MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome 2

Total Repeats: 57922

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_009457	CA	3	6	180533	180538	50 %	0 %	0 %	50 %	147675292
3502	NC_009457	CAC	2	6	180547	180552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147675292
3503	NC_009457	CGT	2	6	180556	180561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147675292
3504	NC_009457	CGT	2	6	180586	180591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147675292
3505	NC_009457	CTG	2	6	180595	180600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147675292
3506	NC_009457	CGT	2	6	180661	180666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147675292
3507	NC_009457	TCG	2	6	180671	180676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3508	NC_009457	T	6	6	180716	180721	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_009457	TCCT	2	8	180752	180759	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3510	NC_009457	AGT	2	6	180763	180768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_009457	CCG	2	6	180778	180783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3512	NC_009457	TAG	2	6	180971	180976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_009457	TGATT	2	10	180992	181001	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_009457	AGT	2	6	181046	181051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147674727
3515	NC_009457	GCA	2	6	181119	181124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147674727
3516	NC_009457	AAGA	2	8	181173	181180	75 %	0 %	25 %	0 %	147674727
3517	NC_009457	TTC	2	6	181200	181205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147674727
3518	NC_009457	CAT	2	6	181415	181420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147674727
3519	NC_009457	GAT	2	6	181424	181429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147674727
3520	NC_009457	GCA	2	6	181440	181445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147674727
3521	NC_009457	TGG	2	6	181564	181569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147674727
3522	NC_009457	TGG	2	6	181597	181602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147674727
3523	NC_009457	CTGA	2	8	181620	181627	25 %	25 %	25 %	25 %	147674727
3524	NC_009457	AGA	2	6	181628	181633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147674727
3525	NC_009457	GCTG	2	8	181637	181644	0 %	25 %	50 %	25 %	147674727
3526	NC_009457	CAA	3	9	181665	181673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147674727
3527	NC_009457	CAAT	2	8	181687	181694	50 %	25 %	0 %	25 %	147674727
3528	NC_009457	GCT	2	6	181773	181778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147674727
3529	NC_009457	TGG	2	6	181795	181800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147674727
3530	NC_009457	CGG	2	6	181867	181872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147674727
3531	NC_009457	CTG	2	6	181875	181880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147674727
3532	NC_009457	A	6	6	181936	181941	100 %	0 %	0 %	0 %	147674727
3533	NC_009457	GTT	2	6	181944	181949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147674727
3534	NC_009457	GCA	2	6	181954	181959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147674727
3535	NC_009457	GCTCT	2	10	182050	182059	0 %	40 %	20 %	40 %	147674727
3536	NC_009457	GTG	2	6	182068	182073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147674727
3537	NC_009457	ATC	2	6	182124	182129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147674727
3538	NC_009457	GAA	2	6	182147	182152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147674727
3539	NC_009457	TG	3	6	182190	182195	0 %	50 %	50 %	0 %	147674727
3540	NC_009457	CGT	2	6	182226	182231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147674727
3541	NC_009457	TGC	2	6	182267	182272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147674727
3542	NC_009457	AGA	2	6	182288	182293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147674727
3543	NC_009457	TG	4	8	182360	182367	0 %	50 %	50 %	0 %	147674727
3544	NC_009457	GATG	2	8	182384	182391	25 %	25 %	50 %	0 %	147674727
3545	NC_009457	AGA	2	6	182444	182449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147674727
3546	NC_009457	TCTG	2	8	182465	182472	0 %	50 %	25 %	25 %	147674727
3547	NC_009457	TGA	2	6	182483	182488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147674727
3548	NC_009457	ACTGC	2	10	182541	182550	20 %	20 %	20 %	40 %	147674727
3549	NC_009457	TCTG	2	8	182633	182640	0 %	50 %	25 %	25 %	147674727
3550	NC_009457	GGT	2	6	182748	182753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147674727
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3552	NC_009457	ACC	2	6	182787	182792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147674727
3553	NC_009457	TGC	2	6	182825	182830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147674727
3554	NC_009457	AAG	2	6	182851	182856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147674727
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3556	NC_009457	CCG	2	6	182881	182886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147674727
3557	NC_009457	TTC	2	6	182956	182961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147674727
3558	NC_009457	TC	3	6	182986	182991	0 %	50 %	0 %	50 %	147674727
3559	NC_009457	CTGA	2	8	183030	183037	25 %	25 %	25 %	25 %	147674727
3560	NC_009457	AAG	2	6	183043	183048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147674727
3561	NC_009457	AAG	2	6	183103	183108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147674727
3562	NC_009457	GCA	3	9	183126	183134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147674727
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3564	NC_009457	CAC	2	6	183154	183159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147674727
3565	NC_009457	AAT	2	6	183166	183171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147674727
3566	NC_009457	ACA	2	6	183192	183197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3567	NC_009457	ATA	2	6	183213	183218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_009457	T	6	6	183253	183258	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_009457	ATG	2	6	183279	183284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_009457	CTG	2	6	183328	183333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147674411
3571	NC_009457	GAAT	2	8	183351	183358	50 %	25 %	25 %	0 %	147674411
3572	NC_009457	CAA	2	6	183412	183417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147674411
3573	NC_009457	ATT	2	6	183444	183449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147674411
3574	NC_009457	ATT	2	6	183506	183511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147674411
3575	NC_009457	GGCTC	2	10	183537	183546	0 %	20 %	40 %	40 %	147674411
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3577	NC_009457	TTCGA	2	10	183652	183661	20 %	40 %	20 %	20 %	147674411
3578	NC_009457	CAA	2	6	183769	183774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147674411
3579	NC_009457	CAT	2	6	183810	183815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147674411
3580	NC_009457	CAG	2	6	183868	183873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147674411
3581	NC_009457	ATT	2	6	183949	183954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147674411
3582	NC_009457	CT	4	8	184052	184059	0 %	50 %	0 %	50 %	147674411
3583	NC_009457	CAA	2	6	184141	184146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147674411
3584	NC_009457	GC	4	8	184165	184172	0 %	0 %	50 %	50 %	147674411
3585	NC_009457	CT	4	8	184204	184211	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3586	NC_009457	A	6	6	184215	184220	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_009457	T	7	7	184236	184242	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_009457	A	6	6	184315	184320	100 %	0 %	0 %	0 %	147674022
3589	NC_009457	GCC	2	6	184332	184337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147674022
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3591	NC_009457	GCTCA	2	10	184374	184383	20 %	20 %	20 %	40 %	147674022
3592	NC_009457	TCT	2	6	184650	184655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147674022
3593	NC_009457	GAA	2	6	184656	184661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147674022
3594	NC_009457	GAT	2	6	184664	184669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147674022
3595	NC_009457	TTA	2	6	184712	184717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_009457	CTAA	3	12	184724	184735	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3597	NC_009457	ATG	2	6	184750	184755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147673240
3598	NC_009457	ATCG	2	8	184757	184764	25 %	25 %	25 %	25 %	147673240
3599	NC_009457	GTG	2	6	184833	184838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147673240
3600	NC_009457	TCAA	2	8	184965	184972	50 %	25 %	0 %	25 %	147673240
3601	NC_009457	TGA	2	6	185023	185028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147673240
3602	NC_009457	TGC	2	6	185032	185037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147673240
3603	NC_009457	CTT	2	6	185084	185089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147673240
3604	NC_009457	GAAG	2	8	185106	185113	50 %	0 %	50 %	0 %	147673240
3605	NC_009457	TTG	2	6	185152	185157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147673240
3606	NC_009457	TGTT	2	8	185160	185167	0 %	75 %	25 %	0 %	147673240
3607	NC_009457	TTA	2	6	185232	185237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147673240
3608	NC_009457	CCA	2	6	185323	185328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147673240
3609	NC_009457	GGT	3	9	185339	185347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147673240
3610	NC_009457	TTA	2	6	185352	185357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147673240
3611	NC_009457	TTTCT	2	10	185369	185378	0 %	80 %	0 %	20 %	147673240
3612	NC_009457	TCG	2	6	185402	185407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147673240
3613	NC_009457	T	6	6	185466	185471	0 %	100 %	0 %	0 %	147673240
3614	NC_009457	CCA	2	6	185488	185493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147673240
3615	NC_009457	TGA	2	6	185515	185520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147673240
3616	NC_009457	CTA	2	6	185582	185587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147673240
3617	NC_009457	TTA	2	6	185673	185678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147673240
3618	NC_009457	GGGA	2	8	185705	185712	25 %	0 %	75 %	0 %	147673240
3619	NC_009457	CAGCGA	2	12	185771	185782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147673240
3620	NC_009457	GTG	2	6	185850	185855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147673240
3621	NC_009457	GCG	2	6	185859	185864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147673240
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