MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae M66-2 chromosome I

Total Repeats: 55388

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_012578	TC	3	6	649647	649652	0 %	50 %	0 %	50 %	227080828
12502	NC_012578	CTGA	2	8	649691	649698	25 %	25 %	25 %	25 %	227080828
12503	NC_012578	AAG	2	6	649704	649709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080828
12504	NC_012578	AAG	2	6	649764	649769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080828
12505	NC_012578	TGC	2	6	649786	649791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080828
12506	NC_012578	AGC	2	6	649792	649797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080828
12507	NC_012578	CAC	2	6	649806	649811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080828
12508	NC_012578	AAT	2	6	649818	649823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227080828
12509	NC_012578	ACA	2	6	649844	649849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12510	NC_012578	ATA	2	6	649865	649870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12511	NC_012578	T	6	6	649905	649910	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12512	NC_012578	ATG	2	6	649931	649936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12513	NC_012578	CTG	2	6	649980	649985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080829
12514	NC_012578	GAAT	2	8	650003	650010	50 %	25 %	25 %	0 %	227080829
12515	NC_012578	CAA	2	6	650064	650069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227080829
12516	NC_012578	ATT	2	6	650096	650101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080829
12517	NC_012578	ATT	2	6	650158	650163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080829
12518	NC_012578	GGCTC	2	10	650189	650198	0 %	20 %	40 %	40 %	227080829
12519	NC_012578	CGC	2	6	650288	650293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227080829
12520	NC_012578	TTCGA	2	10	650304	650313	20 %	40 %	20 %	20 %	227080829
12521	NC_012578	CAT	2	6	650462	650467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080829
12522	NC_012578	CAG	2	6	650520	650525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080829
12523	NC_012578	ATT	2	6	650601	650606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080829
12524	NC_012578	CT	4	8	650704	650711	0 %	50 %	0 %	50 %	227080829
12525	NC_012578	CAA	2	6	650793	650798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227080829
12526	NC_012578	GC	4	8	650817	650824	0 %	0 %	50 %	50 %	227080829
12527	NC_012578	CT	4	8	650856	650863	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12528	NC_012578	A	6	6	650867	650872	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12529	NC_012578	T	7	7	650888	650894	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12530	NC_012578	A	6	6	650967	650972	100 %	0 %	0 %	0 %	227080830
12531	NC_012578	GCC	2	6	650984	650989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227080830
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12533	NC_012578	GCTCA	2	10	651026	651035	20 %	20 %	20 %	40 %	227080830
12534	NC_012578	TCT	2	6	651302	651307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080830
12535	NC_012578	GAA	2	6	651308	651313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080830
12536	NC_012578	GAT	2	6	651316	651321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080830
12537	NC_012578	TTA	2	6	651364	651369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12538	NC_012578	CTAA	3	12	651376	651387	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12539	NC_012578	ATG	2	6	651402	651407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080831
12540	NC_012578	ATCG	2	8	651409	651416	25 %	25 %	25 %	25 %	227080831
12541	NC_012578	GTG	2	6	651486	651491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080831
12542	NC_012578	TCAA	2	8	651618	651625	50 %	25 %	0 %	25 %	227080831
12543	NC_012578	TGA	2	6	651676	651681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080831
12544	NC_012578	TGC	2	6	651685	651690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080831
12545	NC_012578	CTT	2	6	651737	651742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080831
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12547	NC_012578	TTG	2	6	651805	651810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080831
12548	NC_012578	TGTT	2	8	651813	651820	0 %	75 %	25 %	0 %	227080831
12549	NC_012578	TTA	2	6	651885	651890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080831
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12552	NC_012578	TTA	2	6	652005	652010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080831
12553	NC_012578	TTTCT	2	10	652022	652031	0 %	80 %	0 %	20 %	227080831
12554	NC_012578	TCG	2	6	652055	652060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080831
12555	NC_012578	T	6	6	652119	652124	0 %	100 %	0 %	0 %	227080831
12556	NC_012578	CCA	2	6	652141	652146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080831
12557	NC_012578	TGA	2	6	652168	652173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080831
12558	NC_012578	CTA	2	6	652235	652240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080831
12559	NC_012578	TTA	2	6	652326	652331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080831
12560	NC_012578	GGGA	2	8	652358	652365	25 %	0 %	75 %	0 %	227080831
12561	NC_012578	CAGCGA	2	12	652424	652435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080831
12562	NC_012578	GTG	2	6	652503	652508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080831
12563	NC_012578	GCG	2	6	652512	652517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080831
12564	NC_012578	CCA	2	6	652528	652533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080831
12565	NC_012578	TTA	2	6	652555	652560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080831
12566	NC_012578	CTT	2	6	652589	652594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080831
12567	NC_012578	T	6	6	652611	652616	0 %	100 %	0 %	0 %	227080831
12568	NC_012578	GAAAAG	2	12	652738	652749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080831
12569	NC_012578	TGA	2	6	652768	652773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12570	NC_012578	CAC	2	6	652939	652944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080832
12571	NC_012578	CAG	2	6	653081	653086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080832
12572	NC_012578	AGC	2	6	653130	653135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080832
12573	NC_012578	GC	3	6	653134	653139	0 %	0 %	50 %	50 %	227080832
12574	NC_012578	TCA	2	6	653207	653212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080832
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12577	NC_012578	CGGC	2	8	653325	653332	0 %	0 %	50 %	50 %	227080832
12578	NC_012578	CGA	2	6	653334	653339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080832
12579	NC_012578	AAGG	2	8	653343	653350	50 %	0 %	50 %	0 %	227080832
12580	NC_012578	CAT	2	6	653382	653387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080832
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12582	NC_012578	TAG	2	6	653466	653471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080832
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12585	NC_012578	AG	3	6	653497	653502	50 %	0 %	50 %	0 %	227080832
12586	NC_012578	TTTCA	2	10	653533	653542	20 %	60 %	0 %	20 %	227080832
12587	NC_012578	GGC	3	9	653593	653601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080832
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12590	NC_012578	GCA	2	6	653903	653908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080833
12591	NC_012578	TGA	2	6	653978	653983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080833
12592	NC_012578	CGC	2	6	654024	654029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227080833
12593	NC_012578	ATCA	2	8	654036	654043	50 %	25 %	0 %	25 %	227080833
12594	NC_012578	GA	3	6	654154	654159	50 %	0 %	50 %	0 %	227080833
12595	NC_012578	ATG	2	6	654178	654183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080833
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12598	NC_012578	CG	3	6	654269	654274	0 %	0 %	50 %	50 %	227080833
12599	NC_012578	TGA	2	6	654304	654309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080833
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12601	NC_012578	GC	3	6	654381	654386	0 %	0 %	50 %	50 %	227080833
12602	NC_012578	T	7	7	654515	654521	0 %	100 %	0 %	0 %	227080833
12603	NC_012578	ATC	2	6	654603	654608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080833
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12606	NC_012578	CCGG	2	8	654673	654680	0 %	0 %	50 %	50 %	227080833
12607	NC_012578	AGGA	2	8	654736	654743	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12608	NC_012578	CCA	2	6	654777	654782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12609	NC_012578	GGC	2	6	654820	654825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080834
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12612	NC_012578	TTG	2	6	654926	654931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080834
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12615	NC_012578	ATCG	2	8	655064	655071	25 %	25 %	25 %	25 %	227080834
12616	NC_012578	CGA	2	6	655094	655099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080834
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12619	NC_012578	TGT	2	6	655219	655224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080834
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12992	NC_012578	GTC	2	6	674802	674807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080852
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