MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio fischeri MJ11 chromosome I

Total Repeats: 63278

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011184	AT	4	8	12	19	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011184	TTA	2	6	41	46	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011184	TAT	2	6	51	56	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011184	TCG	2	6	62	67	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_011184	GATC	2	8	114	121	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_011184	GTT	2	6	126	131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011184	TCTT	2	8	133	140	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_011184	G	6	6	189	194	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011184	ATAACT	2	12	219	230	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_011184	TAG	2	6	262	267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011184	TAA	2	6	280	285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011184	TTA	2	6	310	315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197334190
13	NC_011184	TGT	2	6	323	328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197334190
14	NC_011184	CTG	2	6	342	347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197334190
15	NC_011184	TTC	2	6	349	354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197334190
16	NC_011184	ATCT	2	8	376	383	25 %	50 %	0 %	25 %	197334190
17	NC_011184	CTG	2	6	444	449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197334190
18	NC_011184	CAA	2	6	483	488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197334190
19	NC_011184	ACA	2	6	587	592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197334190
20	NC_011184	ATC	2	6	619	624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197334190
21	NC_011184	TCT	2	6	665	670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197334190
22	NC_011184	CAC	2	6	705	710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197334190
23	NC_011184	TAA	2	6	726	731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197334190
24	NC_011184	T	6	6	739	744	0 %	100 %	0 %	0 %	197334190
25	NC_011184	A	6	6	761	766	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011184	TTA	2	6	794	799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011184	TTTA	2	8	808	815	25 %	75 %	0 %	0 %	197334085
28	NC_011184	ATC	2	6	851	856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197334085
29	NC_011184	TGT	3	9	888	896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197334085
30	NC_011184	TTC	2	6	908	913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197334085
31	NC_011184	CTT	2	6	1024	1029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197334085
32	NC_011184	T	6	6	1194	1199	0 %	100 %	0 %	0 %	197334085
33	NC_011184	AATT	2	8	1226	1233	50 %	50 %	0 %	0 %	197334085
34	NC_011184	GTT	2	6	1254	1259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197334085
35	NC_011184	ATAA	2	8	1269	1276	75 %	25 %	0 %	0 %	197334085
36	NC_011184	TCA	2	6	1335	1340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197334085
37	NC_011184	CGG	2	6	1357	1362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197334085
38	NC_011184	AAT	2	6	1367	1372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197334085
39	NC_011184	CT	3	6	1403	1408	0 %	50 %	0 %	50 %	197334085
40	NC_011184	AAG	2	6	1475	1480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197334085
41	NC_011184	AAC	2	6	1514	1519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197334085
42	NC_011184	ATG	2	6	1536	1541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197334085
43	NC_011184	CTT	2	6	1555	1560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197334085
44	NC_011184	CAC	2	6	1600	1605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197334085
45	NC_011184	TCT	2	6	1635	1640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197334085
46	NC_011184	TGC	2	6	1655	1660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197334085
47	NC_011184	TAGA	2	8	1676	1683	50 %	25 %	25 %	0 %	197334085
48	NC_011184	CTT	2	6	1756	1761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197334085
49	NC_011184	GAC	2	6	1907	1912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197334085
50	NC_011184	ACC	2	6	1916	1921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197334085
51	NC_011184	AATG	2	8	1956	1963	50 %	25 %	25 %	0 %	197334085
52	NC_011184	CTTTTG	2	12	2083	2094	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	197334085
53	NC_011184	CGC	2	6	2119	2124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197334085
54	NC_011184	CAA	2	6	2149	2154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197334085
55	NC_011184	TGTA	2	8	2162	2169	25 %	50 %	25 %	0 %	197334085
56	NC_011184	ATT	2	6	2178	2183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011184	A	6	6	2225	2230	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011184	GCC	2	6	2242	2247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_011184	T	6	6	2292	2297	0 %	100 %	0 %	0 %	197333980
60	NC_011184	AAG	2	6	2386	2391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197333980
61	NC_011184	TCT	2	6	2426	2431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197333980
62	NC_011184	TGT	2	6	2451	2456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197333980
63	NC_011184	TCT	2	6	2465	2470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197333980
64	NC_011184	TAA	2	6	2496	2501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197333980
65	NC_011184	GTA	2	6	2511	2516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197333980
66	NC_011184	CCAA	2	8	2544	2551	50 %	0 %	0 %	50 %	197333980
67	NC_011184	GAA	3	9	2621	2629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197333980
68	NC_011184	ACC	2	6	2640	2645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197333980
69	NC_011184	TCTT	2	8	2662	2669	0 %	75 %	0 %	25 %	197333980
70	NC_011184	CAT	2	6	2679	2684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197333980
71	NC_011184	CAC	2	6	2804	2809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197333980
72	NC_011184	GTG	2	6	2888	2893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197333980
73	NC_011184	AACC	2	8	2908	2915	50 %	0 %	0 %	50 %	197333980
74	NC_011184	TTTC	2	8	2957	2964	0 %	75 %	0 %	25 %	197333980
75	NC_011184	CTT	2	6	3005	3010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197333980
76	NC_011184	CTG	2	6	3014	3019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197333980
77	NC_011184	CAT	2	6	3089	3094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197333980
78	NC_011184	AGT	2	6	3125	3130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197333980
79	NC_011184	GATA	2	8	3171	3178	50 %	25 %	25 %	0 %	197333980
80	NC_011184	GTC	2	6	3195	3200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197333980
81	NC_011184	T	6	6	3210	3215	0 %	100 %	0 %	0 %	197333980
82	NC_011184	TCT	2	6	3226	3231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197333980
83	NC_011184	AGC	2	6	3240	3245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197333980
84	NC_011184	ACC	2	6	3273	3278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197333980
85	NC_011184	ATC	2	6	3279	3284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197333980
86	NC_011184	T	6	6	3479	3484	0 %	100 %	0 %	0 %	197333980
87	NC_011184	TG	3	6	3560	3565	0 %	50 %	50 %	0 %	197333980
88	NC_011184	CGT	2	6	3569	3574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197333980
89	NC_011184	AAG	2	6	3579	3584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197333980
90	NC_011184	CGT	2	6	3614	3619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197333980
91	NC_011184	TTA	2	6	3622	3627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197333980
92	NC_011184	ATG	2	6	3640	3645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197333980
93	NC_011184	CAC	2	6	3647	3652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197333980
94	NC_011184	TTGTGA	2	12	3686	3697	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	197333980
95	NC_011184	GAA	2	6	3748	3753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197333980
96	NC_011184	GTTTGT	2	12	3772	3783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197333980
97	NC_011184	TGC	2	6	3808	3813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197333980
98	NC_011184	TTG	2	6	3834	3839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197333980
99	NC_011184	A	6	6	3847	3852	100 %	0 %	0 %	0 %	197333980
100	NC_011184	TGC	2	6	3921	3926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_011184	TGGG	2	8	3928	3935	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011184	CAT	2	6	3952	3957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_011184	TGA	2	6	4090	4095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011184	TTG	2	6	4175	4180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197333937
105	NC_011184	ACGA	2	8	4273	4280	50 %	0 %	25 %	25 %	197333937
106	NC_011184	TTG	2	6	4292	4297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197333937
107	NC_011184	CAG	2	6	4305	4310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197333937
108	NC_011184	CTT	2	6	4321	4326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197333937
109	NC_011184	AG	3	6	4358	4363	50 %	0 %	50 %	0 %	197333937
110	NC_011184	GCTT	2	8	4409	4416	0 %	50 %	25 %	25 %	197333937
111	NC_011184	GA	3	6	4461	4466	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011184	TCA	2	6	4476	4481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_011184	AAT	2	6	4483	4488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011184	TAGA	2	8	4500	4507	50 %	25 %	25 %	0 %	197334034
115	NC_011184	ACG	2	6	4525	4530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197334034
116	NC_011184	TTACG	2	10	4539	4548	20 %	40 %	20 %	20 %	197334034
117	NC_011184	TAG	2	6	4557	4562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197334034
118	NC_011184	TTA	2	6	4640	4645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011184	AGT	2	6	4652	4657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011184	TTAA	2	8	4666	4673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011184	CAA	2	6	4706	4711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_011184	CAA	2	6	4747	4752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_011184	CGA	2	6	4898	4903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197334117
124	NC_011184	TC	3	6	4942	4947	0 %	50 %	0 %	50 %	197334117
125	NC_011184	AAC	2	6	4968	4973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197334117
126	NC_011184	TTC	2	6	5002	5007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197334117
127	NC_011184	TCA	2	6	5059	5064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197334117
128	NC_011184	GTT	3	9	5114	5122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197334117
129	NC_011184	CCT	2	6	5125	5130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	197334117
130	NC_011184	GCT	2	6	5137	5142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197334117
131	NC_011184	ATC	2	6	5175	5180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197334117
132	NC_011184	T	6	6	5196	5201	0 %	100 %	0 %	0 %	197334117
133	NC_011184	CGT	2	6	5207	5212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197334117
134	NC_011184	TTA	2	6	5234	5239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197334117
135	NC_011184	CAT	2	6	5366	5371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197334117
136	NC_011184	AATGC	2	10	5412	5421	40 %	20 %	20 %	20 %	197334117
137	NC_011184	TC	3	6	5468	5473	0 %	50 %	0 %	50 %	197334117
138	NC_011184	TTTA	2	8	5475	5482	25 %	75 %	0 %	0 %	197334117
139	NC_011184	ATC	2	6	5548	5553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197334117
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142	NC_011184	AATA	2	8	5623	5630	75 %	25 %	0 %	0 %	197333922
143	NC_011184	TGA	2	6	5669	5674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197333922
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157	NC_011184	CT	3	6	6225	6230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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161	NC_011184	GATG	2	8	6333	6340	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
162	NC_011184	GTAA	2	8	6341	6348	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
163	NC_011184	ACTT	2	8	6351	6358	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
164	NC_011184	GA	3	6	6406	6411	50 %	0 %	50 %	0 %	197334002
165	NC_011184	CT	3	6	6431	6436	0 %	50 %	0 %	50 %	197334002
166	NC_011184	CTT	2	6	6460	6465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197334002
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179	NC_011184	TAA	2	6	7207	7212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_011184	TTG	2	6	7246	7251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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183	NC_011184	A	6	6	7296	7301	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_011184	ATC	2	6	7340	7345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
185	NC_011184	ATTA	2	8	7400	7407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_011184	AAG	2	6	7463	7468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
187	NC_011184	ATT	2	6	7605	7610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197334133
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219	NC_011184	TA	4	8	8847	8854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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269	NC_011184	CAA	2	6	11499	11504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197334084
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271	NC_011184	GAA	2	6	11592	11597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197334084
272	NC_011184	GTA	2	6	11610	11615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197334084
273	NC_011184	TCTT	2	8	11655	11662	0 %	75 %	0 %	25 %	197334084
274	NC_011184	TATC	2	8	11674	11681	25 %	50 %	0 %	25 %	197334084
275	NC_011184	GAA	2	6	11700	11705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197334084
276	NC_011184	GGT	2	6	11733	11738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197334084
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280	NC_011184	TAA	2	6	11888	11893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197334084
281	NC_011184	TGG	2	6	11909	11914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197334084
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283	NC_011184	AAG	2	6	11974	11979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197334084
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287	NC_011184	CAAA	2	8	12081	12088	75 %	0 %	0 %	25 %	197334084
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304	NC_011184	TCG	2	6	12872	12877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197334084
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397	NC_011184	GAG	2	6	16940	16945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	197333992
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400	NC_011184	CCA	2	6	16996	17001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197334221
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499	NC_011184	TAG	2	6	22000	22005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
500	NC_011184	AGA	2	6	22022	22027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197333985

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