MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae M66-2 chromosome I

Total Repeats: 55388

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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49002	NC_012578	GGCTT	2	10	2553144	2553153	0 %	40 %	40 %	20 %	227082559
49003	NC_012578	TAA	2	6	2553157	2553162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227082559
49004	NC_012578	TG	3	6	2553276	2553281	0 %	50 %	50 %	0 %	227082559
49005	NC_012578	TGAT	2	8	2553298	2553305	25 %	50 %	25 %	0 %	227082559
49006	NC_012578	CGG	2	6	2553315	2553320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227082559
49007	NC_012578	GC	3	6	2553330	2553335	0 %	0 %	50 %	50 %	227082559
49008	NC_012578	ATG	2	6	2553347	2553352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082559
49009	NC_012578	A	8	8	2553400	2553407	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49010	NC_012578	AAT	2	6	2553438	2553443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49011	NC_012578	T	6	6	2553443	2553448	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49012	NC_012578	AGC	2	6	2553542	2553547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082560
49013	NC_012578	TCA	2	6	2553552	2553557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082560
49014	NC_012578	CCA	2	6	2553573	2553578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227082560
49015	NC_012578	TTG	2	6	2553590	2553595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227082560
49016	NC_012578	CTG	2	6	2553636	2553641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082560
49017	NC_012578	TGA	2	6	2553720	2553725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082560
49018	NC_012578	GCT	2	6	2553740	2553745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082560
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49020	NC_012578	T	6	6	2553756	2553761	0 %	100 %	0 %	0 %	227082560
49021	NC_012578	ATC	2	6	2553806	2553811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082560
49022	NC_012578	GCT	2	6	2553908	2553913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082560
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49024	NC_012578	TGC	2	6	2553957	2553962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082560
49025	NC_012578	GCT	2	6	2553979	2553984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082560
49026	NC_012578	CCA	2	6	2553990	2553995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227082560
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49028	NC_012578	CTCA	2	8	2554051	2554058	25 %	25 %	0 %	50 %	227082560
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49030	NC_012578	CTG	2	6	2554102	2554107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082560
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49033	NC_012578	GGC	2	6	2554326	2554331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227082560
49034	NC_012578	CG	4	8	2554347	2554354	0 %	0 %	50 %	50 %	227082560
49035	NC_012578	ATCAC	2	10	2554424	2554433	40 %	20 %	0 %	40 %	227082560
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49038	NC_012578	ACAGCA	2	12	2554473	2554484	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	227082560
49039	NC_012578	TGC	2	6	2554547	2554552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082560
49040	NC_012578	TGG	2	6	2554572	2554577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227082560
49041	NC_012578	GCT	2	6	2554617	2554622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082560
49042	NC_012578	GACGA	2	10	2554672	2554681	40 %	0 %	40 %	20 %	227082560
49043	NC_012578	TGAG	2	8	2554759	2554766	25 %	25 %	50 %	0 %	227082560
49044	NC_012578	TAT	2	6	2554787	2554792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49045	NC_012578	ATA	2	6	2554815	2554820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49046	NC_012578	TCA	2	6	2554869	2554874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49047	NC_012578	AGAC	2	8	2554955	2554962	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
49048	NC_012578	GAAC	2	8	2554977	2554984	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
49049	NC_012578	AAGG	2	8	2555011	2555018	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49050	NC_012578	TCA	2	6	2555041	2555046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49051	NC_012578	GCCTCC	2	12	2555169	2555180	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
49052	NC_012578	TTAT	2	8	2555182	2555189	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49053	NC_012578	CTC	2	6	2555321	2555326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227082561
49054	NC_012578	CCA	2	6	2555341	2555346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227082561
49055	NC_012578	ATC	2	6	2555375	2555380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082561
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49057	NC_012578	CTG	2	6	2555489	2555494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082561
49058	NC_012578	GTT	2	6	2555569	2555574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227082561
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49060	NC_012578	CT	3	6	2555736	2555741	0 %	50 %	0 %	50 %	227082561
49061	NC_012578	TCT	2	6	2555808	2555813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227082561
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49072	NC_012578	TCA	2	6	2556546	2556551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082561
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49076	NC_012578	A	6	6	2556701	2556706	100 %	0 %	0 %	0 %	227082561
49077	NC_012578	AG	3	6	2556787	2556792	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49078	NC_012578	GC	3	6	2556852	2556857	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49079	NC_012578	TTA	2	6	2556918	2556923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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49083	NC_012578	ACT	2	6	2557196	2557201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082562
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49087	NC_012578	TGGG	2	8	2557545	2557552	0 %	25 %	75 %	0 %	227082562
49088	NC_012578	AGCGC	2	10	2557568	2557577	20 %	0 %	40 %	40 %	227082562
49089	NC_012578	GAC	2	6	2557657	2557662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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49091	NC_012578	ATT	2	6	2557792	2557797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227082563
49092	NC_012578	ATTGGT	2	12	2557828	2557839	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	227082563
49093	NC_012578	CAATG	2	10	2557854	2557863	40 %	20 %	20 %	20 %	227082563
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49098	NC_012578	CT	4	8	2557995	2558002	0 %	50 %	0 %	50 %	227082563
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49102	NC_012578	CACT	2	8	2558106	2558113	25 %	25 %	0 %	50 %	227082563
49103	NC_012578	ATC	2	6	2558116	2558121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082563
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49109	NC_012578	GGT	2	6	2558424	2558429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227082563
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49118	NC_012578	CGT	2	6	2558811	2558816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082563
49119	NC_012578	TGGT	2	8	2558861	2558868	0 %	50 %	50 %	0 %	227082563
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49225	NC_012578	T	6	6	2563600	2563605	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49226	NC_012578	CTT	2	6	2563670	2563675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227082568
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49231	NC_012578	GA	3	6	2563844	2563849	50 %	0 %	50 %	0 %	227082568
49232	NC_012578	TCAG	2	8	2563900	2563907	25 %	25 %	25 %	25 %	227082568
49233	NC_012578	TCAG	2	8	2564107	2564114	25 %	25 %	25 %	25 %	227082568
49234	NC_012578	TTCT	2	8	2564178	2564185	0 %	75 %	0 %	25 %	227082568
49235	NC_012578	CGT	2	6	2564192	2564197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082568
49236	NC_012578	AGC	2	6	2564208	2564213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082568
49237	NC_012578	ACC	2	6	2564322	2564327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227082568
49238	NC_012578	CTT	2	6	2564411	2564416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227082568
49239	NC_012578	GTT	2	6	2564466	2564471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227082568
49240	NC_012578	CAC	2	6	2564483	2564488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227082568
49241	NC_012578	TGA	2	6	2564492	2564497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082568
49242	NC_012578	TCA	2	6	2564501	2564506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082568
49243	NC_012578	TCAGC	2	10	2564543	2564552	20 %	20 %	20 %	40 %	227082568
49244	NC_012578	TGC	2	6	2564580	2564585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082568
49245	NC_012578	GCT	3	9	2564587	2564595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082568
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49247	NC_012578	GCT	2	6	2564845	2564850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082568
49248	NC_012578	ACC	2	6	2564865	2564870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227082568
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49250	NC_012578	GCT	2	6	2565064	2565069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082569
49251	NC_012578	CTT	2	6	2565183	2565188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227082569
49252	NC_012578	CTG	2	6	2565191	2565196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082569
49253	NC_012578	GCA	2	6	2565239	2565244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082569
49254	NC_012578	GTT	2	6	2565246	2565251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227082569
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49256	NC_012578	GC	3	6	2565498	2565503	0 %	0 %	50 %	50 %	227082569
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49259	NC_012578	ACCA	2	8	2565783	2565790	50 %	0 %	0 %	50 %	227082569
49260	NC_012578	CTT	2	6	2565821	2565826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227082569
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49262	NC_012578	CA	3	6	2565887	2565892	50 %	0 %	0 %	50 %	227082569
49263	NC_012578	ATC	2	6	2565897	2565902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082569
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49267	NC_012578	AGT	2	6	2566346	2566351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082569
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49271	NC_012578	AG	3	6	2566624	2566629	50 %	0 %	50 %	0 %	227082569
49272	NC_012578	GTC	2	6	2566663	2566668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082569
49273	NC_012578	TCT	2	6	2566708	2566713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49274	NC_012578	GGACG	2	10	2566714	2566723	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
49275	NC_012578	T	6	6	2566776	2566781	0 %	100 %	0 %	0 %	227082570
49276	NC_012578	T	6	6	2566783	2566788	0 %	100 %	0 %	0 %	227082570
49277	NC_012578	TCAAA	2	10	2566792	2566801	60 %	20 %	0 %	20 %	227082570
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49280	NC_012578	TGC	2	6	2566887	2566892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082570
49281	NC_012578	GATT	2	8	2566919	2566926	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49282	NC_012578	TTC	2	6	2566972	2566977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227082571
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49293	NC_012578	TTCAC	2	10	2567829	2567838	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
49294	NC_012578	AACAT	2	10	2567879	2567888	60 %	20 %	0 %	20 %	227082572
49295	NC_012578	CG	3	6	2567916	2567921	0 %	0 %	50 %	50 %	227082572
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49333	NC_012578	GCC	2	6	2569844	2569849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227082572
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49336	NC_012578	TAA	2	6	2570088	2570093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49337	NC_012578	CAAA	2	8	2570154	2570161	75 %	0 %	0 %	25 %	227082573
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49339	NC_012578	AG	3	6	2570311	2570316	50 %	0 %	50 %	0 %	227082573
49340	NC_012578	CTGCGC	2	12	2570334	2570345	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	227082573
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49342	NC_012578	ATT	2	6	2570437	2570442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227082573
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49344	NC_012578	CAC	2	6	2570506	2570511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227082573
49345	NC_012578	CGCTTG	2	12	2570512	2570523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082573
49346	NC_012578	AGA	2	6	2570559	2570564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227082573
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49351	NC_012578	GC	3	6	2570811	2570816	0 %	0 %	50 %	50 %	227082573
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49353	NC_012578	CACT	2	8	2570894	2570901	25 %	25 %	0 %	50 %	227082573
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49471	NC_012578	TCA	2	6	2577360	2577365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082577
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