MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae M66-2 chromosome I

Total Repeats: 55388

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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44002	NC_012578	C	7	7	2294170	2294176	0 %	0 %	0 %	100 %	227082333
44003	NC_012578	AGTG	2	8	2294193	2294200	25 %	25 %	50 %	0 %	227082333
44004	NC_012578	AG	3	6	2294222	2294227	50 %	0 %	50 %	0 %	227082333
44005	NC_012578	TTC	2	6	2294312	2294317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227082333
44006	NC_012578	GAA	2	6	2294329	2294334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227082333
44007	NC_012578	ATG	2	6	2294387	2294392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082333
44008	NC_012578	CAC	2	6	2294411	2294416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227082333
44009	NC_012578	ATT	2	6	2294477	2294482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227082333
44010	NC_012578	ACC	2	6	2294484	2294489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227082333
44011	NC_012578	ATA	2	6	2294528	2294533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227082333
44012	NC_012578	TTGGCT	2	12	2294543	2294554	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	227082333
44013	NC_012578	GTG	2	6	2294575	2294580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227082333
44014	NC_012578	TCAA	2	8	2294616	2294623	50 %	25 %	0 %	25 %	227082333
44015	NC_012578	CAC	2	6	2294669	2294674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227082333
44016	NC_012578	GCA	2	6	2294727	2294732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082333
44017	NC_012578	TGA	2	6	2294776	2294781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082333
44018	NC_012578	GCAA	2	8	2294803	2294810	50 %	0 %	25 %	25 %	227082333
44019	NC_012578	ACAA	2	8	2294943	2294950	75 %	0 %	0 %	25 %	227082333
44020	NC_012578	TGC	2	6	2294952	2294957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082333
44021	NC_012578	GCG	2	6	2295043	2295048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227082333
44022	NC_012578	ATG	2	6	2295055	2295060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082333
44023	NC_012578	GAT	2	6	2295085	2295090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082333
44024	NC_012578	TGA	3	9	2295154	2295162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082333
44025	NC_012578	TCG	2	6	2295174	2295179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082333
44026	NC_012578	GCA	2	6	2295295	2295300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082333
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44028	NC_012578	TCA	2	6	2295322	2295327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082333
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44032	NC_012578	GCG	2	6	2295772	2295777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227082333
44033	NC_012578	CAC	2	6	2295806	2295811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227082333
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44035	NC_012578	TAG	2	6	2295839	2295844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082333
44036	NC_012578	GCA	2	6	2295846	2295851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082333
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44039	NC_012578	GCT	2	6	2295991	2295996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082333
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44043	NC_012578	CGC	2	6	2296228	2296233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227082333
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44049	NC_012578	ATCAA	2	10	2296389	2296398	60 %	20 %	0 %	20 %	227082333
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44051	NC_012578	GT	3	6	2296797	2296802	0 %	50 %	50 %	0 %	227082333
44052	NC_012578	TC	3	6	2296859	2296864	0 %	50 %	0 %	50 %	227082333
44053	NC_012578	GAT	2	6	2296924	2296929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082333
44054	NC_012578	CGG	2	6	2297047	2297052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227082333
44055	NC_012578	TCG	2	6	2297056	2297061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082333
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44066	NC_012578	AG	3	6	2297839	2297844	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44067	NC_012578	TGAA	2	8	2297890	2297897	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44068	NC_012578	CATC	2	8	2297928	2297935	25 %	25 %	0 %	50 %	227082334
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44075	NC_012578	GCCA	2	8	2298310	2298317	25 %	0 %	25 %	50 %	227082334
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44083	NC_012578	T	6	6	2298676	2298681	0 %	100 %	0 %	0 %	227082334
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44086	NC_012578	AGCTC	2	10	2298945	2298954	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
44087	NC_012578	A	7	7	2298974	2298980	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44088	NC_012578	GTT	2	6	2299004	2299009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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44091	NC_012578	GA	3	6	2299109	2299114	50 %	0 %	50 %	0 %	227082335
44092	NC_012578	GTT	2	6	2299121	2299126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227082335
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44105	NC_012578	GA	3	6	2300277	2300282	50 %	0 %	50 %	0 %	227082335
44106	NC_012578	CAG	2	6	2300326	2300331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082335
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44115	NC_012578	TGC	2	6	2300627	2300632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082335
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44118	NC_012578	TC	3	6	2300860	2300865	0 %	50 %	0 %	50 %	227082335
44119	NC_012578	TGC	2	6	2300913	2300918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082335
44120	NC_012578	T	6	6	2300925	2300930	0 %	100 %	0 %	0 %	227082335
44121	NC_012578	CAT	3	9	2301019	2301027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082335
44122	NC_012578	CTTC	2	8	2301165	2301172	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44123	NC_012578	CAAAA	2	10	2301211	2301220	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
44124	NC_012578	CGA	2	6	2301271	2301276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44125	NC_012578	CAT	2	6	2301338	2301343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44126	NC_012578	TAA	2	6	2301353	2301358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44127	NC_012578	CAAAT	2	10	2301363	2301372	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
44128	NC_012578	TAGA	2	8	2301410	2301417	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44129	NC_012578	AG	3	6	2301438	2301443	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44130	NC_012578	AG	3	6	2301504	2301509	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44131	NC_012578	G	6	6	2301544	2301549	0 %	0 %	100 %	0 %	227082336
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44135	NC_012578	ATTCAT	2	12	2301780	2301791	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	227082336
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44143	NC_012578	A	6	6	2302250	2302255	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44144	NC_012578	TGA	2	6	2302290	2302295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44145	NC_012578	ATT	2	6	2302305	2302310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227082337
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44148	NC_012578	CTG	2	6	2302374	2302379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082337
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44170	NC_012578	ATT	2	6	2303294	2303299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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44174	NC_012578	A	6	6	2303516	2303521	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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44214	NC_012578	ACCTT	2	10	2305136	2305145	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
44215	NC_012578	AAGGTT	2	12	2305146	2305157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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44219	NC_012578	GC	3	6	2305451	2305456	0 %	0 %	50 %	50 %	227082339
44220	NC_012578	CAG	2	6	2305595	2305600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082339
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44223	NC_012578	CT	4	8	2305684	2305691	0 %	50 %	0 %	50 %	227082339
44224	NC_012578	TTA	2	6	2305694	2305699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227082339
44225	NC_012578	CAGCA	2	10	2305886	2305895	40 %	0 %	20 %	40 %	227082339
44226	NC_012578	ACA	2	6	2305905	2305910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227082339
44227	NC_012578	TTA	2	6	2305954	2305959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227082339
44228	NC_012578	GGC	2	6	2306002	2306007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227082339
44229	NC_012578	ATG	2	6	2306011	2306016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082339
44230	NC_012578	TAG	2	6	2306025	2306030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082339
44231	NC_012578	G	7	7	2306045	2306051	0 %	0 %	100 %	0 %	227082339
44232	NC_012578	CCG	2	6	2306084	2306089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227082339
44233	NC_012578	CTT	2	6	2306097	2306102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227082339
44234	NC_012578	GCT	2	6	2306173	2306178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082339
44235	NC_012578	AGCA	2	8	2306357	2306364	50 %	0 %	25 %	25 %	227082339
44236	NC_012578	AAG	2	6	2306534	2306539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227082339
44237	NC_012578	GTT	3	9	2306716	2306724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227082339
44238	NC_012578	ATC	2	6	2306815	2306820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082339
44239	NC_012578	AGC	2	6	2306880	2306885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082339
44240	NC_012578	GTG	2	6	2306947	2306952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227082339
44241	NC_012578	TGA	2	6	2307018	2307023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082339
44242	NC_012578	AGC	2	6	2307056	2307061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082339
44243	NC_012578	AAC	2	6	2307104	2307109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227082339
44244	NC_012578	ACGTGG	2	12	2307150	2307161	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	227082339
44245	NC_012578	CT	3	6	2307201	2307206	0 %	50 %	0 %	50 %	227082339
44246	NC_012578	GCA	2	6	2307268	2307273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082339
44247	NC_012578	CGGTGG	2	12	2307287	2307298	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	227082339
44248	NC_012578	TGC	2	6	2307479	2307484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082339
44249	NC_012578	GCA	2	6	2307498	2307503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082339
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44252	NC_012578	GCTG	2	8	2307579	2307586	0 %	25 %	50 %	25 %	227082339
44253	NC_012578	GCAGTG	2	12	2307605	2307616	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	227082339
44254	NC_012578	TCA	2	6	2307655	2307660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082339
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44256	NC_012578	ATTT	2	8	2307735	2307742	25 %	75 %	0 %	0 %	227082339
44257	NC_012578	ACA	2	6	2307743	2307748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227082339
44258	NC_012578	GCG	2	6	2307823	2307828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227082339
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44262	NC_012578	GTT	2	6	2308015	2308020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227082340
44263	NC_012578	TGC	2	6	2308072	2308077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082340
44264	NC_012578	ACA	2	6	2308081	2308086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227082340
44265	NC_012578	CAA	2	6	2308101	2308106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227082340
44266	NC_012578	AGCT	2	8	2308123	2308130	25 %	25 %	25 %	25 %	227082340
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44268	NC_012578	AAGA	2	8	2308284	2308291	75 %	0 %	25 %	0 %	227082340
44269	NC_012578	CTT	2	6	2308368	2308373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44270	NC_012578	A	6	6	2308429	2308434	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44271	NC_012578	AAAAG	2	10	2308438	2308447	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
44272	NC_012578	ATT	2	6	2308497	2308502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227082341
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44320	NC_012578	CT	3	6	2311706	2311711	0 %	50 %	0 %	50 %	227082344
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44337	NC_012578	TTCT	2	8	2312735	2312742	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
44338	NC_012578	TC	3	6	2312781	2312786	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44339	NC_012578	CAG	2	6	2312799	2312804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44340	NC_012578	A	6	6	2312815	2312820	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44341	NC_012578	TGC	2	6	2312886	2312891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44342	NC_012578	GGA	2	6	2312934	2312939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44343	NC_012578	TCT	2	6	2312960	2312965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227082345
44344	NC_012578	CT	3	6	2312985	2312990	0 %	50 %	0 %	50 %	227082345
44345	NC_012578	TTC	2	6	2313042	2313047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227082345
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44347	NC_012578	T	6	6	2313150	2313155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44348	NC_012578	TA	3	6	2313224	2313229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44349	NC_012578	CAA	2	6	2313292	2313297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227082346
44350	NC_012578	ATG	2	6	2313298	2313303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082346
44351	NC_012578	A	6	6	2313343	2313348	100 %	0 %	0 %	0 %	227082346
44352	NC_012578	CCA	2	6	2313351	2313356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227082346
44353	NC_012578	TGA	2	6	2313456	2313461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082346
44354	NC_012578	AAG	2	6	2313569	2313574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227082346
44355	NC_012578	AGTGA	2	10	2313580	2313589	40 %	20 %	40 %	0 %	227082346
44356	NC_012578	CCA	2	6	2313667	2313672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227082346
44357	NC_012578	TGA	2	6	2313677	2313682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082346
44358	NC_012578	GGC	2	6	2313754	2313759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227082346
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44360	NC_012578	TCA	2	6	2313943	2313948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082347
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44369	NC_012578	AAGCG	2	10	2314574	2314583	40 %	0 %	40 %	20 %	227082347
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44375	NC_012578	A	6	6	2314791	2314796	100 %	0 %	0 %	0 %	227082347
44376	NC_012578	CGT	2	6	2314803	2314808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082347
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44379	NC_012578	CTAGC	2	10	2314924	2314933	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
44380	NC_012578	TTA	2	6	2315009	2315014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227082348
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44388	NC_012578	CT	3	6	2315375	2315380	0 %	50 %	0 %	50 %	227082348
44389	NC_012578	CGA	2	6	2315406	2315411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082348
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44404	NC_012578	A	7	7	2316358	2316364	100 %	0 %	0 %	0 %	227082348
44405	NC_012578	AAT	2	6	2316370	2316375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227082348
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44411	NC_012578	TCA	2	6	2316835	2316840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082349
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44458	NC_012578	GACT	2	8	2320050	2320057	25 %	25 %	25 %	25 %	227082353
44459	NC_012578	CCCA	2	8	2320114	2320121	25 %	0 %	0 %	75 %	227082353
44460	NC_012578	CA	3	6	2320216	2320221	50 %	0 %	0 %	50 %	227082353
44461	NC_012578	CTTA	2	8	2320237	2320244	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44462	NC_012578	TCAA	2	8	2320301	2320308	50 %	25 %	0 %	25 %	227082354
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44468	NC_012578	AGAC	2	8	2320504	2320511	50 %	0 %	25 %	25 %	227082354
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