MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae M66-2 chromosome I

Total Repeats: 55388

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44501	NC_012578	AGA	2	6	2322095	2322100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227082355
44502	NC_012578	TCA	2	6	2322232	2322237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082355
44503	NC_012578	GGT	2	6	2322240	2322245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227082355
44504	NC_012578	TGG	2	6	2322277	2322282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227082355
44505	NC_012578	CGG	2	6	2322329	2322334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227082355
44506	NC_012578	CGC	2	6	2322378	2322383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227082355
44507	NC_012578	AAC	2	6	2322391	2322396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227082355
44508	NC_012578	GGAA	2	8	2322410	2322417	50 %	0 %	50 %	0 %	227082355
44509	NC_012578	GC	3	6	2322432	2322437	0 %	0 %	50 %	50 %	227082355
44510	NC_012578	GATG	2	8	2322458	2322465	25 %	25 %	50 %	0 %	227082355
44511	NC_012578	AGCA	2	8	2322467	2322474	50 %	0 %	25 %	25 %	227082355
44512	NC_012578	ATT	2	6	2322567	2322572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227082355
44513	NC_012578	CGG	2	6	2322590	2322595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227082355
44514	NC_012578	CTCG	2	8	2322627	2322634	0 %	25 %	25 %	50 %	227082355
44515	NC_012578	GAT	2	6	2322695	2322700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082355
44516	NC_012578	ATGGTT	2	12	2322868	2322879	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	227082355
44517	NC_012578	CTA	2	6	2322911	2322916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082355
44518	NC_012578	AG	3	6	2322999	2323004	50 %	0 %	50 %	0 %	227082355
44519	NC_012578	TC	3	6	2323007	2323012	0 %	50 %	0 %	50 %	227082355
44520	NC_012578	TGA	2	6	2323157	2323162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082355
44521	NC_012578	ATT	2	6	2323188	2323193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227082355
44522	NC_012578	ATG	2	6	2323215	2323220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082355
44523	NC_012578	GTC	2	6	2323315	2323320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082355
44524	NC_012578	CGC	2	6	2323434	2323439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227082355
44525	NC_012578	CTG	2	6	2323512	2323517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082355
44526	NC_012578	GAAGCG	2	12	2323521	2323532	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	227082355
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44528	NC_012578	CA	3	6	2323595	2323600	50 %	0 %	0 %	50 %	227082355
44529	NC_012578	CAC	2	6	2323643	2323648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44530	NC_012578	TTCA	2	8	2323711	2323718	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44531	NC_012578	AAC	2	6	2323729	2323734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44532	NC_012578	CTT	2	6	2323778	2323783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227082356
44533	NC_012578	GGC	2	6	2323785	2323790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227082356
44534	NC_012578	CAG	2	6	2323813	2323818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082356
44535	NC_012578	T	6	6	2323820	2323825	0 %	100 %	0 %	0 %	227082356
44536	NC_012578	CAAAC	2	10	2323846	2323855	60 %	0 %	0 %	40 %	227082356
44537	NC_012578	CTA	2	6	2323888	2323893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082356
44538	NC_012578	CAT	2	6	2323901	2323906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082356
44539	NC_012578	GCT	2	6	2323918	2323923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082356
44540	NC_012578	GCTCTT	2	12	2323948	2323959	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	227082356
44541	NC_012578	CTT	2	6	2323981	2323986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227082356
44542	NC_012578	AGT	2	6	2324110	2324115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082356
44543	NC_012578	ATC	2	6	2324192	2324197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082356
44544	NC_012578	ATC	2	6	2324247	2324252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082356
44545	NC_012578	TGAA	2	8	2324304	2324311	50 %	25 %	25 %	0 %	227082356
44546	NC_012578	CTCTTG	2	12	2324345	2324356	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	227082356
44547	NC_012578	CGCA	2	8	2324357	2324364	25 %	0 %	25 %	50 %	227082356
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44549	NC_012578	CAT	2	6	2324476	2324481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082356
44550	NC_012578	GA	3	6	2324528	2324533	50 %	0 %	50 %	0 %	227082356
44551	NC_012578	CAA	2	6	2324545	2324550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227082356
44552	NC_012578	A	6	6	2324586	2324591	100 %	0 %	0 %	0 %	227082356
44553	NC_012578	TAAATT	2	12	2324635	2324646	50 %	50 %	0 %	0 %	227082356
44554	NC_012578	CTCGG	2	10	2324662	2324671	0 %	20 %	40 %	40 %	227082356
44555	NC_012578	GTCG	2	8	2324678	2324685	0 %	25 %	50 %	25 %	227082356
44556	NC_012578	TGT	2	6	2324713	2324718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227082356
44557	NC_012578	TGCC	2	8	2324741	2324748	0 %	25 %	25 %	50 %	227082356
44558	NC_012578	GAT	2	6	2324777	2324782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082356
44559	NC_012578	ATA	2	6	2324834	2324839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227082356
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44562	NC_012578	ACT	2	6	2324978	2324983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082356
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44565	NC_012578	CA	3	6	2325318	2325323	50 %	0 %	0 %	50 %	227082357
44566	NC_012578	CAC	2	6	2325417	2325422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227082357
44567	NC_012578	TGA	2	6	2325495	2325500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082357
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44570	NC_012578	GCC	2	6	2325700	2325705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227082357
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44578	NC_012578	GCC	2	6	2325987	2325992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227082358
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44582	NC_012578	TG	3	6	2326231	2326236	0 %	50 %	50 %	0 %	227082358
44583	NC_012578	GC	3	6	2326483	2326488	0 %	0 %	50 %	50 %	227082359
44584	NC_012578	CCAA	2	8	2326542	2326549	50 %	0 %	0 %	50 %	227082359
44585	NC_012578	GCAA	2	8	2326597	2326604	50 %	0 %	25 %	25 %	227082359
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44587	NC_012578	GGCT	2	8	2326701	2326708	0 %	25 %	50 %	25 %	227082359
44588	NC_012578	TGA	2	6	2326740	2326745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082359
44589	NC_012578	CAT	2	6	2326755	2326760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082359
44590	NC_012578	TAA	2	6	2326786	2326791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227082359
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44593	NC_012578	TCA	2	6	2327128	2327133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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44596	NC_012578	CTGTG	2	10	2327224	2327233	0 %	40 %	40 %	20 %	227082360
44597	NC_012578	ACTTAA	2	12	2327283	2327294	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	227082360
44598	NC_012578	CATCAC	2	12	2327312	2327323	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	227082360
44599	NC_012578	GGC	2	6	2327333	2327338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227082360
44600	NC_012578	CTCA	2	8	2327408	2327415	25 %	25 %	0 %	50 %	227082360
44601	NC_012578	TGA	2	6	2327449	2327454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082360
44602	NC_012578	AC	3	6	2327482	2327487	50 %	0 %	0 %	50 %	227082360
44603	NC_012578	GCG	2	6	2327529	2327534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227082360
44604	NC_012578	TTC	2	6	2327593	2327598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227082360
44605	NC_012578	GCC	2	6	2327660	2327665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227082360
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44607	NC_012578	TGA	2	6	2327722	2327727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082360
44608	NC_012578	CG	3	6	2327741	2327746	0 %	0 %	50 %	50 %	227082360
44609	NC_012578	CAC	2	6	2327767	2327772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227082360
44610	NC_012578	T	6	6	2327800	2327805	0 %	100 %	0 %	0 %	227082360
44611	NC_012578	ACGC	2	8	2327806	2327813	25 %	0 %	25 %	50 %	227082360
44612	NC_012578	GAA	2	6	2327896	2327901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227082360
44613	NC_012578	TAT	2	6	2327946	2327951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44614	NC_012578	CAG	2	6	2327952	2327957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44615	NC_012578	GAA	2	6	2327962	2327967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44616	NC_012578	TGC	2	6	2328014	2328019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082361
44617	NC_012578	C	6	6	2328035	2328040	0 %	0 %	0 %	100 %	227082361
44618	NC_012578	A	8	8	2328106	2328113	100 %	0 %	0 %	0 %	227082361
44619	NC_012578	CTGC	2	8	2328139	2328146	0 %	25 %	25 %	50 %	227082361
44620	NC_012578	AGA	3	9	2328165	2328173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227082361
44621	NC_012578	TGC	2	6	2328444	2328449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082361
44622	NC_012578	CAAA	2	8	2328495	2328502	75 %	0 %	0 %	25 %	227082361
44623	NC_012578	CGA	2	6	2328520	2328525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082361
44624	NC_012578	CGC	3	9	2328531	2328539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227082361
44625	NC_012578	CGCTG	2	10	2328546	2328555	0 %	20 %	40 %	40 %	227082361
44626	NC_012578	CGC	2	6	2328609	2328614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227082361
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44629	NC_012578	A	6	6	2328661	2328666	100 %	0 %	0 %	0 %	227082361
44630	NC_012578	TCT	2	6	2328686	2328691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227082361
44631	NC_012578	CTG	2	6	2328946	2328951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082361
44632	NC_012578	GGT	2	6	2329017	2329022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227082361
44633	NC_012578	ACA	2	6	2329073	2329078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227082361
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44639	NC_012578	CGT	2	6	2329724	2329729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082362
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44642	NC_012578	CGCC	2	8	2329825	2329832	0 %	0 %	25 %	75 %	227082362
44643	NC_012578	AGT	2	6	2329869	2329874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082362
44644	NC_012578	CTG	2	6	2329883	2329888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082362
44645	NC_012578	ATTA	2	8	2330057	2330064	50 %	50 %	0 %	0 %	227082362
44646	NC_012578	TC	3	6	2330074	2330079	0 %	50 %	0 %	50 %	227082362
44647	NC_012578	TGA	2	6	2330124	2330129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082362
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44649	NC_012578	CGC	3	9	2330399	2330407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227082362
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44651	NC_012578	T	6	6	2330435	2330440	0 %	100 %	0 %	0 %	227082362
44652	NC_012578	CAAA	2	8	2330455	2330462	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
44653	NC_012578	TTA	3	9	2330481	2330489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44654	NC_012578	TGA	2	6	2330570	2330575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082363
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44673	NC_012578	AATG	2	8	2331627	2331634	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44674	NC_012578	CAA	2	6	2331656	2331661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44675	NC_012578	CAAA	2	8	2331757	2331764	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
44676	NC_012578	ATA	2	6	2331767	2331772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44677	NC_012578	GAAC	2	8	2331859	2331866	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
44678	NC_012578	TAA	2	6	2331926	2331931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227082365
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44684	NC_012578	TG	3	6	2332254	2332259	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44685	NC_012578	ATTT	2	8	2332267	2332274	25 %	75 %	0 %	0 %	227082366
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44709	NC_012578	CGC	3	9	2333510	2333518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227082366
44710	NC_012578	TGC	2	6	2333560	2333565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082366
44711	NC_012578	AG	3	6	2333599	2333604	50 %	0 %	50 %	0 %	227082367
44712	NC_012578	AAT	2	6	2333710	2333715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44713	NC_012578	TCA	2	6	2333748	2333753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082368
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44716	NC_012578	GCA	2	6	2334030	2334035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082368
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44718	NC_012578	CAC	2	6	2334091	2334096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227082368
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44721	NC_012578	TCA	2	6	2334428	2334433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082368
44722	NC_012578	TCT	2	6	2334531	2334536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227082368
44723	NC_012578	CTT	2	6	2334553	2334558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227082368
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44725	NC_012578	GC	3	6	2334847	2334852	0 %	0 %	50 %	50 %	227082369
44726	NC_012578	GTA	2	6	2334871	2334876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082369
44727	NC_012578	A	6	6	2334934	2334939	100 %	0 %	0 %	0 %	227082369
44728	NC_012578	TTG	2	6	2334940	2334945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227082369
44729	NC_012578	CG	3	6	2334998	2335003	0 %	0 %	50 %	50 %	227082369
44730	NC_012578	CG	3	6	2335023	2335028	0 %	0 %	50 %	50 %	227082369
44731	NC_012578	TCA	2	6	2335055	2335060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082369
44732	NC_012578	ACC	2	6	2335079	2335084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227082369
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44734	NC_012578	TCA	2	6	2335209	2335214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082369
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44744	NC_012578	CACC	2	8	2335698	2335705	25 %	0 %	0 %	75 %	227082369
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44990	NC_012578	A	7	7	2349850	2349856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44991	NC_012578	TGC	2	6	2349862	2349867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44992	NC_012578	GCA	2	6	2349928	2349933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082381
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