MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae M66-2 chromosome I

Total Repeats: 55388

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
42001	NC_012578	GT	3	6	2190443	2190448	0 %	50 %	50 %	0 %	227082218
42002	NC_012578	CTT	2	6	2190455	2190460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227082218
42003	NC_012578	CCG	2	6	2190562	2190567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227082218
42004	NC_012578	TG	3	6	2190591	2190596	0 %	50 %	50 %	0 %	227082218
42005	NC_012578	GTG	2	6	2190599	2190604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227082218
42006	NC_012578	GCT	2	6	2190614	2190619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082218
42007	NC_012578	ATG	2	6	2190788	2190793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082218
42008	NC_012578	GAG	2	6	2190809	2190814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227082218
42009	NC_012578	CATCGA	2	12	2190888	2190899	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	227082218
42010	NC_012578	GCA	2	6	2190947	2190952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082218
42011	NC_012578	TGG	2	6	2190982	2190987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227082218
42012	NC_012578	TGA	2	6	2191234	2191239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082218
42013	NC_012578	GAA	2	6	2191252	2191257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227082218
42014	NC_012578	CAT	2	6	2191288	2191293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082218
42015	NC_012578	GTC	2	6	2191410	2191415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082218
42016	NC_012578	CAAAAG	2	12	2191487	2191498	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42017	NC_012578	T	6	6	2191517	2191522	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42018	NC_012578	TATCAA	2	12	2191540	2191551	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	227082219
42019	NC_012578	CAC	2	6	2191750	2191755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227082219
42020	NC_012578	TTC	2	6	2191853	2191858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227082219
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42023	NC_012578	CGTA	2	8	2192033	2192040	25 %	25 %	25 %	25 %	227082219
42024	NC_012578	GTG	2	6	2192096	2192101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227082219
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42027	NC_012578	TTAA	2	8	2192229	2192236	50 %	50 %	0 %	0 %	227082219
42028	NC_012578	GTG	3	9	2192362	2192370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227082220
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42031	NC_012578	AGA	2	6	2192579	2192584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227082220
42032	NC_012578	T	6	6	2192627	2192632	0 %	100 %	0 %	0 %	227082220
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42036	NC_012578	TTA	2	6	2192838	2192843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227082220
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42038	NC_012578	TGA	2	6	2192876	2192881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082220
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42040	NC_012578	AGC	2	6	2192956	2192961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082220
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42042	NC_012578	AATCTG	2	12	2193070	2193081	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	227082220
42043	NC_012578	A	6	6	2193133	2193138	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42044	NC_012578	TTCAT	2	10	2193161	2193170	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
42045	NC_012578	CTG	2	6	2193211	2193216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082221
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42053	NC_012578	CT	3	6	2193647	2193652	0 %	50 %	0 %	50 %	227082221
42054	NC_012578	AGAGT	2	10	2193676	2193685	40 %	20 %	40 %	0 %	227082221
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42057	NC_012578	ATCA	2	8	2193754	2193761	50 %	25 %	0 %	25 %	227082221
42058	NC_012578	GCCC	2	8	2193799	2193806	0 %	0 %	25 %	75 %	227082221
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42074	NC_012578	ATAAA	2	10	2194848	2194857	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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42082	NC_012578	CGATG	2	10	2195169	2195178	20 %	20 %	40 %	20 %	227082222
42083	NC_012578	CGAT	2	8	2195204	2195211	25 %	25 %	25 %	25 %	227082222
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42088	NC_012578	GAC	2	6	2195370	2195375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082222
42089	NC_012578	TCA	2	6	2195441	2195446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082222
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42091	NC_012578	CTT	2	6	2195565	2195570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227082223
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42094	NC_012578	GC	3	6	2195652	2195657	0 %	0 %	50 %	50 %	227082223
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42099	NC_012578	AGTGA	2	10	2195973	2195982	40 %	20 %	40 %	0 %	227082223
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42104	NC_012578	CA	3	6	2196188	2196193	50 %	0 %	0 %	50 %	227082223
42105	NC_012578	AGCCA	2	10	2196222	2196231	40 %	0 %	20 %	40 %	227082223
42106	NC_012578	GC	3	6	2196394	2196399	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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42109	NC_012578	CGT	2	6	2196551	2196556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082224
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42111	NC_012578	TCT	2	6	2196711	2196716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227082225
42112	NC_012578	GAT	2	6	2196754	2196759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082225
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42115	NC_012578	AGC	2	6	2196809	2196814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082225
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42118	NC_012578	TAC	2	6	2196866	2196871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082225
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42226	NC_012578	GAT	2	6	2202407	2202412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082233
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42230	NC_012578	GCTT	2	8	2202517	2202524	0 %	50 %	25 %	25 %	227082233
42231	NC_012578	AGC	2	6	2202538	2202543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082233
42232	NC_012578	ATGCCA	2	12	2202550	2202561	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	227082233
42233	NC_012578	GAT	2	6	2202603	2202608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082233
42234	NC_012578	TGC	3	9	2202640	2202648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082233
42235	NC_012578	GCC	2	6	2202709	2202714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227082233
42236	NC_012578	GAA	2	6	2202717	2202722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227082233
42237	NC_012578	CT	3	6	2202732	2202737	0 %	50 %	0 %	50 %	227082233
42238	NC_012578	CGCGGT	2	12	2202768	2202779	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	227082233
42239	NC_012578	ATCA	2	8	2202861	2202868	50 %	25 %	0 %	25 %	227082233
42240	NC_012578	ATC	2	6	2202870	2202875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082233
42241	NC_012578	TCA	2	6	2202952	2202957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082233
42242	NC_012578	CGA	2	6	2203046	2203051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42243	NC_012578	GCC	2	6	2203057	2203062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42244	NC_012578	T	6	6	2203187	2203192	0 %	100 %	0 %	0 %	227082234
42245	NC_012578	ACC	2	6	2203214	2203219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227082234
42246	NC_012578	GTC	2	6	2203245	2203250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082234
42247	NC_012578	GTG	2	6	2203340	2203345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227082234
42248	NC_012578	GCC	2	6	2203439	2203444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227082234
42249	NC_012578	CTT	2	6	2203450	2203455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227082234
42250	NC_012578	AATC	2	8	2203516	2203523	50 %	25 %	0 %	25 %	227082234
42251	NC_012578	CGA	2	6	2203618	2203623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082234
42252	NC_012578	CG	3	6	2203645	2203650	0 %	0 %	50 %	50 %	227082234
42253	NC_012578	ACC	3	9	2203674	2203682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227082234
42254	NC_012578	GCC	4	12	2203685	2203696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227082234
42255	NC_012578	TGG	2	6	2203765	2203770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227082234
42256	NC_012578	CAT	2	6	2203793	2203798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082234
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42258	NC_012578	AGT	2	6	2203921	2203926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082234
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42261	NC_012578	CCA	2	6	2204070	2204075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227082234
42262	NC_012578	CGAT	2	8	2204202	2204209	25 %	25 %	25 %	25 %	227082234
42263	NC_012578	TTC	2	6	2204213	2204218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227082234
42264	NC_012578	GATT	2	8	2204221	2204228	25 %	50 %	25 %	0 %	227082234
42265	NC_012578	CTT	2	6	2204323	2204328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227082234
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42269	NC_012578	TAT	2	6	2204397	2204402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42270	NC_012578	GAT	2	6	2204416	2204421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42271	NC_012578	GAA	2	6	2204425	2204430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42272	NC_012578	ACG	2	6	2204547	2204552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082235
42273	NC_012578	ATC	2	6	2204643	2204648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082235
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42275	NC_012578	ATG	2	6	2204937	2204942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082235
42276	NC_012578	CTGC	2	8	2204983	2204990	0 %	25 %	25 %	50 %	227082235
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42282	NC_012578	GCCT	2	8	2205490	2205497	0 %	25 %	25 %	50 %	227082235
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42284	NC_012578	GCG	2	6	2205561	2205566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227082235
42285	NC_012578	CAA	2	6	2205674	2205679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227082235
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42289	NC_012578	GT	3	6	2205886	2205891	0 %	50 %	50 %	0 %	227082235
42290	NC_012578	ACG	2	6	2206023	2206028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082235
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42293	NC_012578	TG	3	6	2206223	2206228	0 %	50 %	50 %	0 %	227082235
42294	NC_012578	ATC	2	6	2206236	2206241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082235
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42299	NC_012578	CA	3	6	2206513	2206518	50 %	0 %	0 %	50 %	227082235
42300	NC_012578	A	6	6	2206550	2206555	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42301	NC_012578	T	6	6	2206600	2206605	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42302	NC_012578	CCG	2	6	2206627	2206632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227082236
42303	NC_012578	TCAGC	2	10	2206636	2206645	20 %	20 %	20 %	40 %	227082236
42304	NC_012578	AAAG	2	8	2206736	2206743	75 %	0 %	25 %	0 %	227082236
42305	NC_012578	GCA	2	6	2206761	2206766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082236
42306	NC_012578	CAC	2	6	2206780	2206785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227082236
42307	NC_012578	CGC	2	6	2206877	2206882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227082236
42308	NC_012578	TTA	2	6	2207085	2207090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227082236
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42310	NC_012578	TGG	2	6	2207134	2207139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227082236
42311	NC_012578	CAA	2	6	2207187	2207192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42312	NC_012578	T	7	7	2207199	2207205	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42313	NC_012578	GTT	2	6	2207211	2207216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42314	NC_012578	AAC	2	6	2207228	2207233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42315	NC_012578	TGGTT	2	10	2207334	2207343	0 %	60 %	40 %	0 %	227082237
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42319	NC_012578	TCA	2	6	2207535	2207540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082237
42320	NC_012578	ATCA	2	8	2207564	2207571	50 %	25 %	0 %	25 %	227082237
42321	NC_012578	CAG	2	6	2207576	2207581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082237
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42323	NC_012578	GCA	2	6	2207667	2207672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082238
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42332	NC_012578	T	6	6	2208215	2208220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42333	NC_012578	TCACCT	2	12	2208318	2208329	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
42334	NC_012578	A	6	6	2208333	2208338	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42335	NC_012578	ACT	2	6	2208396	2208401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082239
42336	NC_012578	GTAG	2	8	2208409	2208416	25 %	25 %	50 %	0 %	227082239
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42338	NC_012578	TA	3	6	2208506	2208511	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42339	NC_012578	CTG	2	6	2208516	2208521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42340	NC_012578	ATGC	2	8	2208534	2208541	25 %	25 %	25 %	25 %	227082240
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42342	NC_012578	GCCG	2	8	2208601	2208608	0 %	0 %	50 %	50 %	227082240
42343	NC_012578	GGT	2	6	2208664	2208669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227082240
42344	NC_012578	TCA	2	6	2208782	2208787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082240
42345	NC_012578	ATC	2	6	2208841	2208846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082240
42346	NC_012578	TGG	2	6	2208921	2208926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227082240
42347	NC_012578	TGC	2	6	2208929	2208934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082240
42348	NC_012578	ACC	2	6	2208954	2208959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227082240
42349	NC_012578	CTTG	2	8	2209023	2209030	0 %	50 %	25 %	25 %	227082240
42350	NC_012578	TGG	2	6	2209070	2209075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227082240
42351	NC_012578	CGG	2	6	2209169	2209174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42352	NC_012578	GCA	2	6	2209293	2209298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082241
42353	NC_012578	GAT	2	6	2209299	2209304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082241
42354	NC_012578	CA	3	6	2209357	2209362	50 %	0 %	0 %	50 %	227082241
42355	NC_012578	GAC	2	6	2209371	2209376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082241
42356	NC_012578	CAA	2	6	2209467	2209472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227082241
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42359	NC_012578	T	6	6	2209735	2209740	0 %	100 %	0 %	0 %	227082241
42360	NC_012578	AGA	2	6	2209791	2209796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227082241
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42370	NC_012578	AG	3	6	2210122	2210127	50 %	0 %	50 %	0 %	227082241
42371	NC_012578	GGT	2	6	2210158	2210163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227082241
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42382	NC_012578	CTTCTG	2	12	2211016	2211027	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	227082243
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42385	NC_012578	CGCT	2	8	2211273	2211280	0 %	25 %	25 %	50 %	227082243
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42420	NC_012578	CTT	2	6	2213219	2213224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227082245
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42422	NC_012578	AATA	2	8	2213315	2213322	75 %	25 %	0 %	0 %	227082246
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42431	NC_012578	GC	4	8	2213943	2213950	0 %	0 %	50 %	50 %	227082246
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42443	NC_012578	CCA	2	6	2214388	2214393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227082248
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42451	NC_012578	TCA	2	6	2214928	2214933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082248
42452	NC_012578	TGG	2	6	2214982	2214987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227082248
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42454	NC_012578	TGGA	2	8	2215105	2215112	25 %	25 %	50 %	0 %	227082248
42455	NC_012578	AGCG	2	8	2215142	2215149	25 %	0 %	50 %	25 %	227082248
42456	NC_012578	AGC	2	6	2215173	2215178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082248
42457	NC_012578	GTC	2	6	2215194	2215199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082248
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42459	NC_012578	CTC	2	6	2215287	2215292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227082249
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42462	NC_012578	TGA	2	6	2215418	2215423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082249
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42468	NC_012578	CCA	2	6	2215757	2215762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227082250
42469	NC_012578	GCA	2	6	2215781	2215786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082250
42470	NC_012578	GTG	2	6	2215913	2215918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227082250
42471	NC_012578	TTC	2	6	2215983	2215988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227082250
42472	NC_012578	CCG	2	6	2216049	2216054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42473	NC_012578	ATC	2	6	2216065	2216070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42474	NC_012578	CGT	2	6	2216075	2216080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42475	NC_012578	ATT	2	6	2216088	2216093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227082251
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42483	NC_012578	CCG	2	6	2216686	2216691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227082251
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42490	NC_012578	GAA	2	6	2217017	2217022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227082251
42491	NC_012578	CTT	2	6	2217066	2217071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227082251
42492	NC_012578	AGC	2	6	2217098	2217103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082251
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42494	NC_012578	CAG	2	6	2217305	2217310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082252
42495	NC_012578	TCGG	2	8	2217465	2217472	0 %	25 %	50 %	25 %	227082252
42496	NC_012578	GCG	2	6	2217474	2217479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227082252
42497	NC_012578	TCTGC	2	10	2217493	2217502	0 %	40 %	20 %	40 %	227082252
42498	NC_012578	TCG	2	6	2217516	2217521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082252
42499	NC_012578	CAT	2	6	2217533	2217538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082252
42500	NC_012578	CAC	3	9	2217550	2217558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227082252

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