MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae M66-2 chromosome I

Total Repeats: 55388

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_012578	CAAGAG	2	12	364430	364441	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	227080573
7002	NC_012578	ATTACC	2	12	364448	364459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080573
7003	NC_012578	CCA	3	9	364467	364475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080573
7004	NC_012578	CAT	2	6	364522	364527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080573
7005	NC_012578	CAA	2	6	364690	364695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227080573
7006	NC_012578	GTA	2	6	364727	364732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080573
7007	NC_012578	AGA	3	9	364792	364800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080573
7008	NC_012578	GAA	2	6	364880	364885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080573
7009	NC_012578	ACC	2	6	364926	364931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080573
7010	NC_012578	TGA	2	6	365161	365166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080573
7011	NC_012578	TTC	2	6	365212	365217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080573
7012	NC_012578	TTG	2	6	365247	365252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080573
7013	NC_012578	AAAG	2	8	365326	365333	75 %	0 %	25 %	0 %	227080573
7014	NC_012578	ATGC	2	8	365357	365364	25 %	25 %	25 %	25 %	227080573
7015	NC_012578	TGA	2	6	365374	365379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080573
7016	NC_012578	TG	3	6	365451	365456	0 %	50 %	50 %	0 %	227080573
7017	NC_012578	TGT	2	6	365467	365472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080573
7018	NC_012578	A	6	6	365547	365552	100 %	0 %	0 %	0 %	227080573
7019	NC_012578	GCA	2	6	365576	365581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080573
7020	NC_012578	CAT	2	6	365589	365594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080573
7021	NC_012578	TCG	2	6	365667	365672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080573
7022	NC_012578	GTTC	2	8	365770	365777	0 %	50 %	25 %	25 %	227080573
7023	NC_012578	GTCA	2	8	365778	365785	25 %	25 %	25 %	25 %	227080573
7024	NC_012578	GGT	2	6	365786	365791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080573
7025	NC_012578	CTG	2	6	365829	365834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080573
7026	NC_012578	GTG	2	6	365874	365879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080573
7027	NC_012578	GAG	2	6	365921	365926	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227080573
7028	NC_012578	AAC	2	6	365933	365938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227080573
7029	NC_012578	GT	3	6	365940	365945	0 %	50 %	50 %	0 %	227080573
7030	NC_012578	TTC	2	6	366081	366086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080573
7031	NC_012578	AGA	2	6	366121	366126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080573
7032	NC_012578	TGT	2	6	366139	366144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080573
7033	NC_012578	CGT	3	9	366158	366166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080573
7034	NC_012578	CAT	2	6	366169	366174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080573
7035	NC_012578	ATC	2	6	366209	366214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080573
7036	NC_012578	CA	3	6	366271	366276	50 %	0 %	0 %	50 %	227080573
7037	NC_012578	CTT	2	6	366285	366290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080573
7038	NC_012578	GTT	2	6	366367	366372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7039	NC_012578	TAA	2	6	366377	366382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7040	NC_012578	GC	3	6	366431	366436	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7041	NC_012578	AGGA	2	8	366471	366478	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7042	NC_012578	AAC	2	6	366561	366566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227080574
7043	NC_012578	CTGTA	2	10	366582	366591	20 %	40 %	20 %	20 %	227080574
7044	NC_012578	CGG	2	6	366606	366611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080574
7045	NC_012578	AGA	2	6	366648	366653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080574
7046	NC_012578	CAAT	2	8	366671	366678	50 %	25 %	0 %	25 %	227080574
7047	NC_012578	GCA	2	6	366772	366777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080574
7048	NC_012578	CGG	2	6	366786	366791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080574
7049	NC_012578	CTG	2	6	366847	366852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080574
7050	NC_012578	CAT	2	6	366876	366881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080574
7051	NC_012578	GCT	2	6	366954	366959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080574
7052	NC_012578	TGA	2	6	366981	366986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080574
7053	NC_012578	GC	3	6	367016	367021	0 %	0 %	50 %	50 %	227080574
7054	NC_012578	TTG	2	6	367052	367057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080574
7055	NC_012578	ATAC	2	8	367076	367083	50 %	25 %	0 %	25 %	227080574
7056	NC_012578	CCAGAG	2	12	367087	367098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080574
7057	NC_012578	AGT	2	6	367164	367169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080574
7058	NC_012578	GCT	2	6	367278	367283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080574
7059	NC_012578	GAA	2	6	367339	367344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080574
7060	NC_012578	CACAC	2	10	367383	367392	40 %	0 %	0 %	60 %	227080574
7061	NC_012578	TTC	2	6	367453	367458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080574
7062	NC_012578	GCA	2	6	367505	367510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080574
7063	NC_012578	ATC	2	6	367660	367665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080574
7064	NC_012578	TGC	2	6	367694	367699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7065	NC_012578	TCT	2	6	367764	367769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7066	NC_012578	ACA	2	6	367797	367802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227080575
7067	NC_012578	ATGA	2	8	367952	367959	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7068	NC_012578	GTTT	2	8	367980	367987	0 %	75 %	25 %	0 %	227080576
7069	NC_012578	GT	3	6	368096	368101	0 %	50 %	50 %	0 %	227080576
7070	NC_012578	ATC	2	6	368118	368123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080576
7071	NC_012578	GAA	2	6	368124	368129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080576
7072	NC_012578	CTT	2	6	368169	368174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7073	NC_012578	CTC	2	6	368182	368187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7074	NC_012578	AGG	2	6	368218	368223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7075	NC_012578	GCTAT	2	10	368224	368233	20 %	40 %	20 %	20 %	227080577
7076	NC_012578	ATCA	2	8	368295	368302	50 %	25 %	0 %	25 %	227080577
7077	NC_012578	CTT	2	6	368306	368311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080577
7078	NC_012578	TGA	2	6	368378	368383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080577
7079	NC_012578	TGA	2	6	368461	368466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080577
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7081	NC_012578	GAA	2	6	368610	368615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080577
7082	NC_012578	TGA	2	6	368696	368701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080577
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7085	NC_012578	AAT	2	6	368898	368903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7086	NC_012578	AAT	2	6	368916	368921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227080578
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7089	NC_012578	TGA	2	6	369101	369106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080578
7090	NC_012578	TGA	2	6	369132	369137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080578
7091	NC_012578	GCT	2	6	369199	369204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080578
7092	NC_012578	TGA	2	6	369294	369299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080579
7093	NC_012578	AATCG	2	10	369302	369311	40 %	20 %	20 %	20 %	227080579
7094	NC_012578	GCG	2	6	369318	369323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080579
7095	NC_012578	T	6	6	369432	369437	0 %	100 %	0 %	0 %	227080579
7096	NC_012578	TGG	2	6	369450	369455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080579
7097	NC_012578	T	6	6	369523	369528	0 %	100 %	0 %	0 %	227080579
7098	NC_012578	TGC	2	6	369567	369572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080579
7099	NC_012578	CGT	3	9	369629	369637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080580
7100	NC_012578	GATT	2	8	369673	369680	25 %	50 %	25 %	0 %	227080580
7101	NC_012578	AGCT	2	8	369774	369781	25 %	25 %	25 %	25 %	227080580
7102	NC_012578	CGCT	2	8	369796	369803	0 %	25 %	25 %	50 %	227080580
7103	NC_012578	AAGA	2	8	369857	369864	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7104	NC_012578	CGT	2	6	370022	370027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080581
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7106	NC_012578	GTT	2	6	370310	370315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080581
7107	NC_012578	T	7	7	370368	370374	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7108	NC_012578	TGCTT	2	10	370425	370434	0 %	60 %	20 %	20 %	227080582
7109	NC_012578	GTT	2	6	370584	370589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080582
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7112	NC_012578	TCT	2	6	370894	370899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080582
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7114	NC_012578	TGACTC	2	12	370989	371000	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	227080582
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7117	NC_012578	GGC	2	6	371233	371238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7118	NC_012578	CATT	2	8	371396	371403	25 %	50 %	0 %	25 %	227080583
7119	NC_012578	TGG	2	6	371425	371430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080583
7120	NC_012578	TGC	2	6	371433	371438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080583
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7122	NC_012578	GCC	2	6	371496	371501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227080583
7123	NC_012578	AGC	2	6	371586	371591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080583
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7142	NC_012578	AGC	2	6	372480	372485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080583
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7153	NC_012578	TTG	2	6	372966	372971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080584
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7162	NC_012578	TGA	2	6	373694	373699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080584
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7167	NC_012578	CATG	2	8	373872	373879	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7168	NC_012578	CT	3	6	373883	373888	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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7183	NC_012578	AGCG	2	8	374718	374725	25 %	0 %	50 %	25 %	227080586
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7203	NC_012578	CCTG	2	8	376175	376182	0 %	25 %	25 %	50 %	227080586
7204	NC_012578	CTT	2	6	376357	376362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080587
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7231	NC_012578	TAT	2	6	377621	377626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080588
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7234	NC_012578	AAAAC	2	10	377678	377687	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
7235	NC_012578	GAA	2	6	377803	377808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080589
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7239	NC_012578	TTCGC	2	10	377918	377927	0 %	40 %	20 %	40 %	227080589
7240	NC_012578	CTT	2	6	377972	377977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080589
7241	NC_012578	CG	3	6	378062	378067	0 %	0 %	50 %	50 %	227080589
7242	NC_012578	CGC	2	6	378104	378109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227080589
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