MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome 2

Total Repeats: 57922

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_009457	GA	3	6	509239	509244	50 %	0 %	50 %	0 %	147674391
10003	NC_009457	TCA	2	6	509305	509310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147674391
10004	NC_009457	TTA	2	6	509373	509378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147674391
10005	NC_009457	CAG	2	6	509551	509556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147673619
10006	NC_009457	TACG	2	8	509580	509587	25 %	25 %	25 %	25 %	147673619
10007	NC_009457	TGT	2	6	509645	509650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147673619
10008	NC_009457	GCA	2	6	509703	509708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147673619
10009	NC_009457	CCAC	2	8	509790	509797	25 %	0 %	0 %	75 %	147673619
10010	NC_009457	CG	3	6	509869	509874	0 %	0 %	50 %	50 %	147673619
10011	NC_009457	TCA	2	6	509913	509918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147673619
10012	NC_009457	CAT	2	6	510172	510177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147673619
10013	NC_009457	GTT	2	6	510235	510240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147673619
10014	NC_009457	ACC	2	6	510367	510372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147673619
10015	NC_009457	GTA	2	6	510385	510390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147673619
10016	NC_009457	CAG	2	6	510421	510426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147673619
10017	NC_009457	TCA	2	6	510440	510445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147673619
10018	NC_009457	GCA	2	6	510468	510473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147673619
10019	NC_009457	AGA	2	6	510480	510485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147673619
10020	NC_009457	ACC	2	6	510523	510528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147673619
10021	NC_009457	AGT	2	6	510552	510557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147673619
10022	NC_009457	CG	3	6	510605	510610	0 %	0 %	50 %	50 %	147673619
10023	NC_009457	GGT	2	6	510679	510684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147673619
10024	NC_009457	CCAT	2	8	510725	510732	25 %	25 %	0 %	50 %	147673619
10025	NC_009457	CAC	2	6	510733	510738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147673619
10026	NC_009457	TCT	2	6	510740	510745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147673619
10027	NC_009457	CTG	2	6	510768	510773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147673619
10028	NC_009457	GCA	2	6	510908	510913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147673619
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10030	NC_009457	ATAG	2	8	511147	511154	50 %	25 %	25 %	0 %	147673619
10031	NC_009457	GGAT	2	8	511175	511182	25 %	25 %	50 %	0 %	147673619
10032	NC_009457	CTTT	2	8	511206	511213	0 %	75 %	0 %	25 %	147673619
10033	NC_009457	GGC	2	6	511270	511275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147673619
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10035	NC_009457	AGC	2	6	511502	511507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147673619
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10039	NC_009457	T	7	7	511653	511659	0 %	100 %	0 %	0 %	147673619
10040	NC_009457	GTA	2	6	511711	511716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147673619
10041	NC_009457	T	6	6	511832	511837	0 %	100 %	0 %	0 %	147673619
10042	NC_009457	CAG	2	6	511851	511856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147673619
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10044	NC_009457	GA	3	6	511920	511925	50 %	0 %	50 %	0 %	147673619
10045	NC_009457	TGT	3	9	512046	512054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147673619
10046	NC_009457	CATC	2	8	512116	512123	25 %	25 %	0 %	50 %	147673619
10047	NC_009457	TTCGG	2	10	512157	512166	0 %	40 %	40 %	20 %	147673619
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10049	NC_009457	GA	3	6	512225	512230	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10050	NC_009457	GA	3	6	512234	512239	50 %	0 %	50 %	0 %	147675601
10051	NC_009457	GGT	2	6	512280	512285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147675601
10052	NC_009457	GCG	2	6	512353	512358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147675601
10053	NC_009457	AGCAA	2	10	512438	512447	60 %	0 %	20 %	20 %	147675601
10054	NC_009457	AGC	2	6	512449	512454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147675601
10055	NC_009457	TGA	2	6	512465	512470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147675601
10056	NC_009457	ACCG	2	8	512506	512513	25 %	0 %	25 %	50 %	147675601
10057	NC_009457	GCC	2	6	512687	512692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147675601
10058	NC_009457	A	6	6	512729	512734	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10059	NC_009457	TTTTAC	2	12	512753	512764	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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10061	NC_009457	CTCG	2	8	512932	512939	0 %	25 %	25 %	50 %	147675422
10062	NC_009457	TTG	2	6	512961	512966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147675422
10063	NC_009457	GC	3	6	513000	513005	0 %	0 %	50 %	50 %	147675422
10064	NC_009457	GCGA	2	8	513008	513015	25 %	0 %	50 %	25 %	147675422
10065	NC_009457	ACCAA	2	10	513047	513056	60 %	0 %	0 %	40 %	147675422
10066	NC_009457	CAT	2	6	513058	513063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147675422
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10070	NC_009457	TGAT	2	8	513387	513394	25 %	50 %	25 %	0 %	147675422
10071	NC_009457	GCA	2	6	513432	513437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147675422
10072	NC_009457	GAG	2	6	513456	513461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147675422
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10076	NC_009457	TAAGC	2	10	513735	513744	40 %	20 %	20 %	20 %	147675422
10077	NC_009457	CAG	2	6	513758	513763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147675422
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10082	NC_009457	A	6	6	513941	513946	100 %	0 %	0 %	0 %	147675422
10083	NC_009457	AGCC	2	8	513957	513964	25 %	0 %	25 %	50 %	147675422
10084	NC_009457	GCC	2	6	514037	514042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147675422
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10086	NC_009457	TGG	2	6	514140	514145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147675422
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10088	NC_009457	ATA	2	6	514267	514272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147675422
10089	NC_009457	TCTTT	2	10	514287	514296	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
10090	NC_009457	CTTA	2	8	514300	514307	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10091	NC_009457	AG	3	6	514311	514316	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10092	NC_009457	ACT	2	6	514322	514327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147675736
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10095	NC_009457	CG	4	8	514445	514452	0 %	0 %	50 %	50 %	147675736
10096	NC_009457	TCA	2	6	514472	514477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147675736
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10100	NC_009457	TCG	3	9	514609	514617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147675736
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10103	NC_009457	CCA	2	6	514697	514702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147675736
10104	NC_009457	CTT	2	6	514793	514798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147675736
10105	NC_009457	TGC	2	6	514906	514911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147675736
10106	NC_009457	ATG	2	6	514921	514926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147675736
10107	NC_009457	CGAT	2	8	514954	514961	25 %	25 %	25 %	25 %	147675736
10108	NC_009457	CGCGCA	2	12	514994	515005	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	147675736
10109	NC_009457	TCAA	2	8	515053	515060	50 %	25 %	0 %	25 %	147675736
10110	NC_009457	AAG	2	6	515146	515151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147675736
10111	NC_009457	TG	3	6	515227	515232	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10112	NC_009457	GA	3	6	515328	515333	50 %	0 %	50 %	0 %	147673894
10113	NC_009457	TCA	2	6	515350	515355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147673894
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10116	NC_009457	GA	3	6	515648	515653	50 %	0 %	50 %	0 %	147673894
10117	NC_009457	TTG	2	6	515748	515753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147673299
10118	NC_009457	GC	3	6	515772	515777	0 %	0 %	50 %	50 %	147673299
10119	NC_009457	ATTT	2	8	515791	515798	25 %	75 %	0 %	0 %	147673299
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10121	NC_009457	ACG	3	9	515810	515818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147673299
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10363	NC_009457	GCCT	2	8	528046	528053	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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