MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae M66-2 chromosome I

Total Repeats: 55388

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18502	NC_012578	GAA	2	6	953361	953366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227081105
18503	NC_012578	ATCA	2	8	953410	953417	50 %	25 %	0 %	25 %	227081105
18504	NC_012578	TTG	2	6	953438	953443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227081105
18505	NC_012578	GTTG	2	8	953450	953457	0 %	50 %	50 %	0 %	227081105
18506	NC_012578	ATA	2	6	953462	953467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227081105
18507	NC_012578	GTGG	2	8	953497	953504	0 %	25 %	75 %	0 %	227081105
18508	NC_012578	CAA	2	6	953536	953541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227081105
18509	NC_012578	CGG	2	6	953558	953563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227081105
18510	NC_012578	CGAT	2	8	953594	953601	25 %	25 %	25 %	25 %	227081105
18511	NC_012578	TAC	2	6	953610	953615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227081105
18512	NC_012578	CAA	2	6	953619	953624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227081105
18513	NC_012578	CGG	2	6	953631	953636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227081105
18514	NC_012578	GGT	2	6	953656	953661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227081105
18515	NC_012578	GT	3	6	953660	953665	0 %	50 %	50 %	0 %	227081105
18516	NC_012578	GGT	2	6	953731	953736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227081105
18517	NC_012578	GGTT	2	8	953881	953888	0 %	50 %	50 %	0 %	227081105
18518	NC_012578	CTA	2	6	953910	953915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227081105
18519	NC_012578	T	7	7	953970	953976	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18520	NC_012578	TCA	2	6	954031	954036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18521	NC_012578	GAT	2	6	954206	954211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227081106
18522	NC_012578	CAAAA	2	10	954291	954300	80 %	0 %	0 %	20 %	227081106
18523	NC_012578	ATG	2	6	954303	954308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227081106
18524	NC_012578	TGG	2	6	954319	954324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227081106
18525	NC_012578	TG	3	6	954364	954369	0 %	50 %	50 %	0 %	227081106
18526	NC_012578	A	6	6	954379	954384	100 %	0 %	0 %	0 %	227081106
18527	NC_012578	CAT	2	6	954490	954495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227081106
18528	NC_012578	AATA	2	8	954584	954591	75 %	25 %	0 %	0 %	227081106
18529	NC_012578	AGA	2	6	954634	954639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227081106
18530	NC_012578	A	6	6	954674	954679	100 %	0 %	0 %	0 %	227081106
18531	NC_012578	AG	3	6	954761	954766	50 %	0 %	50 %	0 %	227081106
18532	NC_012578	AAT	2	6	954777	954782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227081106
18533	NC_012578	T	7	7	954782	954788	0 %	100 %	0 %	0 %	227081106
18534	NC_012578	TGT	2	6	954809	954814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227081106
18535	NC_012578	CAA	2	6	954836	954841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227081106
18536	NC_012578	A	7	7	954934	954940	100 %	0 %	0 %	0 %	227081106
18537	NC_012578	AGC	2	6	954960	954965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227081106
18538	NC_012578	GAT	2	6	955128	955133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227081106
18539	NC_012578	TAGC	2	8	955216	955223	25 %	25 %	25 %	25 %	227081106
18540	NC_012578	TGC	2	6	955232	955237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227081106
18541	NC_012578	AAAC	2	8	955247	955254	75 %	0 %	0 %	25 %	227081106
18542	NC_012578	TAA	3	9	955259	955267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227081106
18543	NC_012578	A	6	6	955350	955355	100 %	0 %	0 %	0 %	227081106
18544	NC_012578	GA	3	6	955451	955456	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18545	NC_012578	GCCAT	2	10	955475	955484	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
18546	NC_012578	ACC	3	9	955581	955589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227081107
18547	NC_012578	GGC	3	9	955642	955650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227081107
18548	NC_012578	GGTT	2	8	955668	955675	0 %	50 %	50 %	0 %	227081107
18549	NC_012578	GAT	2	6	955716	955721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227081107
18550	NC_012578	GTT	2	6	955826	955831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227081107
18551	NC_012578	CT	3	6	956047	956052	0 %	50 %	0 %	50 %	227081107
18552	NC_012578	A	6	6	956124	956129	100 %	0 %	0 %	0 %	227081107
18553	NC_012578	CAAT	2	8	956132	956139	50 %	25 %	0 %	25 %	227081107
18554	NC_012578	ATT	2	6	956203	956208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18555	NC_012578	AAT	2	6	956253	956258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18556	NC_012578	T	6	6	956262	956267	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18557	NC_012578	AAT	2	6	956280	956285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18558	NC_012578	TTATTT	2	12	956316	956327	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18559	NC_012578	TTTA	2	8	956345	956352	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18560	NC_012578	CAT	2	6	956376	956381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18561	NC_012578	TGG	2	6	956407	956412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18562	NC_012578	TAA	2	6	956414	956419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18563	NC_012578	GTTT	2	8	956449	956456	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
18564	NC_012578	TATT	2	8	956459	956466	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18565	NC_012578	T	7	7	956465	956471	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18566	NC_012578	GTT	2	6	956506	956511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18567	NC_012578	TCA	2	6	956523	956528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18569	NC_012578	A	6	6	956595	956600	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18570	NC_012578	ATT	2	6	956618	956623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18571	NC_012578	TGA	2	6	956659	956664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227081108
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18573	NC_012578	ACTA	2	8	956688	956695	50 %	25 %	0 %	25 %	227081108
18574	NC_012578	TA	3	6	956751	956756	50 %	50 %	0 %	0 %	227081108
18575	NC_012578	TGT	2	6	956777	956782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227081108
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18577	NC_012578	CTTT	2	8	956889	956896	0 %	75 %	0 %	25 %	227081108
18578	NC_012578	TTGG	2	8	957025	957032	0 %	50 %	50 %	0 %	227081108
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18583	NC_012578	AGCGC	2	10	957305	957314	20 %	0 %	40 %	40 %	227081108
18584	NC_012578	T	6	6	957378	957383	0 %	100 %	0 %	0 %	227081108
18585	NC_012578	AGC	2	6	957504	957509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227081108
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18590	NC_012578	TGC	2	6	957856	957861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227081108
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18593	NC_012578	A	6	6	958040	958045	100 %	0 %	0 %	0 %	227081108
18594	NC_012578	CGT	2	6	958069	958074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18595	NC_012578	AATA	2	8	958095	958102	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18596	NC_012578	T	6	6	958151	958156	0 %	100 %	0 %	0 %	227081109
18597	NC_012578	CAGC	2	8	958157	958164	25 %	0 %	25 %	50 %	227081109
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18603	NC_012578	CAG	2	6	958818	958823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227081109
18604	NC_012578	ATA	2	6	958829	958834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227081109
18605	NC_012578	ACT	2	6	958838	958843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227081109
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18607	NC_012578	CAGC	2	8	958928	958935	25 %	0 %	25 %	50 %	227081109
18608	NC_012578	GATGTG	2	12	958963	958974	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	227081109
18609	NC_012578	CGAC	2	8	959027	959034	25 %	0 %	25 %	50 %	227081109
18610	NC_012578	CA	3	6	959087	959092	50 %	0 %	0 %	50 %	227081109
18611	NC_012578	GAC	2	6	959109	959114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227081109
18612	NC_012578	TGA	3	9	959163	959171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227081109
18613	NC_012578	ACG	2	6	959173	959178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227081109
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18615	NC_012578	ATG	2	6	959326	959331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227081110
18616	NC_012578	CT	3	6	959341	959346	0 %	50 %	0 %	50 %	227081110
18617	NC_012578	T	6	6	959346	959351	0 %	100 %	0 %	0 %	227081110
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18619	NC_012578	CCTT	2	8	959501	959508	0 %	50 %	0 %	50 %	227081110
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18622	NC_012578	ATC	2	6	959672	959677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227081110
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18999	NC_012578	AG	3	6	981021	981026	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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