MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae M66-2 chromosome I

Total Repeats: 55388

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
51001	NC_012578	CAA	2	6	2661894	2661899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51002	NC_012578	TTG	2	6	2661970	2661975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227082662
51003	NC_012578	ACA	2	6	2661980	2661985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227082662
51004	NC_012578	CT	3	6	2662016	2662021	0 %	50 %	0 %	50 %	227082662
51005	NC_012578	GCC	2	6	2662041	2662046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227082662
51006	NC_012578	ACA	2	6	2662111	2662116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227082662
51007	NC_012578	CAA	2	6	2662131	2662136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227082662
51008	NC_012578	GT	3	6	2662194	2662199	0 %	50 %	50 %	0 %	227082662
51009	NC_012578	GAA	3	9	2662212	2662220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227082662
51010	NC_012578	CAA	2	6	2662250	2662255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227082662
51011	NC_012578	GTG	2	6	2662269	2662274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227082662
51012	NC_012578	CCG	2	6	2662346	2662351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227082662
51013	NC_012578	CCG	2	6	2662371	2662376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227082662
51014	NC_012578	AGG	2	6	2662381	2662386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227082662
51015	NC_012578	TAA	2	6	2662403	2662408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227082662
51016	NC_012578	TC	3	6	2662517	2662522	0 %	50 %	0 %	50 %	227082662
51017	NC_012578	AGA	2	6	2662640	2662645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227082662
51018	NC_012578	TGG	2	6	2662681	2662686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227082662
51019	NC_012578	CA	3	6	2662736	2662741	50 %	0 %	0 %	50 %	227082662
51020	NC_012578	TTGA	2	8	2662797	2662804	25 %	50 %	25 %	0 %	227082662
51021	NC_012578	CAT	2	6	2662841	2662846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082662
51022	NC_012578	T	6	6	2662884	2662889	0 %	100 %	0 %	0 %	227082662
51023	NC_012578	A	6	6	2662898	2662903	100 %	0 %	0 %	0 %	227082662
51024	NC_012578	CGC	2	6	2662959	2662964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51025	NC_012578	GCG	2	6	2662970	2662975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51026	NC_012578	AAT	3	9	2663066	2663074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51027	NC_012578	TGA	2	6	2663157	2663162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082663
51028	NC_012578	GACG	2	8	2663406	2663413	25 %	0 %	50 %	25 %	227082663
51029	NC_012578	GCT	2	6	2663505	2663510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082663
51030	NC_012578	TCAC	2	8	2663522	2663529	25 %	25 %	0 %	50 %	227082663
51031	NC_012578	A	6	6	2663667	2663672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51032	NC_012578	CAGCT	2	10	2663675	2663684	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
51033	NC_012578	T	6	6	2663688	2663693	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51034	NC_012578	AATC	2	8	2663735	2663742	50 %	25 %	0 %	25 %	227082664
51035	NC_012578	GT	3	6	2663863	2663868	0 %	50 %	50 %	0 %	227082664
51036	NC_012578	CCA	2	6	2663912	2663917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227082664
51037	NC_012578	GGTTT	2	10	2663956	2663965	0 %	60 %	40 %	0 %	227082664
51038	NC_012578	ACTG	2	8	2663981	2663988	25 %	25 %	25 %	25 %	227082664
51039	NC_012578	TGT	2	6	2663989	2663994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227082664
51040	NC_012578	CT	3	6	2664010	2664015	0 %	50 %	0 %	50 %	227082664
51041	NC_012578	TGC	2	6	2664049	2664054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082664
51042	NC_012578	TC	4	8	2664058	2664065	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51043	NC_012578	GGT	3	9	2664352	2664360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227082665
51044	NC_012578	CAA	2	6	2664403	2664408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227082665
51045	NC_012578	AGA	2	6	2664447	2664452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227082665
51046	NC_012578	GTGA	2	8	2664455	2664462	25 %	25 %	50 %	0 %	227082665
51047	NC_012578	GTT	2	6	2664517	2664522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227082665
51048	NC_012578	TCA	2	6	2664573	2664578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082665
51049	NC_012578	CTT	2	6	2664588	2664593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227082665
51050	NC_012578	TCACC	2	10	2664642	2664651	20 %	20 %	0 %	60 %	227082665
51051	NC_012578	TCG	2	6	2664737	2664742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082665
51052	NC_012578	GTCA	2	8	2664793	2664800	25 %	25 %	25 %	25 %	227082665
51053	NC_012578	CGG	2	6	2664856	2664861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227082665
51054	NC_012578	CAT	2	6	2664988	2664993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082665
51055	NC_012578	GGT	2	6	2665078	2665083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227082665
51056	NC_012578	GCA	2	6	2665218	2665223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082665
51057	NC_012578	GTTAA	2	10	2665316	2665325	40 %	40 %	20 %	0 %	227082665
51058	NC_012578	CGCA	2	8	2665351	2665358	25 %	0 %	25 %	50 %	227082665
51059	NC_012578	GA	3	6	2665382	2665387	50 %	0 %	50 %	0 %	227082665
51060	NC_012578	TAA	2	6	2665408	2665413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227082665
51061	NC_012578	CCAA	2	8	2665468	2665475	50 %	0 %	0 %	50 %	227082665
51062	NC_012578	GCG	2	6	2665542	2665547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227082665
51063	NC_012578	GCC	2	6	2665588	2665593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227082665
51064	NC_012578	GCT	2	6	2665629	2665634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082665
51065	NC_012578	CTT	2	6	2665692	2665697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227082665
51066	NC_012578	GCG	2	6	2665736	2665741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227082665
51067	NC_012578	GA	3	6	2665772	2665777	50 %	0 %	50 %	0 %	227082665
51068	NC_012578	TGT	2	6	2665787	2665792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227082665
51069	NC_012578	GC	3	6	2666000	2666005	0 %	0 %	50 %	50 %	227082665
51070	NC_012578	GCA	3	9	2666151	2666159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082665
51071	NC_012578	GCCA	2	8	2666418	2666425	25 %	0 %	25 %	50 %	227082665
51072	NC_012578	CAC	2	6	2666460	2666465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227082665
51073	NC_012578	GCC	2	6	2666581	2666586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227082665
51074	NC_012578	CAG	2	6	2666827	2666832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082665
51075	NC_012578	GCTCA	2	10	2667037	2667046	20 %	20 %	20 %	40 %	227082665
51076	NC_012578	TAGAGA	2	12	2667051	2667062	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	227082665
51077	NC_012578	CGT	2	6	2667063	2667068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082665
51078	NC_012578	GAT	2	6	2667096	2667101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082665
51079	NC_012578	GAT	2	6	2667106	2667111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082665
51080	NC_012578	ATC	2	6	2667176	2667181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082665
51081	NC_012578	GCC	2	6	2667230	2667235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227082665
51082	NC_012578	TTGCC	2	10	2667314	2667323	0 %	40 %	20 %	40 %	227082665
51083	NC_012578	TGC	2	6	2667344	2667349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082665
51084	NC_012578	TCA	2	6	2667458	2667463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082665
51085	NC_012578	CT	3	6	2667476	2667481	0 %	50 %	0 %	50 %	227082665
51086	NC_012578	AGCTT	2	10	2667573	2667582	20 %	40 %	20 %	20 %	227082665
51087	NC_012578	TGCT	2	8	2667691	2667698	0 %	50 %	25 %	25 %	227082665
51088	NC_012578	GC	3	6	2667699	2667704	0 %	0 %	50 %	50 %	227082665
51089	NC_012578	CCAGCA	2	12	2667756	2667767	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	227082665
51090	NC_012578	AG	3	6	2667793	2667798	50 %	0 %	50 %	0 %	227082665
51091	NC_012578	AAGTG	2	10	2667845	2667854	40 %	20 %	40 %	0 %	227082666
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51098	NC_012578	CCA	2	6	2668201	2668206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227082666
51099	NC_012578	GC	3	6	2668233	2668238	0 %	0 %	50 %	50 %	227082666
51100	NC_012578	AAG	2	6	2668253	2668258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227082666
51101	NC_012578	ATC	2	6	2668416	2668421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082666
51102	NC_012578	GCC	2	6	2668479	2668484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227082666
51103	NC_012578	TAGAT	2	10	2668512	2668521	40 %	40 %	20 %	0 %	227082666
51104	NC_012578	CCG	2	6	2668616	2668621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227082666
51105	NC_012578	AG	3	6	2668645	2668650	50 %	0 %	50 %	0 %	227082666
51106	NC_012578	CTG	2	6	2668654	2668659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082666
51107	NC_012578	TTC	2	6	2668693	2668698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227082666
51108	NC_012578	CAA	2	6	2668832	2668837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227082666
51109	NC_012578	GCG	2	6	2669147	2669152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227082666
51110	NC_012578	GCG	2	6	2669172	2669177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227082666
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51112	NC_012578	GTA	2	6	2669322	2669327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082666
51113	NC_012578	CTT	2	6	2669356	2669361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227082666
51114	NC_012578	TGG	2	6	2669387	2669392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227082666
51115	NC_012578	CGAT	2	8	2669408	2669415	25 %	25 %	25 %	25 %	227082666
51116	NC_012578	GA	3	6	2669416	2669421	50 %	0 %	50 %	0 %	227082666
51117	NC_012578	CAT	2	6	2669591	2669596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51118	NC_012578	TGC	2	6	2669669	2669674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51119	NC_012578	CCA	2	6	2669698	2669703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51120	NC_012578	CAT	2	6	2669718	2669723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082667
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51122	NC_012578	CA	3	6	2669750	2669755	50 %	0 %	0 %	50 %	227082667
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51132	NC_012578	TTTG	2	8	2670412	2670419	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
51133	NC_012578	CA	3	6	2670500	2670505	50 %	0 %	0 %	50 %	227082668
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51143	NC_012578	GA	3	6	2671111	2671116	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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51147	NC_012578	TGAT	2	8	2671311	2671318	25 %	50 %	25 %	0 %	227082669
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51157	NC_012578	TTA	2	6	2671549	2671554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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51198	NC_012578	GC	3	6	2674299	2674304	0 %	0 %	50 %	50 %	227082672
51199	NC_012578	TGAC	2	8	2674360	2674367	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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51210	NC_012578	GATA	2	8	2674984	2674991	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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51230	NC_012578	TAT	2	6	2675979	2675984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227082674
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51234	NC_012578	TGA	2	6	2676129	2676134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082674
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51354	NC_012578	ATT	2	6	2683157	2683162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227082681
51355	NC_012578	TGG	2	6	2683226	2683231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227082681
51356	NC_012578	CAGT	2	8	2683298	2683305	25 %	25 %	25 %	25 %	227082681
51357	NC_012578	GC	3	6	2683322	2683327	0 %	0 %	50 %	50 %	227082681
51358	NC_012578	TCTT	2	8	2683354	2683361	0 %	75 %	0 %	25 %	227082681
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51365	NC_012578	TCACGC	2	12	2683693	2683704	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	227082681
51366	NC_012578	ACC	2	6	2683798	2683803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227082681
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51378	NC_012578	TAT	2	6	2684574	2684579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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51380	NC_012578	CTGC	2	8	2684663	2684670	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
51381	NC_012578	TTGCAG	2	12	2684710	2684721	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
51382	NC_012578	GAT	2	6	2684765	2684770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082682
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51401	NC_012578	CTCG	2	8	2685701	2685708	0 %	25 %	25 %	50 %	227082683
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51428	NC_012578	CCAAT	2	10	2686550	2686559	40 %	20 %	0 %	40 %	227082684
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51431	NC_012578	TGC	2	6	2686599	2686604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082684
51432	NC_012578	CTT	2	6	2686607	2686612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227082684
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51435	NC_012578	AAGC	2	8	2686887	2686894	50 %	0 %	25 %	25 %	227082685
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51437	NC_012578	TTG	2	6	2686989	2686994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227082685
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51439	NC_012578	TGA	2	6	2687017	2687022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082685
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51442	NC_012578	CTG	2	6	2687289	2687294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082685
51443	NC_012578	GGTTG	2	10	2687321	2687330	0 %	40 %	60 %	0 %	227082685
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51449	NC_012578	T	6	6	2687522	2687527	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51450	NC_012578	CTTA	2	8	2687635	2687642	25 %	50 %	0 %	25 %	227082686
51451	NC_012578	CAA	2	6	2687798	2687803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227082686
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51454	NC_012578	AAG	2	6	2687952	2687957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227082686
51455	NC_012578	ATGCC	2	10	2688091	2688100	20 %	20 %	20 %	40 %	227082686
51456	NC_012578	A	6	6	2688190	2688195	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51457	NC_012578	CAG	3	9	2688240	2688248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082687
51458	NC_012578	CAG	2	6	2688255	2688260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082687
51459	NC_012578	GCC	2	6	2688343	2688348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227082687
51460	NC_012578	GAC	2	6	2688429	2688434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082687
51461	NC_012578	ACG	2	6	2688479	2688484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082687
51462	NC_012578	AGT	2	6	2688511	2688516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082687
51463	NC_012578	AG	3	6	2688539	2688544	50 %	0 %	50 %	0 %	227082687
51464	NC_012578	CTG	2	6	2688578	2688583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082687
51465	NC_012578	GTTGA	2	10	2688589	2688598	20 %	40 %	40 %	0 %	227082687
51466	NC_012578	CTAA	2	8	2688634	2688641	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51467	NC_012578	TGG	2	6	2688669	2688674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227082688
51468	NC_012578	AGAC	2	8	2688699	2688706	50 %	0 %	25 %	25 %	227082688
51469	NC_012578	CTT	2	6	2688744	2688749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227082688
51470	NC_012578	AAG	2	6	2688768	2688773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227082688
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51472	NC_012578	CTTC	2	8	2688905	2688912	0 %	50 %	0 %	50 %	227082688
51473	NC_012578	TTG	2	6	2688971	2688976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227082688
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51482	NC_012578	GT	3	6	2689572	2689577	0 %	50 %	50 %	0 %	227082688
51483	NC_012578	CAA	2	6	2689598	2689603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227082688
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51498	NC_012578	CGA	2	6	2690152	2690157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082689
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