MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae M66-2 chromosome I

Total Repeats: 55388

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_012578	TTC	2	6	600210	600215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11502	NC_012578	GAT	2	6	600242	600247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11503	NC_012578	GAT	2	6	600258	600263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080792
11504	NC_012578	GAA	2	6	600292	600297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080792
11505	NC_012578	TAA	2	6	600341	600346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227080792
11506	NC_012578	T	6	6	600455	600460	0 %	100 %	0 %	0 %	227080792
11507	NC_012578	TTG	2	6	600474	600479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080792
11508	NC_012578	TCA	2	6	600486	600491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080792
11509	NC_012578	AG	3	6	600572	600577	50 %	0 %	50 %	0 %	227080792
11510	NC_012578	CCA	2	6	600604	600609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080792
11511	NC_012578	GCC	2	6	600665	600670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227080792
11512	NC_012578	AG	3	6	600690	600695	50 %	0 %	50 %	0 %	227080792
11513	NC_012578	CGG	2	6	600766	600771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080792
11514	NC_012578	TG	3	6	600789	600794	0 %	50 %	50 %	0 %	227080792
11515	NC_012578	CAC	2	6	600809	600814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080792
11516	NC_012578	CAG	2	6	600839	600844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080792
11517	NC_012578	GTA	3	9	600845	600853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080792
11518	NC_012578	TTCG	2	8	600869	600876	0 %	50 %	25 %	25 %	227080792
11519	NC_012578	GAT	2	6	600902	600907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080792
11520	NC_012578	ACC	2	6	601016	601021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080792
11521	NC_012578	CACGTC	2	12	601049	601060	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	227080792
11522	NC_012578	T	6	6	601142	601147	0 %	100 %	0 %	0 %	227080792
11523	NC_012578	TGA	2	6	601171	601176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080792
11524	NC_012578	CGA	2	6	601183	601188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080792
11525	NC_012578	TGA	2	6	601204	601209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080792
11526	NC_012578	TCGA	2	8	601245	601252	25 %	25 %	25 %	25 %	227080792
11527	NC_012578	TGC	2	6	601284	601289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080792
11528	NC_012578	TCT	2	6	601294	601299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080792
11529	NC_012578	CCA	2	6	601326	601331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080792
11530	NC_012578	ACC	2	6	601428	601433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080792
11531	NC_012578	CAC	2	6	601463	601468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080792
11532	NC_012578	CGG	2	6	601527	601532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080792
11533	NC_012578	ATG	2	6	601571	601576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080792
11534	NC_012578	GAT	2	6	601577	601582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080792
11535	NC_012578	CCA	2	6	601600	601605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080792
11536	NC_012578	TTC	2	6	601628	601633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080792
11537	NC_012578	ACGC	2	8	601642	601649	25 %	0 %	25 %	50 %	227080792
11538	NC_012578	GCC	2	6	601652	601657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227080792
11539	NC_012578	AAC	2	6	601807	601812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227080793
11540	NC_012578	CTGC	2	8	601829	601836	0 %	25 %	25 %	50 %	227080793
11541	NC_012578	GATC	2	8	601995	602002	25 %	25 %	25 %	25 %	227080793
11542	NC_012578	TGG	2	6	602043	602048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080793
11543	NC_012578	CCAG	2	8	602062	602069	25 %	0 %	25 %	50 %	227080793
11544	NC_012578	GGT	2	6	602088	602093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080793
11545	NC_012578	TGG	2	6	602111	602116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080793
11546	NC_012578	ATG	2	6	602126	602131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080793
11547	NC_012578	GAT	2	6	602170	602175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080793
11548	NC_012578	CAC	2	6	602226	602231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080793
11549	NC_012578	CCCATG	2	12	602253	602264	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	227080793
11550	NC_012578	TCA	2	6	602333	602338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080793
11551	NC_012578	ATG	2	6	602352	602357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080793
11552	NC_012578	ACA	2	6	602448	602453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227080793
11553	NC_012578	TCA	2	6	602630	602635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080793
11554	NC_012578	CAC	3	9	602706	602714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080793
11555	NC_012578	CAT	2	6	602803	602808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080793
11556	NC_012578	GCC	2	6	602830	602835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227080793
11557	NC_012578	TCG	2	6	602855	602860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080793
11558	NC_012578	ATCTT	2	10	602954	602963	20 %	60 %	0 %	20 %	227080793
11559	NC_012578	GT	3	6	603122	603127	0 %	50 %	50 %	0 %	227080793
11560	NC_012578	GCC	2	6	603178	603183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227080793
11561	NC_012578	ACCAC	2	10	603210	603219	40 %	0 %	0 %	60 %	227080793
11562	NC_012578	AC	3	6	603218	603223	50 %	0 %	0 %	50 %	227080793
11563	NC_012578	TTGG	2	8	603271	603278	0 %	50 %	50 %	0 %	227080793
11564	NC_012578	GCA	2	6	603441	603446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080793
11565	NC_012578	CAC	2	6	603465	603470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080793
11566	NC_012578	GTA	2	6	603607	603612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080793
11567	NC_012578	ATC	2	6	603625	603630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080793
11568	NC_012578	GTA	2	6	603637	603642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080793
11569	NC_012578	AACA	2	8	603832	603839	75 %	0 %	0 %	25 %	227080793
11570	NC_012578	TGG	2	6	603846	603851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080793
11571	NC_012578	CAT	2	6	603975	603980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080793
11572	NC_012578	GTGA	2	8	604056	604063	25 %	25 %	50 %	0 %	227080793
11573	NC_012578	TG	3	6	604086	604091	0 %	50 %	50 %	0 %	227080793
11574	NC_012578	TAGT	2	8	604124	604131	25 %	50 %	25 %	0 %	227080793
11575	NC_012578	TGA	2	6	604158	604163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080793
11576	NC_012578	ATTATC	2	12	604174	604185	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	227080793
11577	NC_012578	CGT	2	6	604282	604287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11578	NC_012578	GAA	2	6	604299	604304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11579	NC_012578	GC	3	6	604333	604338	0 %	0 %	50 %	50 %	227080794
11580	NC_012578	CAG	2	6	604361	604366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080794
11581	NC_012578	CAC	2	6	604503	604508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080794
11582	NC_012578	TTC	2	6	604628	604633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080794
11583	NC_012578	GGC	2	6	604718	604723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080794
11584	NC_012578	TGA	2	6	604776	604781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080794
11585	NC_012578	CTT	2	6	604783	604788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080794
11586	NC_012578	T	6	6	604823	604828	0 %	100 %	0 %	0 %	227080794
11587	NC_012578	CA	3	6	604920	604925	50 %	0 %	0 %	50 %	227080794
11588	NC_012578	CTT	2	6	604984	604989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080794
11589	NC_012578	CGTTGT	2	12	605041	605052	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	227080794
11590	NC_012578	CGCGG	2	10	605120	605129	0 %	0 %	60 %	40 %	227080794
11591	NC_012578	TGTC	2	8	605293	605300	0 %	50 %	25 %	25 %	227080794
11592	NC_012578	TCA	3	9	605337	605345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080794
11593	NC_012578	TTGA	2	8	605387	605394	25 %	50 %	25 %	0 %	227080794
11594	NC_012578	GGCG	2	8	605428	605435	0 %	0 %	75 %	25 %	227080794
11595	NC_012578	CAT	2	6	605444	605449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080794
11596	NC_012578	GCA	2	6	605530	605535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080794
11597	NC_012578	GCAT	2	8	605547	605554	25 %	25 %	25 %	25 %	227080794
11598	NC_012578	CTGC	2	8	605568	605575	0 %	25 %	25 %	50 %	227080794
11599	NC_012578	TGCA	2	8	605693	605700	25 %	25 %	25 %	25 %	227080794
11600	NC_012578	GCA	2	6	605721	605726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080794
11601	NC_012578	CG	3	6	605727	605732	0 %	0 %	50 %	50 %	227080794
11602	NC_012578	CTGG	2	8	605756	605763	0 %	25 %	50 %	25 %	227080794
11603	NC_012578	TGA	3	9	605989	605997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080794
11604	NC_012578	ATCA	2	8	606113	606120	50 %	25 %	0 %	25 %	227080794
11605	NC_012578	AATTC	2	10	606216	606225	40 %	40 %	0 %	20 %	227080794
11606	NC_012578	CTG	2	6	606322	606327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080795
11607	NC_012578	TGC	2	6	606366	606371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080795
11608	NC_012578	GCG	2	6	606434	606439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080795
11609	NC_012578	CGC	2	6	606471	606476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227080795
11610	NC_012578	CAA	2	6	606546	606551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227080795
11611	NC_012578	TCA	2	6	606579	606584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080795
11612	NC_012578	CA	3	6	606591	606596	50 %	0 %	0 %	50 %	227080795
11613	NC_012578	AGC	2	6	606629	606634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080795
11614	NC_012578	TTG	2	6	606637	606642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080795
11615	NC_012578	GC	3	6	606789	606794	0 %	0 %	50 %	50 %	227080795
11616	NC_012578	TGC	2	6	606851	606856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080795
11617	NC_012578	GTC	2	6	606925	606930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080795
11618	NC_012578	AACGC	2	10	606981	606990	40 %	0 %	20 %	40 %	227080795
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11620	NC_012578	CCG	2	6	607085	607090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227080795
11621	NC_012578	GTA	2	6	607105	607110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080795
11622	NC_012578	TCC	2	6	607123	607128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227080795
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11625	NC_012578	CTG	2	6	607241	607246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080796
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11657	NC_012578	CGT	2	6	608622	608627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080796
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11982	NC_012578	TGG	2	6	623498	623503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080808
11983	NC_012578	CGG	2	6	623532	623537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080808
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11990	NC_012578	ACT	2	6	623772	623777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080809
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