MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae M66-2 chromosome I

Total Repeats: 55388

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17501	NC_012578	CTTTAT	2	12	899628	899639	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	227081056
17502	NC_012578	T	6	6	899641	899646	0 %	100 %	0 %	0 %	227081056
17503	NC_012578	GTGAT	2	10	899699	899708	20 %	40 %	40 %	0 %	227081056
17504	NC_012578	TCT	2	6	899731	899736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227081056
17505	NC_012578	T	6	6	899761	899766	0 %	100 %	0 %	0 %	227081056
17506	NC_012578	GCG	2	6	899767	899772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227081056
17507	NC_012578	CTT	2	6	899784	899789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227081056
17508	NC_012578	TTC	2	6	899872	899877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227081056
17509	NC_012578	TG	3	6	899891	899896	0 %	50 %	50 %	0 %	227081056
17510	NC_012578	TGA	2	6	899909	899914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227081056
17511	NC_012578	CTCTGC	2	12	899919	899930	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	227081056
17512	NC_012578	TGG	2	6	899975	899980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227081056
17513	NC_012578	TATCG	2	10	900010	900019	20 %	40 %	20 %	20 %	227081056
17514	NC_012578	CAT	2	6	900036	900041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227081056
17515	NC_012578	GAT	2	6	900048	900053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227081056
17516	NC_012578	TCGGTA	2	12	900104	900115	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	227081056
17517	NC_012578	GGT	2	6	900144	900149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227081056
17518	NC_012578	TGG	2	6	900155	900160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227081056
17519	NC_012578	GCC	2	6	900220	900225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227081056
17520	NC_012578	TAC	2	6	900229	900234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227081056
17521	NC_012578	T	6	6	900285	900290	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17522	NC_012578	GAT	2	6	900341	900346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227081057
17523	NC_012578	GGC	2	6	900378	900383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227081057
17524	NC_012578	GC	3	6	900409	900414	0 %	0 %	50 %	50 %	227081057
17525	NC_012578	GC	3	6	900444	900449	0 %	0 %	50 %	50 %	227081057
17526	NC_012578	ACC	2	6	900498	900503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227081057
17527	NC_012578	GC	3	6	900617	900622	0 %	0 %	50 %	50 %	227081057
17528	NC_012578	GCG	2	6	900694	900699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227081057
17529	NC_012578	TTTG	2	8	900770	900777	0 %	75 %	25 %	0 %	227081058
17530	NC_012578	GCT	2	6	900841	900846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227081058
17531	NC_012578	AAT	2	6	900926	900931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227081058
17532	NC_012578	TGC	3	9	900996	901004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227081058
17533	NC_012578	GCC	2	6	901076	901081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17534	NC_012578	GA	3	6	901126	901131	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17535	NC_012578	CTTA	2	8	901188	901195	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17536	NC_012578	TTGG	2	8	901223	901230	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17537	NC_012578	CAG	2	6	901254	901259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17538	NC_012578	GTG	2	6	901342	901347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17539	NC_012578	GTGAG	2	10	901401	901410	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
17540	NC_012578	GAT	2	6	901418	901423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17541	NC_012578	TGA	2	6	901494	901499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17542	NC_012578	ATT	2	6	901512	901517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17543	NC_012578	GAT	2	6	901590	901595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17544	NC_012578	TGC	2	6	901622	901627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17545	NC_012578	A	7	7	901733	901739	100 %	0 %	0 %	0 %	227081059
17546	NC_012578	AAC	2	6	901776	901781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227081059
17547	NC_012578	CAG	2	6	901784	901789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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17552	NC_012578	CGA	2	6	902018	902023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227081060
17553	NC_012578	TTC	2	6	902067	902072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227081060
17554	NC_012578	GC	3	6	902151	902156	0 %	0 %	50 %	50 %	227081060
17555	NC_012578	TGGATG	2	12	902336	902347	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	227081060
17556	NC_012578	CGGTG	2	10	902409	902418	0 %	20 %	60 %	20 %	227081060
17557	NC_012578	TCG	2	6	902475	902480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227081061
17558	NC_012578	CAAA	2	8	902497	902504	75 %	0 %	0 %	25 %	227081061
17559	NC_012578	GCT	2	6	902638	902643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227081061
17560	NC_012578	CTG	2	6	902720	902725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227081062
17561	NC_012578	GCA	2	6	902779	902784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227081062
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17563	NC_012578	ATCGC	2	10	902970	902979	20 %	20 %	20 %	40 %	227081062
17564	NC_012578	GGCA	2	8	903158	903165	25 %	0 %	50 %	25 %	227081062
17565	NC_012578	GTA	2	6	903305	903310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227081062
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17571	NC_012578	TTG	2	6	903614	903619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227081062
17572	NC_012578	GCA	2	6	903709	903714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227081062
17573	NC_012578	CTTT	2	8	903760	903767	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
17574	NC_012578	TCA	2	6	903804	903809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17575	NC_012578	TGC	2	6	903887	903892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227081063
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17581	NC_012578	CAAG	2	8	904490	904497	50 %	0 %	25 %	25 %	227081064
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17588	NC_012578	GCTT	2	8	904828	904835	0 %	50 %	25 %	25 %	227081064
17589	NC_012578	TTGG	2	8	904843	904850	0 %	50 %	50 %	0 %	227081064
17590	NC_012578	TGA	2	6	904875	904880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227081064
17591	NC_012578	A	6	6	904900	904905	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17592	NC_012578	TCA	2	6	904910	904915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17593	NC_012578	GCG	2	6	904958	904963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17594	NC_012578	GCTC	2	8	905000	905007	0 %	25 %	25 %	50 %	227081065
17595	NC_012578	TGCA	2	8	905035	905042	25 %	25 %	25 %	25 %	227081065
17596	NC_012578	TCT	2	6	905045	905050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227081065
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17602	NC_012578	GCA	2	6	905295	905300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227081065
17603	NC_012578	GCT	2	6	905392	905397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227081065
17604	NC_012578	CT	3	6	905396	905401	0 %	50 %	0 %	50 %	227081065
17605	NC_012578	TTGATG	2	12	905452	905463	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	227081065
17606	NC_012578	CATT	2	8	905486	905493	25 %	50 %	0 %	25 %	227081065
17607	NC_012578	CCG	2	6	905499	905504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227081065
17608	NC_012578	CG	3	6	905593	905598	0 %	0 %	50 %	50 %	227081065
17609	NC_012578	AAG	2	6	905669	905674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227081065
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17611	NC_012578	CA	3	6	905865	905870	50 %	0 %	0 %	50 %	227081065
17612	NC_012578	TGC	2	6	905910	905915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227081065
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17989	NC_012578	A	6	6	925943	925948	100 %	0 %	0 %	0 %	227081083
17990	NC_012578	TTCTT	2	10	925982	925991	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
17991	NC_012578	CG	3	6	926080	926085	0 %	0 %	50 %	50 %	227081084
17992	NC_012578	GTG	2	6	926188	926193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227081084
17993	NC_012578	CAT	2	6	926213	926218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227081084
17994	NC_012578	CAGT	2	8	926254	926261	25 %	25 %	25 %	25 %	227081084
17995	NC_012578	TGC	2	6	926266	926271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227081084
17996	NC_012578	A	6	6	926329	926334	100 %	0 %	0 %	0 %	227081084
17997	NC_012578	ATG	2	6	926410	926415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227081084
17998	NC_012578	GCA	2	6	926429	926434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227081084
17999	NC_012578	TGA	2	6	926462	926467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227081084
18000	NC_012578	GCA	2	6	926516	926521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227081084

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