MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae M66-2 chromosome I

Total Repeats: 55388

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43501	NC_012578	A	7	7	2267825	2267831	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43502	NC_012578	AAAAT	2	10	2267905	2267914	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43503	NC_012578	ATG	2	6	2267955	2267960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43504	NC_012578	CGT	2	6	2267980	2267985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43505	NC_012578	CCA	2	6	2267988	2267993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43506	NC_012578	GGT	2	6	2268024	2268029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43507	NC_012578	CCT	2	6	2268093	2268098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43508	NC_012578	TCT	2	6	2268202	2268207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43509	NC_012578	TGA	2	6	2268222	2268227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43510	NC_012578	ATC	2	6	2268233	2268238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43511	NC_012578	CAG	2	6	2268240	2268245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43512	NC_012578	TAT	2	6	2268370	2268375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43513	NC_012578	TC	3	6	2268378	2268383	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43514	NC_012578	ATG	2	6	2268434	2268439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43515	NC_012578	CGT	2	6	2268459	2268464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43516	NC_012578	CCA	2	6	2268467	2268472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43517	NC_012578	GGT	2	6	2268498	2268503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43518	NC_012578	CCT	2	6	2268567	2268572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43519	NC_012578	ATT	2	6	2268673	2268678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43520	NC_012578	GAT	2	6	2268681	2268686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43521	NC_012578	CAA	2	6	2268704	2268709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43522	NC_012578	TCT	2	6	2268785	2268790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43523	NC_012578	TGA	2	6	2268804	2268809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43524	NC_012578	ATC	2	6	2268815	2268820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43525	NC_012578	GAT	2	6	2268908	2268913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43526	NC_012578	TCT	2	6	2269012	2269017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43527	NC_012578	ATG	2	6	2269090	2269095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43528	NC_012578	CGT	2	6	2269115	2269120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43529	NC_012578	CCA	2	6	2269123	2269128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43530	NC_012578	GGT	2	6	2269153	2269158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43531	NC_012578	CCT	2	6	2269222	2269227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43532	NC_012578	ATT	2	6	2269328	2269333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43533	NC_012578	CAA	2	6	2269359	2269364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43534	NC_012578	TCT	2	6	2269442	2269447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43535	NC_012578	ATT	2	6	2269456	2269461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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43538	NC_012578	GAT	2	6	2269577	2269582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43539	NC_012578	TCT	2	6	2269681	2269686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43540	NC_012578	AAC	2	6	2269700	2269705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43541	NC_012578	GTTTT	2	10	2269720	2269729	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
43542	NC_012578	ACATC	2	10	2269751	2269760	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
43543	NC_012578	CGG	2	6	2269786	2269791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43544	NC_012578	AAGCT	2	10	2269792	2269801	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
43545	NC_012578	CCA	2	6	2269822	2269827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43546	NC_012578	TC	3	6	2269873	2269878	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43547	NC_012578	TTC	2	6	2269886	2269891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43548	NC_012578	CA	3	6	2269909	2269914	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43549	NC_012578	CAA	2	6	2269919	2269924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43550	NC_012578	A	6	6	2269937	2269942	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43551	NC_012578	CAGCTG	2	12	2269945	2269956	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43552	NC_012578	T	6	6	2269959	2269964	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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43555	NC_012578	GTT	2	6	2270150	2270155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227082311
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43557	NC_012578	CT	3	6	2270244	2270249	0 %	50 %	0 %	50 %	227082311
43558	NC_012578	CAC	2	6	2270254	2270259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227082311
43559	NC_012578	GCA	2	6	2270301	2270306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082311
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43561	NC_012578	GCA	2	6	2270346	2270351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082311
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43574	NC_012578	T	7	7	2271245	2271251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43575	NC_012578	GA	3	6	2271282	2271287	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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43579	NC_012578	GA	3	6	2271456	2271461	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43580	NC_012578	TGG	2	6	2271474	2271479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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43582	NC_012578	AG	3	6	2271576	2271581	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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43588	NC_012578	ACC	2	6	2272024	2272029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227082312
43589	NC_012578	CAA	2	6	2272065	2272070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227082312
43590	NC_012578	CTT	2	6	2272086	2272091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227082312
43591	NC_012578	TCA	2	6	2272154	2272159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082312
43592	NC_012578	TCTT	2	8	2272199	2272206	0 %	75 %	0 %	25 %	227082312
43593	NC_012578	GGT	2	6	2272238	2272243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227082312
43594	NC_012578	C	6	6	2272245	2272250	0 %	0 %	0 %	100 %	227082312
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43601	NC_012578	TGA	2	6	2272705	2272710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082312
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43603	NC_012578	TCTA	2	8	2273024	2273031	25 %	50 %	0 %	25 %	227082313
43604	NC_012578	TGT	2	6	2273135	2273140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43605	NC_012578	ACTCA	2	10	2273166	2273175	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
43606	NC_012578	TGC	2	6	2273374	2273379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082314
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43609	NC_012578	AC	3	6	2273549	2273554	50 %	0 %	0 %	50 %	227082314
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43619	NC_012578	TCT	2	6	2274085	2274090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227082314
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43622	NC_012578	GCT	2	6	2274227	2274232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082314
43623	NC_012578	CTT	2	6	2274233	2274238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227082314
43624	NC_012578	ACA	2	6	2274290	2274295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227082314
43625	NC_012578	CTT	2	6	2274297	2274302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227082314
43626	NC_012578	TTA	2	6	2274325	2274330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227082314
43627	NC_012578	GAC	2	6	2274347	2274352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082314
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43629	NC_012578	TCA	2	6	2274503	2274508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082315
43630	NC_012578	GGC	2	6	2274513	2274518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227082315
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43634	NC_012578	GAT	2	6	2274657	2274662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082315
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43636	NC_012578	CGG	2	6	2274828	2274833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227082315
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43641	NC_012578	CAC	2	6	2275281	2275286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227082315
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43665	NC_012578	CGG	2	6	2276463	2276468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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43844	NC_012578	CATCTC	2	12	2286003	2286014	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
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43846	NC_012578	CTA	2	6	2286042	2286047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43847	NC_012578	GAA	2	6	2286056	2286061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227082327
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43851	NC_012578	CTG	2	6	2286265	2286270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082327
43852	NC_012578	TGC	2	6	2286290	2286295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082327
43853	NC_012578	CAA	2	6	2286343	2286348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227082327
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