MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome 2

Total Repeats: 57922

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_009457	CAT	2	6	820769	820774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229259764
16002	NC_009457	GTT	2	6	820788	820793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229259764
16003	NC_009457	T	6	6	820821	820826	0 %	100 %	0 %	0 %	229259764
16004	NC_009457	CTT	2	6	820868	820873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229259764
16005	NC_009457	CCA	2	6	820892	820897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229259764
16006	NC_009457	GC	3	6	820911	820916	0 %	0 %	50 %	50 %	229259764
16007	NC_009457	AAG	2	6	820996	821001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229259764
16008	NC_009457	GTT	2	6	821009	821014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229259764
16009	NC_009457	CGC	2	6	821031	821036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229259764
16010	NC_009457	GCA	2	6	821044	821049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229259764
16011	NC_009457	CCG	2	6	821069	821074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229259764
16012	NC_009457	GTC	2	6	821088	821093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229259764
16013	NC_009457	CAA	2	6	821216	821221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229259764
16014	NC_009457	CCA	2	6	821347	821352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229259764
16015	NC_009457	CCG	2	6	821395	821400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229259764
16016	NC_009457	CAC	2	6	821442	821447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229259764
16017	NC_009457	GGC	2	6	821469	821474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229259764
16018	NC_009457	CAA	2	6	821481	821486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229259764
16019	NC_009457	TCA	2	6	821488	821493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229259764
16020	NC_009457	GCCACG	2	12	821526	821537	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	229259764
16021	NC_009457	CGC	2	6	821565	821570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229259764
16022	NC_009457	GAT	2	6	821589	821594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229259764
16023	NC_009457	CAT	2	6	821598	821603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229259764
16024	NC_009457	AAG	2	6	821780	821785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229259764
16025	NC_009457	TTC	2	6	821790	821795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229259764
16026	NC_009457	TTG	2	6	821815	821820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229259764
16027	NC_009457	ATTG	2	8	821898	821905	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16028	NC_009457	GGA	2	6	822071	822076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16029	NC_009457	AAG	2	6	822101	822106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16030	NC_009457	GCA	2	6	822120	822125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16031	NC_009457	TTTG	2	8	822130	822137	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16032	NC_009457	CAA	2	6	822155	822160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16033	NC_009457	TA	3	6	822210	822215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16034	NC_009457	CAT	2	6	822235	822240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16035	NC_009457	T	7	7	822250	822256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16036	NC_009457	TA	3	6	822269	822274	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16037	NC_009457	GCA	2	6	822295	822300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147674138
16038	NC_009457	ACC	2	6	822366	822371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147674138
16039	NC_009457	TGA	2	6	822533	822538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147674138
16040	NC_009457	AAG	2	6	822574	822579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147674138
16041	NC_009457	TGA	2	6	822584	822589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147674138
16042	NC_009457	AGC	2	6	822622	822627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147674138
16043	NC_009457	CTA	2	6	822670	822675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147674138
16044	NC_009457	AAG	2	6	822679	822684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147674138
16045	NC_009457	AGA	2	6	822728	822733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16046	NC_009457	AGC	2	6	822872	822877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16047	NC_009457	GAT	2	6	822945	822950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147673379
16048	NC_009457	TGA	2	6	822964	822969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147673379
16049	NC_009457	CG	3	6	823063	823068	0 %	0 %	50 %	50 %	147673379
16050	NC_009457	TTG	2	6	823096	823101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147673379
16051	NC_009457	GTCTGG	2	12	823110	823121	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	147673379
16052	NC_009457	AGT	2	6	823124	823129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147673379
16053	NC_009457	CTTGC	2	10	823173	823182	0 %	40 %	20 %	40 %	147673379
16054	NC_009457	TGC	2	6	823189	823194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147673379
16055	NC_009457	TGA	2	6	823209	823214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147673379
16056	NC_009457	CAAATT	2	12	823280	823291	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	147673379
16057	NC_009457	CTTG	2	8	823349	823356	0 %	50 %	25 %	25 %	147673379
16058	NC_009457	TTGA	2	8	823389	823396	25 %	50 %	25 %	0 %	147673379
16059	NC_009457	TGC	2	6	823404	823409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147673379
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16061	NC_009457	CA	3	6	823663	823668	50 %	0 %	0 %	50 %	147673379
16062	NC_009457	TGA	2	6	823832	823837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147673379
16063	NC_009457	TCT	2	6	823858	823863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147673379
16064	NC_009457	TCAG	2	8	823909	823916	25 %	25 %	25 %	25 %	147673379
16065	NC_009457	GTC	2	6	823974	823979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147673379
16066	NC_009457	TGC	2	6	824104	824109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147673379
16067	NC_009457	GTT	2	6	824166	824171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16068	NC_009457	CAGTG	2	10	824179	824188	20 %	20 %	40 %	20 %	147675725
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16071	NC_009457	TGC	2	6	824227	824232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147675725
16072	NC_009457	CTAT	2	8	824266	824273	25 %	50 %	0 %	25 %	147675725
16073	NC_009457	GGCA	2	8	824306	824313	25 %	0 %	50 %	25 %	147675725
16074	NC_009457	GCA	2	6	824477	824482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147675725
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16076	NC_009457	ATA	2	6	824575	824580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147675725
16077	NC_009457	TC	3	6	824584	824589	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16078	NC_009457	TGTA	2	8	824599	824606	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16079	NC_009457	TAT	2	6	824614	824619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16080	NC_009457	TGGT	2	8	824620	824627	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16081	NC_009457	A	7	7	824652	824658	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16082	NC_009457	GAT	2	6	824683	824688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16084	NC_009457	ATTTG	2	10	824699	824708	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
16085	NC_009457	TTG	2	6	824724	824729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16086	NC_009457	A	7	7	824740	824746	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16087	NC_009457	GCG	2	6	824789	824794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16088	NC_009457	GCT	2	6	824875	824880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147675000
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16091	NC_009457	ATG	2	6	824964	824969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147675000
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16095	NC_009457	TAAA	2	8	825105	825112	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16096	NC_009457	A	7	7	825110	825116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16097	NC_009457	TTA	2	6	825223	825228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147673824
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16107	NC_009457	GGCGG	2	10	825675	825684	0 %	0 %	80 %	20 %	147673824
16108	NC_009457	ATCA	2	8	825696	825703	50 %	25 %	0 %	25 %	147673824
16109	NC_009457	CG	3	6	825772	825777	0 %	0 %	50 %	50 %	147673824
16110	NC_009457	CCAG	2	8	825907	825914	25 %	0 %	25 %	50 %	147673824
16111	NC_009457	TTCA	2	8	826050	826057	25 %	50 %	0 %	25 %	147673824
16112	NC_009457	CAT	2	6	826154	826159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147673824
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16114	NC_009457	TCTT	2	8	826220	826227	0 %	75 %	0 %	25 %	147673824
16115	NC_009457	GTTGA	2	10	826260	826269	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
16116	NC_009457	CGG	2	6	826349	826354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147673077
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16118	NC_009457	CG	3	6	826574	826579	0 %	0 %	50 %	50 %	147673077
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