	TGC	2	6	281904	281909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811886
5390	NC_012580	GTA	2	6	281978	281983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811886
5391	NC_012580	GA	3	6	281998	282003	50 %	0 %	50 %	0 %	227811886
5392	NC_012580	T	6	6	282121	282126	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5393	NC_012580	CA	3	6	282130	282135	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5394	NC_012580	TACT	2	8	282197	282204	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5395	NC_012580	AGA	2	6	282210	282215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5396	NC_012580	TCA	2	6	282247	282252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811887
5397	NC_012580	A	7	7	282272	282278	100 %	0 %	0 %	0 %	227811887
5398	NC_012580	CGG	2	6	282309	282314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227811887
5399	NC_012580	AGA	2	6	282406	282411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227811887
5400	NC_012580	GC	3	6	282413	282418	0 %	0 %	50 %	50 %	227811887
5401	NC_012580	TTA	2	6	282425	282430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227811887
5402	NC_012580	AGA	3	9	282451	282459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227811887
5403	NC_012580	AAG	2	6	282492	282497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227811887
5404	NC_012580	AAC	2	6	282616	282621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5405	NC_012580	T	6	6	282709	282714	0 %	100 %	0 %	0 %	227811888
5406	NC_012580	A	6	6	282715	282720	100 %	0 %	0 %	0 %	227811888
5407	NC_012580	TAA	2	6	282808	282813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227811888
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5409	NC_012580	CGA	2	6	282971	282976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811888
5410	NC_012580	TTG	2	6	282978	282983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227811888
5411	NC_012580	GGT	3	9	283039	283047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811888
5412	NC_012580	CT	3	6	283058	283063	0 %	50 %	0 %	50 %	227811888
5413	NC_012580	ATCA	2	8	283096	283103	50 %	25 %	0 %	25 %	227811888
5414	NC_012580	ATG	2	6	283205	283210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811888
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5420	NC_012580	GA	3	6	283482	283487	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5421	NC_012580	GC	3	6	283505	283510	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5422	NC_012580	ATGA	2	8	283522	283529	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5423	NC_012580	TC	3	6	283554	283559	0 %	50 %	0 %	50 %	227811889
5424	NC_012580	TCG	2	6	283594	283599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811889
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5432	NC_012580	T	6	6	284034	284039	0 %	100 %	0 %	0 %	227811889
5433	NC_012580	GTT	2	6	284116	284121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227811889
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5437	NC_012580	GCT	2	6	284348	284353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811889
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5441	NC_012580	GCACT	2	10	284482	284491	20 %	20 %	20 %	40 %	227811889
5442	NC_012580	TAT	2	6	284544	284549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227811889
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5445	NC_012580	TTG	2	6	284694	284699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5446	NC_012580	CAA	2	6	284718	284723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5447	NC_012580	ATA	2	6	284773	284778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5448	NC_012580	TAATT	2	10	284798	284807	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5449	NC_012580	TCC	2	6	284811	284816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5450	NC_012580	TCATT	2	10	284901	284910	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5451	NC_012580	CATG	2	8	284956	284963	25 %	25 %	25 %	25 %	227811890
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5453	NC_012580	CT	4	8	285069	285076	0 %	50 %	0 %	50 %	227811890
5454	NC_012580	GA	3	6	285082	285087	50 %	0 %	50 %	0 %	227811890
5455	NC_012580	TGAT	2	8	285088	285095	25 %	50 %	25 %	0 %	227811890
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5462	NC_012580	A	6	6	285435	285440	100 %	0 %	0 %	0 %	227811890
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5467	NC_012580	TGA	2	6	285599	285604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811890
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5469	NC_012580	TAC	2	6	285729	285734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811890
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5472	NC_012580	GATGTC	2	12	285807	285818	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	227811890
5473	NC_012580	ATCA	2	8	285888	285895	50 %	25 %	0 %	25 %	227811890
5474	NC_012580	TGC	2	6	285910	285915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811890
5475	NC_012580	TCG	2	6	285965	285970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811890
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5479	NC_012580	GAAC	2	8	286121	286128	50 %	0 %	25 %	25 %	227811890
5480	NC_012580	GGT	2	6	286163	286168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811890
5481	NC_012580	TGAG	2	8	286186	286193	25 %	25 %	50 %	0 %	227811890
5482	NC_012580	GC	3	6	286197	286202	0 %	0 %	50 %	50 %	227811890
5483	NC_012580	AATCA	2	10	286225	286234	60 %	20 %	0 %	20 %	227811890
5484	NC_012580	GCA	2	6	286262	286267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811890
5485	NC_012580	AAT	2	6	286284	286289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227811890
5486	NC_012580	CTT	2	6	286306	286311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227811890
5487	NC_012580	CAAA	2	8	286366	286373	75 %	0 %	0 %	25 %	227811890
5488	NC_012580	CTG	2	6	286422	286427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811890
5489	NC_012580	GCG	2	6	286449	286454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227811890
5490	NC_012580	GGT	2	6	286484	286489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811890
5491	NC_012580	GTGC	2	8	286500	286507	0 %	25 %	50 %	25 %	227811890
5492	NC_012580	CAC	2	6	286532	286537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227811890
5493	NC_012580	CGT	2	6	286583	286588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811890
5494	NC_012580	AGC	2	6	286609	286614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811890
5495	NC_012580	ACG	2	6	286623	286628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811890
5496	NC_012580	ATG	2	6	286665	286670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811890
5497	NC_012580	TGA	2	6	286691	286696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811890
5498	NC_012580	CA	3	6	286703	286708	50 %	0 %	0 %	50 %	227811890
5499	NC_012580	GCG	3	9	286713	286721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227811890
5500	NC_012580	AGC	2	6	286726	286731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811890

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