MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae M66-2 chromosome I

Total Repeats: 55388

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_012578	GCT	2	6	521964	521969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080716
10002	NC_012578	AGGA	2	8	521975	521982	50 %	0 %	50 %	0 %	227080716
10003	NC_012578	AGA	2	6	522002	522007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080716
10004	NC_012578	CCA	2	6	522011	522016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080716
10005	NC_012578	AGA	2	6	522208	522213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080717
10006	NC_012578	TGA	2	6	522271	522276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080717
10007	NC_012578	GAA	3	9	522401	522409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080717
10008	NC_012578	TCG	2	6	522421	522426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080717
10009	NC_012578	GTG	2	6	522435	522440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080717
10010	NC_012578	TGG	2	6	522483	522488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080717
10011	NC_012578	GAA	2	6	522542	522547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080717
10012	NC_012578	CTAC	2	8	522609	522616	25 %	25 %	0 %	50 %	227080717
10013	NC_012578	TGG	2	6	522623	522628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080717
10014	NC_012578	TGA	2	6	522654	522659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080717
10015	NC_012578	GTC	2	6	522692	522697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080717
10016	NC_012578	ATTT	2	8	522710	522717	25 %	75 %	0 %	0 %	227080717
10017	NC_012578	AGA	2	6	522766	522771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080717
10018	NC_012578	GACC	2	8	522788	522795	25 %	0 %	25 %	50 %	227080717
10019	NC_012578	GAT	2	6	522800	522805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080717
10020	NC_012578	TGC	2	6	522816	522821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080717
10021	NC_012578	AACG	2	8	522827	522834	50 %	0 %	25 %	25 %	227080717
10022	NC_012578	TGG	2	6	522859	522864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080717
10023	NC_012578	CTG	2	6	522881	522886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080717
10024	NC_012578	GAT	2	6	522935	522940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080717
10025	NC_012578	GCT	2	6	522955	522960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080717
10026	NC_012578	AAG	2	6	522993	522998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080717
10027	NC_012578	CTT	2	6	523019	523024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080717
10028	NC_012578	GAA	2	6	523046	523051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080717
10029	NC_012578	CGT	2	6	523112	523117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080717
10030	NC_012578	TTG	2	6	523230	523235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10031	NC_012578	AGC	2	6	523283	523288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080718
10032	NC_012578	GAG	2	6	523323	523328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227080718
10033	NC_012578	GGCTT	2	10	523416	523425	0 %	40 %	40 %	20 %	227080718
10034	NC_012578	GTT	2	6	523461	523466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080718
10035	NC_012578	GC	4	8	523475	523482	0 %	0 %	50 %	50 %	227080718
10036	NC_012578	GCCA	2	8	523507	523514	25 %	0 %	25 %	50 %	227080718
10037	NC_012578	AGCG	2	8	523723	523730	25 %	0 %	50 %	25 %	227080718
10038	NC_012578	CATC	2	8	523767	523774	25 %	25 %	0 %	50 %	227080718
10039	NC_012578	CCA	2	6	523830	523835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080718
10040	NC_012578	ATC	2	6	523861	523866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080718
10041	NC_012578	TCAT	2	8	524066	524073	25 %	50 %	0 %	25 %	227080718
10042	NC_012578	ACC	2	6	524098	524103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080718
10043	NC_012578	CTT	2	6	524121	524126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080718
10044	NC_012578	GC	3	6	524162	524167	0 %	0 %	50 %	50 %	227080718
10045	NC_012578	GCA	2	6	524181	524186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080718
10046	NC_012578	GCC	2	6	524207	524212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227080718
10047	NC_012578	GTT	2	6	524214	524219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080718
10048	NC_012578	GCT	2	6	524223	524228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080718
10049	NC_012578	AAC	2	6	524252	524257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227080718
10050	NC_012578	TTC	2	6	524332	524337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080718
10051	NC_012578	GAT	2	6	524338	524343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080718
10052	NC_012578	T	6	6	524357	524362	0 %	100 %	0 %	0 %	227080718
10053	NC_012578	CCA	2	6	524579	524584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080718
10054	NC_012578	CAC	2	6	524593	524598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080718
10055	NC_012578	GGGT	2	8	524599	524606	0 %	25 %	75 %	0 %	227080718
10056	NC_012578	GCT	2	6	524685	524690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080718
10057	NC_012578	GCTC	2	8	524694	524701	0 %	25 %	25 %	50 %	227080718
10058	NC_012578	CTG	2	6	524725	524730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080718
10059	NC_012578	CATGG	2	10	524731	524740	20 %	20 %	40 %	20 %	227080718
10060	NC_012578	CG	3	6	524757	524762	0 %	0 %	50 %	50 %	227080718
10061	NC_012578	TGG	2	6	524915	524920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080718
10062	NC_012578	TGAG	2	8	525011	525018	25 %	25 %	50 %	0 %	227080718
10063	NC_012578	TG	3	6	525090	525095	0 %	50 %	50 %	0 %	227080718
10064	NC_012578	AGC	2	6	525135	525140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080718
10065	NC_012578	CTG	2	6	525141	525146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080718
10066	NC_012578	TGCT	2	8	525163	525170	0 %	50 %	25 %	25 %	227080718
10067	NC_012578	CG	3	6	525192	525197	0 %	0 %	50 %	50 %	227080718
10068	NC_012578	GCT	2	6	525216	525221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080718
10069	NC_012578	CGG	2	6	525260	525265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080718
10070	NC_012578	GGC	2	6	525273	525278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080718
10071	NC_012578	CGG	2	6	525348	525353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080718
10072	NC_012578	TCT	2	6	525359	525364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080718
10073	NC_012578	CGC	2	6	525448	525453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227080718
10074	NC_012578	ACT	2	6	525521	525526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080718
10075	NC_012578	TGG	2	6	525549	525554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080718
10076	NC_012578	CCG	2	6	525666	525671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227080718
10077	NC_012578	CAG	2	6	525766	525771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080718
10078	NC_012578	CAT	2	6	525811	525816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080718
10079	NC_012578	GTG	2	6	525823	525828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080718
10080	NC_012578	CTCG	2	8	525838	525845	0 %	25 %	25 %	50 %	227080718
10081	NC_012578	TCA	2	6	525861	525866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080718
10082	NC_012578	GCT	2	6	525879	525884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080719
10083	NC_012578	ATC	3	9	525886	525894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080719
10084	NC_012578	TCA	2	6	525915	525920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080719
10085	NC_012578	TGA	2	6	526007	526012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10086	NC_012578	TCA	2	6	526022	526027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10087	NC_012578	CGC	2	6	526034	526039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10088	NC_012578	AAT	2	6	526142	526147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227080720
10089	NC_012578	ATAA	2	8	526155	526162	75 %	25 %	0 %	0 %	227080720
10090	NC_012578	CA	3	6	526178	526183	50 %	0 %	0 %	50 %	227080720
10091	NC_012578	TTG	2	6	526210	526215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080720
10092	NC_012578	CTT	2	6	526272	526277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080720
10093	NC_012578	GCA	2	6	526346	526351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080720
10094	NC_012578	GAT	2	6	526429	526434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080720
10095	NC_012578	TTG	2	6	526450	526455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080720
10096	NC_012578	GA	3	6	526467	526472	50 %	0 %	50 %	0 %	227080720
10097	NC_012578	TGC	2	6	526535	526540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080720
10098	NC_012578	ATTGA	2	10	526591	526600	40 %	40 %	20 %	0 %	227080720
10099	NC_012578	TACCT	2	10	526606	526615	20 %	40 %	0 %	40 %	227080720
10100	NC_012578	CTT	2	6	526620	526625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080720
10101	NC_012578	TCAGC	2	10	526686	526695	20 %	20 %	20 %	40 %	227080720
10102	NC_012578	GC	3	6	526703	526708	0 %	0 %	50 %	50 %	227080720
10103	NC_012578	ATC	2	6	526754	526759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080720
10104	NC_012578	GGC	2	6	526774	526779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080720
10105	NC_012578	TGG	2	6	526812	526817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080720
10106	NC_012578	AAT	2	6	526822	526827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227080720
10107	NC_012578	CG	3	6	526851	526856	0 %	0 %	50 %	50 %	227080720
10108	NC_012578	ATT	2	6	526912	526917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080720
10109	NC_012578	TTCTA	2	10	527033	527042	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
10110	NC_012578	TCTA	2	8	527119	527126	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10111	NC_012578	ACTC	2	8	527138	527145	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10112	NC_012578	GCC	2	6	527150	527155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10113	NC_012578	GTT	2	6	527171	527176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10114	NC_012578	TTGA	2	8	527194	527201	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10115	NC_012578	GAC	2	6	527216	527221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10116	NC_012578	GCG	2	6	527231	527236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10117	NC_012578	CAG	2	6	527249	527254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10118	NC_012578	ATT	2	6	527298	527303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10119	NC_012578	T	6	6	527326	527331	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10120	NC_012578	AGC	2	6	527355	527360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10121	NC_012578	AAC	2	6	527400	527405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10122	NC_012578	CAA	2	6	527553	527558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227080721
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10229	NC_012578	CA	3	6	533873	533878	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10230	NC_012578	GAAGA	2	10	533890	533899	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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10364	NC_012578	GTC	2	6	541291	541296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080733
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10484	NC_012578	ATT	2	6	547333	547338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080737
10485	NC_012578	GTG	2	6	547339	547344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080737
10486	NC_012578	AGA	2	6	547395	547400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080737
10487	NC_012578	ATC	2	6	547408	547413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080737
10488	NC_012578	TGC	2	6	547464	547469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080738
10489	NC_012578	GGC	2	6	547489	547494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080738
10490	NC_012578	ACC	2	6	547506	547511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080738
10491	NC_012578	AAGCG	2	10	547517	547526	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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10497	NC_012578	TCG	2	6	547888	547893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080739
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10499	NC_012578	ATT	2	6	547960	547965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080739
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