MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio splendidus LGP32 chromosome 2

Total Repeats: 31516

< Previous12...3233343536373839404142...6364Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_011744	CAT	2	6	957930	957935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218676623
18002	NC_011744	TCAAT	2	10	957973	957982	40 %	40 %	0 %	20 %	218676623
18003	NC_011744	CAT	2	6	957993	957998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218676623
18004	NC_011744	TGA	2	6	958004	958009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218676623
18005	NC_011744	TC	3	6	958056	958061	0 %	50 %	0 %	50 %	218676623
18006	NC_011744	AGG	2	6	958080	958085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218676623
18007	NC_011744	CCAA	2	8	958224	958231	50 %	0 %	0 %	50 %	218676624
18008	NC_011744	GTT	2	6	958243	958248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218676624
18009	NC_011744	A	6	6	958297	958302	100 %	0 %	0 %	0 %	218676624
18010	NC_011744	GAAGA	2	10	958307	958316	60 %	0 %	40 %	0 %	218676624
18011	NC_011744	TCA	2	6	958326	958331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218676624
18012	NC_011744	CAA	2	6	958357	958362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218676624
18013	NC_011744	CGT	2	6	958403	958408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218676624
18014	NC_011744	CTT	2	6	958462	958467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218676624
18015	NC_011744	TGG	2	6	958468	958473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218676624
18016	NC_011744	TCA	2	6	958524	958529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218676624
18017	NC_011744	ATC	2	6	958679	958684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218676624
18018	NC_011744	CAA	2	6	958826	958831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218676624
18019	NC_011744	TGT	3	9	958846	958854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218676624
18020	NC_011744	CAT	2	6	958897	958902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218676624
18021	NC_011744	CAA	2	6	958946	958951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218676624
18022	NC_011744	CTT	2	6	959012	959017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218676624
18023	NC_011744	GTCG	2	8	959029	959036	0 %	25 %	50 %	25 %	218676624
18024	NC_011744	GAC	2	6	959050	959055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218676624
18025	NC_011744	CAT	2	6	959206	959211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218676624
18026	NC_011744	GTTC	2	8	959286	959293	0 %	50 %	25 %	25 %	218676624
18027	NC_011744	ATT	2	6	959306	959311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218676624
18028	NC_011744	TC	3	6	959448	959453	0 %	50 %	0 %	50 %	218676624
18029	NC_011744	TTA	2	6	959474	959479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218676624
18030	NC_011744	CGA	2	6	959518	959523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218676624
18031	NC_011744	GC	3	6	959552	959557	0 %	0 %	50 %	50 %	218676624
18032	NC_011744	ATC	2	6	959603	959608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218676624
18033	NC_011744	ACC	2	6	959634	959639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218676624
18034	NC_011744	AAT	2	6	959695	959700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218676625
18035	NC_011744	ATG	2	6	959738	959743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218676625
18036	NC_011744	TGTGA	2	10	959899	959908	20 %	40 %	40 %	0 %	218676625
18037	NC_011744	TCT	2	6	959984	959989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218676625
18038	NC_011744	TGC	2	6	960011	960016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218676625
18039	NC_011744	AAC	3	9	960031	960039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218676625
18040	NC_011744	TGCT	2	8	960070	960077	0 %	50 %	25 %	25 %	218676625
18041	NC_011744	ACC	2	6	960114	960119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218676625
18042	NC_011744	ACA	2	6	960170	960175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218676625
18043	NC_011744	TCA	2	6	960209	960214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218676625
18044	NC_011744	TTC	2	6	960238	960243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218676625
18045	NC_011744	ATT	2	6	960316	960321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218676625
18046	NC_011744	GCT	2	6	960423	960428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218676625
18047	NC_011744	TCT	2	6	960466	960471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218676625
18048	NC_011744	TCA	2	6	960566	960571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218676625
18049	NC_011744	GCT	2	6	960856	960861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218676625
18050	NC_011744	TCG	2	6	961039	961044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218676625
18051	NC_011744	CAA	2	6	961053	961058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218676625
18052	NC_011744	ATGA	2	8	961069	961076	50 %	25 %	25 %	0 %	218676625
18053	NC_011744	A	6	6	961094	961099	100 %	0 %	0 %	0 %	218676625
18054	NC_011744	GTG	2	6	961139	961144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218676625
18055	NC_011744	GCG	2	6	961165	961170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218676625
18056	NC_011744	AACC	2	8	961179	961186	50 %	0 %	0 %	50 %	218676625
18057	NC_011744	GTC	2	6	961216	961221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218676625
18058	NC_011744	AGA	2	6	961278	961283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218676625
18059	NC_011744	TATCGC	2	12	961339	961350	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	218676625
18060	NC_011744	GATT	2	8	961427	961434	25 %	50 %	25 %	0 %	218676625
18061	NC_011744	CTT	2	6	961464	961469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218676625
18062	NC_011744	TGA	2	6	961608	961613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218676625
18063	NC_011744	T	6	6	961694	961699	0 %	100 %	0 %	0 %	218676625
18064	NC_011744	ATA	2	6	961813	961818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18065	NC_011744	GATG	2	8	961848	961855	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
18066	NC_011744	GA	4	8	961876	961883	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18067	NC_011744	CTTA	2	8	961954	961961	25 %	50 %	0 %	25 %	218676626
18068	NC_011744	GA	3	6	962026	962031	50 %	0 %	50 %	0 %	218676626
18069	NC_011744	CGT	2	6	962114	962119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218676626
18070	NC_011744	CGCT	2	8	962152	962159	0 %	25 %	25 %	50 %	218676626
18071	NC_011744	TTAA	2	8	962287	962294	50 %	50 %	0 %	0 %	218676626
18072	NC_011744	TCA	2	6	962312	962317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18073	NC_011744	ATCAAA	2	12	962324	962335	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18074	NC_011744	TA	3	6	962480	962485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18075	NC_011744	TGGA	2	8	962494	962501	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
18076	NC_011744	CTA	2	6	962570	962575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218676627
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18080	NC_011744	CGAC	2	8	962856	962863	25 %	0 %	25 %	50 %	218676627
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18086	NC_011744	AGAA	2	8	963394	963401	75 %	0 %	25 %	0 %	218676627
18087	NC_011744	TATT	2	8	963405	963412	25 %	75 %	0 %	0 %	218676627
18088	NC_011744	TTGC	2	8	963425	963432	0 %	50 %	25 %	25 %	218676627
18089	NC_011744	CAA	2	6	963478	963483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218676627
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18093	NC_011744	AGA	2	6	963667	963672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218676627
18094	NC_011744	GAA	2	6	963677	963682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218676627
18095	NC_011744	CTT	2	6	963724	963729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218676627
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18099	NC_011744	AC	3	6	964029	964034	50 %	0 %	0 %	50 %	218676627
18100	NC_011744	TGA	2	6	964044	964049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218676627
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18102	NC_011744	TGA	2	6	964077	964082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218676627
18103	NC_011744	CAG	2	6	964110	964115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218676627
18104	NC_011744	AACAGA	2	12	964218	964229	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	218676627
18105	NC_011744	AAG	2	6	964248	964253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218676627
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18109	NC_011744	GTT	2	6	964368	964373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218676627
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18112	NC_011744	CAA	2	6	964517	964522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218676627
18113	NC_011744	GA	3	6	964525	964530	50 %	0 %	50 %	0 %	218676627
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18119	NC_011744	ACA	2	6	964860	964865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218676627
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18474	NC_011744	CA	3	6	984948	984953	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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18477	NC_011744	CAT	2	6	985017	985022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18485	NC_011744	ACA	2	6	985266	985271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218676643
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