MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae M66-2 chromosome I

Total Repeats: 55388

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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50002	NC_012578	ACT	2	6	2606577	2606582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082609
50003	NC_012578	CAAC	2	8	2606588	2606595	50 %	0 %	0 %	50 %	227082609
50004	NC_012578	ATA	2	6	2606670	2606675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227082609
50005	NC_012578	GCAT	2	8	2606764	2606771	25 %	25 %	25 %	25 %	227082609
50006	NC_012578	TCA	2	6	2606828	2606833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082609
50007	NC_012578	TCA	2	6	2606845	2606850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50008	NC_012578	TTC	2	6	2606881	2606886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50009	NC_012578	A	6	6	2606951	2606956	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50010	NC_012578	TG	3	6	2607012	2607017	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50011	NC_012578	TC	3	6	2607044	2607049	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50012	NC_012578	CTA	2	6	2607059	2607064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50013	NC_012578	CA	3	6	2607110	2607115	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50014	NC_012578	A	6	6	2607120	2607125	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50015	NC_012578	T	7	7	2607143	2607149	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50016	NC_012578	ACA	2	6	2607163	2607168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50017	NC_012578	GTC	2	6	2607565	2607570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082610
50018	NC_012578	GAT	2	6	2607613	2607618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082610
50019	NC_012578	GGC	2	6	2607754	2607759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227082610
50020	NC_012578	ATT	2	6	2607760	2607765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227082610
50021	NC_012578	ATC	2	6	2607805	2607810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082610
50022	NC_012578	GAC	2	6	2607826	2607831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082610
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50037	NC_012578	A	7	7	2608741	2608747	100 %	0 %	0 %	0 %	227082610
50038	NC_012578	ACACAA	2	12	2608837	2608848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50039	NC_012578	GACA	2	8	2608878	2608885	50 %	0 %	25 %	25 %	227082611
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50056	NC_012578	GCGG	2	8	2609725	2609732	0 %	0 %	75 %	25 %	227082611
50057	NC_012578	GC	3	6	2609735	2609740	0 %	0 %	50 %	50 %	227082611
50058	NC_012578	TGC	2	6	2609801	2609806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082611
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50065	NC_012578	GAA	2	6	2610016	2610021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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50099	NC_012578	TC	3	6	2612262	2612267	0 %	50 %	0 %	50 %	227082614
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50111	NC_012578	CAAA	2	8	2613109	2613116	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
50112	NC_012578	CA	3	6	2613230	2613235	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50113	NC_012578	TTAAA	2	10	2613269	2613278	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50114	NC_012578	GTTTC	2	10	2613332	2613341	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
50115	NC_012578	CAA	2	6	2613438	2613443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50116	NC_012578	CA	4	8	2613467	2613474	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50117	NC_012578	AC	3	6	2613579	2613584	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50118	NC_012578	AAC	2	6	2613610	2613615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50119	NC_012578	AGC	2	6	2613778	2613783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50120	NC_012578	ACG	2	6	2613832	2613837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50121	NC_012578	TGA	2	6	2613912	2613917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50122	NC_012578	CCG	2	6	2613940	2613945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50123	NC_012578	ACC	2	6	2614027	2614032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50124	NC_012578	CTC	2	6	2614146	2614151	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50125	NC_012578	GAG	2	6	2614165	2614170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50126	NC_012578	CCA	2	6	2614190	2614195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50127	NC_012578	GGT	2	6	2614250	2614255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50128	NC_012578	GTA	2	6	2614347	2614352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50129	NC_012578	ATTTCA	2	12	2614406	2614417	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50130	NC_012578	CAT	2	6	2614445	2614450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50131	NC_012578	GCC	2	6	2614520	2614525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50132	NC_012578	TAA	2	6	2614645	2614650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50133	NC_012578	TC	3	6	2614772	2614777	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50134	NC_012578	ACC	2	6	2614802	2614807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50135	NC_012578	GTA	2	6	2614890	2614895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50136	NC_012578	CGT	2	6	2614902	2614907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50137	NC_012578	AG	4	8	2614919	2614926	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50138	NC_012578	C	6	6	2615002	2615007	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
50139	NC_012578	GAG	2	6	2615133	2615138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50140	NC_012578	CGACT	2	10	2615310	2615319	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
50141	NC_012578	CTTT	2	8	2615334	2615341	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
50142	NC_012578	ATG	2	6	2615344	2615349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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50144	NC_012578	GTT	2	6	2615439	2615444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50145	NC_012578	ACG	2	6	2615454	2615459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50146	NC_012578	GT	3	6	2615476	2615481	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50147	NC_012578	TACT	2	8	2615493	2615500	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
50148	NC_012578	AGT	2	6	2615569	2615574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50149	NC_012578	TCGGT	2	10	2615684	2615693	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
50150	NC_012578	CAC	2	6	2615870	2615875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50151	NC_012578	GTAC	2	8	2615895	2615902	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50152	NC_012578	GTCA	2	8	2615978	2615985	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50153	NC_012578	GGA	2	6	2616001	2616006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50154	NC_012578	C	6	6	2616011	2616016	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
50155	NC_012578	TCGC	2	8	2616158	2616165	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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50158	NC_012578	GTT	3	9	2616433	2616441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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50162	NC_012578	TTG	2	6	2616608	2616613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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50201	NC_012578	ATC	2	6	2618590	2618595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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50203	NC_012578	GATT	2	8	2618612	2618619	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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50207	NC_012578	TTTA	2	8	2618878	2618885	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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50228	NC_012578	GGCT	2	8	2620024	2620031	0 %	25 %	50 %	25 %	227082616
50229	NC_012578	TGATT	2	10	2620101	2620110	20 %	60 %	20 %	0 %	227082616
50230	NC_012578	ATCT	2	8	2620181	2620188	25 %	50 %	0 %	25 %	227082616
50231	NC_012578	AGA	2	6	2620250	2620255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50232	NC_012578	TAA	3	9	2620259	2620267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50233	NC_012578	GTT	2	6	2620293	2620298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50234	NC_012578	AATATG	2	12	2620319	2620330	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50235	NC_012578	CTT	2	6	2620363	2620368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50236	NC_012578	GGAC	2	8	2620386	2620393	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
50237	NC_012578	CGT	2	6	2620431	2620436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50238	NC_012578	CAC	2	6	2620449	2620454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50239	NC_012578	AAG	2	6	2620499	2620504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50240	NC_012578	AAAAT	2	10	2620531	2620540	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
50241	NC_012578	ATT	2	6	2620550	2620555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50242	NC_012578	CAC	2	6	2620557	2620562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50243	NC_012578	CT	3	6	2620585	2620590	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50244	NC_012578	AATGAT	2	12	2620641	2620652	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	227082617
50245	NC_012578	TCC	2	6	2620668	2620673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227082617
50246	NC_012578	T	7	7	2620680	2620686	0 %	100 %	0 %	0 %	227082617
50247	NC_012578	ACG	2	6	2620709	2620714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082617
50248	NC_012578	ATG	2	6	2620738	2620743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082617
50249	NC_012578	GGC	2	6	2620747	2620752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227082617
50250	NC_012578	GTC	2	6	2620756	2620761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082617
50251	NC_012578	TGG	2	6	2620778	2620783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227082617
50252	NC_012578	GCGA	2	8	2620819	2620826	25 %	0 %	50 %	25 %	227082617
50253	NC_012578	TCT	2	6	2620827	2620832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227082617
50254	NC_012578	CT	3	6	2620831	2620836	0 %	50 %	0 %	50 %	227082617
50255	NC_012578	CGG	2	6	2620917	2620922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227082617
50256	NC_012578	GC	3	6	2620938	2620943	0 %	0 %	50 %	50 %	227082617
50257	NC_012578	CAC	2	6	2620975	2620980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227082617
50258	NC_012578	CA	3	6	2620989	2620994	50 %	0 %	0 %	50 %	227082617
50259	NC_012578	TGT	2	6	2621045	2621050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227082617
50260	NC_012578	A	6	6	2621059	2621064	100 %	0 %	0 %	0 %	227082617
50261	NC_012578	TTTTGA	2	12	2621172	2621183	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50262	NC_012578	T	6	6	2621209	2621214	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50263	NC_012578	CAT	2	6	2621446	2621451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082618
50264	NC_012578	GA	3	6	2621560	2621565	50 %	0 %	50 %	0 %	227082618
50265	NC_012578	TCA	2	6	2621694	2621699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082618
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50267	NC_012578	A	6	6	2621736	2621741	100 %	0 %	0 %	0 %	227082618
50268	NC_012578	T	6	6	2621755	2621760	0 %	100 %	0 %	0 %	227082618
50269	NC_012578	GATAAA	2	12	2621818	2621829	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	227082618
50270	NC_012578	CAC	2	6	2621877	2621882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227082618
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50272	NC_012578	T	6	6	2621916	2621921	0 %	100 %	0 %	0 %	227082618
50273	NC_012578	AAT	2	6	2621959	2621964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227082618
50274	NC_012578	CAG	2	6	2622021	2622026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082618
50275	NC_012578	CAC	2	6	2622034	2622039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227082618
50276	NC_012578	GCC	2	6	2622092	2622097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227082618
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50278	NC_012578	GCT	2	6	2622192	2622197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082618
50279	NC_012578	TGA	2	6	2622207	2622212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082618
50280	NC_012578	AG	3	6	2622217	2622222	50 %	0 %	50 %	0 %	227082618
50281	NC_012578	CAA	2	6	2622225	2622230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227082618
50282	NC_012578	CAA	2	6	2622258	2622263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227082618
50283	NC_012578	CAG	2	6	2622388	2622393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082619
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50286	NC_012578	GA	4	8	2622589	2622596	50 %	0 %	50 %	0 %	227082619
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50304	NC_012578	AAT	2	6	2623396	2623401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227082619
50305	NC_012578	T	7	7	2623430	2623436	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50306	NC_012578	T	6	6	2623472	2623477	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50307	NC_012578	AAT	2	6	2623479	2623484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50308	NC_012578	CAGCG	2	10	2623634	2623643	20 %	0 %	40 %	40 %	227082620
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50310	NC_012578	CTG	2	6	2623778	2623783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082620
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50312	NC_012578	TCG	2	6	2623821	2623826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082620
50313	NC_012578	CTT	2	6	2623927	2623932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227082620
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50315	NC_012578	CCG	2	6	2624047	2624052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227082620
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50332	NC_012578	GT	3	6	2624743	2624748	0 %	50 %	50 %	0 %	227082620
50333	NC_012578	CATCA	2	10	2624762	2624771	40 %	20 %	0 %	40 %	227082620
50334	NC_012578	TGA	2	6	2624863	2624868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082620
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50339	NC_012578	GTG	2	6	2625167	2625172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50340	NC_012578	AGC	2	6	2625341	2625346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082621
50341	NC_012578	GGT	2	6	2625528	2625533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227082621
50342	NC_012578	AGC	2	6	2625563	2625568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082621
50343	NC_012578	GC	3	6	2625571	2625576	0 %	0 %	50 %	50 %	227082621
50344	NC_012578	CT	3	6	2625664	2625669	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50345	NC_012578	CAT	2	6	2625843	2625848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082622
50346	NC_012578	TGG	2	6	2625998	2626003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227082622
50347	NC_012578	AGA	2	6	2626023	2626028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227082622
50348	NC_012578	AGC	2	6	2626115	2626120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082622
50349	NC_012578	CGT	2	6	2626123	2626128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082622
50350	NC_012578	GATG	2	8	2626167	2626174	25 %	25 %	50 %	0 %	227082622
50351	NC_012578	AAG	2	6	2626196	2626201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227082622
50352	NC_012578	GAT	2	6	2626222	2626227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082622
50353	NC_012578	CCA	2	6	2626394	2626399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227082622
50354	NC_012578	AGA	2	6	2626446	2626451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227082622
50355	NC_012578	TCG	2	6	2626496	2626501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082622
50356	NC_012578	GTC	2	6	2626502	2626507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082622
50357	NC_012578	TG	3	6	2626558	2626563	0 %	50 %	50 %	0 %	227082622
50358	NC_012578	TCA	2	6	2626611	2626616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082622
50359	NC_012578	GAT	2	6	2626623	2626628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082622
50360	NC_012578	AAGC	2	8	2626691	2626698	50 %	0 %	25 %	25 %	227082622
50361	NC_012578	TGC	2	6	2626749	2626754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082622
50362	NC_012578	GAA	2	6	2626780	2626785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227082622
50363	NC_012578	GTG	2	6	2626841	2626846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227082622
50364	NC_012578	CTGA	2	8	2626867	2626874	25 %	25 %	25 %	25 %	227082622
50365	NC_012578	TC	3	6	2627009	2627014	0 %	50 %	0 %	50 %	227082622
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50367	NC_012578	TGTT	2	8	2627069	2627076	0 %	75 %	25 %	0 %	227082622
50368	NC_012578	GAA	3	9	2627086	2627094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227082622
50369	NC_012578	GTGC	2	8	2627095	2627102	0 %	25 %	50 %	25 %	227082622
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50374	NC_012578	A	6	6	2627207	2627212	100 %	0 %	0 %	0 %	227082622
50375	NC_012578	CAT	2	6	2627265	2627270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082622
50376	NC_012578	CTT	2	6	2627271	2627276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227082622
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50391	NC_012578	CG	3	6	2628243	2628248	0 %	0 %	50 %	50 %	227082622
50392	NC_012578	TGA	2	6	2628365	2628370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227082622
50393	NC_012578	TGAT	2	8	2628386	2628393	25 %	50 %	25 %	0 %	227082622
50394	NC_012578	GC	3	6	2628451	2628456	0 %	0 %	50 %	50 %	227082622
50395	NC_012578	AAG	2	6	2628545	2628550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227082622
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50397	NC_012578	A	6	6	2628625	2628630	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50398	NC_012578	GCA	2	6	2628632	2628637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50399	NC_012578	GAT	2	6	2628662	2628667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50400	NC_012578	GAC	2	6	2628678	2628683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082623
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50474	NC_012578	GGCTT	2	10	2632556	2632565	0 %	40 %	40 %	20 %	227082625
50475	NC_012578	CGA	2	6	2632598	2632603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227082625
50476	NC_012578	CAA	2	6	2632605	2632610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227082625
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50480	NC_012578	TCA	2	6	2632741	2632746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082625
50481	NC_012578	CAT	2	6	2632776	2632781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227082625
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50497	NC_012578	TGC	2	6	2633328	2633333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227082625
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50499	NC_012578	TCA	2	6	2633448	2633453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50500	NC_012578	ACTTC	2	10	2633478	2633487	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding

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