MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae M66-2 chromosome I

Total Repeats: 55388

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41501	NC_012578	ACC	2	6	2163023	2163028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227082196
41502	NC_012578	TGA	2	6	2163036	2163041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082196
41503	NC_012578	TCA	2	6	2163042	2163047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082196
41504	NC_012578	ACC	2	6	2163059	2163064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227082196
41505	NC_012578	ACCG	2	8	2163067	2163074	25 %	0 %	25 %	50 %	227082196
41506	NC_012578	CAC	2	6	2163091	2163096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227082196
41507	NC_012578	CGC	2	6	2163124	2163129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227082196
41508	NC_012578	CAG	2	6	2163208	2163213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082196
41509	NC_012578	CGC	2	6	2163226	2163231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227082196
41510	NC_012578	CAC	2	6	2163271	2163276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227082196
41511	NC_012578	GAA	2	6	2163301	2163306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227082196
41512	NC_012578	GGA	2	6	2163333	2163338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227082196
41513	NC_012578	GCC	2	6	2163534	2163539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41514	NC_012578	ACTC	2	8	2163564	2163571	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
41515	NC_012578	A	6	6	2163702	2163707	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41516	NC_012578	AAC	2	6	2163720	2163725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41517	NC_012578	GCT	2	6	2163730	2163735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41518	NC_012578	ATG	2	6	2163760	2163765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41519	NC_012578	CAA	2	6	2163926	2163931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41520	NC_012578	TCAA	2	8	2163951	2163958	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41521	NC_012578	GTAA	2	8	2164075	2164082	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41522	NC_012578	TTGA	2	8	2164122	2164129	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41523	NC_012578	GC	4	8	2164135	2164142	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41524	NC_012578	TCGG	2	8	2164167	2164174	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
41525	NC_012578	CTG	2	6	2164206	2164211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41526	NC_012578	ATA	2	6	2164228	2164233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41527	NC_012578	CTAC	2	8	2164250	2164257	25 %	25 %	0 %	50 %	227082197
41528	NC_012578	GCT	2	6	2164273	2164278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082197
41529	NC_012578	T	6	6	2164282	2164287	0 %	100 %	0 %	0 %	227082197
41530	NC_012578	CAG	2	6	2164296	2164301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082197
41531	NC_012578	GACTTC	2	12	2164312	2164323	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	227082197
41532	NC_012578	AAT	3	9	2164369	2164377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41533	NC_012578	TCA	2	6	2164465	2164470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082198
41534	NC_012578	AT	3	6	2164477	2164482	50 %	50 %	0 %	0 %	227082198
41535	NC_012578	TCAG	2	8	2164674	2164681	25 %	25 %	25 %	25 %	227082198
41536	NC_012578	TAA	2	6	2164693	2164698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227082198
41537	NC_012578	TCT	2	6	2164728	2164733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227082198
41538	NC_012578	TCAG	2	8	2164776	2164783	25 %	25 %	25 %	25 %	227082198
41539	NC_012578	T	6	6	2164784	2164789	0 %	100 %	0 %	0 %	227082198
41540	NC_012578	GCA	2	6	2164915	2164920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082198
41541	NC_012578	ATT	2	6	2164994	2164999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227082198
41542	NC_012578	ATT	2	6	2165016	2165021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227082198
41543	NC_012578	TGA	2	6	2165031	2165036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082198
41544	NC_012578	CTCC	2	8	2165135	2165142	0 %	25 %	0 %	75 %	227082198
41545	NC_012578	TTG	2	6	2165145	2165150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227082198
41546	NC_012578	CTA	2	6	2165242	2165247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082198
41547	NC_012578	A	6	6	2165252	2165257	100 %	0 %	0 %	0 %	227082198
41548	NC_012578	CT	3	6	2165261	2165266	0 %	50 %	0 %	50 %	227082198
41549	NC_012578	ACT	2	6	2165339	2165344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082198
41550	NC_012578	CTG	2	6	2165349	2165354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082198
41551	NC_012578	TG	3	6	2165399	2165404	0 %	50 %	50 %	0 %	227082198
41552	NC_012578	AGGA	2	8	2165412	2165419	50 %	0 %	50 %	0 %	227082198
41553	NC_012578	TGA	2	6	2165431	2165436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082198
41554	NC_012578	ATT	2	6	2165438	2165443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227082198
41555	NC_012578	GGCGT	2	10	2165491	2165500	0 %	20 %	60 %	20 %	227082198
41556	NC_012578	TGG	2	6	2165580	2165585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227082198
41557	NC_012578	GCA	2	6	2165593	2165598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082198
41558	NC_012578	ATG	2	6	2165633	2165638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082198
41559	NC_012578	TTG	2	6	2165657	2165662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227082198
41560	NC_012578	A	6	6	2165735	2165740	100 %	0 %	0 %	0 %	227082198
41561	NC_012578	ACT	2	6	2165780	2165785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082198
41562	NC_012578	AAC	2	6	2165787	2165792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227082198
41563	NC_012578	AACCC	2	10	2165838	2165847	40 %	0 %	0 %	60 %	227082198
41564	NC_012578	TGA	2	6	2166030	2166035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082198
41565	NC_012578	TG	4	8	2166042	2166049	0 %	50 %	50 %	0 %	227082198
41566	NC_012578	CCA	2	6	2166124	2166129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227082198
41567	NC_012578	CCA	2	6	2166237	2166242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227082198
41568	NC_012578	AGC	2	6	2166246	2166251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082198
41569	NC_012578	GCC	2	6	2166275	2166280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227082198
41570	NC_012578	TGA	2	6	2166370	2166375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082198
41571	NC_012578	GCC	2	6	2166461	2166466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227082198
41572	NC_012578	CAA	2	6	2166593	2166598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227082198
41573	NC_012578	GAT	2	6	2166599	2166604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082198
41574	NC_012578	ATC	2	6	2166675	2166680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082198
41575	NC_012578	CTT	2	6	2166694	2166699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227082198
41576	NC_012578	TGGT	2	8	2166735	2166742	0 %	50 %	50 %	0 %	227082198
41577	NC_012578	TGA	2	6	2166832	2166837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082198
41578	NC_012578	CCCGA	2	10	2166929	2166938	20 %	0 %	20 %	60 %	227082198
41579	NC_012578	ATG	2	6	2167200	2167205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082198
41580	NC_012578	C	6	6	2167267	2167272	0 %	0 %	0 %	100 %	227082199
41581	NC_012578	CTC	2	6	2167405	2167410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227082199
41582	NC_012578	GAT	2	6	2167567	2167572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082199
41583	NC_012578	GGC	2	6	2167575	2167580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227082199
41584	NC_012578	TGA	2	6	2167628	2167633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082199
41585	NC_012578	GTT	2	6	2167764	2167769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227082199
41586	NC_012578	GTT	3	9	2167794	2167802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227082199
41587	NC_012578	TAC	2	6	2167839	2167844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41588	NC_012578	GGT	2	6	2167889	2167894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41589	NC_012578	ATT	2	6	2167934	2167939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41590	NC_012578	ATG	2	6	2167961	2167966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082200
41591	NC_012578	TCC	2	6	2167971	2167976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227082200
41592	NC_012578	TTGAA	2	10	2167986	2167995	40 %	40 %	20 %	0 %	227082200
41593	NC_012578	CAG	2	6	2168067	2168072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082200
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41596	NC_012578	CAT	2	6	2168413	2168418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082200
41597	NC_012578	A	6	6	2168597	2168602	100 %	0 %	0 %	0 %	227082200
41598	NC_012578	CGT	2	6	2168647	2168652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082200
41599	NC_012578	GAA	2	6	2168692	2168697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227082200
41600	NC_012578	GTTG	2	8	2168698	2168705	0 %	50 %	50 %	0 %	227082200
41601	NC_012578	TGC	2	6	2168799	2168804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082200
41602	NC_012578	GAT	2	6	2168849	2168854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082200
41603	NC_012578	GC	3	6	2168856	2168861	0 %	0 %	50 %	50 %	227082200
41604	NC_012578	GTG	2	6	2168864	2168869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227082200
41605	NC_012578	GGA	2	6	2168875	2168880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227082200
41606	NC_012578	GGC	2	6	2168933	2168938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227082200
41607	NC_012578	ACA	2	6	2168948	2168953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227082200
41608	NC_012578	GT	3	6	2169003	2169008	0 %	50 %	50 %	0 %	227082200
41609	NC_012578	TCAACA	2	12	2169028	2169039	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	227082200
41610	NC_012578	CAC	2	6	2169104	2169109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227082200
41611	NC_012578	ATG	2	6	2169119	2169124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082200
41612	NC_012578	GGC	2	6	2169161	2169166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227082200
41613	NC_012578	ATCGA	2	10	2169221	2169230	40 %	20 %	20 %	20 %	227082200
41614	NC_012578	AGA	2	6	2169250	2169255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227082200
41615	NC_012578	GGC	2	6	2169286	2169291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227082200
41616	NC_012578	ACA	2	6	2169348	2169353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227082200
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41618	NC_012578	AAGAGA	2	12	2169474	2169485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227082200
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41634	NC_012578	T	6	6	2170379	2170384	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41635	NC_012578	ACT	2	6	2170419	2170424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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41646	NC_012578	GTA	2	6	2170900	2170905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082203
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41731	NC_012578	T	7	7	2176042	2176048	0 %	100 %	0 %	0 %	227082206
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