MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae M66-2 chromosome I

Total Repeats: 55388

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14002	NC_012578	CTT	2	6	728901	728906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080897
14003	NC_012578	CGT	2	6	728959	728964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080897
14004	NC_012578	CAC	2	6	728992	728997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080897
14005	NC_012578	T	6	6	729046	729051	0 %	100 %	0 %	0 %	227080897
14006	NC_012578	CTGC	2	8	729056	729063	0 %	25 %	25 %	50 %	227080897
14007	NC_012578	TCT	2	6	729155	729160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080897
14008	NC_012578	TCTTTT	2	12	729170	729181	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	227080897
14009	NC_012578	TTC	2	6	729182	729187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080897
14010	NC_012578	CTT	2	6	729198	729203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080897
14011	NC_012578	T	6	6	729264	729269	0 %	100 %	0 %	0 %	227080897
14012	NC_012578	TCA	2	6	729315	729320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080897
14013	NC_012578	TTG	2	6	729480	729485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080897
14014	NC_012578	A	7	7	729551	729557	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14015	NC_012578	GTT	2	6	729573	729578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14016	NC_012578	CTTTG	2	10	729580	729589	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
14017	NC_012578	AT	3	6	729604	729609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14018	NC_012578	TTTG	2	8	729637	729644	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
14019	NC_012578	GTT	2	6	729735	729740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080898
14020	NC_012578	TGT	2	6	729766	729771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080898
14021	NC_012578	GCTG	2	8	729839	729846	0 %	25 %	50 %	25 %	227080898
14022	NC_012578	TGG	2	6	729887	729892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080898
14023	NC_012578	TCA	2	6	729907	729912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080898
14024	NC_012578	TGT	2	6	729950	729955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080898
14025	NC_012578	GTG	2	6	729970	729975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080898
14026	NC_012578	AAG	3	9	729976	729984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080898
14027	NC_012578	GAT	2	6	730014	730019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080898
14028	NC_012578	GTTG	2	8	730049	730056	0 %	50 %	50 %	0 %	227080898
14029	NC_012578	CCG	2	6	730076	730081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227080898
14030	NC_012578	GGA	2	6	730100	730105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227080898
14031	NC_012578	TGAT	2	8	730108	730115	25 %	50 %	25 %	0 %	227080898
14032	NC_012578	CTT	2	6	730208	730213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080898
14033	NC_012578	AC	3	6	730218	730223	50 %	0 %	0 %	50 %	227080898
14034	NC_012578	GT	3	6	730231	730236	0 %	50 %	50 %	0 %	227080898
14035	NC_012578	AGC	2	6	730246	730251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080898
14036	NC_012578	AAT	2	6	730257	730262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227080898
14037	NC_012578	TCG	2	6	730313	730318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080898
14038	NC_012578	AGA	2	6	730334	730339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080898
14039	NC_012578	GCGCG	2	10	730370	730379	0 %	0 %	60 %	40 %	227080898
14040	NC_012578	T	8	8	730472	730479	0 %	100 %	0 %	0 %	227080899
14041	NC_012578	TGG	2	6	730495	730500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080899
14042	NC_012578	GCT	2	6	730526	730531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080899
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14045	NC_012578	GGT	3	9	730757	730765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080899
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14050	NC_012578	GAT	2	6	730902	730907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080899
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14053	NC_012578	TGC	2	6	731095	731100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080899
14054	NC_012578	AGA	2	6	731120	731125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080899
14055	NC_012578	TGA	2	6	731170	731175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080899
14056	NC_012578	AGC	2	6	731179	731184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080899
14057	NC_012578	CTG	2	6	731214	731219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080899
14058	NC_012578	AAG	2	6	731302	731307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080899
14059	NC_012578	GTG	2	6	731320	731325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080899
14060	NC_012578	GCA	2	6	731330	731335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080899
14061	NC_012578	GC	3	6	731446	731451	0 %	0 %	50 %	50 %	227080899
14062	NC_012578	GTTT	2	8	731693	731700	0 %	75 %	25 %	0 %	227080899
14063	NC_012578	TGG	2	6	731713	731718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080899
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14065	NC_012578	TTGGTT	2	12	731765	731776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080900
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14069	NC_012578	GCA	2	6	732018	732023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080900
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14073	NC_012578	TCAA	2	8	732380	732387	50 %	25 %	0 %	25 %	227080900
14074	NC_012578	GGGT	2	8	732405	732412	0 %	25 %	75 %	0 %	227080900
14075	NC_012578	GCT	2	6	732433	732438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080900
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14088	NC_012578	GTT	3	9	733073	733081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080901
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14092	NC_012578	GGC	2	6	733278	733283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080901
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14094	NC_012578	GTG	2	6	733324	733329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080901
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14105	NC_012578	GCA	2	6	734017	734022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080901
14106	NC_012578	T	7	7	734113	734119	0 %	100 %	0 %	0 %	227080901
14107	NC_012578	GCA	2	6	734134	734139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080901
14108	NC_012578	GCT	2	6	734150	734155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080901
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14110	NC_012578	ACC	2	6	734188	734193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080901
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14112	NC_012578	ACT	2	6	734260	734265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080901
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14115	NC_012578	TCCA	2	8	734522	734529	25 %	25 %	0 %	50 %	227080902
14116	NC_012578	CAT	2	6	734562	734567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080902
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14118	NC_012578	TGA	2	6	734616	734621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080902
14119	NC_012578	GAT	2	6	734677	734682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080902
14120	NC_012578	GGC	2	6	734770	734775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080902
14121	NC_012578	T	6	6	734776	734781	0 %	100 %	0 %	0 %	227080902
14122	NC_012578	TTGGCG	2	12	734789	734800	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	227080902
14123	NC_012578	GGT	2	6	734859	734864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080902
14124	NC_012578	CGG	2	6	734919	734924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080902
14125	NC_012578	TTGG	2	8	734932	734939	0 %	50 %	50 %	0 %	227080902
14126	NC_012578	GC	3	6	734968	734973	0 %	0 %	50 %	50 %	227080902
14127	NC_012578	AACG	2	8	735012	735019	50 %	0 %	25 %	25 %	227080902
14128	NC_012578	CTT	2	6	735030	735035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080902
14129	NC_012578	TAA	2	6	735042	735047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227080902
14130	NC_012578	TCA	2	6	735143	735148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080902
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14132	NC_012578	TCA	2	6	735216	735221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080902
14133	NC_012578	GAC	2	6	735265	735270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080902
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14135	NC_012578	GTTT	2	8	735417	735424	0 %	75 %	25 %	0 %	227080902
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14137	NC_012578	GAAA	2	8	735451	735458	75 %	0 %	25 %	0 %	227080902
14138	NC_012578	CAAG	2	8	735627	735634	50 %	0 %	25 %	25 %	227080902
14139	NC_012578	CAGA	2	8	735739	735746	50 %	0 %	25 %	25 %	227080902
14140	NC_012578	AAT	2	6	735751	735756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227080902
14141	NC_012578	AAT	2	6	735769	735774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227080902
14142	NC_012578	GCA	2	6	735804	735809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080902
14143	NC_012578	TCA	2	6	735932	735937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080902
14144	NC_012578	GCA	2	6	735939	735944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080902
14145	NC_012578	GCA	2	6	735963	735968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080902
14146	NC_012578	CTT	2	6	735969	735974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080902
14147	NC_012578	GCTTT	2	10	736109	736118	0 %	60 %	20 %	20 %	227080902
14148	NC_012578	GAG	2	6	736129	736134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227080902
14149	NC_012578	C	7	7	736154	736160	0 %	0 %	0 %	100 %	227080902
14150	NC_012578	CTT	2	6	736287	736292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080902
14151	NC_012578	TCA	2	6	736392	736397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14152	NC_012578	GTT	2	6	736462	736467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14153	NC_012578	CG	4	8	736594	736601	0 %	0 %	50 %	50 %	227080903
14154	NC_012578	GTG	2	6	736618	736623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080903
14155	NC_012578	TGG	2	6	736641	736646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080903
14156	NC_012578	GT	3	6	736652	736657	0 %	50 %	50 %	0 %	227080903
14157	NC_012578	GTG	2	6	736730	736735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080903
14158	NC_012578	CAA	2	6	736757	736762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227080903
14159	NC_012578	TGA	2	6	736775	736780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080903
14160	NC_012578	ATG	2	6	736820	736825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080903
14161	NC_012578	GGTT	2	8	736930	736937	0 %	50 %	50 %	0 %	227080903
14162	NC_012578	AGC	2	6	737069	737074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080903
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14184	NC_012578	ATG	2	6	738487	738492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080903
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14191	NC_012578	TTGG	2	8	738860	738867	0 %	50 %	50 %	0 %	227080904
14192	NC_012578	TGC	2	6	738899	738904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080904
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14195	NC_012578	CGCTT	2	10	739175	739184	0 %	40 %	20 %	40 %	227080904
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14220	NC_012578	ATC	2	6	740698	740703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080905
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14223	NC_012578	GAT	2	6	740838	740843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080905
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14227	NC_012578	GCGATT	2	12	740958	740969	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	227080905
14228	NC_012578	CTT	2	6	740985	740990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080905
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14230	NC_012578	CA	3	6	741083	741088	50 %	0 %	0 %	50 %	227080905
14231	NC_012578	GCA	2	6	741095	741100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080905
14232	NC_012578	GCG	2	6	741102	741107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080905
14233	NC_012578	CG	3	6	741106	741111	0 %	0 %	50 %	50 %	227080905
14234	NC_012578	GGC	2	6	741342	741347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080906
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14237	NC_012578	GC	3	6	741408	741413	0 %	0 %	50 %	50 %	227080906
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14483	NC_012578	ATC	2	6	753556	753561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080922
14484	NC_012578	TCG	2	6	753587	753592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080922
14485	NC_012578	TGC	2	6	753639	753644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080922
14486	NC_012578	GTG	3	9	753671	753679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080922
14487	NC_012578	CAA	2	6	753733	753738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227080922
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14489	NC_012578	CG	3	6	753784	753789	0 %	0 %	50 %	50 %	227080922
14490	NC_012578	AGC	2	6	753836	753841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080922
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14493	NC_012578	GCA	2	6	754174	754179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080922
14494	NC_012578	CTG	2	6	754190	754195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080922
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