MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio harveyi ATCC BAA-1116 plasmid pVIBHAR

Total Repeats: 1592

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009777	GAT	2	6	73	78	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009777	GAT	2	6	115	120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009777	TGT	2	6	153	158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009777	GAC	2	6	177	182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_009777	GCA	2	6	283	288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_009777	GTC	2	6	307	312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_009777	CTT	2	6	373	378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_009777	GTC	2	6	389	394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_009777	CTT	2	6	411	416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_009777	GA	3	6	579	584	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009777	TAT	2	6	667	672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009777	TAT	2	6	712	717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009777	GAACAG	2	12	937	948	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	156936675
14	NC_009777	CGC	2	6	991	996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156936675
15	NC_009777	CAT	2	6	1139	1144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156936676
16	NC_009777	TGA	2	6	1145	1150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156936676
17	NC_009777	CGA	2	6	1202	1207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936676
18	NC_009777	GA	3	6	1229	1234	50 %	0 %	50 %	0 %	156936676
19	NC_009777	T	6	6	1242	1247	0 %	100 %	0 %	0 %	156936676
20	NC_009777	GT	3	6	1366	1371	0 %	50 %	50 %	0 %	156936676
21	NC_009777	TTC	2	6	1417	1422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_009777	TC	3	6	1540	1545	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_009777	TTCT	2	8	1546	1553	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_009777	GTC	3	9	1673	1681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936677
25	NC_009777	GAAA	2	8	1696	1703	75 %	0 %	25 %	0 %	156936677
26	NC_009777	AT	3	6	1704	1709	50 %	50 %	0 %	0 %	156936677
27	NC_009777	GAA	2	6	1746	1751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156936677
28	NC_009777	GT	3	6	1766	1771	0 %	50 %	50 %	0 %	156936677
29	NC_009777	GATTG	2	10	1858	1867	20 %	40 %	40 %	0 %	156936678
30	NC_009777	AGG	2	6	1892	1897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	156936678
31	NC_009777	CAG	2	6	1951	1956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936678
32	NC_009777	TGT	2	6	1965	1970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	156936678
33	NC_009777	TGA	2	6	2103	2108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156936678
34	NC_009777	TCA	2	6	2459	2464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156936679
35	NC_009777	GGC	2	6	2544	2549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_009777	TCC	2	6	2585	2590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156936680
37	NC_009777	GTTC	2	8	2632	2639	0 %	50 %	25 %	25 %	156936680
38	NC_009777	TCC	2	6	2774	2779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_009777	TA	3	6	2869	2874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009777	GC	3	6	2881	2886	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_009777	AGA	2	6	2895	2900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009777	ACG	2	6	2930	2935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_009777	TGAC	2	8	2970	2977	25 %	25 %	25 %	25 %	156936681
44	NC_009777	GATG	2	8	3172	3179	25 %	25 %	50 %	0 %	156936681
45	NC_009777	GTA	2	6	3189	3194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156936681
46	NC_009777	ATG	2	6	3333	3338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156936681
47	NC_009777	ATTCTG	2	12	3420	3431	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	156936681
48	NC_009777	AGC	2	6	3469	3474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936681
49	NC_009777	GGT	2	6	3532	3537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156936681
50	NC_009777	GAA	2	6	3538	3543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156936681
51	NC_009777	TTC	2	6	3622	3627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156936681
52	NC_009777	CGC	2	6	3655	3660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156936681
53	NC_009777	T	6	6	3720	3725	0 %	100 %	0 %	0 %	156936681
54	NC_009777	GAGCC	2	10	3752	3761	20 %	0 %	40 %	40 %	156936681
55	NC_009777	CGT	2	6	3770	3775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936681
56	NC_009777	GGC	2	6	3894	3899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_009777	CGC	2	6	3903	3908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_009777	T	7	7	3910	3916	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009777	TTC	2	6	3919	3924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156936682
60	NC_009777	TCG	2	6	3928	3933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936682
61	NC_009777	GAATT	2	10	3942	3951	40 %	40 %	20 %	0 %	156936682
62	NC_009777	AGT	2	6	4021	4026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156936682
63	NC_009777	T	6	6	4026	4031	0 %	100 %	0 %	0 %	156936682
64	NC_009777	GCG	2	6	4078	4083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_009777	CT	3	6	4242	4247	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_009777	TTG	2	6	4322	4327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009777	ATG	2	6	4375	4380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009777	TGA	2	6	4459	4464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009777	GTTG	2	8	4529	4536	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009777	CAA	2	6	4537	4542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_009777	AAC	2	6	4625	4630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_009777	TGG	2	6	4688	4693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009777	CGT	2	6	4740	4745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936683
74	NC_009777	CTC	2	6	4750	4755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156936683
75	NC_009777	GTTC	2	8	4798	4805	0 %	50 %	25 %	25 %	156936683
76	NC_009777	TCC	2	6	4940	4945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_009777	TA	3	6	5035	5040	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009777	GC	3	6	5047	5052	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_009777	AGA	2	6	5061	5066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009777	ACG	2	6	5096	5101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_009777	TGAC	2	8	5136	5143	25 %	25 %	25 %	25 %	156936684
82	NC_009777	TGT	2	6	5356	5361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	156936684
83	NC_009777	TGA	2	6	5576	5581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156936685
84	NC_009777	GCT	2	6	5598	5603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936685
85	NC_009777	ATT	2	6	5622	5627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156936685
86	NC_009777	TGC	2	6	5630	5635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936685
87	NC_009777	AGA	2	6	5682	5687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156936685
88	NC_009777	ACG	2	6	5699	5704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936685
89	NC_009777	TCA	2	6	5768	5773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156936685
90	NC_009777	ACA	2	6	5794	5799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156936685
91	NC_009777	TTG	2	6	5803	5808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	156936685
92	NC_009777	GGGCA	2	10	5829	5838	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
93	NC_009777	TTC	2	6	5890	5895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_009777	GTAT	2	8	5959	5966	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009777	TGT	2	6	5997	6002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009777	CTA	2	6	6006	6011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_009777	CAC	2	6	6022	6027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_009777	CT	3	6	6057	6062	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_009777	GGC	2	6	6066	6071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_009777	T	8	8	6072	6079	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009777	T	6	6	6084	6089	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009777	A	6	6	6153	6158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009777	GGTA	2	8	6162	6169	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009777	ATAG	2	8	6190	6197	50 %	25 %	25 %	0 %	156936686
105	NC_009777	CAA	2	6	6220	6225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156936686
106	NC_009777	GAA	3	9	6251	6259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156936686
107	NC_009777	CTT	2	6	6346	6351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156936686
108	NC_009777	TGAG	2	8	6355	6362	25 %	25 %	50 %	0 %	156936686
109	NC_009777	TTG	2	6	6374	6379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	156936686
110	NC_009777	GCT	2	6	6403	6408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936686
111	NC_009777	T	6	6	6454	6459	0 %	100 %	0 %	0 %	156936686
112	NC_009777	AGG	2	6	6466	6471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	156936686
113	NC_009777	CTCG	2	8	6479	6486	0 %	25 %	25 %	50 %	156936686
114	NC_009777	TTC	2	6	6533	6538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156936686
115	NC_009777	CAA	2	6	6544	6549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156936686
116	NC_009777	GTT	2	6	6556	6561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	156936686
117	NC_009777	T	6	6	6643	6648	0 %	100 %	0 %	0 %	156936687
118	NC_009777	CA	3	6	6844	6849	50 %	0 %	0 %	50 %	156936687
119	NC_009777	CA	3	6	6894	6899	50 %	0 %	0 %	50 %	156936687
120	NC_009777	AGA	2	6	6928	6933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156936687
121	NC_009777	AGT	2	6	6947	6952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156936687
122	NC_009777	TGT	2	6	7019	7024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	156936687
123	NC_009777	TAAA	2	8	7048	7055	75 %	25 %	0 %	0 %	156936687
124	NC_009777	GGA	2	6	7117	7122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	156936687
125	NC_009777	ATG	2	6	7340	7345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156936687
126	NC_009777	GTT	2	6	7372	7377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	156936688
127	NC_009777	AGTAA	2	10	7389	7398	60 %	20 %	20 %	0 %	156936688
128	NC_009777	GTT	2	6	7424	7429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	156936688
129	NC_009777	CTT	2	6	7451	7456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156936688
130	NC_009777	CGA	2	6	7529	7534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936688
131	NC_009777	T	6	6	7620	7625	0 %	100 %	0 %	0 %	156936688
132	NC_009777	TA	3	6	7632	7637	50 %	50 %	0 %	0 %	156936688
133	NC_009777	GCC	2	6	7674	7679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156936688
134	NC_009777	ACTA	2	8	7746	7753	50 %	25 %	0 %	25 %	156936688
135	NC_009777	ACAAG	2	10	7848	7857	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
136	NC_009777	AGA	2	6	7968	7973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009777	A	6	6	7977	7982	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009777	T	6	6	7994	7999	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009777	AAAG	2	8	8096	8103	75 %	0 %	25 %	0 %	156936689
140	NC_009777	TATTCA	2	12	8110	8121	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	156936689
141	NC_009777	A	6	6	8182	8187	100 %	0 %	0 %	0 %	156936689
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