MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae M66-2 chromosome I

Total Repeats: 55388

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21002	NC_012578	GC	3	6	1085357	1085362	0 %	0 %	50 %	50 %	227081233
21003	NC_012578	AAG	2	6	1085375	1085380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227081233
21004	NC_012578	AAGC	2	8	1085420	1085427	50 %	0 %	25 %	25 %	227081233
21005	NC_012578	AAG	2	6	1085433	1085438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227081233
21006	NC_012578	AAG	2	6	1085505	1085510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227081233
21007	NC_012578	TGA	2	6	1085563	1085568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227081233
21008	NC_012578	TGC	3	9	1085571	1085579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227081233
21009	NC_012578	TGG	2	6	1085590	1085595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227081233
21010	NC_012578	ATGGTT	2	12	1085607	1085618	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	227081233
21011	NC_012578	CAT	2	6	1085622	1085627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227081233
21012	NC_012578	GGCT	2	8	1085650	1085657	0 %	25 %	50 %	25 %	227081233
21013	NC_012578	GCG	2	6	1085694	1085699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227081233
21014	NC_012578	ATG	2	6	1085705	1085710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227081233
21015	NC_012578	GTG	2	6	1085768	1085773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227081233
21016	NC_012578	CTG	2	6	1085798	1085803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227081233
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21019	NC_012578	GAA	2	6	1085915	1085920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227081233
21020	NC_012578	GAT	2	6	1086053	1086058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227081233
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21022	NC_012578	CTG	2	6	1086095	1086100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227081233
21023	NC_012578	GCC	2	6	1086155	1086160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227081233
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21025	NC_012578	T	6	6	1086272	1086277	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21029	NC_012578	CGCA	2	8	1086618	1086625	25 %	0 %	25 %	50 %	227081234
21030	NC_012578	GCTCG	2	10	1086651	1086660	0 %	20 %	40 %	40 %	227081234
21031	NC_012578	GGC	2	6	1086668	1086673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227081234
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21033	NC_012578	GTA	2	6	1086729	1086734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227081234
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21035	NC_012578	CA	4	8	1086765	1086772	50 %	0 %	0 %	50 %	227081234
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21039	NC_012578	CATCTG	2	12	1086876	1086887	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	227081234
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21055	NC_012578	CT	3	6	1087711	1087716	0 %	50 %	0 %	50 %	227081235
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21118	NC_012578	TGG	2	6	1091057	1091062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227081240
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21354	NC_012578	CAA	2	6	1102467	1102472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227081250
21355	NC_012578	TGA	2	6	1102616	1102621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227081250
21356	NC_012578	GCT	2	6	1102748	1102753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227081250
21357	NC_012578	ATCA	2	8	1102798	1102805	50 %	25 %	0 %	25 %	227081250
21358	NC_012578	GC	3	6	1102821	1102826	0 %	0 %	50 %	50 %	227081250
21359	NC_012578	AGC	2	6	1102831	1102836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227081250
21360	NC_012578	TGGAT	2	10	1102926	1102935	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
21361	NC_012578	CG	3	6	1102953	1102958	0 %	0 %	50 %	50 %	227081251
21362	NC_012578	TTG	2	6	1103008	1103013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227081251
21363	NC_012578	TGG	2	6	1103099	1103104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227081251
21364	NC_012578	GCAA	2	8	1103119	1103126	50 %	0 %	25 %	25 %	227081251
21365	NC_012578	T	7	7	1103150	1103156	0 %	100 %	0 %	0 %	227081251
21366	NC_012578	GCA	2	6	1103317	1103322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227081251
21367	NC_012578	CCG	2	6	1103338	1103343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227081251
21368	NC_012578	TG	3	6	1103395	1103400	0 %	50 %	50 %	0 %	227081251
21369	NC_012578	GGT	2	6	1103412	1103417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227081251
21370	NC_012578	ATTA	2	8	1103471	1103478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21371	NC_012578	T	7	7	1103545	1103551	0 %	100 %	0 %	0 %	227081252
21372	NC_012578	TGC	2	6	1103636	1103641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227081252
21373	NC_012578	TCT	2	6	1103667	1103672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21374	NC_012578	GCTG	2	8	1103699	1103706	0 %	25 %	50 %	25 %	227081253
21375	NC_012578	TGG	2	6	1103750	1103755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227081253
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21377	NC_012578	CTT	2	6	1103836	1103841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227081253
21378	NC_012578	GCT	2	6	1103863	1103868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227081253
21379	NC_012578	AG	3	6	1103885	1103890	50 %	0 %	50 %	0 %	227081253
21380	NC_012578	TCA	2	6	1103946	1103951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227081253
21381	NC_012578	TGA	2	6	1104012	1104017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227081253
21382	NC_012578	CTT	2	6	1104034	1104039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227081253
21383	NC_012578	GC	3	6	1104081	1104086	0 %	0 %	50 %	50 %	227081253
21384	NC_012578	GCG	2	6	1104165	1104170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227081253
21385	NC_012578	CTG	2	6	1104197	1104202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227081253
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21389	NC_012578	AG	3	6	1104443	1104448	50 %	0 %	50 %	0 %	227081253
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21415	NC_012578	CTG	2	6	1106115	1106120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227081255
21416	NC_012578	A	6	6	1106139	1106144	100 %	0 %	0 %	0 %	227081255
21417	NC_012578	TAC	2	6	1106157	1106162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227081255
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21423	NC_012578	T	6	6	1106421	1106426	0 %	100 %	0 %	0 %	227081255
21424	NC_012578	GAGT	2	8	1106460	1106467	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
21425	NC_012578	TGA	2	6	1106493	1106498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227081256
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21428	NC_012578	GC	3	6	1106759	1106764	0 %	0 %	50 %	50 %	227081256
21429	NC_012578	AACA	2	8	1106804	1106811	75 %	0 %	0 %	25 %	227081256
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21433	NC_012578	CGG	2	6	1107038	1107043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227081257
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21435	NC_012578	GGAT	2	8	1107128	1107135	25 %	25 %	50 %	0 %	227081257
21436	NC_012578	AG	3	6	1107149	1107154	50 %	0 %	50 %	0 %	227081257
21437	NC_012578	ATTGA	2	10	1107213	1107222	40 %	40 %	20 %	0 %	227081257
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21445	NC_012578	TGAA	2	8	1107518	1107525	50 %	25 %	25 %	0 %	227081258
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21453	NC_012578	TG	3	6	1107796	1107801	0 %	50 %	50 %	0 %	227081258
21454	NC_012578	GAA	2	6	1107862	1107867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227081258
21455	NC_012578	AATT	2	8	1107920	1107927	50 %	50 %	0 %	0 %	227081258
21456	NC_012578	A	6	6	1107935	1107940	100 %	0 %	0 %	0 %	227081258
21457	NC_012578	TAA	2	6	1107984	1107989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227081258
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21459	NC_012578	ACT	2	6	1108031	1108036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227081258
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21461	NC_012578	ATTTT	2	10	1108145	1108154	20 %	80 %	0 %	0 %	227081258
21462	NC_012578	CGG	2	6	1108163	1108168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227081258
21463	NC_012578	TC	3	6	1108183	1108188	0 %	50 %	0 %	50 %	227081258
21464	NC_012578	A	6	6	1108218	1108223	100 %	0 %	0 %	0 %	227081258
21465	NC_012578	ATCGA	2	10	1108285	1108294	40 %	20 %	20 %	20 %	227081258
21466	NC_012578	ATC	2	6	1108303	1108308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227081258
21467	NC_012578	ACA	2	6	1108325	1108330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227081258
21468	NC_012578	T	6	6	1108370	1108375	0 %	100 %	0 %	0 %	227081258
21469	NC_012578	ATCA	2	8	1108390	1108397	50 %	25 %	0 %	25 %	227081258
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21473	NC_012578	GGA	2	6	1108527	1108532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227081258
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