MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae M66-2 chromosome I

Total Repeats: 55388

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
45001	NC_012578	GTA	2	6	2350323	2350328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082381
45002	NC_012578	CAG	2	6	2350347	2350352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082381
45003	NC_012578	T	6	6	2350437	2350442	0 %	100 %	0 %	0 %	227082381
45004	NC_012578	TTTCG	2	10	2350478	2350487	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
45005	NC_012578	TTCG	2	8	2350495	2350502	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
45006	NC_012578	ACGAC	2	10	2350554	2350563	40 %	0 %	20 %	40 %	227082382
45007	NC_012578	CGC	2	6	2350631	2350636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227082382
45008	NC_012578	TTCT	2	8	2350655	2350662	0 %	75 %	0 %	25 %	227082382
45009	NC_012578	TTCAAT	2	12	2350772	2350783	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	227082382
45010	NC_012578	GTA	2	6	2350809	2350814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082382
45011	NC_012578	GCA	2	6	2350836	2350841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082382
45012	NC_012578	CAC	2	6	2350847	2350852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227082382
45013	NC_012578	CA	4	8	2350900	2350907	50 %	0 %	0 %	50 %	227082382
45014	NC_012578	CATT	2	8	2350981	2350988	25 %	50 %	0 %	25 %	227082382
45015	NC_012578	CAA	2	6	2351017	2351022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227082382
45016	NC_012578	CAC	2	6	2351053	2351058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227082382
45017	NC_012578	GCC	2	6	2351069	2351074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227082382
45018	NC_012578	CTT	2	6	2351122	2351127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227082382
45019	NC_012578	CAC	2	6	2351188	2351193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227082382
45020	NC_012578	AG	3	6	2351260	2351265	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45021	NC_012578	TCA	2	6	2351315	2351320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45022	NC_012578	CTT	2	6	2351453	2351458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227082383
45023	NC_012578	CTT	2	6	2351474	2351479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227082383
45024	NC_012578	TTC	2	6	2351617	2351622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227082383
45025	NC_012578	CAG	2	6	2351717	2351722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082383
45026	NC_012578	CGT	2	6	2351726	2351731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082383
45027	NC_012578	CAG	2	6	2351798	2351803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082383
45028	NC_012578	ACA	2	6	2351815	2351820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227082383
45029	NC_012578	GATGTT	2	12	2351883	2351894	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	227082383
45030	NC_012578	CAA	2	6	2351909	2351914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227082383
45031	NC_012578	CTT	2	6	2351927	2351932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227082383
45032	NC_012578	AGC	2	6	2351976	2351981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082383
45033	NC_012578	GCCTTC	2	12	2352069	2352080	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	227082383
45034	NC_012578	ATG	2	6	2352088	2352093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082383
45035	NC_012578	CAG	2	6	2352101	2352106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082383
45036	NC_012578	AGC	2	6	2352126	2352131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082383
45037	NC_012578	AGC	2	6	2352135	2352140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082383
45038	NC_012578	CAA	2	6	2352191	2352196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227082383
45039	NC_012578	CAT	2	6	2352213	2352218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082383
45040	NC_012578	AGC	2	6	2352255	2352260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082383
45041	NC_012578	ATT	2	6	2352403	2352408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227082384
45042	NC_012578	CAG	2	6	2352439	2352444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082384
45043	NC_012578	AGC	3	9	2352479	2352487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082384
45044	NC_012578	CGT	3	9	2352517	2352525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082384
45045	NC_012578	GAT	2	6	2352533	2352538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082384
45046	NC_012578	CAA	2	6	2352571	2352576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227082384
45047	NC_012578	GTT	2	6	2352599	2352604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227082384
45048	NC_012578	CTT	2	6	2352607	2352612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227082384
45049	NC_012578	CAGG	2	8	2352658	2352665	25 %	0 %	50 %	25 %	227082384
45050	NC_012578	CTT	2	6	2352733	2352738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227082384
45051	NC_012578	TTGA	2	8	2352798	2352805	25 %	50 %	25 %	0 %	227082384
45052	NC_012578	GTT	2	6	2352851	2352856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227082384
45053	NC_012578	GTA	2	6	2352860	2352865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082384
45054	NC_012578	TTGC	2	8	2352870	2352877	0 %	50 %	25 %	25 %	227082384
45055	NC_012578	GCT	2	6	2352882	2352887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082384
45056	NC_012578	GC	3	6	2352909	2352914	0 %	0 %	50 %	50 %	227082384
45057	NC_012578	TCT	2	6	2352943	2352948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227082384
45058	NC_012578	CAGCT	2	10	2352962	2352971	20 %	20 %	20 %	40 %	227082384
45059	NC_012578	T	6	6	2352997	2353002	0 %	100 %	0 %	0 %	227082384
45060	NC_012578	TGA	2	6	2353009	2353014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082384
45061	NC_012578	TG	4	8	2353215	2353222	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45062	NC_012578	GC	3	6	2353291	2353296	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45063	NC_012578	TG	3	6	2353317	2353322	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45064	NC_012578	A	6	6	2353328	2353333	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45065	NC_012578	TCG	2	6	2353335	2353340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45066	NC_012578	GAC	2	6	2353386	2353391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45067	NC_012578	TG	3	6	2353443	2353448	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45068	NC_012578	A	6	6	2353507	2353512	100 %	0 %	0 %	0 %	227082385
45069	NC_012578	CAC	2	6	2353645	2353650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227082385
45070	NC_012578	CAA	3	9	2353979	2353987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227082385
45071	NC_012578	AAC	2	6	2353989	2353994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227082385
45072	NC_012578	CGTG	2	8	2354015	2354022	0 %	25 %	50 %	25 %	227082385
45073	NC_012578	GTG	2	6	2354070	2354075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227082385
45074	NC_012578	TGC	2	6	2354101	2354106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082385
45075	NC_012578	GAT	2	6	2354114	2354119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082385
45076	NC_012578	TGA	3	9	2354168	2354176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082385
45077	NC_012578	CCG	2	6	2354197	2354202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227082385
45078	NC_012578	A	6	6	2354208	2354213	100 %	0 %	0 %	0 %	227082385
45079	NC_012578	GAA	2	6	2354280	2354285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227082385
45080	NC_012578	CTG	2	6	2354340	2354345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45081	NC_012578	T	7	7	2354356	2354362	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45082	NC_012578	AG	3	6	2354467	2354472	50 %	0 %	50 %	0 %	227082386
45083	NC_012578	AGC	3	9	2354478	2354486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082386
45084	NC_012578	T	6	6	2354600	2354605	0 %	100 %	0 %	0 %	227082386
45085	NC_012578	TGA	2	6	2354611	2354616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082386
45086	NC_012578	GTG	2	6	2354658	2354663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227082386
45087	NC_012578	CT	3	6	2354673	2354678	0 %	50 %	0 %	50 %	227082386
45088	NC_012578	AAG	2	6	2354856	2354861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227082386
45089	NC_012578	TCT	2	6	2354943	2354948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227082386
45090	NC_012578	ACC	2	6	2354999	2355004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227082386
45091	NC_012578	CGC	2	6	2355077	2355082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227082386
45092	NC_012578	ATGAG	2	10	2355105	2355114	40 %	20 %	40 %	0 %	227082386
45093	NC_012578	GCGT	2	8	2355180	2355187	0 %	25 %	50 %	25 %	227082386
45094	NC_012578	GAT	3	9	2355298	2355306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082386
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45100	NC_012578	ATT	2	6	2355413	2355418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227082386
45101	NC_012578	GAT	2	6	2355419	2355424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082386
45102	NC_012578	CCA	2	6	2355528	2355533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227082386
45103	NC_012578	GCCA	2	8	2355547	2355554	25 %	0 %	25 %	50 %	227082386
45104	NC_012578	TCG	2	6	2355577	2355582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082386
45105	NC_012578	CGC	2	6	2355613	2355618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227082386
45106	NC_012578	TGC	2	6	2355700	2355705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082386
45107	NC_012578	TTG	2	6	2355729	2355734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227082386
45108	NC_012578	A	6	6	2355875	2355880	100 %	0 %	0 %	0 %	227082386
45109	NC_012578	GCT	2	6	2355883	2355888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082386
45110	NC_012578	CGG	2	6	2355928	2355933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227082386
45111	NC_012578	TGA	2	6	2355955	2355960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082386
45112	NC_012578	CCT	2	6	2356036	2356041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227082386
45113	NC_012578	GTCA	2	8	2356045	2356052	25 %	25 %	25 %	25 %	227082386
45114	NC_012578	CGT	2	6	2356061	2356066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082386
45115	NC_012578	ATC	2	6	2356088	2356093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082386
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45117	NC_012578	TGA	2	6	2356114	2356119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082386
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45227	NC_012578	CT	3	6	2361731	2361736	0 %	50 %	0 %	50 %	227082394
45228	NC_012578	CGA	2	6	2361999	2362004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082394
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45232	NC_012578	ATA	2	6	2362283	2362288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227082394
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45352	NC_012578	TCT	2	6	2368890	2368895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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45471	NC_012578	T	7	7	2374496	2374502	0 %	100 %	0 %	0 %	227082406
45472	NC_012578	AACC	2	8	2374561	2374568	50 %	0 %	0 %	50 %	227082406
45473	NC_012578	AGC	2	6	2374689	2374694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082406
45474	NC_012578	ATC	2	6	2374763	2374768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082406
45475	NC_012578	TGC	2	6	2374800	2374805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082406
45476	NC_012578	CAA	2	6	2374981	2374986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227082406
45477	NC_012578	CAA	2	6	2375006	2375011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227082406
45478	NC_012578	TGA	2	6	2375071	2375076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082406
45479	NC_012578	CT	3	6	2375160	2375165	0 %	50 %	0 %	50 %	227082406
45480	NC_012578	TCA	2	6	2375197	2375202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45481	NC_012578	TTTA	2	8	2375231	2375238	25 %	75 %	0 %	0 %	227082407
45482	NC_012578	TTG	2	6	2375323	2375328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227082407
45483	NC_012578	ACC	2	6	2375386	2375391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227082407
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45487	NC_012578	CACC	2	8	2375556	2375563	25 %	0 %	0 %	75 %	227082407
45488	NC_012578	AGA	2	6	2375593	2375598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227082407
45489	NC_012578	ACC	2	6	2375780	2375785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227082407
45490	NC_012578	CCA	2	6	2375814	2375819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227082407
45491	NC_012578	TCTT	2	8	2375852	2375859	0 %	75 %	0 %	25 %	227082407
45492	NC_012578	AAC	2	6	2375889	2375894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227082407
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45494	NC_012578	GCC	2	6	2375930	2375935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227082407
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45497	NC_012578	A	6	6	2376230	2376235	100 %	0 %	0 %	0 %	227082407
45498	NC_012578	CCAC	2	8	2376248	2376255	25 %	0 %	0 %	75 %	227082407
45499	NC_012578	CCAAC	2	10	2376296	2376305	40 %	0 %	0 %	60 %	227082407
45500	NC_012578	T	6	6	2376322	2376327	0 %	100 %	0 %	0 %	227082407

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