MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae M66-2 chromosome I

Total Repeats: 55388

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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54002	NC_012578	CCG	2	6	2821918	2821923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227082825
54003	NC_012578	TCG	2	6	2821972	2821977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082825
54004	NC_012578	CCA	2	6	2821978	2821983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227082825
54005	NC_012578	TGA	2	6	2822023	2822028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082825
54006	NC_012578	AGCC	2	8	2822102	2822109	25 %	0 %	25 %	50 %	227082825
54007	NC_012578	TG	3	6	2822112	2822117	0 %	50 %	50 %	0 %	227082825
54008	NC_012578	CTG	2	6	2822118	2822123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082825
54009	NC_012578	CAC	2	6	2822131	2822136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227082825
54010	NC_012578	CAAA	2	8	2822246	2822253	75 %	0 %	0 %	25 %	227082825
54011	NC_012578	CG	3	6	2822324	2822329	0 %	0 %	50 %	50 %	227082825
54012	NC_012578	CAT	2	6	2822366	2822371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082825
54013	NC_012578	TCA	2	6	2822425	2822430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54014	NC_012578	CGC	2	6	2822488	2822493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54015	NC_012578	CT	3	6	2822521	2822526	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54016	NC_012578	CAGAG	2	10	2822530	2822539	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
54017	NC_012578	ACT	2	6	2822555	2822560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54018	NC_012578	GGC	2	6	2822575	2822580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54019	NC_012578	GAAC	2	8	2822627	2822634	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
54020	NC_012578	ACC	2	6	2822709	2822714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54021	NC_012578	CT	3	6	2822829	2822834	0 %	50 %	0 %	50 %	227082826
54022	NC_012578	CTG	2	6	2822852	2822857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082826
54023	NC_012578	CAT	2	6	2822935	2822940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082826
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54025	NC_012578	ATT	2	6	2823056	2823061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227082826
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54033	NC_012578	CTG	2	6	2823746	2823751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082826
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54044	NC_012578	TTCA	2	8	2824169	2824176	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54045	NC_012578	TGC	2	6	2824200	2824205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082827
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54052	NC_012578	GGGC	2	8	2824537	2824544	0 %	0 %	75 %	25 %	227082827
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54118	NC_012578	GATG	2	8	2827356	2827363	25 %	25 %	50 %	0 %	227082830
54119	NC_012578	CGC	2	6	2827492	2827497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227082830
54120	NC_012578	AAGCG	2	10	2827578	2827587	40 %	0 %	40 %	20 %	227082830
54121	NC_012578	A	6	6	2827694	2827699	100 %	0 %	0 %	0 %	227082830
54122	NC_012578	CG	3	6	2827736	2827741	0 %	0 %	50 %	50 %	227082830
54123	NC_012578	CG	3	6	2827825	2827830	0 %	0 %	50 %	50 %	227082830
54124	NC_012578	TGC	2	6	2827838	2827843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082830
54125	NC_012578	CTT	2	6	2827860	2827865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227082830
54126	NC_012578	AG	3	6	2827899	2827904	50 %	0 %	50 %	0 %	227082830
54127	NC_012578	GC	3	6	2827906	2827911	0 %	0 %	50 %	50 %	227082830
54128	NC_012578	CATT	2	8	2827950	2827957	25 %	50 %	0 %	25 %	227082830
54129	NC_012578	AAAATC	2	12	2828011	2828022	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	227082830
54130	NC_012578	TGA	2	6	2828045	2828050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082830
54131	NC_012578	GC	3	6	2828064	2828069	0 %	0 %	50 %	50 %	227082830
54132	NC_012578	CCA	2	6	2828096	2828101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227082830
54133	NC_012578	CTG	2	6	2828113	2828118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082830
54134	NC_012578	GGC	2	6	2828121	2828126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227082830
54135	NC_012578	CGG	2	6	2828129	2828134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227082830
54136	NC_012578	CG	3	6	2828140	2828145	0 %	0 %	50 %	50 %	227082830
54137	NC_012578	CGCA	2	8	2828237	2828244	25 %	0 %	25 %	50 %	227082830
54138	NC_012578	CTG	2	6	2828284	2828289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082830
54139	NC_012578	A	6	6	2828396	2828401	100 %	0 %	0 %	0 %	227082830
54140	NC_012578	GCG	2	6	2828449	2828454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227082830
54141	NC_012578	CG	3	6	2828502	2828507	0 %	0 %	50 %	50 %	227082830
54142	NC_012578	TTG	2	6	2828621	2828626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227082830
54143	NC_012578	GCA	2	6	2828704	2828709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082830
54144	NC_012578	TGA	2	6	2828736	2828741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082830
54145	NC_012578	A	6	6	2828773	2828778	100 %	0 %	0 %	0 %	227082830
54146	NC_012578	ATGG	2	8	2828833	2828840	25 %	25 %	50 %	0 %	227082830
54147	NC_012578	GGT	2	6	2828886	2828891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227082830
54148	NC_012578	GAA	2	6	2828907	2828912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227082830
54149	NC_012578	CG	3	6	2828965	2828970	0 %	0 %	50 %	50 %	227082830
54150	NC_012578	CAT	2	6	2829015	2829020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082830
54151	NC_012578	GTCAAA	2	12	2829265	2829276	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	227082830
54152	NC_012578	AGCGTA	2	12	2829296	2829307	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	227082830
54153	NC_012578	TGA	2	6	2829408	2829413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082830
54154	NC_012578	GTG	2	6	2829434	2829439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227082830
54155	NC_012578	GCT	2	6	2829460	2829465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082830
54156	NC_012578	GAA	2	6	2829477	2829482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227082830
54157	NC_012578	TCA	2	6	2829501	2829506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54158	NC_012578	TGC	2	6	2829521	2829526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54159	NC_012578	A	7	7	2829529	2829535	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54160	NC_012578	GT	3	6	2829604	2829609	0 %	50 %	50 %	0 %	227082831
54161	NC_012578	ATA	2	6	2829629	2829634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227082831
54162	NC_012578	GC	3	6	2829656	2829661	0 %	0 %	50 %	50 %	227082831
54163	NC_012578	CGC	2	6	2829680	2829685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227082831
54164	NC_012578	ATG	2	6	2829690	2829695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082831
54165	NC_012578	CGCAT	2	10	2829714	2829723	20 %	20 %	20 %	40 %	227082831
54166	NC_012578	CGC	2	6	2829829	2829834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227082831
54167	NC_012578	CTG	2	6	2829856	2829861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082831
54168	NC_012578	TTGC	2	8	2829875	2829882	0 %	50 %	25 %	25 %	227082831
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54172	NC_012578	GCT	2	6	2830233	2830238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082832
54173	NC_012578	CGCCTC	2	12	2830246	2830257	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	227082832
54174	NC_012578	GCA	2	6	2830377	2830382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082832
54175	NC_012578	TCA	2	6	2830406	2830411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082832
54176	NC_012578	ACAGC	2	10	2830479	2830488	40 %	0 %	20 %	40 %	227082832
54177	NC_012578	GC	3	6	2830513	2830518	0 %	0 %	50 %	50 %	227082832
54178	NC_012578	CCA	2	6	2830578	2830583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227082832
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54180	NC_012578	TCT	2	6	2830790	2830795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227082832
54181	NC_012578	CCA	2	6	2830842	2830847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227082832
54182	NC_012578	TGC	2	6	2830886	2830891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082832
54183	NC_012578	CAC	2	6	2831088	2831093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227082833
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54185	NC_012578	GCTTG	2	10	2831171	2831180	0 %	40 %	40 %	20 %	227082833
54186	NC_012578	CCG	2	6	2831261	2831266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227082833
54187	NC_012578	TG	3	6	2831280	2831285	0 %	50 %	50 %	0 %	227082833
54188	NC_012578	AGCC	2	8	2831394	2831401	25 %	0 %	25 %	50 %	227082833
54189	NC_012578	GGC	2	6	2831430	2831435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227082833
54190	NC_012578	CTG	2	6	2831468	2831473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082833
54191	NC_012578	GC	3	6	2831474	2831479	0 %	0 %	50 %	50 %	227082833
54192	NC_012578	ACC	2	6	2831511	2831516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227082833
54193	NC_012578	CGC	2	6	2831528	2831533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227082833
54194	NC_012578	CAA	2	6	2831549	2831554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227082833
54195	NC_012578	ATC	2	6	2831607	2831612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082833
54196	NC_012578	ACCA	2	8	2831619	2831626	50 %	0 %	0 %	50 %	227082833
54197	NC_012578	T	6	6	2831770	2831775	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54198	NC_012578	ATC	2	6	2831792	2831797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54199	NC_012578	TCG	2	6	2831850	2831855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082834
54200	NC_012578	ATTACT	2	12	2831867	2831878	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	227082834
54201	NC_012578	GCT	2	6	2831905	2831910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082834
54202	NC_012578	CAG	2	6	2831915	2831920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082834
54203	NC_012578	GT	3	6	2831940	2831945	0 %	50 %	50 %	0 %	227082834
54204	NC_012578	TGA	2	6	2832058	2832063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082834
54205	NC_012578	GAA	2	6	2832083	2832088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227082834
54206	NC_012578	GGCC	2	8	2832232	2832239	0 %	0 %	50 %	50 %	227082834
54207	NC_012578	TGG	2	6	2832241	2832246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227082834
54208	NC_012578	GAT	2	6	2832272	2832277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082834
54209	NC_012578	GCT	2	6	2832315	2832320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082834
54210	NC_012578	AAG	2	6	2832342	2832347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227082834
54211	NC_012578	GCT	2	6	2832361	2832366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082834
54212	NC_012578	ACTG	2	8	2832385	2832392	25 %	25 %	25 %	25 %	227082834
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54214	NC_012578	GCCT	2	8	2832450	2832457	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
54215	NC_012578	T	6	6	2832494	2832499	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54216	NC_012578	ATT	2	6	2832534	2832539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227082835
54217	NC_012578	AT	3	6	2832544	2832549	50 %	50 %	0 %	0 %	227082835
54218	NC_012578	T	6	6	2832559	2832564	0 %	100 %	0 %	0 %	227082835
54219	NC_012578	GTC	2	6	2832714	2832719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082835
54220	NC_012578	TGA	2	6	2832726	2832731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082835
54221	NC_012578	CTC	2	6	2832761	2832766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227082835
54222	NC_012578	CCG	2	6	2832840	2832845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227082835
54223	NC_012578	AGA	2	6	2832871	2832876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227082835
54224	NC_012578	GC	4	8	2832888	2832895	0 %	0 %	50 %	50 %	227082835
54225	NC_012578	CGC	2	6	2832903	2832908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227082835
54226	NC_012578	GGT	2	6	2832916	2832921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227082835
54227	NC_012578	CTT	2	6	2832930	2832935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227082835
54228	NC_012578	TTG	2	6	2832960	2832965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227082835
54229	NC_012578	AGA	2	6	2833045	2833050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227082835
54230	NC_012578	CTG	2	6	2833052	2833057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082835
54231	NC_012578	GC	3	6	2833079	2833084	0 %	0 %	50 %	50 %	227082835
54232	NC_012578	TTC	2	6	2833116	2833121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227082835
54233	NC_012578	TC	3	6	2833169	2833174	0 %	50 %	0 %	50 %	227082836
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54450	NC_012578	T	7	7	2844303	2844309	0 %	100 %	0 %	0 %	227082847
54451	NC_012578	CGT	2	6	2844350	2844355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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54469	NC_012578	GTT	2	6	2845272	2845277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227082848
54470	NC_012578	CTTG	2	8	2845433	2845440	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
54471	NC_012578	AAT	2	6	2845475	2845480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54472	NC_012578	TAA	2	6	2845490	2845495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54473	NC_012578	AG	3	6	2845500	2845505	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54474	NC_012578	AGA	2	6	2845531	2845536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227082849
54475	NC_012578	GCA	2	6	2845562	2845567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082849
54476	NC_012578	CGCT	2	8	2845583	2845590	0 %	25 %	25 %	50 %	227082849
54477	NC_012578	CG	3	6	2845591	2845596	0 %	0 %	50 %	50 %	227082849
54478	NC_012578	GC	3	6	2845636	2845641	0 %	0 %	50 %	50 %	227082849
54479	NC_012578	ATG	2	6	2845695	2845700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082849
54480	NC_012578	ATT	2	6	2845712	2845717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227082849
54481	NC_012578	ATG	2	6	2845811	2845816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082849
54482	NC_012578	CATC	2	8	2845882	2845889	25 %	25 %	0 %	50 %	227082849
54483	NC_012578	ATT	2	6	2845903	2845908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54484	NC_012578	GAC	2	6	2845915	2845920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082850
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54487	NC_012578	CTAT	2	8	2845951	2845958	25 %	50 %	0 %	25 %	227082850
54488	NC_012578	GTG	2	6	2845977	2845982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227082850
54489	NC_012578	GAC	2	6	2845997	2846002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082850
54490	NC_012578	GAT	2	6	2846014	2846019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082850
54491	NC_012578	GCC	2	6	2846039	2846044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227082850
54492	NC_012578	ACA	2	6	2846047	2846052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227082850
54493	NC_012578	ACT	2	6	2846065	2846070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082850
54494	NC_012578	CTG	2	6	2846084	2846089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082850
54495	NC_012578	CTGCAA	2	12	2846123	2846134	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	227082850
54496	NC_012578	TC	4	8	2846148	2846155	0 %	50 %	0 %	50 %	227082850
54497	NC_012578	TCA	2	6	2846160	2846165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082850
54498	NC_012578	AAC	2	6	2846174	2846179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227082850
54499	NC_012578	CAA	2	6	2846180	2846185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227082850
54500	NC_012578	GCGTG	2	10	2846188	2846197	0 %	20 %	60 %	20 %	227082850

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