MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome 1

Total Repeats: 20894

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_009456	CCCG	2	8	131108	131115	0 %	0 %	25 %	75 %	147671987
2502	NC_009456	TCA	2	6	131119	131124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147671987
2503	NC_009456	AGA	2	6	131126	131131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147671987
2504	NC_009456	TTC	2	6	131133	131138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147671987
2505	NC_009456	CGA	2	6	131150	131155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671987
2506	NC_009456	GC	3	6	131203	131208	0 %	0 %	50 %	50 %	147671987
2507	NC_009456	GTT	2	6	131241	131246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147671987
2508	NC_009456	CAC	2	6	131258	131263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671987
2509	NC_009456	GCC	2	6	131265	131270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147671987
2510	NC_009456	CTT	2	6	131273	131278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147671987
2511	NC_009456	GCT	2	6	131291	131296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671987
2512	NC_009456	ACC	3	9	131317	131325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671987
2513	NC_009456	GCA	2	6	131384	131389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671987
2514	NC_009456	GGC	2	6	131426	131431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147671987
2515	NC_009456	GGC	2	6	131460	131465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147671987
2516	NC_009456	GCC	2	6	131664	131669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147671987
2517	NC_009456	CTT	2	6	131780	131785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147671987
2518	NC_009456	GCG	2	6	131788	131793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147671987
2519	NC_009456	CA	3	6	131832	131837	50 %	0 %	0 %	50 %	147671987
2520	NC_009456	GCA	2	6	131900	131905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671987
2521	NC_009456	AG	3	6	131910	131915	50 %	0 %	50 %	0 %	147671987
2522	NC_009456	AGGC	2	8	131978	131985	25 %	0 %	50 %	25 %	147671987
2523	NC_009456	TGA	2	6	132010	132015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147671987
2524	NC_009456	CCA	2	6	132110	132115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671987
2525	NC_009456	CAG	2	6	132122	132127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671987
2526	NC_009456	A	7	7	132190	132196	100 %	0 %	0 %	0 %	147671987
2527	NC_009456	ACC	2	6	132235	132240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671987
2528	NC_009456	TTCC	2	8	132301	132308	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2529	NC_009456	GCC	2	6	132381	132386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2530	NC_009456	TCA	2	6	132446	132451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147671643
2531	NC_009456	GAT	2	6	132577	132582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147671643
2532	NC_009456	AAG	2	6	132608	132613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147671643
2533	NC_009456	AG	3	6	132682	132687	50 %	0 %	50 %	0 %	147671643
2534	NC_009456	CAG	2	6	132697	132702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671643
2535	NC_009456	ACG	2	6	132797	132802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671643
2536	NC_009456	CTG	2	6	132811	132816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671643
2537	NC_009456	CATCT	2	10	132823	132832	20 %	40 %	0 %	40 %	147671643
2538	NC_009456	GAAT	2	8	132847	132854	50 %	25 %	25 %	0 %	147671643
2539	NC_009456	CAG	2	6	132867	132872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671643
2540	NC_009456	TAAA	2	8	132967	132974	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2541	NC_009456	CAA	2	6	133077	133082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2542	NC_009456	CTTG	2	8	133113	133120	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2543	NC_009456	AG	3	6	133178	133183	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2544	NC_009456	CAC	2	6	133191	133196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2545	NC_009456	AGA	2	6	133211	133216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2546	NC_009456	CAA	2	6	133232	133237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2547	NC_009456	A	7	7	133236	133242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2548	NC_009456	T	7	7	133255	133261	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2549	NC_009456	TA	3	6	133311	133316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2550	NC_009456	GCG	2	6	133369	133374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147671860
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2552	NC_009456	CTG	2	6	133410	133415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671860
2553	NC_009456	CAA	2	6	133487	133492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147671860
2554	NC_009456	CTG	2	6	133532	133537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671860
2555	NC_009456	AC	3	6	133567	133572	50 %	0 %	0 %	50 %	147671860
2556	NC_009456	CATC	2	8	133585	133592	25 %	25 %	0 %	50 %	147671860
2557	NC_009456	T	6	6	133823	133828	0 %	100 %	0 %	0 %	147671860
2558	NC_009456	CATA	2	8	133840	133847	50 %	25 %	0 %	25 %	147671860
2559	NC_009456	TGC	2	6	133878	133883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671860
2560	NC_009456	TCA	2	6	133887	133892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147671860
2561	NC_009456	AGCG	2	8	133911	133918	25 %	0 %	50 %	25 %	147671860
2562	NC_009456	AG	3	6	133949	133954	50 %	0 %	50 %	0 %	147671860
2563	NC_009456	TGG	2	6	134004	134009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147671860
2564	NC_009456	AAACC	2	10	134079	134088	60 %	0 %	0 %	40 %	147671860
2565	NC_009456	CCT	2	6	134179	134184	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147671860
2566	NC_009456	AAT	2	6	134269	134274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147671860
2567	NC_009456	CAC	2	6	134516	134521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671860
2568	NC_009456	TGG	2	6	134535	134540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147671860
2569	NC_009456	ATC	2	6	134564	134569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147671860
2570	NC_009456	GCT	2	6	134815	134820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671860
2571	NC_009456	ACG	2	6	134846	134851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671860
2572	NC_009456	AAG	2	6	134875	134880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147671860
2573	NC_009456	CGA	2	6	135033	135038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671860
2574	NC_009456	CGC	3	9	135074	135082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147671860
2575	NC_009456	ATC	2	6	135230	135235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147671860
2576	NC_009456	GCC	2	6	135317	135322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147671860
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2579	NC_009456	T	7	7	135506	135512	0 %	100 %	0 %	0 %	147671860
2580	NC_009456	CCTAA	2	10	135532	135541	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
2581	NC_009456	GT	3	6	135637	135642	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2582	NC_009456	AGG	2	6	135663	135668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2583	NC_009456	CTT	2	6	135689	135694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2584	NC_009456	TGGC	2	8	135733	135740	0 %	25 %	50 %	25 %	147671504
2585	NC_009456	TGC	2	6	135743	135748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671504
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2587	NC_009456	CG	3	6	135788	135793	0 %	0 %	50 %	50 %	147671504
2588	NC_009456	GCC	2	6	135928	135933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147671504
2589	NC_009456	TGCAGT	2	12	135937	135948	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	147671504
2590	NC_009456	GCCAC	2	10	136019	136028	20 %	0 %	20 %	60 %	147671504
2591	NC_009456	GCT	2	6	136082	136087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671504
2592	NC_009456	ATC	2	6	136128	136133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147671504
2593	NC_009456	ACC	2	6	136221	136226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671504
2594	NC_009456	CTTC	2	8	136229	136236	0 %	50 %	0 %	50 %	147671504
2595	NC_009456	GAA	3	9	136245	136253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147671504
2596	NC_009456	CGCGT	2	10	136275	136284	0 %	20 %	40 %	40 %	147671504
2597	NC_009456	AGC	2	6	136285	136290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671504
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2599	NC_009456	GTA	2	6	136392	136397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147671504
2600	NC_009456	TCG	2	6	136412	136417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671504
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2602	NC_009456	GCA	2	6	136448	136453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671504
2603	NC_009456	GCA	2	6	136505	136510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671504
2604	NC_009456	CGG	2	6	136602	136607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147671504
2605	NC_009456	GCA	2	6	136628	136633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671504
2606	NC_009456	TTC	2	6	136719	136724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147671504
2607	NC_009456	TGA	2	6	136798	136803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147671504
2608	NC_009456	CGC	2	6	136920	136925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147671504
2609	NC_009456	GCA	2	6	136931	136936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671504
2610	NC_009456	GC	3	6	136976	136981	0 %	0 %	50 %	50 %	147671504
2611	NC_009456	T	6	6	137007	137012	0 %	100 %	0 %	0 %	147671504
2612	NC_009456	CAG	2	6	137025	137030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671504
2613	NC_009456	TGC	2	6	137134	137139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671504
2614	NC_009456	CAA	2	6	137276	137281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147671504
2615	NC_009456	CGC	3	9	137285	137293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147671504
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2619	NC_009456	TCA	2	6	137563	137568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147671504
2620	NC_009456	CG	3	6	137645	137650	0 %	0 %	50 %	50 %	147671504
2621	NC_009456	CCA	2	6	137714	137719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671504
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2623	NC_009456	TCT	2	6	137735	137740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147671504
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2746	NC_009456	CTA	2	6	143727	143732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147672133
2747	NC_009456	TCA	2	6	143826	143831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147671480
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2758	NC_009456	CACT	2	8	144231	144238	25 %	25 %	0 %	50 %	147671480
2759	NC_009456	TTA	2	6	144265	144270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2760	NC_009456	GCAA	2	8	144315	144322	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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2863	NC_009456	GAGC	2	8	149442	149449	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2864	NC_009456	TCA	2	6	149489	149494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2866	NC_009456	TGT	2	6	149560	149565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2867	NC_009456	CATCT	2	10	149625	149634	20 %	40 %	0 %	40 %	147671404
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2994	NC_009456	TTC	2	6	155513	155518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147672269
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