MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae M66-2 chromosome I

Total Repeats: 55388

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
42501	NC_012578	GCCA	2	8	2217560	2217567	25 %	0 %	25 %	50 %	227082252
42502	NC_012578	CGG	2	6	2217577	2217582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227082252
42503	NC_012578	ATG	2	6	2217588	2217593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082252
42504	NC_012578	TCT	2	6	2217636	2217641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227082252
42505	NC_012578	TAA	2	6	2217691	2217696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227082253
42506	NC_012578	TTG	2	6	2217713	2217718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227082253
42507	NC_012578	TTC	2	6	2217756	2217761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227082253
42508	NC_012578	TGCG	2	8	2217779	2217786	0 %	25 %	50 %	25 %	227082253
42509	NC_012578	GCT	2	6	2217824	2217829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082253
42510	NC_012578	TGC	2	6	2217844	2217849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082253
42511	NC_012578	TGC	2	6	2217880	2217885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082253
42512	NC_012578	CGTG	2	8	2217931	2217938	0 %	25 %	50 %	25 %	227082253
42513	NC_012578	TTC	2	6	2218048	2218053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227082253
42514	NC_012578	CAT	3	9	2218056	2218064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082253
42515	NC_012578	CTG	2	6	2218187	2218192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082253
42516	NC_012578	TCT	2	6	2218216	2218221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227082253
42517	NC_012578	ACG	2	6	2218242	2218247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082253
42518	NC_012578	TGC	2	6	2218281	2218286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082253
42519	NC_012578	GGC	2	6	2218302	2218307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227082253
42520	NC_012578	CGC	2	6	2218395	2218400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227082253
42521	NC_012578	GTG	2	6	2218423	2218428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227082253
42522	NC_012578	TGC	2	6	2218435	2218440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082253
42523	NC_012578	GACT	2	8	2218473	2218480	25 %	25 %	25 %	25 %	227082253
42524	NC_012578	CTT	2	6	2218520	2218525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227082253
42525	NC_012578	TG	3	6	2218582	2218587	0 %	50 %	50 %	0 %	227082253
42526	NC_012578	CAC	2	6	2218599	2218604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227082253
42527	NC_012578	TCA	2	6	2218645	2218650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082253
42528	NC_012578	TGAT	2	8	2218655	2218662	25 %	50 %	25 %	0 %	227082253
42529	NC_012578	CTTGA	2	10	2218706	2218715	20 %	40 %	20 %	20 %	227082253
42530	NC_012578	CTCA	2	8	2218728	2218735	25 %	25 %	0 %	50 %	227082253
42531	NC_012578	GCC	3	9	2218840	2218848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227082253
42532	NC_012578	CTA	2	6	2218871	2218876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082253
42533	NC_012578	GCC	2	6	2218881	2218886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227082253
42534	NC_012578	CCAT	2	8	2218901	2218908	25 %	25 %	0 %	50 %	227082253
42535	NC_012578	GCA	2	6	2218954	2218959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082253
42536	NC_012578	GGC	2	6	2219032	2219037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227082253
42537	NC_012578	TGT	2	6	2219062	2219067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227082253
42538	NC_012578	TGC	2	6	2219086	2219091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082253
42539	NC_012578	TGA	2	6	2219117	2219122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082253
42540	NC_012578	AAT	2	6	2219152	2219157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227082253
42541	NC_012578	CTCA	2	8	2219166	2219173	25 %	25 %	0 %	50 %	227082253
42542	NC_012578	CAC	2	6	2219201	2219206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227082253
42543	NC_012578	GCGA	2	8	2219251	2219258	25 %	0 %	50 %	25 %	227082253
42544	NC_012578	CTTG	2	8	2219291	2219298	0 %	50 %	25 %	25 %	227082253
42545	NC_012578	TGG	2	6	2219312	2219317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227082253
42546	NC_012578	ATG	2	6	2219339	2219344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082253
42547	NC_012578	CTT	2	6	2219384	2219389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227082253
42548	NC_012578	GCC	2	6	2219395	2219400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227082253
42549	NC_012578	CATC	2	8	2219429	2219436	25 %	25 %	0 %	50 %	227082253
42550	NC_012578	TGC	2	6	2219552	2219557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082253
42551	NC_012578	A	7	7	2219583	2219589	100 %	0 %	0 %	0 %	227082253
42552	NC_012578	CCA	2	6	2219590	2219595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227082253
42553	NC_012578	ACTG	2	8	2219622	2219629	25 %	25 %	25 %	25 %	227082253
42554	NC_012578	TCA	2	6	2219748	2219753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42555	NC_012578	AAG	2	6	2219794	2219799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42556	NC_012578	AGG	2	6	2219829	2219834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42557	NC_012578	ACG	2	6	2219853	2219858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42558	NC_012578	GAG	2	6	2219876	2219881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227082254
42559	NC_012578	CGG	2	6	2219885	2219890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227082254
42560	NC_012578	CATC	2	8	2219916	2219923	25 %	25 %	0 %	50 %	227082254
42561	NC_012578	TAA	2	6	2219947	2219952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227082254
42562	NC_012578	GTTT	2	8	2219963	2219970	0 %	75 %	25 %	0 %	227082254
42563	NC_012578	T	6	6	2219968	2219973	0 %	100 %	0 %	0 %	227082254
42564	NC_012578	TGC	2	6	2220056	2220061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082254
42565	NC_012578	T	6	6	2220069	2220074	0 %	100 %	0 %	0 %	227082254
42566	NC_012578	TGAG	2	8	2220098	2220105	25 %	25 %	50 %	0 %	227082254
42567	NC_012578	TGGC	2	8	2220128	2220135	0 %	25 %	50 %	25 %	227082254
42568	NC_012578	AACT	2	8	2220160	2220167	50 %	25 %	0 %	25 %	227082254
42569	NC_012578	TGG	2	6	2220209	2220214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227082254
42570	NC_012578	GCA	2	6	2220350	2220355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082255
42571	NC_012578	TTTC	2	8	2220383	2220390	0 %	75 %	0 %	25 %	227082255
42572	NC_012578	TGC	2	6	2220397	2220402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082255
42573	NC_012578	AC	3	6	2220504	2220509	50 %	0 %	0 %	50 %	227082255
42574	NC_012578	GGT	2	6	2220555	2220560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227082255
42575	NC_012578	CG	4	8	2220663	2220670	0 %	0 %	50 %	50 %	227082255
42576	NC_012578	GCC	2	6	2220750	2220755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227082255
42577	NC_012578	GC	3	6	2220763	2220768	0 %	0 %	50 %	50 %	227082255
42578	NC_012578	TGG	2	6	2220801	2220806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227082255
42579	NC_012578	GTGA	2	8	2220874	2220881	25 %	25 %	50 %	0 %	227082255
42580	NC_012578	CAG	2	6	2220891	2220896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082255
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42582	NC_012578	CAG	2	6	2220980	2220985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082255
42583	NC_012578	ACC	2	6	2220994	2220999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227082255
42584	NC_012578	CAACC	2	10	2221074	2221083	40 %	0 %	0 %	60 %	227082255
42585	NC_012578	TCA	2	6	2221112	2221117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082255
42586	NC_012578	ACCG	2	8	2221179	2221186	25 %	0 %	25 %	50 %	227082255
42587	NC_012578	ATCA	2	8	2221332	2221339	50 %	25 %	0 %	25 %	227082255
42588	NC_012578	CAG	2	6	2221347	2221352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082255
42589	NC_012578	CAGG	2	8	2221364	2221371	25 %	0 %	50 %	25 %	227082255
42590	NC_012578	GAT	2	6	2221419	2221424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082255
42591	NC_012578	CAC	2	6	2221467	2221472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227082255
42592	NC_012578	GTG	2	6	2221597	2221602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227082255
42593	NC_012578	GCTAAC	2	12	2221636	2221647	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	227082255
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42598	NC_012578	GGTT	2	8	2221940	2221947	0 %	50 %	50 %	0 %	227082256
42599	NC_012578	CAC	2	6	2221962	2221967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227082256
42600	NC_012578	CCA	2	6	2221994	2221999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227082256
42601	NC_012578	GCT	2	6	2222000	2222005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082256
42602	NC_012578	CTT	2	6	2222135	2222140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227082256
42603	NC_012578	TTG	2	6	2222223	2222228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227082256
42604	NC_012578	TCT	2	6	2222254	2222259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227082256
42605	NC_012578	CGA	2	6	2222276	2222281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082256
42606	NC_012578	CAT	2	6	2222405	2222410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082256
42607	NC_012578	CTTT	2	8	2222436	2222443	0 %	75 %	0 %	25 %	227082256
42608	NC_012578	GCA	2	6	2222470	2222475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42609	NC_012578	TCA	2	6	2222491	2222496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42610	NC_012578	AAT	2	6	2222498	2222503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42611	NC_012578	TCG	2	6	2222556	2222561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082257
42612	NC_012578	CCG	2	6	2222565	2222570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227082257
42613	NC_012578	ACG	2	6	2222600	2222605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082257
42614	NC_012578	TCA	2	6	2222683	2222688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082257
42615	NC_012578	CAG	2	6	2222692	2222697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082257
42616	NC_012578	TCT	2	6	2222722	2222727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227082257
42617	NC_012578	GCA	2	6	2222788	2222793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082257
42618	NC_012578	TCG	2	6	2222811	2222816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082257
42619	NC_012578	TTCC	2	8	2222890	2222897	0 %	50 %	0 %	50 %	227082257
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42729	NC_012578	AT	3	6	2228313	2228318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42730	NC_012578	TGT	2	6	2228344	2228349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227082262
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42733	NC_012578	C	7	7	2228416	2228422	0 %	0 %	0 %	100 %	227082262
42734	NC_012578	TGA	2	6	2228443	2228448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082262
42735	NC_012578	GCG	2	6	2228509	2228514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227082262
42736	NC_012578	TCT	2	6	2228559	2228564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227082262
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42739	NC_012578	CAT	2	6	2228765	2228770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082262
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42745	NC_012578	GCA	2	6	2229049	2229054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082262
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42758	NC_012578	TAT	2	6	2229810	2229815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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42762	NC_012578	A	7	7	2229913	2229919	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42763	NC_012578	TAGT	2	8	2229930	2229937	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42764	NC_012578	TTCTA	2	10	2229941	2229950	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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42846	NC_012578	TC	3	6	2234477	2234482	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42847	NC_012578	ACCTC	2	10	2234483	2234492	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
42848	NC_012578	TC	3	6	2234506	2234511	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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42969	NC_012578	GT	3	6	2241338	2241343	0 %	50 %	50 %	0 %	227082277
42970	NC_012578	A	6	6	2241382	2241387	100 %	0 %	0 %	0 %	227082277
42971	NC_012578	ATC	2	6	2241394	2241399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082277
42972	NC_012578	AGC	2	6	2241423	2241428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082278
42973	NC_012578	AC	3	6	2241444	2241449	50 %	0 %	0 %	50 %	227082278
42974	NC_012578	CAAG	2	8	2241523	2241530	50 %	0 %	25 %	25 %	227082278
42975	NC_012578	GCT	2	6	2241631	2241636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082278
42976	NC_012578	AGCC	2	8	2241647	2241654	25 %	0 %	25 %	50 %	227082278
42977	NC_012578	AC	3	6	2241666	2241671	50 %	0 %	0 %	50 %	227082278
42978	NC_012578	GTC	2	6	2241729	2241734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082278
42979	NC_012578	CTG	2	6	2241794	2241799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082278
42980	NC_012578	TC	3	6	2241840	2241845	0 %	50 %	0 %	50 %	227082278
42981	NC_012578	T	6	6	2241877	2241882	0 %	100 %	0 %	0 %	227082278
42982	NC_012578	GCA	2	6	2241949	2241954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082278
42983	NC_012578	AGC	2	6	2241961	2241966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082278
42984	NC_012578	AGC	2	6	2241990	2241995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082278
42985	NC_012578	GGAA	2	8	2242012	2242019	50 %	0 %	50 %	0 %	227082278
42986	NC_012578	TCA	2	6	2242062	2242067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082278
42987	NC_012578	A	7	7	2242200	2242206	100 %	0 %	0 %	0 %	227082279
42988	NC_012578	TGAA	2	8	2242222	2242229	50 %	25 %	25 %	0 %	227082279
42989	NC_012578	AGA	2	6	2242237	2242242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227082279
42990	NC_012578	GGT	2	6	2242337	2242342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227082280
42991	NC_012578	CTT	2	6	2242383	2242388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42992	NC_012578	CTT	2	6	2242397	2242402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227082281
42993	NC_012578	CCA	2	6	2242405	2242410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227082281
42994	NC_012578	CTG	2	6	2242411	2242416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082281
42995	NC_012578	TCA	2	6	2242575	2242580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082281
42996	NC_012578	GC	3	6	2242775	2242780	0 %	0 %	50 %	50 %	227082281
42997	NC_012578	CGCA	2	8	2242787	2242794	25 %	0 %	25 %	50 %	227082281
42998	NC_012578	GTG	2	6	2242812	2242817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227082281
42999	NC_012578	TGG	2	6	2242855	2242860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227082281
43000	NC_012578	CCAA	2	8	2242892	2242899	50 %	0 %	0 %	50 %	227082281

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