MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae M66-2 chromosome I

Total Repeats: 55388

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012578	GCC	2	6	23640	23645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227080264
502	NC_012578	ATC	2	6	23682	23687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080264
503	NC_012578	AAT	2	6	23727	23732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227080264
504	NC_012578	GTACC	2	10	23864	23873	20 %	20 %	20 %	40 %	227080264
505	NC_012578	GCT	3	9	23891	23899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080264
506	NC_012578	GC	3	6	23956	23961	0 %	0 %	50 %	50 %	227080264
507	NC_012578	CCG	2	6	23984	23989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227080264
508	NC_012578	TCA	2	6	23998	24003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080264
509	NC_012578	CAC	2	6	24111	24116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080264
510	NC_012578	GCT	2	6	24136	24141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080264
511	NC_012578	AGGC	2	8	24145	24152	25 %	0 %	50 %	25 %	227080264
512	NC_012578	CGC	2	6	24222	24227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227080264
513	NC_012578	CCG	2	6	24232	24237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227080264
514	NC_012578	ACCG	2	8	24240	24247	25 %	0 %	25 %	50 %	227080264
515	NC_012578	TGC	2	6	24277	24282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080264
516	NC_012578	TTCGGC	2	12	24375	24386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080264
517	NC_012578	TGC	2	6	24404	24409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080264
518	NC_012578	GCA	2	6	24413	24418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080264
519	NC_012578	CGC	2	6	24425	24430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227080264
520	NC_012578	GTG	2	6	24466	24471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080264
521	NC_012578	TGG	2	6	24485	24490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080264
522	NC_012578	TGT	2	6	24599	24604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080264
523	NC_012578	CTGG	2	8	24632	24639	0 %	25 %	50 %	25 %	227080264
524	NC_012578	GCG	2	6	24927	24932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080265
525	NC_012578	GCT	2	6	24934	24939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080265
526	NC_012578	CGC	2	6	25035	25040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227080265
527	NC_012578	ACC	2	6	25077	25082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080265
528	NC_012578	GC	3	6	25106	25111	0 %	0 %	50 %	50 %	227080265
529	NC_012578	AGGT	2	8	25138	25145	25 %	25 %	50 %	0 %	227080265
530	NC_012578	ACG	2	6	25207	25212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080265
531	NC_012578	GCC	2	6	25230	25235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227080265
532	NC_012578	CAG	2	6	25277	25282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080265
533	NC_012578	CAG	2	6	25316	25321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080265
534	NC_012578	CCA	2	6	25372	25377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080265
535	NC_012578	TGCG	2	8	25389	25396	0 %	25 %	50 %	25 %	227080265
536	NC_012578	GTG	2	6	25471	25476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080265
537	NC_012578	CAG	2	6	25484	25489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080265
538	NC_012578	GTTT	2	8	25528	25535	0 %	75 %	25 %	0 %	227080265
539	NC_012578	CGT	2	6	25538	25543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080265
540	NC_012578	GCT	2	6	25553	25558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080265
541	NC_012578	CCGC	2	8	25642	25649	0 %	0 %	25 %	75 %	227080265
542	NC_012578	CGAT	2	8	25726	25733	25 %	25 %	25 %	25 %	227080265
543	NC_012578	TGG	2	6	25796	25801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080265
544	NC_012578	GCC	2	6	25803	25808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227080265
545	NC_012578	GCT	2	6	25843	25848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080265
546	NC_012578	TTG	2	6	25849	25854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080265
547	NC_012578	CAT	2	6	25880	25885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080265
548	NC_012578	GTA	2	6	25893	25898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080265
549	NC_012578	CAA	2	6	25913	25918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227080265
550	NC_012578	CAG	2	6	25928	25933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080265
551	NC_012578	GA	4	8	25991	25998	50 %	0 %	50 %	0 %	227080265
552	NC_012578	CAT	2	6	26127	26132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080265
553	NC_012578	TGA	2	6	26153	26158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080265
554	NC_012578	GCC	2	6	26196	26201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227080265
555	NC_012578	CGC	2	6	26235	26240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227080265
556	NC_012578	AC	3	6	26280	26285	50 %	0 %	0 %	50 %	227080265
557	NC_012578	GCC	2	6	26367	26372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227080265
558	NC_012578	GCC	2	6	26427	26432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227080265
559	NC_012578	ACC	2	6	26515	26520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080265
560	NC_012578	GC	3	6	26563	26568	0 %	0 %	50 %	50 %	227080265
561	NC_012578	GC	4	8	26575	26582	0 %	0 %	50 %	50 %	227080265
562	NC_012578	GT	3	6	26601	26606	0 %	50 %	50 %	0 %	227080265
563	NC_012578	GGT	2	6	26607	26612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080265
564	NC_012578	GCT	2	6	26650	26655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080266
565	NC_012578	TCT	2	6	26686	26691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080266
566	NC_012578	GTG	2	6	26692	26697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080266
567	NC_012578	TAC	2	6	26727	26732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080266
568	NC_012578	CGG	3	9	26801	26809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080266
569	NC_012578	TGG	2	6	26939	26944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080266
570	NC_012578	CAC	2	6	26973	26978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080266
571	NC_012578	AG	3	6	27003	27008	50 %	0 %	50 %	0 %	227080266
572	NC_012578	CCA	2	6	27064	27069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080266
573	NC_012578	AGA	2	6	27078	27083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080266
574	NC_012578	CTT	2	6	27179	27184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080266
575	NC_012578	C	6	6	27197	27202	0 %	0 %	0 %	100 %	227080266
576	NC_012578	ATC	2	6	27217	27222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080266
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578	NC_012578	CG	3	6	27329	27334	0 %	0 %	50 %	50 %	227080266
579	NC_012578	ATG	2	6	27343	27348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080266
580	NC_012578	TCGA	2	8	27352	27359	25 %	25 %	25 %	25 %	227080266
581	NC_012578	GAT	2	6	27429	27434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080266
582	NC_012578	AGC	2	6	27455	27460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080266
583	NC_012578	TGCAT	2	10	27490	27499	20 %	40 %	20 %	20 %	227080266
584	NC_012578	ATC	2	6	27535	27540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080266
585	NC_012578	CAG	2	6	27563	27568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080266
586	NC_012578	TTG	2	6	27572	27577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080266
587	NC_012578	CCTT	2	8	27587	27594	0 %	50 %	0 %	50 %	227080266
588	NC_012578	TGT	2	6	27609	27614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080267
589	NC_012578	GTT	2	6	27617	27622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080267
590	NC_012578	CTTG	2	8	27778	27785	0 %	50 %	25 %	25 %	227080267
591	NC_012578	TAA	2	6	27827	27832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227080267
592	NC_012578	TCT	2	6	27950	27955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080268
593	NC_012578	TCA	2	6	27956	27961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080268
594	NC_012578	GCA	2	6	27972	27977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080268
595	NC_012578	CGCAG	2	10	28007	28016	20 %	0 %	40 %	40 %	227080268
596	NC_012578	CTT	3	9	28023	28031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080268
597	NC_012578	TCA	2	6	28233	28238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080268
598	NC_012578	CAC	2	6	28251	28256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080268
599	NC_012578	GCA	2	6	28292	28297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080268
600	NC_012578	GCC	2	6	28304	28309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227080268
601	NC_012578	GC	3	6	28364	28369	0 %	0 %	50 %	50 %	227080268
602	NC_012578	TGC	2	6	28379	28384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080268
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604	NC_012578	AGC	2	6	28460	28465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080268
605	NC_012578	GTG	2	6	28467	28472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080268
606	NC_012578	TGT	2	6	28479	28484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080268
607	NC_012578	GAT	2	6	28491	28496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080268
608	NC_012578	ATG	2	6	28534	28539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080268
609	NC_012578	GCA	2	6	28607	28612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080268
610	NC_012578	TTG	2	6	28628	28633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080268
611	NC_012578	CGG	2	6	28638	28643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080268
612	NC_012578	TCA	2	6	28709	28714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080268
613	NC_012578	CCAC	2	8	28919	28926	25 %	0 %	0 %	75 %	227080268
614	NC_012578	ATACA	2	10	28927	28936	60 %	20 %	0 %	20 %	227080268
615	NC_012578	CCA	2	6	29070	29075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080268
616	NC_012578	GAC	2	6	29088	29093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080268
617	NC_012578	AG	3	6	29176	29181	50 %	0 %	50 %	0 %	227080268
618	NC_012578	CATC	2	8	29196	29203	25 %	25 %	0 %	50 %	227080268
619	NC_012578	TG	3	6	29226	29231	0 %	50 %	50 %	0 %	227080268
620	NC_012578	TGG	2	6	29307	29312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080268
621	NC_012578	GC	3	6	29359	29364	0 %	0 %	50 %	50 %	227080268
622	NC_012578	CGC	2	6	29383	29388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227080268
623	NC_012578	GGC	2	6	29400	29405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080268
624	NC_012578	CAT	2	6	29439	29444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080268
625	NC_012578	GCC	2	6	29461	29466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227080268
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627	NC_012578	CCT	2	6	29540	29545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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