MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio fischeri MJ11 chromosome I

Total Repeats: 63278

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_011184	GTT	2	6	138669	138674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197334039
3002	NC_011184	AAAG	2	8	138705	138712	75 %	0 %	25 %	0 %	197334039
3003	NC_011184	AAC	2	6	138756	138761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197334039
3004	NC_011184	CAA	2	6	138902	138907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197334039
3005	NC_011184	AG	3	6	139012	139017	50 %	0 %	50 %	0 %	197334039
3006	NC_011184	GAATCC	2	12	139071	139082	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	197334039
3007	NC_011184	C	6	6	139091	139096	0 %	0 %	0 %	100 %	197334039
3008	NC_011184	AGA	2	6	139111	139116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197334039
3009	NC_011184	TAAT	2	8	139169	139176	50 %	50 %	0 %	0 %	197334018
3010	NC_011184	AGT	2	6	139195	139200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197334018
3011	NC_011184	TCA	2	6	139309	139314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197334018
3012	NC_011184	TTTG	2	8	139358	139365	0 %	75 %	25 %	0 %	197334018
3013	NC_011184	CTT	2	6	139405	139410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197334018
3014	NC_011184	TAA	2	6	139497	139502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197334018
3015	NC_011184	A	6	6	139559	139564	100 %	0 %	0 %	0 %	197334018
3016	NC_011184	TTC	2	6	139569	139574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197334018
3017	NC_011184	CGC	2	6	139632	139637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197334018
3018	NC_011184	GTA	2	6	139672	139677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197334018
3019	NC_011184	AGC	2	6	139683	139688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197334018
3020	NC_011184	GTA	2	6	139724	139729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197334018
3021	NC_011184	TCA	2	6	139732	139737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197334018
3022	NC_011184	CGA	2	6	139738	139743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197334018
3023	NC_011184	T	6	6	139783	139788	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_011184	ATT	2	6	139789	139794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_011184	T	6	6	139793	139798	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_011184	GTT	2	6	139809	139814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_011184	TCGCT	2	10	139848	139857	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3028	NC_011184	AGTTC	2	10	139893	139902	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3029	NC_011184	TCG	2	6	140079	140084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197333918
3030	NC_011184	CTT	2	6	140106	140111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197333918
3031	NC_011184	CGG	2	6	140346	140351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197333918
3032	NC_011184	TAA	2	6	140649	140654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197333918
3033	NC_011184	T	6	6	140677	140682	0 %	100 %	0 %	0 %	197333918
3034	NC_011184	TGTT	2	8	140692	140699	0 %	75 %	25 %	0 %	197333918
3035	NC_011184	A	6	6	140717	140722	100 %	0 %	0 %	0 %	197333918
3036	NC_011184	TTC	2	6	140760	140765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197333918
3037	NC_011184	TTG	2	6	140788	140793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197333918
3038	NC_011184	CAG	3	9	140796	140804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197333918
3039	NC_011184	ACG	2	6	140824	140829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197333918
3040	NC_011184	GA	3	6	140892	140897	50 %	0 %	50 %	0 %	197333918
3041	NC_011184	ATA	2	6	140934	140939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197333918
3042	NC_011184	CAG	2	6	140955	140960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197333918
3043	NC_011184	ATCAG	2	10	140972	140981	40 %	20 %	20 %	20 %	197333918
3044	NC_011184	CAG	3	9	141048	141056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197333918
3045	NC_011184	TGC	2	6	141127	141132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197333918
3046	NC_011184	TAC	2	6	141142	141147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197333918
3047	NC_011184	CGA	2	6	141176	141181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197333918
3048	NC_011184	GCC	2	6	141211	141216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197333918
3049	NC_011184	AAG	2	6	141226	141231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197333918
3050	NC_011184	T	8	8	141315	141322	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_011184	CCA	2	6	141348	141353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3052	NC_011184	TCA	2	6	141462	141467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3053	NC_011184	AGA	2	6	141500	141505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197334055
3054	NC_011184	AG	3	6	141516	141521	50 %	0 %	50 %	0 %	197334055
3055	NC_011184	ACTG	2	8	141548	141555	25 %	25 %	25 %	25 %	197334055
3056	NC_011184	GAAT	2	8	141598	141605	50 %	25 %	25 %	0 %	197334055
3057	NC_011184	TGA	2	6	141668	141673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197334055
3058	NC_011184	TATT	2	8	141753	141760	25 %	75 %	0 %	0 %	197334055
3059	NC_011184	AGA	2	6	141776	141781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197334055
3060	NC_011184	AC	3	6	141800	141805	50 %	0 %	0 %	50 %	197334055
3061	NC_011184	ATT	2	6	141902	141907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197334055
3062	NC_011184	TGC	3	9	141923	141931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197334055
3063	NC_011184	GA	3	6	141941	141946	50 %	0 %	50 %	0 %	197334055
3064	NC_011184	GCC	2	6	141978	141983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197334055
3065	NC_011184	AGA	2	6	142038	142043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197334055
3066	NC_011184	GGAT	2	8	142143	142150	25 %	25 %	50 %	0 %	197334055
3067	NC_011184	T	8	8	142158	142165	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_011184	A	8	8	142177	142184	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_011184	A	6	6	142188	142193	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_011184	T	6	6	142299	142304	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_011184	CCA	2	6	142306	142311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3072	NC_011184	AAC	2	6	142395	142400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197333949
3073	NC_011184	A	6	6	142412	142417	100 %	0 %	0 %	0 %	197333949
3074	NC_011184	CCA	2	6	142420	142425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197333949
3075	NC_011184	CGT	2	6	142428	142433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197333949
3076	NC_011184	AAAC	2	8	142675	142682	75 %	0 %	0 %	25 %	197334162
3077	NC_011184	A	6	6	142709	142714	100 %	0 %	0 %	0 %	197334162
3078	NC_011184	TGT	2	6	142723	142728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197334162
3079	NC_011184	AAG	2	6	142749	142754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197334162
3080	NC_011184	TTG	2	6	142812	142817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_011184	T	9	9	142823	142831	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_011184	GA	3	6	142849	142854	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_011184	CGCTT	2	10	142913	142922	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3084	NC_011184	CTC	2	6	142950	142955	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3085	NC_011184	GTT	2	6	143014	143019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_011184	CGCTT	2	10	143105	143114	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3087	NC_011184	CGC	2	6	143249	143254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3088	NC_011184	A	6	6	143318	143323	100 %	0 %	0 %	0 %	197334073
3089	NC_011184	ACA	3	9	143340	143348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197334073
3090	NC_011184	ATC	2	6	143354	143359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197334073
3091	NC_011184	CTC	2	6	143391	143396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	197334073
3092	NC_011184	TAA	2	6	143400	143405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197334073
3093	NC_011184	AGT	2	6	143440	143445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197334073
3094	NC_011184	A	6	6	143487	143492	100 %	0 %	0 %	0 %	197334073
3095	NC_011184	CTT	2	6	143579	143584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197334073
3096	NC_011184	ATG	2	6	143586	143591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197334073
3097	NC_011184	AAAAG	2	10	143608	143617	80 %	0 %	20 %	0 %	197334073
3098	NC_011184	AAG	2	6	143658	143663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197334073
3099	NC_011184	GAT	2	6	143704	143709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197334073
3100	NC_011184	GAA	2	6	143747	143752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197334073
3101	NC_011184	GAG	2	6	143803	143808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_011184	AGA	3	9	143823	143831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_011184	TTA	2	6	143965	143970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197334049
3104	NC_011184	TTTGA	2	10	143983	143992	20 %	60 %	20 %	0 %	197334049
3105	NC_011184	AAC	2	6	144002	144007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197334049
3106	NC_011184	TGGA	2	8	144032	144039	25 %	25 %	50 %	0 %	197334049
3107	NC_011184	TTA	2	6	144122	144127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197334049
3108	NC_011184	AC	3	6	144129	144134	50 %	0 %	0 %	50 %	197334049
3109	NC_011184	GCA	2	6	144195	144200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197334049
3110	NC_011184	GTA	2	6	144220	144225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197334049
3111	NC_011184	TTTGA	2	10	144228	144237	20 %	60 %	20 %	0 %	197334049
3112	NC_011184	GCGA	2	8	144358	144365	25 %	0 %	50 %	25 %	197334049
3113	NC_011184	AGT	2	6	144393	144398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197334049
3114	NC_011184	AAT	2	6	144427	144432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197334049
3115	NC_011184	GAA	2	6	144449	144454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197334049
3116	NC_011184	CAA	2	6	144468	144473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197334049
3117	NC_011184	CGA	2	6	144490	144495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197334049
3118	NC_011184	TGAC	2	8	144563	144570	25 %	25 %	25 %	25 %	197334049
3119	NC_011184	AGG	2	6	144610	144615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	197334049
3120	NC_011184	ATC	2	6	144635	144640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197334049
3121	NC_011184	T	6	6	144748	144753	0 %	100 %	0 %	0 %	197334049
3122	NC_011184	TCA	2	6	144764	144769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197334049
3123	NC_011184	ATG	2	6	144894	144899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197334049
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3125	NC_011184	TATT	2	8	144963	144970	25 %	75 %	0 %	0 %	197334049
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3374	NC_011184	ATGCA	2	10	156367	156376	40 %	20 %	20 %	20 %	197334045
3375	NC_011184	TGCA	2	8	156406	156413	25 %	25 %	25 %	25 %	197334045
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3492	NC_011184	ATTG	2	8	162216	162223	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3493	NC_011184	AAAG	2	8	162233	162240	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3494	NC_011184	AAGT	2	8	162279	162286	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3495	NC_011184	TGT	2	6	162331	162336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3497	NC_011184	ATGA	2	8	162384	162391	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3498	NC_011184	ATT	2	6	162481	162486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3499	NC_011184	TAT	2	6	162487	162492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3500	NC_011184	CTTT	2	8	162495	162502	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding

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